演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

TRBJ1-6TRBJ16

T cell receptor beta joining 1-6

TRBJ1-6(T cell receptor beta joining 1-6)是人類的 T cell receptor gene;來源預測它可能參與適應性免疫反應,並可能是 T cell receptor complex 的一部分。

Homo sapiens7q34
OFFICIAL SYMBOL
TRBJ1-6
CHROMOSOME
7
LOCUS TYPE
TR_J_gene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TRBJ1-6 的正式名稱為 T cell receptor beta joining 1-6,屬於 T cell receptor gene。現有資料將其分類為受體基因,但未提供其 RNA 或蛋白質產物的詳細性質、家族結構特徵或分子組成,因此無法據此進一步描述這些面向。資料所列的生物學角色仍帶有預測性:它可能與適應性免疫反應及 T cell receptor complex 有關;這些預測不等同於已確認的作用。

Official symbol
TRBJ1-6
Gene name
T cell receptor beta joining 1-6
Organism
Homo sapiens
Gene type
T cell receptor gene
HGNC ID
HGNC:12167
Locus type
T cell receptor gene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TRBJ16TCRBJ1S6

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q34
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegTRBJ1-6pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:142,788,988–142,789,040
Gene span
53 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000633713 ★142,788,988–142,789,0401

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前可用資料對 TRBJ1-6 的功能描述屬預測性質,並未提供實驗細節或分子作用機制。來源預測,此基因可能參與適應性免疫反應;因此,這項描述只指出可能的生物學關聯,不能視為已證實其在免疫反應中的具體作用或因果關係。

來源也預測 TRBJ1-6 可能位於質膜,並可能是 T cell receptor complex 的一部分。資料未進一步說明其在複合體中的位置、互作方式、作用對象,或是否會因細胞狀態而改變。由於所提供的註記僅列出預測可能性,不能據此推定該基因產物具有特定的結合功能或複合體組成角色。

綜合而言,現有資訊僅支持將 TRBJ1-6 與適應性免疫反應、質膜定位及 T cell receptor complex 的可能關聯列為預測;未提供更細緻的功能證據或條件說明,故不宜延伸推論其具體機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 142788988 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TRBJ1-6 ENST00000633713 GRCh38 chr7:142787988-142789088 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TACCGTTTCTCTCCCTCACACAGAAAGGAGAAGGTCACAGAAGAGGGAACTTGGGGGATCACACGGGGCC
TAATTGGTCTGCTGACCACCGCATTTTGGGTTGTACCATTGTCTACCCCTCTACCCACCAGGGTTAAAAT
TCTACTAAGGAACAGGAGAGGACCTGGCAGGTGGACTTGGGGAGGCAGGAGTGGAAGGCAGCAGGTCGCG
GTTTTCCTTCCAGTCTTTAATGTTGTGCAACTAATGAAAAACTGTTTTTTGGCAGTGGAACCCAGCTCTC
TGTCTTGGGTATGTAAAAGACTTCTTTCGGGATAGTGTATCATAAGGTCGGAGTTCCAGGAGGACCCCTT
GCGGGAGGGCAGAAACTGAGAACACAGCCAAGAAAAGCTCATAAAATGTGGGTCAGTGGAGTGTGTGGTG
GGGCCCCAAGAGTTCTGTGTGTAAGCAGCTTCTGGAAGGAAGGGCCCACACCAGCTCCTCTGGGGTTTGC
CACACTCATGATGCACTGTGTAGCAATCAGCCCCAGCATTTTGGTGATGGGACTCGACTCTCCATCCTAG
GTAAGTTGCAGAATCAGGGTGGTATGGCCATTGTCCCTTGAAGGCAGAGTTCTCTGCTTCTCCTCCCGGT
GCTGGTGAGGCAGATTGAGTAAAATCTCTTACCCCATGGGGTAAGAGCTGTGCCTGTGCCTGCGTTCCCT
TTGGTGTGTCTTGGTTGACTCCTCTATTTCTCTTCTCTAAGTCTTCAGTCCATAATCTGCCTCCTCACTC
CCTTCTTGGCTCATCCTCCCTCTTATGTGCATGGCTCTGCCTCTCCTAAGCCTCTTCCTCTTGCGCCTTA
TGCTGCACAGTATGCTTAGGCCTTTTTCCTAACAGAATCCCTTTGGTCCAGAGCCATGAATCCAGGCAGA
GAAAGGCAGCCATCCTGCTGTCAGGGAGCTAAGACTTGCCCTCTGACTGGAGATCGCCGGGTGGGTTTTA
TCTAAGCCTCTGCAGCTGTGCTCCTATAATTCACCCCTCCACTTTGGGAATGGGACCAGGCTCACTGTGA
CAGGTATGGGGGCTCCACTCTTGACTCGGGGGTGCCTGGGTTTGACTGCAA
TRBJ1-6 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_867CCS · enhancer · 142784228–142784418 · regulatory

ENSR7_944N7D · enhancer · 142785832–142786208 · regulatory

ENSR7_7BDP22 · enhancer · 142790645–142790764 · regulatory

ENSR7_944N9J · enhancer · 142793185–142793608 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

T cell receptor gene

TRBJ1-6 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000633713 ★TR_J_gene53 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能來源預測 TRBJ1-6 可能參與適應性免疫反應、位於質膜,並屬於 T cell receptor complex 的一部分;這些敘述均為預測,並非已確認的功能或定位。推論支持
證據與來源

Predicted to be involved in adaptive immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000633713 · 53 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCCTATAATTCACCCCTCCACTTTGGGAATGGGACCAGG40
41CTCACTGTGACAG53

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。