演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TRDNTRISK

triadin

TRDN(triadin)編碼單次跨膜蛋白 Triadin,參與肌肉收縮相關的鈣離子釋放調節,也與骨骼肌力量及心跳調控有關。

Homo sapiens6q22.31UniProt Q13061
OFFICIAL SYMBOL
TRDN
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q13061
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TRDN 是蛋白質編碼基因,產物為 Triadin。Triadin 是單次跨膜蛋白,具有細胞質側區段、跨膜區段與較長的腔內區段;其胺基端位於細胞質側,跨膜後延伸至腔內。來源指出,Triadin 與肌肉中的鈣離子調節及肌肉收縮相關,並涉及骨骼肌與心臟功能。其細胞內定位包括細胞膜與肌漿網膜。

Official symbol
TRDN
Gene name
triadin
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12261
UniProt
Q13061
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TRISK

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66q22.31
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegTRDNpq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:123,215,088–123,637,316
Gene span
422,229 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000334268 ★123,216,339–123,636,95041
ENST00000962652123,215,088–123,637,31640
ENST00000962654123,215,088–123,637,31641
ENST00000962658123,215,088–123,637,31637
ENST00000962653123,215,088–123,637,31641
ENST00000962672123,215,088–123,637,31640
ENST00000962673123,215,088–123,637,31640
ENST00000962668123,215,088–123,637,31639
ENST00000962666123,215,088–123,637,31640
ENST00000962665123,215,088–123,637,31639
ENST00000962664123,215,088–123,637,31641
ENST00000962663123,215,088–123,637,31641

顯示 12/63 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Triadin 參與調節肌漿網腔內 Ca2+ 的釋放,相關通道為 RYR1 與 RYR2。這種鈣離子釋放是觸發骨骼肌與心肌收縮的重要步驟;來源支持其具有調節作用,但未進一步說明 Triadin 如何影響通道活性或鈣離子流動。

在骨骼肌中,Triadin 是正常三聯體接合區組織所必需的。此接合區由 T-tubules 與肌漿網的 terminal cisternae 緊密相接形成。這項組織功能的註記為相似性推論(By similarity);此外,Triadin 也被指出是維持正常骨骼肌力量所必需的。

在心臟中,Triadin 參與興奮-收縮耦聯,並參與調節心跳速率。來源將其與骨骼肌及心臟的收縮功能相連,但未提供更多作用環節或效應方向的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 123636950 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TRDN ENST00000334268 GRCh38 chr6:123636850-123637950 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTAGTCAACCCTTGATTATTCACAGATTGGCTAGAGTTTATGATTATCAATGCCCTTCGATTCTCCTTT
TGCTTCCAACTACCAACTATTGAATATTTTTTTGCTCATTAACACCTGTCTAGGAGTGGGAAGGTGAAAT
GCTAATCAGCCAATTTGGTTAATTGTTAGTGGCTGCTATAATCCTTTTTTTTTTAAGTTGAGATAAGGAA
ATACTTTACTTAAATATTGGCTGTGGACTACTAAACTTTATGTCACCTTCCCTTCCTTTTTACTGCATGG
ATAAATGCAGGTATTTAGTTCTTAGTAAGGTAGTAGAGAGAATTAAAAAGATAGTAATTCATCAATCCAA
TGTTTTTCAAGTATCACACTATAAATTCACATTACATAATTCTTATTGGCCAGTGTTCAGAAAATATTAA
TCTTCTACAATATGACTACTTTAAAAGAAAGCTTCAAGATTTAATAGTTGCAATTTTAAGTGTAGCCCTA
TATAAATAACTGCACTTGCTAAGTGGATTTGTATCAACAGGAACATAACTTCTAGAAAATTACTCAAGAC
TACCCTCCCTTTTGCCTGTGATAGACATTTGGGACCCTCCCCAAACCAAATAAGGGAAAGAAGAATGTTC
TGAGCATTAAGAGCACTAAGAATAAATCTGAGCTCTCACGGATAAGATTACTTTCAACTCTTTATTTCAT
GTTTTCTGACATAGACCCCAGGATCTGTAATTATCTTAGAGAAACTGCGGGGGCTTAGATGGTACTTTGT
AGTTCATTTGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGCCTTTCTCTCTTTGGGGCTGAAGAGCTGGTG
TGTCTGTGTGTGTGTTCCTCTAGAGTGCCAAAAAAGAAAAAAAAAAGTGCTGAAGAGTCCTAGGGAGATG
AGGCTATTTTTGTTTGAAGCTGATACTTCTAGCTGAGCCACAAGTGCTGCTTGGAAAGGGCTTAGGTTGT
TTCCAGGGGGAGAACTCTGCAGAGGAGAGGCAAAGTTCAACAGGACAACAAAGAAGCAGCAGAAACAGCC
AGGAAAACGAAGAGCCCCCAGGTTTTGACACAGAACCCTCCACCAGAGTTC
TRDN 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TRDN_1 ↗6:123,636,950負股123,636,940–123,636,999

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_53446JR · CTCF_binding_site · 123635753–123635774 · regulatory

ENSR6_85M5Z7 · promoter · 123636899–123637152 · regulatory

· motif · 123635755–123635771 · motif

· motif · 123636477–123636489 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:729 aa

1 aa729 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q13061 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Triadin 長 729 個胺基酸。第 1–47 位為細胞質區段,第 48–68 位是螺旋型跨膜區,第 69–729 位位於腔內。序列註解指出,第 1–28、117–265、281–682 與 705–729 位區段屬於無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–47 aa
跨膜區Helical48–68 aa
拓樸區域Lumenal69–729 aa
功能區域Disordered1–28 aa
功能區域Disordered117–265 aa
功能區域Disordered281–682 aa
功能區域Disordered705–729 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q13061…

AlphaFold · Q13061

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Sarcoplasmic reticulum membrane

Triadin 是單次跨膜第二型膜蛋白,定位於細胞膜與肌漿網膜。 來源未描述其定位隨條件或異構型而改變的情形。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Sarcoplasmic reticulum membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TRISKTRDNKCNE4PPIBPTPRN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

Triadin 可形成亞基數目不定、以雙硫鍵連結的同源寡聚體;此組裝方式註記為相似性推論(By similarity)。在骨骼肌中,Triadin 與 CASQ1 及 RYR1 互作,也與 CASQ2 互作。來源未將這些關係描述為特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TRDN 變異與常染色體隱性心律不整症候群相關,患者可伴有或不伴有骨骼肌無力。此病通常在嬰兒期或幼兒期出現,心律不整可由身體活動或情緒壓力誘發,並可能反覆昏厥或心搏停止;幼年猝死亦可能發生。部分患者有肌肉無力。來源將疾病歸因於影響 TRDN 的變異。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Triadin 參與調節經由肌漿網 RYR1 與 RYR2 鈣離子釋放通道進行的腔內 Ca2+ 釋放,這是觸發骨骼肌與心肌收縮的重要步驟。其對三聯體接合區正常組織的必要性屬相似性推論;此外,Triadin 對正常骨骼肌力量、心臟興奮-收縮耦聯及心跳速率調節也有作用。含實驗來源
證據與來源

Contributes to the regulation of lumenal Ca2+ release via the sarcoplasmic reticulum calcium release channels RYR1 and RYR2, a key step in triggering skeletal and heart muscle contraction. Required for normal organization of the triad junction, where T-tubules and the sarcoplasmic reticulum terminal cisternae are in close contact (By similarity). Required for normal skeletal muscle strength. Plays a role in excitation-contraction coupling in the heart and in regulating the rate of heart beats

PMID 22422768 ↗

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交互作用Triadin 可形成亞基數目不定、由雙硫鍵連結的同源寡聚體,此組裝方式屬相似性推論。在骨骼肌中,Triadin 與 CASQ1 和 RYR1 互作;來源亦指出它與 CASQ2 互作。含實驗來源
證據與來源

Homooligomer of variable subunit number; disulfide-linked (By similarity). Interacts with CASQ1 and RYR1 in skeletal muscle. Interacts with CASQ2

PMID 15485681 ↗ · PMID 24325401 ↗

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細胞定位Triadin 定位於細胞膜及肌漿網膜,是單次跨膜第二型膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane; Sarcoplasmic reticulum membrane / Single-pass type II membrane protein

PMID 22422768 ↗ · PMID 24325401 ↗

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疾病關聯影響 TRDN 的變異與常染色體隱性心律不整症候群相關,患者可有或沒有骨骼肌無力。疾病常於嬰兒期或幼兒期發生,可能在運動或情緒壓力後誘發心律不整,造成反覆昏厥或心搏停止,幼年猝死亦可能發生;部分患者出現肌肉無力。含實驗來源
證據與來源

Cardiac arrhythmia syndrome, with or without skeletal muscle weakness CARDAR An autosomal recessive cardiac disorder characterized by stress-induced arrhythmias in infancy or early childhood. Patients present with recurrent syncope or cardiac arrest after physical activity or emotional stress. Sudden death may occur in early childhood. Some patients have muscle weakness. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615441

PMID 22422768 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000334268 · 4,627 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGGAGAGGCAAAGTTCAACAGGACAACAAAGAAGCAGC40
41AGAAACAGCCAGGAAAACGAAGAGCCCCCAGGTTTTGACA80
81CAGAACCCTCCACCAGAGTTCTCAAATCCCCAAATACTCT120
121GCAAAGTGCAACTTGACGGGAACTTTTCAACTGACTTTTA160
161CTTTTGACGACCACCATGACTGAGATCACTGCTGAAGGAA200
201ATGCATCTACAACCACAACTGTGATAGACAGCAAAAATGG240
241ATCTGTGCCCAAATCCCCCGGAAAAGTGCTGAAGAGGACA280
281GTCACAGAAGACATAGTGACGACGTTCAGCTCCCCTGCAG320
321CCTGGCTTCTGGTCATTGCCCTGATAATCACGTGGTCAGC360
361TGTTGCCATCGTTATGTTTGATTTAGTGGATTACAAAAAC400
401TTTTCAGCAAGCTCTATTGCCAAGATTGGCTCAGATCCTT440
441TAAAACTGGTACGTGATGCTATGGAGGAAACCACGGACTG480
481GATCTATGGCTTCTTTTCTTTGTTATCTGACATCATCTCA520
521TCTGAAGATGAAGAAGATGATGATGGTGACGAAGATACTG560
561ATAAAGGAGAAATAGATGAGCCTCCCTTGAGAAAAAAAGA600
601AATACACAAAGATAAGACTGAAAAACAAGAGAAACCTGAA640
641AGGAAAATACAAACTAAAGTTACACACAAAGAAAAAGAAA680
681AAGGAAAAGAAAAAGTAAGAGAAAAAGAAAAACCTGAAAA720
721GAAAGCAACTCACAAGGAAAAAATTGAGAAAAAAGAAAAA760
761CCAGAAACAAAGACACTGGCGAAAGAACAGAAGAAAGCTA800
801AGACTGCAGAAAAGAGTGAAGAAAAGACTAAAAAGGAAGT840
841GAAAGGTGGAAAACAGGAGAAAGTGAAGCAAACAGCTGCA880
881AAAGTAAAAGAAGTACAGAAAACACCATCAAAACCCAAAG920
921AAAAGGAGGACAAAGAGAAAGCAGCTGTGTCAAAGCATGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。