基因總覽
TRBV11-1 的正式名稱為 T cell receptor beta variable 11-1,屬於 T cell receptor gene。現有資料將其描述為一個基因位點,未提供其產物的序列、蛋白質結構或家族組成細節。資料庫摘要以預測方式指出,相關產物可能是 T 細胞受體複合體的一部分,並可能在細胞表面受體訊號傳遞中發揮作用;這些描述屬於預測,不能視為已確立的實驗結論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390367 ★ | 142,407,672–142,408,136 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前可用的功能摘要將 TRBV11-1 與細胞表面受體訊號傳遞途徑及 T 細胞受體複合體連結,但兩項關聯皆標示為預測,並非此資料所列的直接實驗證據。因此,較合適的解讀是:現有註釋提出了可能的功能方向,尚不足以據此確定其具體分子作用或作用條件。
摘要另預測相關產物可能位於質膜,並可能成為 T 細胞受體複合體的一部分。這些資訊支持將 TRBV11-1 的可能角色置於細胞表面受體系統的背景中理解;不過,來源沒有說明該預測所依據的實驗、細胞或其他生物學條件,也沒有提供複合體組成或受體訊號如何傳遞的細節。
因此,依據目前來源,不能進一步判定 TRBV11-1 如何參與訊號傳遞、其對相關生物學過程的具體影響,或上述預測在何種情境下成立。功能描述應保留「預測可能」的限定,不將可能的複合體成員身分、質膜位置或訊號相關性表述為已證實的作用機制。
Promoter 與基因調控
>TRBV11-1 ENST00000390367 GRCh38 chr7:142406672-142407772 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCT CCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGTCTCCAGAGTAGCTGGGACTATAGGCATGTGCCGCCATGCC CGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTACCCAGGATGGTCTCGATCTCCTG ACCTCGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACCATACCCGGCCG ATTTTGGATCTCTTACTGTATTCACAATGATATTTTCAGGGATAAGAGAGTCCCCACCCATCTTATAAGA TATCAGAACTTTCATTACATTGATGACCAAGAACCATAGGCAGAACCATGATGAAGACTTGGTACACAAT GCATCATGAAGCTTGATAACAGAAAAGAGAAAGCTGGCCATTGACCTTCACCAAAAATGAACCCTTCCAA CTCTCTCTCAGGGTATTATTTTACCCCTTTAGCTTAGAGCATGTCAGCTGGTTCAACATGCTTCTAGGAT AAACCTGTGTCAACTACCCCAGCTCCCACTCTGTCTAAGCTCATAGCAATGAGAAAATGGAGAACCTGGT AAGACAGAAATGCCCAGAGAGAAGGATATACAGATAAGACATAGAGGTTACTAATTGTTGTCTGTATTTT GAGTTGCCTTTGACACATTCAAGTAGAAACATGCAGCAGAAGATGGCCCTGGAGATGCAGTGGGTGATCC AATCCCCCAAGCCCTAGAGATGTGAGTAAAGACACTTGGATGAACTTACACACAGTCCATGAATACGCTA AAGCAACTTCTAGCTCTGTTTTAGTTCATAACAACTGGTTTCTAAGAACTTAGGCACTTGTGGAGACAAT GATGTTACTGTAGGAACTACCGTATAAGGACAGGATGTCCCACCTCCTCTGCTCCTGTTCACAAGGACCC TGAACTGGCAAAGCTCCCATCCTGCCCTGACCCTGCCATGAGCACCAGGCTTCTCTGCTGGATGGCCCTC TGTCTCCTGGGGGCAGGTGTGTCCTAAGAACACCATGATCATCCCATTGGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_538HCX4 · CTCF_binding_site · 142405355–142405376 · regulatory
ENSR7_86738L · enhancer · 142405439–142405669 · regulatory
ENSR7_944J64 · enhancer · 142408039–142408470 · regulatory
ENSR7_B3394N · enhancer · 142412513–142413077 · regulatory
· motif · 142405357–142405373 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV11-1 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390367 ★ | TR_V_gene | 364 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 資料預測 TRBV11-1 可能參與細胞表面受體訊號傳遞途徑、可能是 T 細胞受體複合體的一部分,並可能在質膜具有活性;這些均屬預測性註釋。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in cell surface receptor signaling pathway. Predicted to be part of T cell receptor complex. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
CCTGCCCTGACCCTGCCATGAGCACCAGGCTTCTCTGCTG40GATGGCCCTCTGTCTCCTGGGGGCAGAACTCTCAGAAGCT80GAAGTTGCCCAGTCCCCCAGATATAAGATTACAGAGAAAA120GCCAGGCTGTGGCTTTTTGGTGTGATCCTATTTCTGGCCA160TGCTACCCTTTACTGGTACCGGCAGATCCTGGGACAGGGC200CCGGAGCTTCTGGTTCAATTTCAGGATGAGAGTGTAGTAG240ATGATTCACAGTTGCCTAAGGATCGATTTTCTGCAGAGAG280GCTCAAAGGAGTAGACTCCACTCTCAAGATCCAGCCTGCA320GAGCTTGGGGACTCGGCCATGTATCTCTGTGCCAGCAGCT360TAGC364cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。