基因總覽
TRBV14 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 14,屬於 T cell receptor gene。現有資料將其相關產物描述為預測可能位於 plasma membrane,並預測為 T cell receptor complex 的一部分。這些資訊提供了其基因類別與預測中的受體複合體關聯,但未說明產物的分子結構、序列特徵或其他基本性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000617639 ★ | 142,587,868–142,588,359 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRBV14 相關產物的功能註釋指出,它預測可能參與 cell surface receptor signaling pathway,並預測為 T cell receptor complex 的一部分。資料也預測其活性位置在 plasma membrane,因而將受體複合體、細胞表面訊號傳遞與膜上的活性位置連結起來。
上述資訊均屬預測性描述,未提供實驗條件、作用機制或訊號傳遞結果,因此不能據此進一步判定 TRBV14 如何影響該路徑,也不能將預測的複合體組成或定位視為已證實。
Promoter 與基因調控
>TRBV14 ENST00000617639 GRCh38 chr7:142586868-142587968 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATCTGGGGGAAAAGAATTCCAGGCAGAGGGAGGAGCCAGTACAAATACCCTAAAAAAATATTTTAGGACC AATGAGGAGGCCCATATGACTGAAAAATTAAGGAAGGGAGTGGTAGGCTTTATTTCCAAGCGGTAATGGG GCAGGATGGATCATTTAAGACCTTGATGGCCTTAAGTGCTTTGTTGTTTTGTTTTCTTATTCCAAATAAA ACTGGGAGCTAGTAGATGATTTGGAGATGAGTGACATGATCTAGCATGTTCTAGAGGGCTGAGTTTGAGA GCTAGTTCAGAAGTAGGTGAAAGCAGGGAGATCAGTTAGGAATCTATTGCAGTAATCCAGGAAAAAGATG ATGGTGGCCTTGTCCTGAGGGTTAGCAAAGAAGGTGATGAAAAAATGGATGGATTCTGAGTGTATTTTCA TGATAGAGCCAGTTGAATTTCCTAATGGATTGGCTATAGGGTGGGATAGAAAAAGAGGATTTGGGAACCA CTCTAAGGTTTTCAGCTGGAAGGCTGTTGGTGGAGTAAAGTTGAGGATAATCTTTCATGTTTAGAGCATG CTGTTTGAGAGTGGTGGGGGGAAAATGTTGATTGGAGTGCATTAGAGAGATAATGGGAAAAGAGAATTTG GAGGTAAGTATTGATCATTAGCAATAGCAACAATAGCTACCGTAGATTAAAATGCCCCACAGTCTATGGG GATGTGATACATGAGGGAAGACAGGGCCAGATGGGATGAGGTAGGATCCAGACATCAGACTCAGGAGCTA CGAGTGGTATATATAAGGTTAACACCTAGTCAAATGCATAAACAGGTTGATTTTAATTGATGTCAGTTTT TCTCCATTGCCCCCTCTAGAGGCAATCTTCTTCAGAGAACCCTGGCTAGGTCTTCTATGTTTCATGTCCG TAGAGGGAGCTCCTGAGACTGTGGACATTGGCTAATATGCTGATGTCACTGGAGGCCACATCTTACAGGG CCAAGAGACAGATTTGCTTTCCTTTTTCTCATGCTTGTAAGCTCCTTCATCTGGAAATGTGATTTACCTG GGTCCTGCCATGGTTTCCAGGCTTCTCAGTTTAGTGTCCCTTTGTCTCCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_B33B2F · enhancer · 142583388–142583931 · regulatory
ENSR7_86774F · enhancer · 142584844–142585042 · regulatory
ENSR7_538JHRB · CTCF_binding_site · 142585330–142585351 · regulatory
ENSR7_86774S · enhancer · 142585527–142585739 · regulatory
ENSR7_538JHX8 · CTCF_binding_site · 142586178–142586199 · regulatory
ENSR7_944L43 · enhancer · 142587599–142588095 · regulatory
· motif · 142583838–142583849 · motif
· motif · 142585332–142585348 · motif
· motif · 142586180–142586196 · motif
· motif · 142592433–142592442 · motif
· motif · 142592433–142592442 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV14 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000617639 ★ | TR_V_gene | 406 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV14 預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,預測為 T cell receptor complex 的一部分,並預測在 plasma membrane 具有活性。這些描述皆為預測,未提供其他實驗條件或作用機制。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
CCTTTTTCTCATGCTTGTAAGCTCCTTCATCTGGAAATGT40GATTTACCTGGGTCCTGCCATGGTTTCCAGGCTTCTCAGT80TTAGTGTCCCTTTGTCTCCTGGGAGCAAAGCACATAGAAG120CTGGAGTTACTCAGTTCCCCAGCCACAGCGTAATAGAGAA160GGGCCAGACTGTGACTCTGAGATGTGACCCAATTTCTGGA200CATGATAATCTTTATTGGTATCGACGTGTTATGGGAAAAG240AAATAAAATTTCTGTTACATTTTGTGAAAGAGTCTAAACA280GGATGAGTCCGGTATGCCCAACAATCGATTCTTAGCTGAA320AGGACTGGAGGGACGTATTCTACTCTGAAGGTGCAGCCTG360CAGAACTGGAGGATTCTGGAGTTTATTTCTGTGCCAGCAG400CCAAGA406cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。