基因總覽
TRBV7-2 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 7-2,屬於 T cell receptor gene。現有資料將它歸類為 T cell receptor 的 beta variable 基因;不過,來源未提供其 RNA 或蛋白質產物的結構細節,也未說明其家族特徵或具體組成。因此,這些資料支持的基本認識主要是其基因類別與名稱所指的可變區身分,不能據此補述其他分子特性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000634605 ★ | 142,352,819–142,353,358 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料對 TRBV7-2 的生物學功能描述屬預測性質:它預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞途徑,並可能是 T cell receptor complex 的一部分。這些註記指出可能的功能關聯,但未提供直接驗證或實驗細節,因此不宜視為已確立的作用機制。
來源也預測 TRBV7-2 可能在 plasma membrane 活性。這項定位描述與細胞表面受體訊號傳遞的預測相符,但資料沒有進一步說明其在膜上的具體位置、作用方式,或定位與訊號傳遞之間的因果關係。
現有摘要未交代此基因產物如何參與受體訊號、在 T cell receptor complex 中的具體角色,亦未提供相關生物學條件或實驗系統。故目前可整理的功能資訊限於上述三項預測:可能參與細胞表面受體訊號傳遞、可能屬於 T cell receptor complex,並可能在 plasma membrane 活性。
Promoter 與基因調控
>TRBV7-2 ENST00000634605 GRCh38 chr7:142351819-142352919 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGCAGCACAGAAAATTAAATGTAAAATATAAAAAAAGTGAAGGAACAAGGAAAAAATGAAGTTTCTAGAA TATTAGAAAGCATATAATGTTTTATTGAAACTTTTCTTACTTTCTTGTATATAACTGACGTTTCAGAAAG AGAAAATAAGGCAAATGATCTGAGGTGATTGTGTATGTGATGCTAGCTGAGAATGTTCCTGAGATGTTTG AGGACCGAAATCCTCGTTCAAGAATTCAGATGAATTGCAAGACAAGTAGGCAGGTCCCTGTGAAACTGCA GACCACAAATGACAAAGAAAAGATTTTAACAGCAGTCAAAAGGGAAAGATAAATATCCTCCAGGGGAATA GAAAGAAAGAAATAGTCAAAGTCAAGAAAGAGGATTAAAAATAACTGTTAAATCAGAATTGAGATTGATA AAAAATACCTACAGGACAGGACAAGAAAATATGGAAAACCAAAATAATTCTGTGAGTTTGCCACCAAAGT ATCTTTTCAGAGTTATAGTTAACAAGGGTGGGAAATGATCCCAGAAGAAATGTATGAGGGCAGTTTGTGA GGGAACCCATGTGATGGGACAATCCCGTTGGGCACATGTGAGTGGGGGAATGGAGGAGGCTGGGGCATGA ATGGGGATGGCAGAGGGGACCCTGACTTGGAGGAAAGACAATGAGCTCATCCCATGGTGCCTGGTGTTGG GGGCACTGTTGGCACATCCTACAGAACGTGCTCAGCAGACAGAGGAGCGGCTGTGGGATGAGAAGGTGAA CTCGGAGATGCAGCGTGAGGCCTCCAAGTCCAGACAGCATGGGAGCCCAAAGCGATGTCCCATGCAATAA CGTTGTTTACAAGGAGCTTATAAATATTTAAAGTAGTCACCCAAGTGTGGTCTAATATAAATCCTGTGTT CCTGAGGTCATGCAGATTGAGAGAGGAAGTGATGTCACTGTGGGAACTTCCGTGTAAGGACGGGGCGTCC CTCCTCCTCTGCTCCTGCTCACAGTGATCCTGATCTGGTAAAGCTCCCATCCTGCCCTGACCCTGCCATG GGCACCAGGCTCCTCTTCTGGGTGGCCTTCTGTCTCCTGGGGGCAGGTGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_B338QK · enhancer · 142349394–142350028 · regulatory
ENSR7_944HK2 · enhancer · 142352627–142352883 · regulatory
ENSR7_7BD28S · enhancer · 142353286–142353406 · regulatory
ENSR7_944HKS · enhancer · 142355341–142355672 · regulatory
ENSR7_B338RR · enhancer · 142357799–142358614 · regulatory
基因座與轉錄註解
TRBV7-2 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000634605 ★ | TR_V_gene | 394 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV7-2 預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞途徑,可能是 T cell receptor complex 的一部分,並可能在 plasma membrane 活性;這些描述均為預測。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ACAGTGATCCTGATCTGGTAAAGCTCCCATCCTGCCCTGA40CCCTGCCATGGGCACCAGGCTCCTCTTCTGGGTGGCCTTC80TGTCTCCTGGGGGCAGATCACACAGGAGCTGGAGTCTCCC120AGTCCCCCAGTAACAAGGTCACAGAGAAGGGAAAGGATGT160AGAGCTCAGGTGTGATCCAATTTCAGGTCATACTGCCCTT200TACTGGTACCGACAGAGCCTGGGGCAGGGCCTGGAGTTTT240TAATTTACTTCCAAGGCAACAGTGCACCAGACAAATCAGG280GCTGCCCAGTGATCGCTTCTCTGCAGAGAGGACTGGGGGA320TCCGTCTCCACTCTGACGATCCAGCGCACACAGCAGGAGG360ACTCGGCCGTGTATCTCTGTGCCAGCAGCTTAGC394cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。