基因總覽
TRBV11-3 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 11-3,屬於 T cell receptor gene。現有資料提供其基因身分資訊,以及對相關分子角色的預測;未提供產物的詳細分子性質、序列或結構特色。因此,僅能確認其與 T 細胞受體系統相關,不能據此補述其他家族特徵或蛋白質結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000611787 ★ | 142,554,836–142,555,318 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有註釋將 TRBV11-3 的功能描述為預測性資訊,而非已確立的功能結論。來源預測它可能參與細胞表面受體訊號傳遞,並可能是 T 細胞受體複合體的一部分;此外,也預測其可能在質膜具有活性。這些陳述指出可能的受體相關角色,但來源沒有提供實驗細節或作用機制,因此不能進一步確定其如何影響訊號傳遞,或在何種條件下發揮作用。
Promoter 與基因調控
>TRBV11-3 ENST00000611787 GRCh38 chr7:142553836-142554936 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGGTTCTGATAATTCTACACTCACAGGTCTTCACCTGATAACCTTGACATGTGTCCCCTAGGTTTTAGGA ACTTGGATTTCTTTAGGCTGAGTTGTACTATTCCCTTTCTCTGAACACACATGTCATTGGTTAGTTCATT CATATTGATTCTCAGGACTTCTCCAATCCCTCAAGCCTTCCCACTCTACCACTCAGATAAGGAGAAGTGT GTCTTAACTAATGTTGCATAATTTTTTAAAAATTGCTGGATACTAACACTGCAATTCAATTGTAAAATAT GATAGAGGTGTAAGTGTTTTAGATCCCAGAAGTCCTGCTCAATTTTGCATTTATTGTTAGATATTCACCC TGATATTTTCAGGAATTAGAGTGTTCTTCATCCATTTGGGTTAAGATATCAGAACTTACTTTCAATTCAT TGGTGACCAGAGACTACAGGCAGAATCATAGTGAAGGCTTGATACATAATACATAATGAAGATTGATAAC AGCAAAAAGGGAACTAGTCATTGGCCTTCAGATAAAATGAAACCTCCCAACTTTGTGCTCAGGGAATTAT TTTACCCCTTTAGGTTAGAGTATGTCAGCTAGTTCAATGCAGTTCTAGGATAAAGCTGTGTCAATTACCC TAGAGGACTGGGAGCATGGAGGACCTGGTAGAAAAGAAATACCCAAAGAGAAGGAAAATTACACATAAAA TCAAGAGGTCACTAATTGATATATCTATTTTGAGTTGCCTTTGAGACTTCCACGTAGAAACATCTAGCAC AGGATAGGCCTAGAGATGTAGTGACAGATCTAATCCCCCAAGCCCTGAATATGTGAGTGAGGACGCTTGG ATGAACTTCCAGTCTATGAATACATTAAACAAACTTTTAGCTCTGTTTTAGTTTACAACAACTGTTTTCT AAGAACTTAAGCATTTGTGGAGACAATGATGTCACTGTAGGAACTTCTCTGTAAGGACAGCAACATCCCA CTTCCTCTGCTCCTGCTCACAGTGACCCTGATCTGGCAAAGCTTCCATCCTGCCCTGACCCTGCCATGGG TACCAGGCTCCTCTGCTGGGTGGCCTTCTGTCTCCTGGTGGAAGGTGAGTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_8676F7 · enhancer · 142553322–142553568 · regulatory
ENSR7_8676FX · enhancer · 142554633–142554865 · regulatory
ENSR7_944KPL · enhancer · 142555101–142555395 · regulatory
ENSR7_B339TJ · enhancer · 142556554–142557126 · regulatory
ENSR7_B339TP · enhancer · 142557872–142558483 · regulatory
ENSR7_538JC5J · CTCF_binding_site · 142558165–142558186 · regulatory
· motif · 142556968–142556982 · motif
· motif · 142556968–142556982 · motif
· motif · 142557456–142557467 · motif
· motif · 142558167–142558183 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV11-3 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000611787 ★ | TR_V_gene | 392 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBV11-3 預測可能參與細胞表面受體訊號傳遞路徑,可能是 T 細胞受體複合體的一部分,並可能在質膜具有活性。這些為預測性註釋,未提供進一步的實驗條件或作用機制。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
AGTGACCCTGATCTGGCAAAGCTTCCATCCTGCCCTGACC40CTGCCATGGGTACCAGGCTCCTCTGCTGGGTGGCCTTCTG80TCTCCTGGTGGAAGAACTCATAGAAGCTGGAGTGGTTCAG120TCTCCCAGATATAAGATTATAGAGAAAAAACAGCCTGTGG160CTTTTTGGTGCAATCCTATTTCTGGCCACAATACCCTTTA200CTGGTACCTGCAGAACTTGGGACAGGGCCCGGAGCTTCTG240ATTCGATATGAGAATGAGGAAGCAGTAGACGATTCACAGT280TGCCTAAGGATCGATTTTCTGCAGAGAGGCTCAAAGGAGT320AGACTCCACTCTCAAGATCCAGCCTGCAGAGCTTGGGGAC360TCGGCCGTGTATCTCTGTGCCAGCAGCTTAGA392cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。