基因總覽
TRGC2 的正式名稱為 T cell receptor gamma constant 2,屬於 T cell receptor gene。現有資料提供其基因身分與分類,但未說明其轉錄產物或蛋白質的具體性質、家族結構特徵,因此不據此延伸描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000436911 ★ | 38,239,580–38,249,572 | 4 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前的功能註釋將 TRGC2 與跨膜訊號受體活性連結,但這項功能屬預測,並非已確立的實驗結論。資料亦預測它可能參與 T cell receptor signaling pathway 與 adaptive immune response,並可能位於 plasma membrane、成為 T cell receptor complex 的一部分。這些描述界定了可能的受體訊號與免疫相關角色;現有來源未提供具體分子作用機制或實驗條件,因而不宜進一步推定其作用方式。
Promoter 與基因調控
>TRGC2 ENST00000436911 GRCh38 chr7:38249472-38250572 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGTATGTACATGCGGAAGTAGATTCTCTTTAAAACAAGTGACTGTGTATGTTAAAAATAAAAGTGAACAA AATGGCTAGGCATGGTGGCTCACACCTATAATCCCAGGATTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGA GCGCAGGAGTTTTAAACCAGCCTGGTCAATATGGTGAAATATGTCTCTAGAAAAAACAAATATTAGCCAG GCATGGTGATGCATACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGGA AGTCGAGACTGCAGTGAGCTATGATCTTGCCGCTGCATTCCAACCTGGACGACAGAGCAAGCCCCAGTCT CAACAACAACAACAAAAATTTTGACATTGATTCATATGGGAAATAAGATAAATAACAAGATAAATATGGT GCATCGCAGAATCAGTTAAATGAAGAGTGGAAGTACACGAAATTGCAGAACATGAGAATGTGTCATATTT GGCCAAAGAACATAAGTTACAAAGGATGGAAAAGGGAAGTGAGAAAAGGACCAAAGAGTCTCATCTGTAG AGAGATCATTAAGGTTTTCTGACCTTCCACTTTCCCCTGCCATCCACCTTGAAAACCTGCTTCACTGTGA TGAAACAAAAGAGATTTAAAAATAAAATAAATATGCTCATGAACTTTGGAAGCCCTGGTAGGAGGCAGTT AAAAATCACACTCATCACAGCATGTGCAGAATAAACAAAGGCCAGGTTTTCGTCCAGCATCTGACACTTG AGAGCTGTGACTTTTGGCAAGTTATTTAATGTCTTGATTCTCTTTTCAACATCTGTAAAATAAGCACAAT AATAAGTACTGTGCAGCCTATCCTGGATGAAAGGCCGCGGTGGACACCAGCTCAATGGCATCTTCTCTTT TTATGGTTATGTACTAGGCCACTCCAAACCGTGCAATGTGTGTGTTTCTCTAATGATTCTTTTAAACTCA TATTTCATTTCTCCCCATAGATAAACAACTTGATGCAGATGTTTCCCCCAAGCCCACTATTTTTCTTCCT TCGATTGCTGAAACAAAACTCCAGAAGGCTGGAACATACCTTTGTCTTCTT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 38249791–38249813 · motif
· motif · 38249791–38249813 · motif
· motif · 38249980–38249993 · motif
· motif · 38250042–38250055 · motif
· motif · 38250475–38250487 · motif
基因座與轉錄註解
TRGC2 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000436911 ★ | TR_C_gene | 1,013 nt | 4 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRGC2 被預測具有跨膜訊號受體活性,可能參與 T cell receptor signaling pathway 與 adaptive immune response;其可能位於 plasma membrane,並可能是 T cell receptor complex 的一部分。這些都是預測性註釋。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable transmembrane signaling receptor activity. Predicted to be involved in T cell receptor signaling pathway and adaptive immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATAAACAACTTGATGCAGATGTTTCCCCCAAGCCCACTAT40TTTTCTTCCTTCGATTGCTGAAACAAAACTCCAGAAGGCT80GGAACATACCTTTGTCTTCTTGAGAAATTTTTCCCAGATA120TTATTAAGATACATTGGCAAGAAAAGAAGAGCAACACGAT160TCTGGGATCCCAGGAGGGGAACACCATGAAGACTAACGAC200ACATACATGAAATTTAGCTGGTTAACGGTGCCAGAAGAGT240CACTGGACAAAGAACACAGATGTATCGTCAGACATGAGAA280TAATAAAAACGGAATTGATCAAGAAATTATCTTTCCTCCA320ATAAAGACAGATGTCACCACAGTGGATCCCAAATACAATT360ATTCAAAGGATGCAAATGATGTCATCACAATGGATCCCAA400AGACAATTGGTCAAAAGATGCAAATGATACACTACTGCTG440CAGCTCACAAACACCTCTGCATATTACACGTACCTCCTCC480TGCTCCTCAAGAGTGTGGTCTATTTTGCCATCATCACCTG520CTGTCTGCTTAGAAGAACGGCTTTCTGCTGCAATGGAGAG560AAATCATAACAGACGGTGGCACAAGGAGGCCATCTTTTCC600TCATCGGTTATTGTCCCTAGAAGCGTCTTCTGAGGATCTA640GTTGGGCTTTCTTTCTGGGTTTGGGCCATTTCAGTTCTCA680TGTGTGTACTATTCTATCATTATTGTATAATGGTTTTCAA720ACCAGTGGGCACACAGAGAACCTCACTCTGTAATAACAAT760GAGGAATAGCCATGGCGATCTCCAGCACCAATCTCTCCAT800GTTTTCCACAGCTCCTCCAGCCAACCCAAATAGCGCCTGC840TATAGTGTAGACAGCCTGCGGCTTCTAGCCTTGTCCCTCT880CTTAGTGTTCTTTAATCAGATAACTGCCTGGAAGCCTTTC920ATTTTACACGCCCTGAAGCAGTCTTCTTTGCTAGTTGAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。