基因總覽
TRGV1 的正式名稱為 T cell receptor gamma variable 1 (non-functional),屬於 T cell receptor gene。名稱標示其為 non-functional;現有資料未提供可據以描述其蛋白質或 RNA 產物、結構特色或家族內細節的資訊,因此不推定其具有功能性產物。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390348 ★ | 38,367,586–38,368,169 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料將 TRGV1 與適應性免疫反應的參與關係標示為預測,並未提供實驗細節或具體分子作用方式,因此不能據此描述它如何影響免疫反應,也不能將這項關聯視為已證實的功能。
資料亦預測 TRGV1 位於質膜,並預測其為 T cell receptor complex 的一部分。這些內容同樣屬於預測性註記;來源沒有說明定位或複合體關係的驗證條件、所涉系統或功能後果。由於其正式名稱標示為 non-functional,也不應將上述預測延伸解讀為已確認的功能性受體成分。
Promoter 與基因調控
>TRGV1 ENST00000390348 GRCh38 chr7:38368069-38369169 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCCACATGGTGAAACCCCATCTCT ATGAAAAATATAAAAATTAGCTAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGG CAGGAGAATTGCTTGAACCCCGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGTCT GAGACACAGAGCGAGACTCTATCTATCTAAAGAAAAAAAAAAAGAACTTTCATTCTTAAGCTCTGTGGTA TTCTAAAATGTTTGTACAGAAATGGCAAGGTAAATGCTTGATTATTTTCTTTTCTGTTTTCAGAATGAGA TGGTGTCTTAGCAACCTCCAGAGGAGACTTTATTTTGCTATATTATGTTTTTCAAGAATTTGTGTAGGTG TTATTCTTTTGGTGCTTAAAATGTCCTACCGATGGTTAGTGAGAGCCACTGCCGTTGTTTTTATTTGAGT AGAGTCCAAGGCAAACCAACATGCCTGACCCTCAGTCCTGTTAATAAAGCAGGCTCAAGCCTTCTCAGAA TGGCCCTGGGTGGACTTGCAAATGTGGACTTGCAAATGTGAAAAGGAAGGTGGTTCAGGGCCCTAATCAG AAGCTTCCTGGCAGGACCAGGTTCTGGCAGCTGCGTTGGCTGCTGAAACTCTGAAGTGCAGGATGTGAGC CTGCTGTGGGACTGCCCTCTCCCAAGGGCCATGACCAGCTAGCGCCAGGGTCAGCTTCCCCCACATCTGC ACTCCCTCTGCTGTGGGCCTGAGCAATCCATGCCCCTGGCTCTCTCCTGAAGAGGGCCTGCTCTCAGCTG CCACAAGAGGGCGATGGAGAACGGGCCTGAGCAGAGAGGCAGGAGCTCCTCTGCAGGTCCTCCCAGGAAC CACCGCTTCTGGGAGGAAGGCTTGGGAGTCCCCTAAGACACATCCTCAGTCACTTCTCCCTGCCTGTGAC TCAGGAAGACCAGCTCCTCTTACTGTCTTCTGTGCTAGGGATCACTTCCTTGTTGAGTGGGGCCTGAGTT TTAAGAGGATCTTCTGCTCCTCTTCATCTGGTCCCTTTCCTTCCAAGGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_C5RR4 · enhancer · 38362367–38363856 · regulatory
ENSR7_5C2M4J · CTCF_binding_site · 38363433–38363454 · regulatory
ENSR7_5C2M59 · CTCF_binding_site · 38363590–38363611 · regulatory
ENSR7_5C2M6H · CTCF_binding_site · 38363854–38363875 · regulatory
ENSR7_C5RRG · enhancer · 38367135–38368647 · regulatory
ENSR7_5C2MX5 · CTCF_binding_site · 38368313–38368334 · regulatory
ENSR7_B9LL8 · enhancer · 38369727–38370377 · regulatory
ENSR7_5C2N84 · CTCF_binding_site · 38370032–38370053 · regulatory
· motif · 38363435–38363451 · motif
· motif · 38363592–38363608 · motif
· motif · 38363856–38363872 · motif
· motif · 38367437–38367452 · motif
· motif · 38367437–38367452 · motif
· motif · 38368136–38368147 · motif
· motif · 38368136–38368147 · motif
· motif · 38368315–38368331 · motif
· motif · 38369729–38369751 · motif
· motif · 38369729–38369751 · motif
· motif · 38369961–38369972 · motif
· motif · 38369980–38369993 · motif
· motif · 38370014–38370036 · motif
· motif · 38370034–38370050 · motif
基因座與轉錄註解
TRGV1 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390348 ★ | TR_V_gene | 465 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRGV1 被預測可能參與適應性免疫反應、位於質膜,並屬於 T cell receptor complex;這些均為預測性註記,來源未提供實驗系統、處理方式或觀察結果。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in adaptive immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
TACTGTCTTCTGTGCTAGGGATCACTTCCTTGTTGAGTGG40GGCCTGAGTTTTAAGAGGATCTTCTGCTCCTCTTCATCTG80GTCCCTTTCCTTCCAAGGCCCCAGAGAGGAAGGCATGCGG120TGGGCCCTAGCGGTGCTTCTAGCTTTCCTGTCTCCTGCCA160GTCAGATATCTTCCAACTTGGAAGGGAGAACGAAGTCAGT200CACCAGGCTGACTGGGTCATCTGCTGAAATCACCTGTGAT240CTTCCTGGAGCAAGTACCTTATACATCCACTGGTACCTGC280ACCAGGAGGGGAAGGCCCCACAGTGTCTTCTGTACTATGA320ACCCTACTACTCCAGGGTTGTGCTGGAATCAGGAATCACT360CCAGGAAAGTATGACACTGGAAGCACAAGGAGCAATTGGA400ATTTGAGACTGCAAAATCTAATTAAAAATGATTCTGGGTT440CTATTACTGTGCCACCTGGGACAGG465cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。