基因總覽
TRBV5-7 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 5-7 (non-functional),屬於人類 T cell receptor gene。名稱中的「non-functional」指出此基因被歸類為非功能性;現有資料未提供其蛋白質或 RNA 產物的詳細性質、序列或結構資訊,因此不能據此描述其產物特徵。資料亦未提供可進一步說明其家族結構或個體差異的內容。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390378 ★ | 142,520,090–142,520,556 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前可用的功能註解屬預測,而非已確立的實驗結論。資料預測 TRBV5-7 可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,並可能是 T cell receptor complex 的一部分;同時預測其活性位置在 plasma membrane。這些描述呈現的是可能的功能關聯與位置,不能視為已證實的分子作用或細胞定位。
註解未說明 TRBV5-7 如何參與受體訊號,也沒有提供訊號傳遞的方向、作用步驟、實驗系統或相關讀出。因此,無法進一步判定它在 T cell receptor complex 中的具體角色,或其與細胞表面訊號之間的因果關係。
Promoter 與基因調控
>TRBV5-7 ENST00000390378 GRCh38 chr7:142519090-142520190 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGTGTCCTGTTCTAGGACTTTATGGAATATAAAATTATGAGCCATTAGCTAGGATATCTGCTGAAAGAAA TATCTAAGCTGCAAAGCATTCAGGCCACTGTGTGACTACTTTTAGGCACCAGGCAATTTAACCCAGCAAG AAGGCAGCCAAGGGAATAGATTTTGCAAACCAGCACAGATGGTGACACTACCTCCCTCTGCTGTCCTGTC TCCCATAAGCCAAACTCACTCTGAAGTTAGAGAAAAGAGGAGACAGTTAACATGATACACTGGAGTCAGC CTGTGAAGGCAGGGTGGATCTGGAGGGATTAACATAAACTTTCCAGAGCACTACATATAGGATGGCCTTG AGGGTGTTGAGTCCAAAGCTGGCTAGGTCTGTGGTGTGAGCTGATAAGGCCCTAGATTTATTTCTGGGGA ATCTGCACTCTTAATAATTTACAGACAACACAGGTCTGCTTTGGATCTGATCAGATGGACTAAATCTTGG GGCCTCTGTACCGCTGGCCACTCAGGAAATGGGTTGGGAATGTTGCCTGGGACAGGAAAATATAGTAAGA AACCTTGGTGTGAATCTAGCTTCAGAAAGATGATGTGAGGAGAGCAAGGAAGAGCTGGAAACTGATGGTT TAATCACAGGCTCCTCACCATCTGCTGATAGGCAGGTGTGCGAGCTCCAGCATGGAGCACCGCAGCACTA GGTCAGAGGAGGGTGATAGGGTGATGGGGCAGCCTGTGAGCTGGGGCAGTTAGGCAGAGGAGCAACTGTA TCACCACAGAAGCTTCTGCCTTCACCCATCCCTCCAGCTCGGCAGGACAGGTAGAGAGTCCAGTGTCCGT GGAGCACTAGACCTAAGGAAGGCTGCATAGGGAAGACACAAGACAGTGACATCACAGCATACCCCTCCCA TCAGGAAAATCAAGGCCCAGAACTCACTCAGCTCTTTCCCAGGAGGACCAAGCCCTGAATCAGGTGCAGT GCTGCCTGCCCCACTGTGCCATGGGCCCCGGGCTCCTCTGCTGGGTGCTGCTTTGTCCCCTAGGAGAAGG TGAGTCCCGGGCACAGGACAGCTGCTCCATTCTCAGCTTTCCCACCCCTGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_538J3QC · CTCF_binding_site · 142515141–142515162 · regulatory
ENSR7_B339MN · enhancer · 142515920–142516604 · regulatory
ENSR7_538J3X2 · CTCF_binding_site · 142516149–142516170 · regulatory
ENSR7_8675MZ · enhancer · 142518370–142518604 · regulatory
ENSR7_538J4GH · CTCF_binding_site · 142519277–142519298 · regulatory
ENSR7_8675PG · enhancer · 142520963–142521176 · regulatory
ENSR7_538J4QR · CTCF_binding_site · 142521064–142521085 · regulatory
ENSR7_538J4TL · CTCF_binding_site · 142521675–142521696 · regulatory
ENSR7_944KDL · enhancer · 142523964–142524282 · regulatory
ENSR7_538J5B7 · CTCF_binding_site · 142524181–142524202 · regulatory
· motif · 142515143–142515159 · motif
· motif · 142516151–142516167 · motif
· motif · 142518261–142518270 · motif
· motif · 142519279–142519295 · motif
· motif · 142521066–142521082 · motif
· motif · 142521677–142521693 · motif
· motif · 142524183–142524199 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV5-7 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390378 ★ | TR_V_gene | 343 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV5-7 的功能註解屬預測性質,指出它可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,也可能是 T cell receptor complex 的一部分;資料並預測其活性位置在 plasma membrane。這些內容未提供已驗證的實驗結果或具體作用機制。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATGGGCCCCGGGCTCCTCTGCTGGGTGCTGCTTTGTCCCC40TAGGAGAAGGCCCAGTGGACGCTGGAGTCACCCAAAGTCC80CACACACCTGATCAAAACGAGAGGACAGCACGTGACTCTG120AGATGCTCTCCTATCTCTGGGCACACCAGTGTGTCCTCGT160ACCAACAGGCCCTGGGTCAGGGGCCCCAGTTTATCTTTCA200GTATTATGAGAAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAAACTTCCCT240GATCAATTCTCAGGTCACCAGTTCCCTAACTATAGCTCTG280AGCTGAATGTGAACGCCTTGTTGCTAGGGGACTCGGCCCT320CTATCTCTGTGCCAGCAGCTTGG343cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。