基因總覽
TRBV20OR9-2 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional),分類為 T cell receptor gene。名稱中的「non-functional」表示此基因被標註為非功能性;現有資料未提供其可產生的 RNA 或蛋白質產物、序列特徵或結構資訊,因此不能據此描述其產物性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000379435 ★ | 33,617,845–33,618,508 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料將 TRBV20OR9-2 與細胞表面受體訊號傳遞路徑的參與,以及在質膜的活性列為預測。這些描述具有推論性,並非已確認的功能或定位;資料未進一步說明其作用機制或相關生物學結果。
Promoter 與基因調控
>TRBV20OR9-2 ENST00000379435 GRCh38 chr9:33616845-33617945 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTAGAAACTAGTTTCACTGTCCAGTACTTAGTATGACCTCCATTACAAGAGAATAAATGTAACTAATTAT TCTCACAACCTCAACAGTGATTAACACAGAAACATACAAGCTAAATCGAGAAATGTTATTAGAATGTTTA GAATTAAGTCCATCTATATGTGAGGGAAATTGTCATGAGATACTCACGAGGTAACTATCTCATTTAGAAA ATGACGAAGTGGCTTCAACATGATTATGAAGAAACATTGGACTTCCAGCCGAGGCACTGGCCTGGGCATT ATCAATATTTATGGTAGTGCCAACCTGTAGGTCTAGTGATTAACAACCATGAGTTGTCTTGGTGTAATTA CTTTGAGGATATGAAACAGAAGCAGCAGACTCCAATGCCATTCATTACCCAAACATACACTCCTTTCCTT ACAAGAAACTCGCTTAAGTCATTGCAATGCTCTACGTCTCAGTGTATCTTTAATAAATTTGGAAGTTGAA TTGGGAAATCTTTAGGCCACTTTAGACACTGTATGGGTTTTTTGTTTTCTTTTGAGACGGAGTCTCATTC TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAA TTCTCTGCCTCAGCCTCCCGAGGAGCCGGGATTATAGGCGCCCGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTGT TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGTTGGTCTTGAATTCCTAACCTTGTGATCTACCCG CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGAGCCACCTCGCCGACCTGTATGGTTCTTTGACAGG CAGAGAGATGGATGTAACACGGGTCATGAGCAAAGATTACCACCAGGGGGCAGACTAGAGCATCCTTGGG ATTCTGTGATCAGTCATCCCTCCTCGCTGGTGAATGGAGACAGTGGTCACAACTCTCCCCAGAGAAGGTG GTGTGGGGCCATCACGGAAGATGCTGCTGCTTCTGCTGCTTCTGGGGCCAGGTATGAGCCTCCTTCTACC TGGGAGCTTGGGTGGGCATGTGCGTGTGTTGCCATGGTCAAGCGGTGGCCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_9HC9D · enhancer · 33617594–33618049 · regulatory
ENSR9_59WHCM · CTCF_binding_site · 33617720–33617741 · regulatory
ENSR9_9HC9X · enhancer · 33619625–33619985 · regulatory
ENSR9_B8N66 · enhancer · 33620856–33621553 · regulatory
· motif · 33614495–33614508 · motif
· motif · 33614495–33614508 · motif
· motif · 33617722–33617738 · motif
· motif · 33619736–33619750 · motif
· motif · 33619736–33619750 · motif
· motif · 33619739–33619747 · motif
· motif · 33619743–33619754 · motif
· motif · 33619788–33619802 · motif
· motif · 33619788–33619802 · motif
· motif · 33619791–33619799 · motif
· motif · 33619795–33619806 · motif
· motif · 33619960–33619968 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV20OR9-2 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000379435 ★ | TR_V_gene | 335 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV20OR9-2 被預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,並預測可能在質膜具有活性;這些是推論性描述,並非已確認的功能或位置。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATGCTGCTGCTTCTGCTGCTTCTGGGGCCAGGCTCCGGGC40TTAGTGCTGTCGTCTCTCAACATCCGAGCAGGGTTATCTG80TAAGAGTGGAACCTCTGTGAACATCGAGTGCCGTTCCCTG120GACTTTCAGGCCACAACTATGTTTTGGTATCGTCAGCTCC160GGAAACAGAGCCTCATGCTGATGGCAACTTCCAATGAGGG200CTCCGAGGTCACATACGAGCAAGGCGTCAAGAAGGACAAG240TTTCCCATCAACCATCCAAACCTGACCTTCTCCGCTCTGA280CAGTGACCAGTGCCCATCCTGAAGACAGCAGCTTCTACAT320CTGCAGTGCTAGAGA335cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。