基因總覽
TRBV6-5 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 6-5,屬於 T 細胞受體基因。現有資料將它定位為 T 細胞受體 β 可變區基因之一;這項身分資訊說明其所屬基因類別與受體鏈別,但未提供產物的長度、結構細節或異構型資訊。資料庫摘要另將其產物與 T 細胞受體複合體及細胞表面受體訊號路徑相連結,不過這些功能性描述標示為預測,應視為推論,而非已確立的實驗結論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390368 ★ | 142,450,947–142,451,448 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料預測,TRBV6-5 可能參與細胞表面受體訊號路徑,並可能是 T 細胞受體複合體的一部分;同時,資料預測其活性位置在質膜。這些敘述均屬預測性註釋,來源未提供支持它們的實驗條件或結果,因此不能據此視為已證實的作用或定位。
依照這項預測,TRBV6-5 與受體訊號及 T 細胞受體複合體之間具有可能的功能關聯。不過,來源沒有進一步說明它如何影響訊號傳遞、是否直接參與複合體組成,或在何種細胞與條件下發揮作用;也未提供可據以描述具體分子機制的資料。因此,功能說明應限於來源所列的預測,不延伸推定其下游效應或生物學後果。
Promoter 與基因調控
>TRBV6-5 ENST00000390368 GRCh38 chr7:142449947-142451047 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAGGAAAACAGCACATGGGGAGGTGAGCAGAATATGAAACACAATTATGGACTCAGAACCAGCCATACAA CTTATTAGCATCCCGTTGGTTCAAAAAATCATAAGAATTTGAAGAACATGACAATGTTATACTGACTGTG GCGTCCTAATAAGTGTGGGACTCTGTGCACCAAGATATGTTATTTGAATTCCTTTTTATTGATTACTAAA TTAATGGCAGGAATCCCACACAAAGGGATACTCCCTATGAAACATGACAACTCAAATTAAAAAAGAGCAC TCTTCCTTACTCTAAAGTCTGCCCTCTCTCCCCGAGTCCCTCACGCATAAGGCCACATTTGTGCCCCTAG GTCATGGGCAGCGCTGGTTGGCCACCATCGTCCACATGTAGAAGGCAGTCAGCAACGTGAAGTGGTTCTG CCTACTGCGGTCTCACCCCAGACATGGAAAGCAAGAGCCCTGGGTGGAGCTGAAGGTGCTCAGCTGGGTT TGTCAGAAGTCTCATCTGTCAGTGAGTTGACAAGAAACAGAGCAAAACGACTCCTCCAATGTTGACGAGC CTGCCCCTGGGATTTGGAAACTTCATAACAGAAAAAACCAATATAGACAAAGGATTTTAAACAGGATTAA GGTCAATTAAGCAAATTAGAAAAGGACACTTGAAGGAGTATTTGGGACAGGGGAATCAAAAGCACCAGGA AGACATGAGGAGTTTCCCTAAGACTCTAGACTACAGCACTAGCACTATGTAGATAACTAACACTAAAATA TTAATTATATCATTGAAAAAATAAAATTTACAGTGAATTACAAACTGTTTCCAAAAGGTCATGAAAATCT TGTAGACTTGTTTCAATTCAGACAGATGTGTTCTTCTCATTCTCAGCTGTTCACTGGTGCATTTATTTTG GATTTGACCATCTGGGGAATGGGTGTGGCCTCTCCTGGCCTCTCCCTCCCTGGGGCCCAGGCAGGGAGAA TGTCTCAGAATGACTTCCTTGAGAGTCCTGCTCCCCTTTCATCAATGCACAGATACAGAAGACCCCTCCG TCATGCAGCATCTGCCATGAGCATCGGCCTCCTGTGCTGTGCAGCCTTGTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_8674BB · enhancer · 142455024–142455196 · regulatory
ENSR7_8674BK · enhancer · 142455517–142455674 · regulatory
基因座與轉錄註解
TRBV6-5 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390368 ★ | TR_V_gene | 410 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 資料預測 TRBV6-5 可能參與細胞表面受體訊號路徑、可能是 T 細胞受體複合體的一部分,並可能在質膜上具有活性。這些內容屬預測性描述,來源未提供實驗條件或結果加以驗證。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
GAGAGTCCTGCTCCCCTTTCATCAATGCACAGATACAGAA40GACCCCTCCGTCATGCAGCATCTGCCATGAGCATCGGCCT80CCTGTGCTGTGCAGCCTTGTCTCTCCTGTGGGCAGGTCCA120GTGAATGCTGGTGTCACTCAGACCCCAAAATTCCAGGTCC160TGAAGACAGGACAGAGCATGACACTGCAGTGTGCCCAGGA200TATGAACCATGAATACATGTCCTGGTATCGACAAGACCCA240GGCATGGGGCTGAGGCTGATTCATTACTCAGTTGGTGCTG280GTATCACTGACCAAGGAGAAGTCCCCAATGGCTACAATGT320CTCCAGATCAACCACAGAGGATTTCCCGCTCAGGCTGCTG360TCGGCTGCTCCCTCCCAGACATCTGTGTACTTCTGTGCCA400GCAGTTACTC410cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。