基因總覽
TRGV10 的正式名稱為 T cell receptor gamma variable 10 (non-functional),屬於 T 細胞受體基因。名稱指出它與 T 細胞受體 γ 可變區相關,並標示為非功能性基因。現有資料未提供其轉錄產物、蛋白質產物或結構特徵,因此無法進一步描述其產物性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390341 ★ | 38,299,810–38,300,280 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料將 TRGV10 與適應性免疫反應的參與、質膜定位及 T 細胞受體複合體成員身分列為預測。這些描述均屬預測,並非已證實的功能或定位;來源沒有提供支持這些預測的實驗條件、作用機制或功能結果。由於該基因的正式名稱標示為非功能性,且資料未說明其轉錄或產物狀態,不能據此推定它會產生具有功能的受體成分。
Promoter 與基因調控
>TRGV10 ENST00000390341 GRCh38 chr7:38300180-38301280 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGTGCACCTGTATTC CCAGTTACTCAAGAGGCTGGGGATGAAAGGATTGCTTGAGCCTCAGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATG AGTGTGCCACTGCACTCCAGGGTGGGTGACAGAACAAGATCTTGTCTCAAAAAATATATGTAAAGAAAAA ATTCTCCAATGACATGGGAAGTTGCTCAGAATATAAGCTGAACTGAAAGAATACAGAACACTATACATGT AAATATATCTATAGTCCATAAAATCATATTAATATTCATGTATCCAAAATGAAAATATCTACAAGTGAGC ATATGATAATGTGAATAGTAGTGGGCCTTTGTGATATGACCGTAGATGTTTTTATTGTTATCTTTCCCCA TTGCTCTGAGTTTCTTCAATGAGCACTGTTACCAGCATGTTCTACCTATCAGCTGTGTGACTTCTGTGGA GTTGATGACTCTGTGCCTCATTCCCTCATCCAAAAAATGAAAATTCCAAGTACCCATATTAAGTGATCAT TGTGAAGATTAGAAGGTGAAAAACGTTTAGAAAAAAAAAAGGCTAGCAAATAGAAAATGCTCAATAAGTA TTTGCTATTATAAAAGTTAATGTTTATTAAATATGCAACAATTTAAAATATTATGCTGAGGAAAAGTGTT CACGAACAACTCCTAGGCAATTAGAAATCCTTCTCATTTCCACAGAAATTAAGCAACCCCCATGGCCCCC TCACATTCGTGCAGAGAACACCATCGAGATTGCTAGCCTGATTTGAGATAAGCAGGGTGAGCAGGAGGGG GGCTCAGTGCTGAGCCTGCAGGAGGCACTGAAGGGCCCAAAAAACCATTTTCTTTCTCTCCCCAGTTCAG GCCACACCCTCCAGAACCTGACCAGAGTCGTCTAGCCACCAGGTCCGCACTTTCCTGCCTTCTCCTTGGG TACACCGCCCCGAAGACAGGATGTCACTGCTGGAAGCATTTGCCTTCTCCTCCTGGGCTCCTGAGTTGCT GTCCGAACATTTCAGTCTAGCTGCGTGACCAAAATCATTCTTCAATGTTTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 38295686–38295699 · motif
· motif · 38295686–38295699 · motif
· motif · 38295870–38295882 · motif
· motif · 38296285–38296296 · motif
· motif · 38296582–38296595 · motif
· motif · 38296582–38296595 · motif
· motif · 38296646–38296657 · motif
· motif · 38296679–38296692 · motif
· motif · 38296679–38296692 · motif
· motif · 38303765–38303779 · motif
基因座與轉錄註解
TRGV10 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390341 ★ | TR_V_gene | 360 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRGV10 被預測可能參與適應性免疫反應、位於質膜,並屬於 T 細胞受體複合體;這些均為預測性描述,來源未提供實驗驗證。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in adaptive immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATGTCACTGCTGGAAGCATTTGCCTTCTCCTCCTGGGCTC40TTGGACTTGGATTATCAAAAGTGGAGCAGTTCCAGCTATC80CATTTCCACGGAAGTCAAGAAAAGTATTGACATACCTTGC120AAGATATCGAGCACAAGGTTTGAAACAGATGTCATTCACT160GGTACCGGCAGAAACCAAATCAGGCTTTGGAGCACCTGAT200CTATATTGTCTCAACAAAATCCGCAGCTCGACGCAGCATG240GGTAAGACAAGCAACAAAGTGGAGGCAAGAAAGAATTCTC280AAACTCTCACTTCAATCCTTACCATCAAGTCCGTAGAGAA320AGAAGACATGGCCGTTTACTACTGTGCTGCGTGGGATTAC360cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。