基因總覽
TRBV1 是人類假基因（pseudogene），正式名稱為 T cell receptor beta variable 1 (pseudogene)。登錄類型為 T cell receptor pseudogene。此基因座位於 7q34。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000476502 ★ | 142,299,177–142,299,460 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
Promoter 與基因調控
>TRBV1 ENST00000476502 GRCh38 chr7:142298177-142299277 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGAGTCATGTGGAGGGAGAAGAGAGGCAGGAGGGAGGAAAGGACTAACGAAGGAATCAAATGCTCTGGT ATCAGGGTTTGCTCCTTGTTGTAGTTGAGAGACCATGTGTGGACAACTTGAAGACACTAAAGTCCATTCC ACCTGGACCTGCATCTCTGCAGTCCCTCTGCTCATGCCCTTAGGGCCTCCTGTTATTCTAGTCTGTGTTC AGGTCCTGCATCCTAAGTAGGTGAGATGCTCCCTGGGGGTAGGGGTCGCAGATTATTTCTCTCATGTCCC CTCGAGCACCCACTGAAAGGTGCTTCCTCCCTAGTTGGCATTACCTTACTGGGTCTTAAAATGATGCACA GCTGGCTCCAGGGAAGGGCTCCACTGAGCTAGGTGAGGTGTCCTCCTGGAATTCACTGAGATGAGGGAGG GGAGCTGGAGTGTGCTCATCCTGGGTCCAAGACAGGCATCGGGAAGGCATCTGCCCAAAGGGAAGGGGTC TGTGTGTTAGGGAGGAGGGGAGCCATAAGTAGAAAGAGGAAGGGGAGACCCATTCATTCGTTGTGGGAAG GGCAGGCAGCTGCTAAGAAAAAAGCAACTGTCTAAAGAACCCGCCCTGCACACCTGGCCCTGAGAAGCTA GTCTAAACCCACCTCTTGAGGTGCCAGTGCCAAGCTTGGAAAGGAAAGAGGAAGTGTGAGCTGTAGACAC TAATAGTGACACCAACAGGAGCAGAGACTTCCCAAGCAGCCCCTGTCTCAGGGCCAGGGAAGCACACCCA GACGACAAGGACACAGAGCAGGGAGACACAGGGTCCCCCTGCCTGTGCCCCGGGTGACCCTGCCATGGGC TGAAGTCTCCACTGTGGTGTGGTCCATTGTCTCAGGTGAGTCCTGGGCACAGGTGGGACATTTCTGTCCT TAAATTTTTTGCTTTTTTCATGGAACTGCTTCAGAAGATTCTGTCCTAGGCTTAGTCTGAATTTGGCTTC TTATTTTCATAGGCTCCATGGATACTGGAATTACCCAGACACCAAAATACCTGGTCACAGCAATGGGGAG TAAAAGGACAATGAAACGTGAGCATCTGGGACATGATTCTATGTATTGGTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_538GNHZ · CTCF_binding_site · 142297977–142297998 · regulatory
ENSR7_944GZ8 · enhancer · 142297985–142298406 · regulatory
ENSR7_538GNJ7 · CTCF_binding_site · 142298026–142298047 · regulatory
ENSR7_538GNJP · CTCF_binding_site · 142298140–142298161 · regulatory
ENSR7_944H22 · enhancer · 142300733–142301038 · regulatory
ENSR7_538GP27 · CTCF_binding_site · 142300834–142300855 · regulatory
ENSR7_866Z2Q · enhancer · 142302009–142302243 · regulatory
ENSR7_944H2W · enhancer · 142303651–142304104 · regulatory
ENSR7_538GPHP · CTCF_binding_site · 142303753–142303774 · regulatory
· motif · 142297979–142297995 · motif
· motif · 142298028–142298044 · motif
· motif · 142298085–142298099 · motif
· motif · 142298085–142298099 · motif
· motif · 142298109–142298125 · motif
· motif · 142298109–142298125 · motif
· motif · 142298142–142298158 · motif
· motif · 142298177–142298185 · motif
· motif · 142298280–142298296 · motif
· motif · 142298280–142298296 · motif
· motif · 142298697–142298710 · motif
· motif · 142298849–142298862 · motif
· motif · 142300836–142300852 · motif
· motif · 142303755–142303771 · motif
基因座與轉錄註解
TRBV1 依 HGNC／Ensembl 分類為 T cell receptor pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000476502 ★ | TR_V_pseudogene | 284 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
DNA 與 RNA 序列
GATACTGGAATTACCCAGACACCAAAATACCTGGTCACAG40CAATGGGGAGTAAAAGGACAATGAAACGTGAGCATCTGGG80ACATGATTCTATGTATTGGTACAGACAGAAAGCTAAGAAA120TCCCTGGAGTTCATGTTTTACTACAACTGTAAGGAATTCA160TTGAAAACAAGACTGTGCCAAATCACTTCACACCTGAATG200CCCTGACAGCTCTCGCTTATACCTTCATGTGGTCGCACTG240CAGCAAGAAGACTCAGCTGCGTATCTCTGCACCAGCAGCC280AAGA284cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。