基因總覽
TRBV12-5 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 12-5,屬於 T cell receptor gene。現有資料將其列為 T 細胞受體相關基因,但未提供其產物的分子性質、家族結構細節或蛋白質結構資訊,因此不宜據此補述其產物的形式與結構。資料所載的功能註釋為預測性內容,指出它可能與 T cell receptor complex 及細胞表面受體訊息傳遞相關;具體功能仍應保留為預測,而非已證實的結論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000621184 ★ | 142,580,917–142,581,427 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前的功能註釋將 TRBV12-5 與細胞表面受體訊息傳遞路徑相連結,但此項關聯屬於預測,不能視為已確立的功能。資料也預測 TRBV12-5 可能是 T cell receptor complex 的一部分,並可能在質膜具有活性;這些描述同樣是推論性註釋,未提供支持其作用方式或實驗條件的細節。
依現有資訊,TRBV12-5 的功能定位僅能概括為可能涉及受體訊息傳遞,且可能與 T cell receptor complex 相關。資料沒有說明它如何參與訊息傳遞、是否直接與複合體中的其他成分結合,或在何種細胞與條件下發揮作用,因此不能進一步推定分子機制或生物學效應。
Promoter 與基因調控
>TRBV12-5 ENST00000621184 GRCh38 chr7:142579917-142581017 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTCTTTGGGGTGTTGGAGGAAAAATCTCTGTGCCAACAGCAGAGACATGGAACTAGTGTGTCACATCCAC TCTATGAACAGAATTCTTACTACTATTTATACCCTAAAAAGCAGGCCATTTTCTAGAGTTTCACCCCCTC ACCAGAAAGAATTTATTTGTGAGTATTGGTTGACTTACTATAACAAGAGACTCAAGTGTTAATCATTAAA GGAACCTGTTAGTGCTTTCTTAGAAGTAAGAGGAAGATCACATTTAACTGGAGAGTGCCTTATTGTGGTT TTCAAGGAAGGTCAAAGCTCTTACTTATCACTGCTCAATCTTCACCCATGCCCAAAGAATTAACATAATT TTGAACCTTACCCTGGAGAAGCGAAATGGGACCTTGTCCTCCAGAAATGCAGAAGACACTGTGCTGTGGG CTGGGGGAGTCACGGAGCACGAGAGTATCCATCTCCAGCCCTCACTGGAAATAAAATCTGCACAGTTCTA TCTCTTTCCAGGGCAGCCACCTTGTTCTCTGCATGAGGAGCATGGAGGTCCAGATGCTTCCAGGAGGGAT ATGGGGCAAAGCTCTAACTAAGCAACACATTATTTTGATTTTGTGTGTCTGGGATATAAGGATGGCCGGT AAGGGGAACAATAAAGTTCTTGAGATTTCACAAGTAATTTATTGATGTCCAGAATTTGAGGTGCTGATGG TACACCTAAGTGGCAATATGCACCAGGCAGATCAATATGTGACGCGTCAGAGAAAGCAGAATGGGTGATG TGATGTGCAATGCCACAGAAGCACTGCAGCCAGGAGAGGTGACAGCTAATGGGGATGTTTGGAGTCTTTG AGTGAACCAAACACATCCCAGAGTAATTGTAATTTATTTCAGTCAATCTTCTGTACAGACTTAGCATTCA CCTTTGGAGGAAGGTCCTTTGAGCAGGGACAGAGATGGTGATGTCACTGACAGTCCCCCTTTTACTCTGG GTGAGAGGTCTAGAATCCTCAGCTCCTGTATTCGTGCCCACAAGGGCCTCATCTAGGTGAAGGCTCCACC TGCCCCACCCTGCCATGGCCACCAGGCTCCTCTGCTGTGTGGTTCTTTGTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_B33B25 · enhancer · 142581252–142581790 · regulatory
ENSR7_B33B2F · enhancer · 142583388–142583931 · regulatory
ENSR7_86774F · enhancer · 142584844–142585042 · regulatory
ENSR7_538JHRB · CTCF_binding_site · 142585330–142585351 · regulatory
ENSR7_86774S · enhancer · 142585527–142585739 · regulatory
· motif · 142579862–142579877 · motif
· motif · 142579862–142579877 · motif
· motif · 142580204–142580211 · motif
· motif · 142580268–142580281 · motif
· motif · 142580862–142580875 · motif
· motif · 142580862–142580875 · motif
· motif · 142581533–142581542 · motif
· motif · 142582546–142582560 · motif
· motif · 142582546–142582560 · motif
· motif · 142583838–142583849 · motif
· motif · 142585332–142585348 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV12-5 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000621184 ★ | TR_V_gene | 411 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV12-5 被預測可能參與細胞表面受體訊息傳遞路徑,也可能是 T cell receptor complex 的一部分,並可能在質膜具有活性;這些均為預測性註釋。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
AGCTCCTGTATTCGTGCCCACAAGGGCCTCATCTAGGTGA40AGGCTCCACCTGCCCCACCCTGCCATGGCCACCAGGCTCC80TCTGCTGTGTGGTTCTTTGTCTCCTGGGAGAAGAGCTTAT120AGATGCTAGAGTCACCCAGACACCAAGGCACAAGGTGACA160GAGATGGGACAAGAAGTAACAATGAGATGTCAGCCAATTT200TAGGCCACAATACTGTTTTCTGGTACAGACAGACCATGAT240GCAAGGACTGGAGTTGCTGGCTTACTTCCGCAACCGGGCT280CCTCTAGATGATTCGGGGATGCCGAAGGATCGATTCTCAG320CAGAGATGCCTGATGCAACTTTAGCCACTCTGAAGATCCA360GCCCTCAGAACCCAGGGACTCAGCTGTGTATTTTTGTGCT400AGTGGTTTGGT411cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。