基因總覽
TRBV13 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 13,分類為 T cell receptor gene。現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物的具體性質、家族結構細節或分子組成,因此不宜據此延伸描述其產物特徵。資料另預測其與 T cell receptor complex 相關,並可能參與細胞表面受體訊號傳遞;這些內容屬預測資訊,不能視為已確立的功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000614171 ★ | 142,535,809–142,536,292 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料將 TRBV13 的功能描述為預測性資訊:它可能參與細胞表面受體訊號傳遞。這表示目前的註釋提出其與此類訊號途徑相關,但並未提供足以確認作用方式或生物學結果的細節,因此不能將此預測表述為已證實的功能。
資料也預測 TRBV13 可能是 T cell receptor complex 的一部分,並可能在 plasma membrane 活性。這些描述分別涉及複合體關聯與可能的活性位置;來源沒有說明其具體分子互作、訊號傳遞步驟,或上述位置與功能之間的因果關係。整體而言,可支持的結論僅限於這些預測性關聯,尚無資料可進一步說明其作用機制或功能影響。
Promoter 與基因調控
>TRBV13 ENST00000614171 GRCh38 chr7:142534809-142535909 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATGTGTTTATTTCTCCAGCTTAGATGATTGTTTCACTGATAGCATGTCACTGTCAGCTGCCTCCAGGAAT TATCTTTGGTTAAAGGGAATGCTTTGCCCAGGTCTCACCCCATTCCTATGGCAGCTGGCATTTAATGACT GGCTGATATCTCCCTTCCTACACCATTATTTGATGAAATTTAAAATTTAAATTAAAATGAAAAATTTTTC TTTCTTGTTTAAAAAGACATTTGCTTTATGTCTCCCTCACCAACCTGTGCAAAATTTGAGTTTGAGGCAG GTAAACCTGAAATCAGCAAGAGCTGTGCTGTGTCCTGAGAGATCCTGAGGGTCTAATTTAGGAAGCACCC AGTCTCCCTAGTCAGGGTCCTTAGAGCTTCCTCATAGTGACTACACACTGGCCACTTGGGGGCACTGTGG ATCCACTGAGTGGGTCACTGATAGCGCTGTCTGAGAGAGAGAGGGTTAAGGGAGACAGTCTTGATTTCGT CTCTGTATCAGGGATATTACCAGATGAACCAGAGGTACTGCTGGCACAGGAAGAGTTAATCATAGTCTTA TCAGATCAACTGATATGCAACATGTATTTGTCATGACAGGAAGCCATGAACTGAAGCCTTGTGTGGCCTC TCTAGCAACCTAGGTTTGATGGGGAGTGTGATGAGGGTTTCAGCAGGGCAGCCTGGATAACCCAAGCCAG GTGGAGATAAAGGAGCATCTGCCTCAGATGAAAATCTCAGAAGCTGTGCGGATGGCTGTCTGCCCGGAAG CCTGCCCCCTCTCGCTCAGCACAGCTAGCTTCCCCTGCTCTGCAGGAAGCTGGACAGGATGGGGGAAAGC CTGAGTTAGCTGAGCTAGTCCTGGAGTACAGGGTGCCTATGGGAGCCTACAGGACGATGACATCAGAACA GTGACATCACAGTAAAAACCTCCAAAAACGGTGAGGAGGAGCAAAAGCCCTGCTTTCTCACCCCAGGAGA CCAGCAACCTGAGCAGGGAGATGCTTAGTCCTGACCTGCCTGACTCTGCCTGGAACACCAGGCTCCTCTG CCGTGTCATGCTTTGTCTCCTGGGAGCAGGTGAGTCCTGAGTACAGGTGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_CJ5TP · enhancer · 142534864–142536060 · regulatory
ENSR7_538J779 · CTCF_binding_site · 142535206–142535227 · regulatory
ENSR7_944KK8 · enhancer · 142539895–142540270 · regulatory
· motif · 142533510–142533524 · motif
· motif · 142533510–142533524 · motif
· motif · 142535208–142535224 · motif
· motif · 142536169–142536183 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV13 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000614171 ★ | TR_V_gene | 374 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 資料預測 TRBV13 可能參與細胞表面受體訊號傳遞,可能屬於 T cell receptor complex,並可能在 plasma membrane 活性;這些均為預測,未提供進一步的作用機制或實驗細節。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATGCTTAGTCCTGACCTGCCTGACTCTGCCTGGAACACCA40GGCTCCTCTGCCGTGTCATGCTTTGTCTCCTGGGAGCAGG80TTCAGTGGCTGCTGGAGTCATCCAGTCCCCAAGACATCTG120ATCAAAGAAAAGAGGGAAACAGCCACTCTGAAATGCTATC160CTATCCCTAGACACGACACTGTCTACTGGTACCAGCAGGG200TCCAGGTCAGGACCCCCAGTTCCTCATTTCGTTTTATGAA240AAGATGCAGAGCGATAAAGGAAGCATCCCTGATCGATTCT280CAGCTCAACAGTTCAGTGACTATCATTCTGAACTGAACAT320GAGCTCCTTGGAGCTGGGGGACTCAGCCCTGTACTTCTGT360GCCAGCAGCTTAGG374cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。