基因總覽
TRBV7-9 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 7-9,屬於 T cell receptor gene。現有資料將它列為人類第 7 號染色體上的基因位點,位於 7q34。來源未提供其產物的序列、長度或結構細節,因此無法據此說明蛋白質的結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000612787 ★ | 142,529,290–142,529,762 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有功能註釋以預測為基礎,指出 TRBV7-9 可能具有與 MHC 蛋白結合及與胜肽抗原結合的能力。這些是推測性的功能描述,並非來源所述的已驗證結果;資料也沒有提供結合對象、作用條件或實驗證據細節。
來源另預測 TRBV7-9 可能參與細胞表面受體訊號傳遞,並可能是 T cell receptor complex 的一部分。這表示它的功能註釋涉及受體複合體與訊號傳遞,但資料未進一步說明它在複合體中的位置、如何影響訊號,或其作用是否取決於特定細胞或刺激。
在細胞位置方面,來源預測其可能在 plasma membrane 發揮作用。此定位同樣屬推論,並未提供定位驗證或動態變化的資訊。綜合而言,資料將 TRBV7-9 與 MHC 蛋白及胜肽抗原結合、T cell receptor complex,以及細胞表面受體訊號傳遞相連結;目前可支持的描述限於這些預測性註釋,不宜延伸為已確立的分子機制或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>TRBV7-9 ENST00000612787 GRCh38 chr7:142528290-142529390 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATATGAAAGAGGGTGCCCATGAAGTTTTAAGAGTTAAGTTAGGAATGAAAATGAGAAATTAATTGCTCAT AATGCAGACTGTTAGGAACCCCAAGGATTAATTCAACTCCCTATTTTTTAATTGTACTACTCCCATCACA ATGTCAAGGGTAAAACAGTTCTGACTTTTTCTAAAGGCTATGGAACATTTATTGATTTCAGAGGTGACTT AGAAACACAGGAGGTGTCGTGATAAGTAGTAGAGACAAAAAAGAAAAAGTATTGAGATTAATGAATTCAT ATGGGGAATTGTTTAACTGTTCTTTTTTTAACCTTTAGAATGAGTTGAAGATCCCAACTTAGCTTGGTGC CTGCTGGAGGCAACGTTTCTTCCCTTGCCCCTCTGAGCTGTGAATTGAAACTCTTTCGGGAAAAAGACGC GGCAATTCTCTCCACTTCCCAAACACCTCCCACTCCTACCCAGACCGTGGATGGGCAGGAAATGCAGGAA CAGAGCCAGAAACAGGAGATCTCCAAGGAAGGTTGACAGTCAGCACTGGGATCGTCTGTGTAAAGTGCTG CTGAAGCAGCCAGGTGGCATGTCCAGCCGACAATGCGAAAGGAAAAAGTGAGAAGACTTCCCGAAGGCGG AGGGTGGAATGCGGGCAGCAGCCCCCTGGAGGGCTGAGTGGGGAAAACAAAATGGACCTCACAGAAGCTG TGTGTGTGGAAACCCACTTCTGACTTATCACTTGTCATGAATTCTATGCTTCATGGTGTTACACCGTTTA TTGTTTCTGATGAGTGACAGTAATTATTTTCTTTCTTGCTGGTACATAATAAAGTGGTGCACATCAGAGT TGCTGCCATCTTAGACTTAACTCATCAGTATCAGGTGATCCTGAGGCTCAGTGATGTCACTGTGGGAACT GCTCTGTGGCGACAAGGACGTCCCTCATCCTCTGCTCCTGCTCACAGTGACCCTGATCTGGTAAAGCTCC CATCCTGCCCTGACCCTGCCATGGGCACCAGCCTCCTCTGCTGGATGGCCCTGTGTCTCCTGGGGGCAGG TGAGTCCTCAGAACACCAAGCAATCTCATTGTGTCTGTGTATGTCTGTGTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_538J64S · CTCF_binding_site · 142528852–142528873 · regulatory
· motif · 142528854–142528870 · motif
· motif · 142533510–142533524 · motif
· motif · 142533510–142533524 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV7-9 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000612787 ★ | TR_V_gene | 347 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV7-9 的功能註釋預測其可能具有與 MHC 蛋白及胜肽抗原結合的能力,並可能參與細胞表面受體訊號傳遞、成為 T cell receptor complex 的一部分,以及在 plasma membrane 發揮作用。這些均為預測性描述,來源未提供實驗驗證或更具體的作用條件。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable MHC protein binding activity and peptide antigen binding activity. Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATGGGCACCAGCCTCCTCTGCTGGATGGCCCTGTGTCTCC40TGGGGGCAGATCACGCAGATACTGGAGTCTCCCAGAACCC80CAGACACAAGATCACAAAGAGGGGACAGAATGTAACTTTC120AGGTGTGATCCAATTTCTGAACACAACCGCCTTTATTGGT160ACCGACAGACCCTGGGGCAGGGCCCAGAGTTTCTGACTTA200CTTCCAGAATGAAGCTCAACTAGAAAAATCAAGGCTGCTC240AGTGATCGGTTCTCTGCAGAGAGGCCTAAGGGATCTTTCT280CCACCTTGGAGATCCAGCGCACAGAGCAGGGGGACTCGGC320CATGTATCTCTGTGCCAGCAGCTTAGC347cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。