基因總覽
TRBJ2-2 的正式名稱為 T cell receptor beta joining 2-2,屬於 T cell receptor gene。現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物的基本性質、家族特徵或結構資訊,因此不進一步推定其分子產物或結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390413 ★ | 142,796,560–142,796,610 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料將 TRBJ2-2 的功能描述為預測性註記,而非已確認的作用。來源預測它可能參與適應性免疫反應,但未說明其參與的具體步驟、分子作用方式或對免疫反應的影響,因此不能據此推定更詳細的機制。
來源也預測 TRBJ2-2 可能位於質膜,並可能是 T cell receptor complex 的一部分;這些定位與複合體關係同樣屬於預測,資料未提供實驗條件或證據細節。因而不宜將其解讀為已證實的細胞定位,亦不能據此補充複合體中的具體角色或互作方式。
Promoter 與基因調控
>TRBJ2-2 ENST00000390413 GRCh38 chr7:142795560-142796660 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCATTTTAATTCACTGCCTTTGTCTTTTCCAAGCCCCACACAGTCAGACTAACCTCTGCCACCTGCGCTT CCTGCCGCTGCCCAGTGGTTGGGGGAGGGGGACTAGCAGGGAGGAAACATTTTTGTATCATGGTGTAACA TTGTGGGGACTAGCGGGAGGGCACGATGATTCAGGTAGAGGAGGTGCTTTTACAAAAAACCCTGATGCAG TAAGCATCCCCACCCAGCTCAGGGAATGCAGCTACCAGGTGGGAAGAGTTCTCTGGGGCTGGTCCCAGCT GTGGTCTTGCAGGGTCCCCCAACCCAGCGAGCACCTGTCCATCTCCCTGTCCAGACTCGGCTTCCAAGGA ATAAGAAGGCCAAGACAGCAAAGTGGGATTATCACTCAGCACTTTTAATAAAACTTGTTCTTGACAAAGT ACTTGCACATGCATTATTTATTAAGAACTGATGAAAACCCTGAGGGAAAGATATTGTCCCATCTTTCCAA TGAGGAAACTGAGATCAGAGGTTACAGGTCATATAACTAGGAAACGGCAAGGTCTAGCCTGCAATATCGC CCAGCTCCAGCCGTTCCAGTACCACCAATGCCCCTTCAGATTTCAAATCCACTGTGTTGTCCCCCAGCCA AGTGGATTCTCCTCTGCAAATTGGTGGTGGCCTCATGCAAGATCCAGGTTACCGTGTCCAGCTAACTCGA GACAGGAAAAGATAGGCTCAGGAAAGAGAGGAAGGGTGTGCCCTCTGTCTGTGCTAAGGGAGGTGGGGAA GGAGAAGGAATTCTGGGCAGCCCCTTCCCACTGTGCTCCTACAATGAGCAGTTCTTCGGGCCAGGGACAC GGCTCACCGTGCTAGGTAAGAAGGGGGCTCCAGGTGGGAGAGAGGGTGAGCAGCCCAGCCTGCACGACCC CAGAACCCTGTTCTTAGGGGAGTGGACACTGGGCAATCCAGGGCCCTCCTCGAGGGAAGCGGGGTTTGCG CCAGGGTCCCCAGGGCTGTGCGAACACCGGGGAGCTGTTTTTTGGAGAAGGCTCTAGGCTGACCGTACTG GGTAAGGAGGCGGTTGGGGCTCCGGAGAGCTCCGAGAGGGCGGGATGGGCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_944N9J · enhancer · 142793185–142793608 · regulatory
ENSR7_B33C6H · promoter · 142798172–142798745 · regulatory
ENSR7_CJ6KR · enhancer · 142798746–142799823 · regulatory
· motif · 142795650–142795660 · motif
· motif · 142797207–142797224 · motif
· motif · 142797493–142797506 · motif
· motif · 142797587–142797594 · motif
· motif · 142797878–142797891 · motif
· motif · 142797883–142797895 · motif
· motif · 142798230–142798243 · motif
· motif · 142798236–142798249 · motif
· motif · 142798678–142798690 · motif
· motif · 142800298–142800311 · motif
· motif · 142800298–142800311 · motif
· motif · 142800461–142800483 · motif
基因座與轉錄註解
TRBJ2-2 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390413 ★ | TR_J_gene | 51 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBJ2-2 被預測可能參與適應性免疫反應,可能位於質膜,並可能為 T cell receptor complex 的一部分;這些描述屬於預測,來源未提供更具體的作用機制或證據細節。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in adaptive immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
CGAACACCGGGGAGCTGTTTTTTGGAGAAGGCTCTAGGCT40GACCGTACTGG51cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。