基因總覽
TRBV3-1 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 3-1,屬於 T cell receptor gene。現有資料將其描述為預測可能位於 plasma membrane,並可能是 T cell receptor complex 的一部分;資料未提供其產物的分子結構或其他特性,因此不宜據此補充蛋白質或 RNA 的細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390387 ★ | 142,308,542–142,309,048 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRBV3-1 的功能註記屬於預測性描述:它可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑。這表示來源將其與細胞表面受體相關的訊號活動連結,但並未說明訊號如何傳遞、涉及哪些分子步驟,或此基因產物在其中扮演何種具體角色,因此不能將預測寫成已確認的作用機制。
資料也預測 TRBV3-1 可能是 T cell receptor complex 的一部分,並可能在 plasma membrane 發揮作用。這些註記指出可能的複合體關聯與作用位置,但未提供實驗系統、互作對象、條件或功能測量結果;因此,不能進一步推定它與特定分子直接結合,或將其定位與訊號功能之間的關係描述為已證實。
上述功能資訊由 Alliance of Genome Resources 提供,並標示為預測。依據現有內容,能支持的結論限於 TRBV3-1 可能涉及細胞表面受體訊號傳遞、可能屬於 T cell receptor complex,且可能在 plasma membrane 活躍;更細緻的生物學作用與其對細胞功能的影響,來源並未交代。
Promoter 與基因調控
>TRBV3-1 ENST00000390387 GRCh38 chr7:142307542-142308642 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGGGTGGTTGATGGCTGGCAGAGGAGAGGAGTACCATGGGCAAGAATAAAGGGGACTGTGGTCCTCAACA TTAGATAATTCACAAAACGCGAAGGCATTTTCTGTCGTCACATTGCCATCAGGTGGGTAGGGCCCAAGGA TGCCGCCAAGCATCCTCCCTACACAGGACAGCTCCCCACAACAAACAATCACCTGATCCAACATGGCAGT AGTGCTGAAATTGAGAAACCCCGCAATAAGCTTCGGTTGTAAACTTTGTACCAAGAAGGAGAATTCTCTG CAGACAACTCAAGGGGCAATACCGTCAACTACTTTTGTTTTCTCTGACTGCCGCGTTGTTGACCTTCATC GCCATTCTTTCCCAGCACATGGTGTCTGCATATTTTCCAGCAGCCTCCTGTTTCCTCATAAATCTGCCCC TTGGACAGATAAGAACATCACAGGGAGCAGGGCTGCAGTTCACTCCCAATAATAACGCCTCAGCAGGGTT TGCTCTGCAGTAGCATCACAGTCATGTGGAGTAGGTGGCTATGGCTGGTATTCAGGTGAAATCTCAGGCC AATCTCTCCTGAATCAAGGGGACCACTGATCATTAATGAGACCTTCAAGTGAGCAAAGATTCAAGAGAGC AAATTAATGTCCTGCGCTATTGTGAAGGGACGCAAAGGATCCAGAGAGGAAACCAGCTGACTCTGAGAGA AGGGCCTGAAAAGGAGAGGAAGGGAGGAGGTGGTCAGATCCCCGGGAAGGAGCAGGGAGGGAGGGGGCTG CTGGCCCAGGAATGACTGTCAGAGACACATCCTGGAGGTCACAATTCCACCCTCTCAATTATTCCCAGAA ATTCCAAAAACTCCTTTAAAGGAGCAAGTGCAGGGCATGAAAGGGAGGAGCCATGCTAGAGGAGACCCTG GGAATGGGGGAATGATTACAGGCTGTGACCTCACTGGCGCAGCACCTCTCAGCGGCAGTGGAAACCACAG CCTAGTCCTCTCACCACTGCAGACCAGAATCCTGCCCTGGGCCTTGCCTGGTCTGCCTCACTCTGCCATG GGCTGCAGGCTCCTCTGCTGTGTGGTCTTCTGCCTCCTCCAAGCAGGTGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_944H2W · enhancer · 142303651–142304104 · regulatory
ENSR7_538GPHP · CTCF_binding_site · 142303753–142303774 · regulatory
· motif · 142303755–142303771 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV3-1 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390387 ★ | TR_V_gene | 391 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV3-1 預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,可能是 T cell receptor complex 的一部分,並可能在 plasma membrane 活躍。這些內容是預測性註記,來源未提供具體作用機制或實驗條件。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
AGACCAGAATCCTGCCCTGGGCCTTGCCTGGTCTGCCTCA40CTCTGCCATGGGCTGCAGGCTCCTCTGCTGTGTGGTCTTC80TGCCTCCTCCAAGCAGGTCCCTTGGACACAGCTGTTTCCC120AGACTCCAAAATACCTGGTCACACAGATGGGAAACGACAA160GTCCATTAAATGTGAACAAAATCTGGGCCATGATACTATG200TATTGGTATAAACAGGACTCTAAGAAATTTCTGAAGATAA240TGTTTAGCTACAATAATAAGGAGCTCATTATAAATGAAAC280AGTTCCAAATCGCTTCTCACCTAAATCTCCAGACAAAGCT320CACTTAAATCTTCACATCAATTCCCTGGAGCTTGGTGACT360CTGCTGTGTATTTCTGTGCCAGCAGCCAAGA391cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。