基因總覽
TRBV16 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 16,屬於 T cell receptor gene。現有資料將它列為 T cell receptor 的 beta variable 成員;所提供資訊未進一步說明其產物的分子形式、結構特色或序列特徵,因此不宜據此補述。關於其生物學角色,目前可確認的內容僅限於資料庫所列的預測性描述,相關功能與定位仍應保留預測性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000620773 ★ | 142,598,016–142,598,469 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRBV16 的功能註記屬於預測,而非已確認的實驗結論。資料預測它可能參與細胞表面受體訊號傳遞,也可能是 T cell receptor complex 的一部分;此外,資料預測其活性位置在 plasma membrane。這些描述指出 TRBV16 可能與細胞表面的受體訊號及 T cell receptor complex 有關,但來源沒有提供足以說明具體分子作用方式的細節。
目前資料未交代 TRBV16 如何參與訊號傳遞、其與複合體其他成分之間的關係,或相關作用所引發的下游變化。因此,不能由這些預測進一步推定特定結合夥伴、訊號步驟或細胞效應。其在 plasma membrane 的預測定位,也僅能作為資料庫所列的可能位置,不代表已由此來源證實。
Promoter 與基因調控
>TRBV16 ENST00000620773 GRCh38 chr7:142597016-142598116 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGATGGATTGGAAAAATGGATGTTTGAGTGCATAAGGTTCACGAGTATAAGAAACAATTGGTACCTCCTA ACTATAGATTGTCAGTTTCAGAGGATGAGAATGAATGTGCCCTCATCCTCATTTTAATTTTGAAAGACAA TGCAGATATCCCTACTATAGAATCATTTTTTACATCACCACCTATAGAGATTAACAACAGTAGATGTTTC CAGCTCCCTAAGAGGCCAAGAAGTATTAACCCAAGGTCAGATTCAGGTAATTGATCGTGACTCACGAATT TTCAGAGATCCACAATGGTTGTTTTTAAATTTTCAGCAGTTATGTCTTTTTCTCTGGGGAGAGGGTATTC AAAGCTCCTCATGAGGCCATTCTGGACTACTTTTCCCCTCCTGCCCCCTGCCCATAAAACAGTTTACAGA AATAGGTGTCCAGACCGTGGGCTGTAGTTCACCAACTCCTGCTCTAGCCTAATTTTGTCTCATTACTAGA GCATGGCCATTCTGTGGATGCCAGTGAAGCCTTTCTGGGGTTTCTCTCCAATGCCTTTTAAAGCTTTTTC CTACACAGACACAGTTTACTGTTTAGCCAAAAAATTAAGATAATTCCTCCAGACATCTGGAGTTCTTGTG CAGCTTCCTCCTCTCTGGTGGTCTTTCCTTAAAAATTCTAGCTGCCTCAGCCCCCGCTGATTTTGTAACC TGTTTCCGCAACTCAAAATTTGCCATGCTCTGTTGCTCTCTTCCCCACTGTGTATGTGCAGAAATTGCCC CCATGTTTTGGTGTTTTGGCAGAATCCCAGTCCTGTGCTGTCTGCTTTCCAGTGGCTGAATACAATTGTT TCACATATTCTCTTAATTTGTGTTACTTGTATAGAGCAGGATGCTAAAGGCAATTGGATTCTACAAAGTG ATCACGTCACAGAGAAGCCGCCGACAGAGGTGGAGAGAGCCACACAGATAGCCAGCTGCCTGTGCTGCCT GCTCTTCCCCTAATTCTGCCATGAGCCCAATATTCACCTGCATCACAATCCTTTGTCTGCTGGCTGCAGG TAAGTCCCTGTTCTGCAGTTGTCAGCTCCCTGCTCTAAGCCTTTCATCCAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_944L8F · enhancer · 142602800–142603137 · regulatory
· motif · 142594271–142594282 · motif
· motif · 142594275–142594289 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV16 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000620773 ★ | TR_V_gene | 347 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV16 被預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞,可能是 T cell receptor complex 的一部分,並可能在 plasma membrane 活性。這些內容均為預測性描述,來源未提供進一步的實驗情境或機制細節。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATGAGCCCAATATTCACCTGCATCACAATCCTTTGTCTGC40TGGCTGCAGGTTCTCCTGGTGAAGAAGTCGCCCAGACTCC80AAAACATCTTGTCAGAGGGGAAGGACAGAAAGCAAAATTA120TATTGTGCCCCAATAAAAGGACACAGTTATGTTTTTTGGT160ACCAACAGGTCCTGAAAAACGAGTTCAAGTTCTTGATTTC200CTTCCAGAATGAAAATGTCTTTGATGAAACAGGTATGCCC240AAGGAAAGATTTTCAGCTAAGTGCCTCCCAAATTCACCCT280GTAGCCTTGAGATCCAGGCTACGAAGCTTGAGGATTCAGC320AGTGTATTTTTGTGCCAGCAGCCAATC347cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。