基因總覽
TRBV6-8 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 6-8,屬於 T cell receptor gene。現有資料將它列為 T 細胞受體相關基因,但未提供其 RNA 或蛋白質產物的詳細性質,也未說明序列、結構特徵或不同形式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390376 ★ | 142,507,382–142,507,810 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料預測,TRBV6-8 可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,並可能是 T cell receptor complex 的一部分;其預測活性位置為質膜。這些描述呈現的是預測性註釋,不能視為已確認的作用或定位,也未提供足以進一步說明其分子作用方式、生物學過程或功能結果的資訊。
Promoter 與基因調控
>TRBV6-8 ENST00000390376 GRCh38 chr7:142506382-142507482 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGAGGGTGTTGGCTGGGTCAAGGAGAAGATGATGAGCTCAGAAAATAGACAAGGAGAAACCCCAGTGGAA AGCTTGTAAAACTCTGGATGAATCACAAGATATGTTATTAGAGCTCCTTTTTATTACTAAATTTTATTTA TTACTAAATTAATGGCAGGAACCCTGCACAAAGGGATATTCCCTATGAAAGATGGCATCTCAAATAAAAA CAGAGCATTCTTCCTTACCCTAAAGTCTGCCCTTTCTCCCCAAGTCCCTCATGCATCAGGCCACCTTTGT GCCCACAGATCATGGGCAGCGCTGGGTGGCCATCATCATCCACACAGAGAGGGCAGTCAGCAGCATGAGC TGGTTCTGCCTGATATGGTCTCACCCTAGGCATGGAAAGCAAGAGACCTGCGTTGAGCTGAAGGTGCTCA GCTGGGTTTGTCAGGAGTCCCATCTGTCAGTGAATTGACAAGAAACAGAGCAAAACGACTCCTGCAATGT TGAGAAGCCTGCACCTAGGATCTGGAAACTTGATAACAGAGAAAACCAATATAGACAAAGGATTTTAAAC AGGATTATGGTCAATTAAGCAAATTAGAAAAGGATACTTGAAGGAGTATTTGGGATACAGGAATCAAAAA CACCAGGAAGACATGAGAAGTTTCCCTAAGAGTCTAGACTACAGCACTGTGTAGATAACTAACATCAGAA TATTAATTATATTATTGAAGAATTAAAATTTACATTGAATTACAAACTCTTTACAAAAGGTCATGAAAAT CTTGTAGACTTGTTTCAATTCAGACAAATGTGTTCTTCTCATTCTCAGCTGTTCACTGGTGCATTTATCT TGAATTTGACCATCTGGGGAATGGGCGTGGCCTCTCCTGACTGGAAGGCTCTGGGGCCCAGGCAGGGAGA ATGATGTCTCAGAATGACTCCCTTGAGAGTCCTGTTCCCCTTTTATCAATGCACAGACCCAGAAGACCCC TCCGTCCTGCAGCCCCTGCCATGAGCCTCGGGCTCCTGTGCTGTGCGGCCTTTTCTCTCCTGTGGGCAGG TGGGTCCTGGGCAGGGCCCTTGCGTGGATTTCAAGGCCCATCCCCTTTCCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_8675CN · enhancer · 142504039–142504226 · regulatory
ENSR7_538HZTC · CTCF_binding_site · 142504124–142504145 · regulatory
ENSR7_944K84 · enhancer · 142508221–142508710 · regulatory
· motif · 142504126–142504142 · motif
· motif · 142507323–142507336 · motif
· motif · 142507923–142507937 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV6-8 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390376 ★ | TR_V_gene | 341 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV6-8 預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,並預測可能是 T cell receptor complex 的一部分;其預測活性位置為質膜。這些內容屬於預測性註釋。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATGAGCCTCGGGCTCCTGTGCTGTGCGGCCTTTTCTCTCC40TGTGGGCAGGTCCCGTGAATGCTGGTGTCACTCAGACCCC80AAAATTCCACATCCTGAAGACAGGACAGAGCATGACACTG120CAGTGTGCCCAGGATATGAACCATGGATACATGTCCTGGT160ATCGACAAGACCCAGGCATGGGGCTGAGACTGATTTACTA200CTCAGCTGCTGCTGGTACTACTGACAAAGAAGTCCCCAAT240GGCTACAATGTCTCTAGATTAAACACAGAGGATTTCCCAC280TCAGGCTGGTGTCGGCTGCTCCCTCCCAGACATCTGTGTA320CTTGTGTGCCAGCAGTTACTC341cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。