基因總覽
TRBV25-1 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 25-1,屬於 T cell receptor gene。現有資料將它歸類為人類基因,並指出其位於第 7 號染色體的 7q34 區域。所提供的資料未描述其 RNA 或蛋白質產物的結構細節,因此不據此補充產物長度、結構域或其他分子特性。關於其生物學角色與細胞位置的資訊屬預測性註記,具體內容見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390398 ★ | 142,670,740–142,671,244 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
資料預測 TRBV25-1 可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,並可能是 T 細胞受體複合體的一部分。這些描述指出其與受體相關訊號及複合體的關聯,但屬預測性註記,並非此資料所列的直接實驗驗證結果。
在細胞位置方面,資料預測 TRBV25-1 可能在質膜具有活性。這項預測與其被認為可能參與細胞表面受體訊號傳遞的描述相互呼應;然而,來源未提供其在質膜上的具體分子作用方式、訊號傳遞步驟或作用條件,因此無法進一步界定其機制。
來源也未說明 TRBV25-1 如何參與 T 細胞受體複合體、是否直接與其他分子結合,或相關作用會造成哪些下游反應。基於目前資訊,能支持的功能性說明僅限於:它被預測與細胞表面受體訊號傳遞路徑、T 細胞受體複合體及質膜活性相關;這些關聯仍應保留為預測,而不應視為已確立的功能細節。
Promoter 與基因調控
>TRBV25-1 ENST00000390398 GRCh38 chr7:142669740-142670840 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AATACATACAGACTTGAAGACATGGTGTTCAAATAGTAGAGATATAATAGTAAAAACCCAAAGCCTATGT CAGCATCATGTGAACAAAAATTTTAGTAAATACCAACTGTAGATCTTAGTGAACTAGGGCAAAGGAAGTG GACAACACTGGGAGAAATTCTGGGATTAATCTTTGTATCTCACAATCAAAACCAAAGACTTTTCTGTTAA GAAGAAATGGGGGAAAGGGCGGAGGGAGAATGGCACTTGGTTTAGACATTGTTTACTGCAGCAGCACCCA AACCATTTGTAGCAGTATTACCAAAGCATGTATTGGATTATATTTTCTGTTCTGTCATGATTGATAGTGC AATTAAAGGCAGATGGACTAAAATCATCCTAGGCAAAGGCTAAGTTGATAAAGCTGATAAAGCCTGAACA CCAAGTCAGTGAAAAATGAGACTGAGAAAGTTATTATCACACAATAATAACACCATTCTGAGGACTCAGT GAATTCCAGTTACTGCTCCAAGCTCTTTACATGTGTCTATATAAATAGATTGCCCCGTTTAATGCTCACA AGTTCTCCTGCTCCTTGTCTGATCAAGCCACGCTGTTCACTGGTTCCCTCTTCTGCATGTTCTTCTCTCT TGGGTTTGCAGAGTTCATTCCTGTTCATCCTTCAGAACCCAACTCAAATGCCACTTCCTTTCCCAACCTT TTTAATTAGGTAAAATCTTGCTATTACAGGCACTCAAAGCTATGTAGTTTTTATGTTCATAGCTTACAAA ACAGTTGCAATGGAATGTTTTGTAAGAATATTAAAGACTTGAGTTAAGATAAGCAAAGCATCAAGCCTAC TTTGGATGAGGGAAGTCAACAAAAATATTACTCATTTGATGGGTTAAAAGGATATAGATGAAACTGTTTC AACAGGATGGCTGTGGGACCCAGGAAGTTTGCAGGGGCTGTGTCATCACACACACACAATGACATTATCA AGAGCCCATCCTGCTTCCCCACTACTGGGAGACATCCTCTCTAGCCCCAACTGTGCCATGACTATCAGGC TCCTCTGCTACGTGGGCTTTTATTTTCTGGGGGCAGGTAAGTCATAGACAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_8678TW · enhancer · 142668599–142668771 · regulatory
ENSR7_944LXN · enhancer · 142669314–142669617 · regulatory
ENSR7_538K37Z · CTCF_binding_site · 142669497–142669518 · regulatory
· motif · 142668656–142668669 · motif
· motif · 142669499–142669515 · motif
· motif · 142671718–142671725 · motif
· motif · 142671746–142671759 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV25-1 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390398 ★ | TR_V_gene | 381 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV25-1 被預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,可能是 T 細胞受體複合體的一部分,並可能在質膜具有活性;這些均為預測性描述。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ACTACTGGGAGACATCCTCTCTAGCCCCAACTGTGCCATG40ACTATCAGGCTCCTCTGCTACGTGGGCTTTTATTTTCTGG80GGGCAGGCCTCATGGAAGCTGACATCTACCAGACCCCAAG120ATACCTTGTTATAGGGACAGGAAAGAAGATCACTCTGGAA160TGTTCTCAAACCATGGGCCATGACAAAATGTACTGGTATC200AACAAGATCCAGGAATGGAACTACACCTCATCCACTATTC240CTATGGAGTTAATTCCACAGAGAAGGGAGATCTTTCCTCT280GAGTCAACAGTCTCCAGAATAAGGACGGAGCATTTTCCCC320TGACCCTGGAGTCTGCCAGGCCCTCACATACCTCTCAGTA360CCTCTGTGCCAGCAGTGAATA381cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。