基因總覽
TRBV20-1 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 20-1,屬於 T cell receptor gene。現有資料將其產物與 T cell receptor complex 相連結,並預測其活性位置在 plasma membrane。這些描述屬於預測性註釋;所提供的來源未進一步說明其產物的分子結構或其他基本特性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390394 ★ | 142,626,649–142,627,399 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
資料預測 TRBV20-1 可能參與細胞表面受體訊號傳遞,並可能是 T cell receptor complex 的一部分。此預測指出它與受體複合體及訊號傳遞過程相關,但來源沒有提供更細的分子作用方式或具體下游反應,因此不能據此延伸出特定機制。
在細胞位置方面,資料預測其可能在 plasma membrane 活躍。此定位與細胞表面受體訊號傳遞的描述並列,但來源未說明定位如何影響訊號,也沒有提供實驗條件、細胞系統或功能測定結果。上述內容均為預測性註釋,並非來源所述的已證實功能。
Promoter 與基因調控
>TRBV20-1 ENST00000390394 GRCh38 chr7:142625649-142626749 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TAATTGCTACATATTTCCAACATCGATCCATTAAAACAAGTATCCCAGCCTGTTCAAATCAAAGAATTTC TTATGCCTCCTAGAAACTATTTTCACTGTCCAGTACTTAGTATGACCTCCATTACAATAGAATAAATTTA ATTATTCTCACAACCTCAACAGTGATTAACACGGAAACATACAAGCTAAATTGAGAAATATTATTAGAAT GTTTAGAATTAAGTCCCTTTATATATGAGGGAAATTGTCATGAGATACACATGAGGTAACTATCTCATTT AGAAAATGATGAAGTGGCTTCAACATGATTATGAAGAAACATTGGACTTCCAGCCGAGGCACTGGCCTGT GCTTTATCAATATTTATGGTAGTGCCAACCTGTGGGTCTAGTGATTAACAACCATGAGTTGTCTTGGTGT TATTACTTTGAGGATATGAAACAGAAGCAGCAAACAGACTCCAATGCCATTCATTACCTAAACCTACACT CCTTTCCTTATAGGAAACTCACTTAAGTCATTACAATGCTTTATGTCTCAGTGTATCTTTAATAAATTTG GAAGTTGAATTGGGAAGTCTTTAGGCCACTTTAGGCAATGTATGGGTTTTTTGTTTTCTTTTGATATGGG GTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATTTCAGCTCATTGCAACCTCCGCCTCCTGGG TTCAAGCAATTCTCTCCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTCCACCACCACGCCTGGCTAA TTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGGTTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTTGAACTCCTAACCTTGTG ATCCACCCGCCTCGGACTCCCAAAGTTCTGGAATTACAGGCGTGAGCCACCTCACCCGACCTGTATGGTT TTTTGACAGGCAGAGATGGACGTAACATCAGTCATGGGCAAAGATTACCACCAGGGGGCAGACTAGGGCA TCCTTGGGATTCTGTGATCAGTCATCCCTCCTCGCTGGTGAATGGAGGCAGTGGTCACAACTCTCCCCAG AGAAGGTGGTGTGAGGCCATCACGGAAGATGCTGCTGCTTCTGCTGCTTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_B33B8M · enhancer · 142626486–142627060 · regulatory
ENSR7_538JQTD · CTCF_binding_site · 142626602–142626623 · regulatory
ENSR7_86782P · enhancer · 142628570–142628729 · regulatory
ENSR7_944LJ9 · enhancer · 142629846–142630216 · regulatory
· motif · 142623643–142623655 · motif
· motif · 142623854–142623866 · motif
· motif · 142626604–142626620 · motif
· motif · 142628640–142628651 · motif
· motif · 142628805–142628813 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV20-1 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390394 ★ | TR_V_gene | 413 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV20-1 預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞,可能是 T cell receptor complex 的一部分,並可能在 plasma membrane 活躍;這些均屬預測性描述。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
GTCATCCCTCCTCGCTGGTGAATGGAGGCAGTGGTCACAA40CTCTCCCCAGAGAAGGTGGTGTGAGGCCATCACGGAAGAT80GCTGCTGCTTCTGCTGCTTCTGGGGCCAGGCTCCGGGCTT120GGTGCTGTCGTCTCTCAACATCCGAGCAGGGTTATCTGTA160AGAGTGGAACCTCTGTGAAGATCGAGTGCCGTTCCCTGGA200CTTTCAGGCCACAACTATGTTTTGGTATCGTCAGTTCCCG240AAACAGAGTCTCATGCTGATGGCAACTTCCAATGAGGGCT280CCAAGGCCACATACGAGCAAGGCGTCGAGAAGGACAAGTT320TCTCATCAACCATGCAAGCCTGACCTTGTCCACTCTGACA360GTGACCAGTGCCCATCCTGAAGACAGCAGCTTCTACATCT400GCAGTGCTAGAGA413cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。