基因總覽
TRBV30 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 30,屬於 T cell receptor gene。現有資料未提供其產物的序列、結構或其他基本性質。資料庫摘要將其與 T cell receptor complex、細胞表面受體訊號及 plasma membrane 相關聯,但這些描述均為預測,並非已確認的定位或功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000417977 ★ | 142,812,586–142,813,399 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前可用資料對 TRBV30 的功能描述有限,且均標示為預測。資料指出它可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,並可能是 T cell receptor complex 的一部分;此外,也預測其可能位於 plasma membrane。這些資訊提供了可能的受體相關角色與位置,但未說明其作用機制、條件或實驗驗證情形,因此不宜視為已確立的功能。
Promoter 與基因調控
>TRBV30 ENST00000417977 GRCh38 chr7:142813299-142814399 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCATCTGAAGGTCTTTTGTCCCATTTCAGCAGAATGACATTTTAGCAGCTACCTAGCAGAGTCCCATGCT TAGCTATTATGAATCCTTACTATTATGAATTCGTGGCTTGACTGTGTTTTTTGTGGCTCGTGATCCCTTC AGCCCCTACCTTCCACCCCATGCCATTGTAAATCTCCCAATCTTTGCTGCAGACATAGGGAGTCAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAACATATGTAAGAGTGCCTGCCTGCAGTGCACCAGGCAAAA TGCATCTTTCAACAATTTTTAGATATTGTCATCATTATTTTCACTTTATAGATAAGAAAATTGAGAATCA GGGTTTGCTTGAGAGTTCCCAAGCCAGCAAGAAGCAGAGCTGTGAAATGAACCCAAATCCATATGATTCC AAGTCTCTGTGATGTTTCCTATTACTCATATTGCATTTAGAGGATAAATTAGATCTAGTTGGCCCATTAG AGACACATGGAGCAGATTCCAACTTTGATCAGTTCAGGAGTTAATTATGCCTGTCCAGGTCTCAAAATCT GTCTGCCAGGGATGAAGATTATGCAGGCGATCCCTTTGGCTGTCATAGAAGCTTCCTGCCCTCAGAACTG AGCATTTCTGCTTTGATTACCCCAAAATACCTGAATCTCTTGAGCCCTATCCTTTCATCTCCCAGGTAAC ATGTCTAGCTCTAGTTTCCAATTTCAGATAAACTAAAATCTTTTTTCATCCTTCTATCAGTATCACAGTT TCTCTGAAGCTTTCCCAGGCTTCTGATGTCTCCCGGGGGAGCTGGAGAGTTACCTTTAGTTTACAGGTAA ATAATGAGTCATTAAATATATTTACATACCAGGATGTCAGCAGGAATGCAAAGAAGATAACAAGTGCAGA GTATAGCTGGTTCCCAGGGAGGCTGGGGGTGATTCACCACACTCTTAAAAGAAGACTAGCCTCATTTCCT CCCCAGCTCATGGGGTAGGATTCCTCTGCTCTGGCAGCAGATCTCCCAGAGGGAGCAGCCTGACCACATC ACTGGCCCAGAAGAGGAGGCGTCTGTCCCCCAGACTAGCTGAAGGAAAGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_B33C83 · promoter · 142808837–142809455 · regulatory
ENSR7_CJ6LK · enhancer · 142809456–142810525 · regulatory
ENSR7_B33C8C · enhancer · 142810993–142811682 · regulatory
ENSR7_538KXJK · CTCF_binding_site · 142811325–142811346 · regulatory
ENSR7_944NH2 · promoter · 142812066–142812566 · regulatory
ENSR7_B33C8L · promoter · 142812903–142813443 · regulatory
ENSR7_B33C8P · enhancer · 142813444–142814050 · regulatory
ENSR7_944NHM · enhancer · 142814442–142814729 · regulatory
· motif · 142808536–142808549 · motif
· motif · 142808536–142808549 · motif
· motif · 142808685–142808694 · motif
· motif · 142808816–142808829 · motif
· motif · 142808816–142808829 · motif
· motif · 142808884–142808892 · motif
· motif · 142808902–142808919 · motif
· motif · 142808947–142808956 · motif
· motif · 142808952–142808960 · motif
· motif · 142809008–142809021 · motif
· motif · 142809037–142809054 · motif
· motif · 142809050–142809059 · motif
· motif · 142809214–142809223 · motif
· motif · 142809237–142809250 · motif
· motif · 142809356–142809365 · motif
· motif · 142809361–142809372 · motif
· motif · 142809425–142809438 · motif
· motif · 142809861–142809874 · motif
· motif · 142809861–142809874 · motif
· motif · 142809913–142809926 · motif
· motif · 142809913–142809926 · motif
· motif · 142810186–142810199 · motif
· motif · 142811327–142811343 · motif
· motif · 142812508–142812521 · motif
· motif · 142812508–142812521 · motif
· motif · 142813588–142813601 · motif
· motif · 142813588–142813601 · motif
· motif · 142817713–142817726 · motif
· motif · 142817713–142817726 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV30 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000417977 ★ | TR_V_gene | 447 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV30 被預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,並可能是 T cell receptor complex 的一部分;其活性位置也被預測在 plasma membrane。這些均為預測性描述,來源未提供進一步的作用機制或驗證資訊。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
TTCCTCTGCTCTGGCAGCAGATCTCCCAGAGGGAGCAGCC40TGACCACATCACTGGCCCAGAAGAGGAGGCGTCTGTCCCC80CAGACTAGCTGAAGGAAAGGCTGGCTTGGATGATGCTCTG120CTCTCTCCTTGCCCTTCTCCTGGGCACTTTCTTTGGGGTC160AGATCTCAGACTATTCATCAATGGCCAGCGACCCTGGTGC200AGCCTGTGGGCAGCCCGCTCTCTCTGGAGTGCACTGTGGA240GGGAACATCAAACCCCAACCTATACTGGTACCGACAGGCT280GCAGGCAGGGGCCTCCAGCTGCTCTTCTACTCCGTTGGTA320TTGGCCAGATCAGCTCTGAGGTGCCCCAGAATCTCTCAGC360CTCCAGACCCCAGGACCGGCAGTTCATCCTGAGTTCTAAG400AAGCTCCTTCTCAGTGACTCTGGCTTCTATCTCTGTGCCT440GGAGTGT447cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。