基因總覽
TRBV2 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 2,屬於 T cell receptor gene。現有資料將其相關產物描述為預測可能是 T cell receptor complex 的一部分,並預測可能在 plasma membrane 活性。這些功能與位置資訊均屬預測性描述;可用資料未提供產物的分子形式、結構細節或其他家族特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000455382 ★ | 142,300,924–142,301,432 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRBV2 的相關產物預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞。這項描述指出其可能涉及由細胞表面受體啟動的訊號路徑,但現有資料未說明具體訊號如何傳遞,也未提供可據以描述其分子作用方式的細節,因此不能進一步推定其作用機制或下游結果。
資料亦預測相關產物可能是 T cell receptor complex 的一部分,並可能在 plasma membrane 活性。這些描述將可能的複合體關聯與細胞位置連結起來,但均屬預測,並非已證實的實驗結論;目前也沒有資料說明其在複合體中的具體角色,或其位置是否會隨條件改變。
Promoter 與基因調控
>TRBV2 ENST00000455382 GRCh38 chr7:142299924-142301024 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTTTTTTTTTCTTTTCTTTCCCTCCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTC TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGTTTCTTTGTTTCTTTCTTTCCTTCTTTCTTTTTTGAGACAGA GTCTCACTGTCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTTCCACCTCCATCTTCCAGATTCAAGCGAT TCTCCTGCCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGAACTACAGGCGCCCAGCACCACGACTGGCTAATTTTTGTAT TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTAACTTCTTGATTTGCCCC CCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCAGGTCCTTTTCTTTTTCTT TCTTTCTTTTTTTTTTGAAAAACTAAAGAATACCCAATCCCCTCCTCAGGTGGCTCTATCACTGCCTCAC CCTGAGGACAGTATTTCCCCATGGGGTTTGGATCACTGTTCTCTAGTTCCCTCTCCCTGGGGCATGTGCA GAGTTTCAACTTCTTGTTGGCTGCTCTCTTCCACTCAGGATTTAAAACATTCACACTTGATTCTTTTTCC TTCTATCTCTGTAATCCTAATACCAAGTTTTCTTGGCATTCATTATCAGCCGTGGAATCTGTTGTACCTG AATTGTTACTCACAGCAGGTAATAAGAGAACAAGACCTCCTGGAATTTCTGAGCCAGACTTTGTACTCAG GGTTACCTTGCTGACCCCCATATTTTCCAGCATTGCTCTTATTAATTAATGGCCCTCAGTCCTGCACACA CCATCAGATCCCAGGGGCTGAGCACAGCCCTGCATTGTCAGGTTCTGCAACAACACAAAGGCTCCCTCCT CTCTCCTATAGAGGGCGCTCCAGGGATGGTGGGTGTTGCCAGAGACACCAGTAATTCTGCCAGACCTTGC CTGTGGGGCCATGGGAGCTCAAAATGCCCCTCCTTTCCTCCACAGGACCAGATGCCTGAGCTAGGAAAGG CCTCATTCCTGCTGTGATCCTGCCATGGATACCTGGCTCGTATGCTGGGCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_538GNHZ · CTCF_binding_site · 142297977–142297998 · regulatory
ENSR7_944GZ8 · enhancer · 142297985–142298406 · regulatory
ENSR7_538GNJ7 · CTCF_binding_site · 142298026–142298047 · regulatory
ENSR7_538GNJP · CTCF_binding_site · 142298140–142298161 · regulatory
ENSR7_944H22 · enhancer · 142300733–142301038 · regulatory
ENSR7_538GP27 · CTCF_binding_site · 142300834–142300855 · regulatory
ENSR7_866Z2Q · enhancer · 142302009–142302243 · regulatory
ENSR7_944H2W · enhancer · 142303651–142304104 · regulatory
ENSR7_538GPHP · CTCF_binding_site · 142303753–142303774 · regulatory
· motif · 142297979–142297995 · motif
· motif · 142298028–142298044 · motif
· motif · 142298085–142298099 · motif
· motif · 142298085–142298099 · motif
· motif · 142298109–142298125 · motif
· motif · 142298109–142298125 · motif
· motif · 142298142–142298158 · motif
· motif · 142298177–142298185 · motif
· motif · 142298280–142298296 · motif
· motif · 142298280–142298296 · motif
· motif · 142298697–142298710 · motif
· motif · 142298849–142298862 · motif
· motif · 142300836–142300852 · motif
· motif · 142303755–142303771 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV2 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000455382 ★ | TR_V_gene | 421 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV2 的相關產物預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞,並預測可能是 T cell receptor complex 的一部分;此外,該產物預測可能在 plasma membrane 活性。這些均為預測性描述,未提供具體作用機制或實驗條件。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
AAAATGCCCCTCCTTTCCTCCACAGGACCAGATGCCTGAG40CTAGGAAAGGCCTCATTCCTGCTGTGATCCTGCCATGGAT80ACCTGGCTCGTATGCTGGGCAATTTTTAGTCTCTTGAAAG120CAGGACTCACAGAACCTGAAGTCACCCAGACTCCCAGCCA160TCAGGTCACACAGATGGGACAGGAAGTGATCTTGCGCTGT200GTCCCCATCTCTAATCACTTATACTTCTATTGGTACAGAC240AAATCTTGGGGCAGAAAGTCGAGTTTCTGGTTTCCTTTTA280TAATAATGAAATCTCAGAGAAGTCTGAAATATTCGATGAT320CAATTCTCAGTTGAAAGGCCTGATGGATCAAATTTCACTC360TGAAGATCCGGTCCACAAAGCTGGAGGACTCAGCCATGTA400CTTCTGTGCCAGCAGTGAAGC421cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。