基因總覽
TRBV5-4 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 5-4,屬於 T cell receptor gene。現有資料未提供其產物的分子性質、家族結構或序列特徵,因此不據此推定其是否形成蛋白質或描述其結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000454561 ★ | 142,462,916–142,463,581 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料將 TRBV5-4 的功能描述為預測性資訊:它可能參與細胞表面受體訊號傳遞。這表示其可能與受體在細胞表面傳遞訊號的過程有關,但資料未說明涉及哪些訊號分子、作用步驟或具體生物學結果,因此不能進一步推定其分子機制或功能效應。
來源也預測 TRBV5-4 可能是 T 細胞受體複合體的一部分,並可能位於質膜。這些描述提供其可能的複合體關聯與細胞位置,但並未列出複合體組成、直接結合對象,或支持定位判斷的實驗細節。上述功能與位置均屬預測,應視為尚待驗證的可能性,而非已確立的作用。
Promoter 與基因調控
>TRBV5-4 ENST00000454561 GRCh38 chr7:142461916-142463016 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGGACTTCCCAGTCTCCACATCTATAAGCCAAATAAACCTCTTGTCTTTATACATTGCCCAGTCCGTGG TATTTCTCTATAGCAGTAGGAAAGAAATTGAAAGAAAATATGGCACCATGAGGCTGTTGTTATAATACCT GAAAATGTAGAAGCAGCTTTGGTTAATGGGAAGTGGCTAATGGATAGAGGTTGAAAGAATTGGGAGGAGC AGACTAGCAAAAGCCTAGACTCCTGAAAACAGAGCATTAAGGGCAATTCTGGTGCAGTGTCAGGGGGAAA TGAGGGACAAGCTATCGGAAATTGAAGCAAATACCATCCTTGTTATAAATAGCAAAAACCTTGGCAAAAT TGTGTCCTGTTCTAGGACTTTATGGAATATAAAATTATGAGCCATTCACTAGGATATCAACTGAAAGAAA TATCTAAGCGGCAAAGCATTCAGGCTACTGTGTGACTACTTTCGGGCACCAGGAAATTTCACCCAGCAAG AAGGGAGCCATGGGAATAGATTTTGCAAACCAGCACAGATGGTAACCCTACCTCCCTCTGCTGTCCTGTC TCCCATAAGCCAAACCCTGTGCTGTGAGCTCTTAAAATCCTAGAATTATTTCTGGGGAATCTATACTCTT AATAATTTATAGACAACCCAGGTCTGCTTTGGATCTGATCAGACGGACTAAATCTTGGGGACTCTGCACC ACTGGCCACTGAAGAAAGGGGCTGGGAATGTTGATGGGACAGGAAAATATAATAAGAAACATTGGTGTGA ATCTAGTATCAGAAAGATGATGTGAGGACAACAAGGAAGAGCTGGAATGTGAGGGTTTAATCACAGGCTC CTCACCCTCCGCTGATGGGTAGGTGTGTTAGCTCCAGCATGGAGCACCACCGCACTAGGTGGGGGAAGGG TGAGAGGGCAATGGGGCAGCCTGTGAGCTGGGGCAACGTAGGCAGAGAAGGAACTGTGTCACCACAGAAA CTTCTGCCTTCACCCATCCCTTCAGCTCTGCAGGACAGGTAGAGACTCCAGGATCATCCACTGAGCACTG GACATAAGGAAGGCTGCATGGGGAGGACACAGGACAGTGACATCACAGGAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_538HP3Q · CTCF_binding_site · 142458637–142458658 · regulatory
ENSR7_B339CH · enhancer · 142459384–142460156 · regulatory
ENSR7_538HP8F · CTCF_binding_site · 142459645–142459666 · regulatory
ENSR7_538HP9B · CTCF_binding_site · 142459834–142459855 · regulatory
ENSR7_B339CQ · enhancer · 142461403–142461952 · regulatory
ENSR7_538HPPF · CTCF_binding_site · 142462453–142462474 · regulatory
ENSR7_944JQ5 · enhancer · 142463474–142463925 · regulatory
ENSR7_538HQ22 · CTCF_binding_site · 142464087–142464108 · regulatory
ENSR7_538HQ4R · CTCF_binding_site · 142464690–142464711 · regulatory
ENSR7_944JR7 · enhancer · 142467195–142467544 · regulatory
ENSR7_538HQKJ · CTCF_binding_site · 142467443–142467464 · regulatory
· motif · 142458639–142458655 · motif
· motif · 142459647–142459663 · motif
· motif · 142459836–142459852 · motif
· motif · 142462455–142462471 · motif
· motif · 142464089–142464105 · motif
· motif · 142464692–142464708 · motif
· motif · 142467445–142467461 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV5-4 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000454561 ★ | TR_V_gene | 544 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV5-4 預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞,可能是 T 細胞受體複合體的一部分,並可能位於質膜。這些敘述均為預測,來源未提供更具體的作用機制或實驗條件。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
TTCAGCTCTGCAGGACAGGTAGAGACTCCAGGATCATCCA40CTGAGCACTGGACATAAGGAAGGCTGCATGGGGAGGACAC80AGGACAGTGACATCACAGGATACCCCTCCTATTAGGAAAA120TCAAGGCCCAGAATTCACTCGGCTCTTCCCCAGGAGGACC160AAGCCCTGAATCAGGTGCAGTGCTGCCTGCCCCACTGTGC200CATGGGCCCTGGGCTCCTCTGCTGGGCGCTGCTTTGTCTC240CTGGGAGCAGGCTCAGTGGAGACTGGAGTCACCCAAAGTC280CCACACACCTGATCAAAACGAGAGGACAGCAAGTGACTCT320GAGATGCTCTTCTCAGTCTGGGCACAACACTGTGTCCTGG360TACCAACAGGCCCTGGGTCAGGGGCCCCAGTTTATCTTTC400AGTATTATAGGGAGGAAGAGAATGGCAGAGGAAACTTCCC440TCCTAGATTCTCAGGTCTCCAGTTCCCTAATTATAGCTCT480GAGCTGAATGTGAACGCCTTGGAGCTGGACGACTCGGCCC520TGTATCTCTGTGCCAGCAGCTTGG544cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。