基因總覽
TRBV12-2 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 12-2 (pseudogene)，分類為 T cell receptor pseudogene。此分類指出它是 T cell receptor 相關的假基因位點；現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物的性質與結構，因此不據此推定其會產生功能性蛋白質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000489763 ★ | 142,440,883–142,441,325 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
目前資料將 TRBV12-2 與免疫系統過程的參與列為預測，並非已確認的功能。資料也預測此基因位於質膜；這項定位同樣屬推論，不能視為已證實的細胞位置。現有來源未提供支持這些預測的實驗細節，也未說明其作用方式。
Promoter 與基因調控
>TRBV12-2 ENST00000489763 GRCh38 chr7:142439883-142440983 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGGGCGCAGGGGACTCAGCTGTATGCCTCTGTGCCAACAGCGAAAATGTGGCCTTAAACTGCTCCTTCTT CTTTGTTAGCAAATAACCTAGTTGACCAATTCATAGAGCAGAGGTTCTCTCAGTTCTCTATACTCTACAC CCCGAGAGGAAGTCAGTTAGTGAGATGTAAGATTCTTTTATAAGAAAAAGACCAGGTGTAAAGATTAAGA AATGCTGAGCTTTGCTAGAGGTAAGAATAAGATGTAAATCAACTCTGGAACATTTAATTTCCAAATCTTT GTGAGAAAGACAATCTTGTTTCTGATTTATTGTGTGGATAGAGAATGTGAGAGATTCTGTGCTCTGGGCT TTGCAAACTCAATAGAGTTCAAGGATCAATAAACTCGGAGAGACCCTTCACTGCAAAGAAGAGCTTTGAA ATCTAATGAGCTTCCGGGACACTGATTCAGCTCCTGTATCTTTAACAACGCGGTTGACATGCTTGCTCTT CCTGGGTAACTCAGATGCTAACTTCTAACTCATTTAAAGGCATTTGAAGAACTAGGAGCACAGAGTCACC AGTGAGAGGAAGAGGAGAGTTTGCAGAGAAGCTGGCTTGCAATAAGGCAATGAGTTCATCTTTAAATACT TGGAGTTTGAGGTGCAGATGGATATAGTTGGCAGGCTCCTAGGTAAGGCATGTTATGGAGAAGGTGCTAT GAATTGATAATATCAAAGCAAATCTACAGGGATCCTCTGCAAGTGTGCATCTGTATCTCAGATCAATTAT AGTTGACTTCAGTCCTGCCTGATTCATCTCCCAAAAATGTAGTCTGCCTGATTCATCTCCCAAAAATGTA GCCTCCGCTTAAAGGAGCTTTCAAGTTGGGGGTGGTGGGCCATTCAGTGTTGTCACTAACAGATGCATCT TGTGGGGGTAAAATGTCCCAAAGTATCTTTTCTTGCTTATGTTCATAAGGGCGCTGGTCTGGAATGTGCC ACATCTGTTCTCACTCTGCCATGGACTCCTGGACCCTCTGTGTGTCCCTTTGTATCCTGGTAGCGAGTGA GTCCTCATGTATTTATCATCCTCATGCTGGGCCTCTGTATAGATGACTTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_944JGS · enhancer · 142438302–142438733 · regulatory
ENSR7_538HKL8 · CTCF_binding_site · 142438432–142438453 · regulatory
ENSR7_8673ZH · enhancer · 142439853–142439987 · regulatory
ENSR7_CJ5LT · enhancer · 142440285–142441442 · regulatory
ENSR7_86743Q · enhancer · 142443680–142443886 · regulatory
ENSR7_944JJR · enhancer · 142445096–142445469 · regulatory
ENSR7_538HLQH · CTCF_binding_site · 142445189–142445210 · regulatory
ENSR7_538HLS4 · CTCF_binding_site · 142445532–142445553 · regulatory
· motif · 142438371–142438384 · motif
· motif · 142438434–142438450 · motif
· motif · 142439875–142439888 · motif
· motif · 142439875–142439888 · motif
· motif · 142445191–142445207 · motif
· motif · 142445534–142445550 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV12-2 依 HGNC／Ensembl 分類為 T cell receptor pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000489763 ★ | TR_V_pseudogene | 344 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV12-2 被預測可能參與免疫系統過程，並被預測位於質膜；這些描述屬於預測資訊，來源未提供實驗細節。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in immune system process. Predicted to be located in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATGGACTCCTGGACCCTCTGTGTGTCCCTTTGTATCCTGG40TAGCGACATGCACAGATGCTGGCATTATCCAGTCACCCAA80GCATGAGGTGACAGAAATGGGACAAACAGTGACTCTGAGA120TGTGAGCCAATTTTTGGCCACAATTTCCTTTTCTGGTACA160GAGATACCTTCGTGCAGGGACTGGAATTGCTGAGTTACTT200CCGGAGCTGATCTATTATAGATAATGCAGGTATGCCCACA240GAGCGATTCTCAGCTGAGAGGCCTGATGGATCATTCTCTA280CTCTGAAGATCCAGCCTGCAGAGCAGGGGGACTCGGCCGT320GTATGTCTGTGCAAGTCGCTTAGC344cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。