基因總覽
TRBJ1-2 的正式名稱為 T cell receptor beta joining 1-2,屬於 T cell receptor gene。現有資料將其列為 T 細胞受體基因,並預測其產物可能是 T cell receptor complex 的一部分。資料未提供其產物的分子形式、序列或結構細節,因此無法進一步描述蛋白質或 RNA 的特性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000633553 ★ | 142,787,017–142,787,064 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料將 TRBJ1-2 與適應性免疫反應相連,但此功能註記帶有預測性質,並未提供具體參與步驟或實驗條件。因此,現有資訊支持的功能描述限於它可能參與適應性免疫反應,不能據此判定其作用方式或對免疫反應造成的具體影響。
資料也預測 TRBJ1-2 可能位於質膜,並可能是 T cell receptor complex 的一部分。這些敘述指出可能的細胞位置及複合體關聯,但沒有說明其定位或複合體組成如何得到驗證,也未提供與其他分子的結合、訊號傳遞或調控機制。
Promoter 與基因調控
>TRBJ1-2 ENST00000633553 GRCh38 chr7:142786017-142787117 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CATCCTGAGGACAGTGCCTGGAGGTGAGAAGGAAGCCCCCGGCCTGGTCCATACCCCACCACCAACTTGC ATAATGGGGGGTGATGTCACCCACCCTCCACTCCCCTCAAAGGAGCAGCTGCTCTGGTGGTCTCTCCCAG GCTCTGGGGGCGGACCCATGGGAGGGGCTGTTTTTGTACAAAGCTGTAACATTGTGGGGACAGGGGGCCA CAATGATTCAACTCTACGGGAAACCTTTACAAAAACCTCTCTGGCGGTCCCAACTCCCAGAGTCCTCTTC TTTCCTCCTGGGTCACAGGTCTTAATGCAATTTGGTTCAGAATGCCTCTGCCTCACTCCTGATCACATGT CAGACCAAGACTGTGGACAAGGACAGGCCCAGATGAGAACTAAAGCTTCCCAGGCAGAGAGAGGTCAGAC ATAAGAAGACTGCCTCAGGAACCTCACAAGTGGAGGACTCAGGGAGGGTCCCAATCCCCAAAAATTGAGA CAAAGTCAGGTGGAAGGTTCATCGGAGGTGACCAGCTCTCCAGAGGACTCGGGAAGAAGTCAGGGGTATC TATAGATGGAGTCACAGGTTCTGGGCCCCTGCCATCCTCTGCAGGCCATGCACTTTCCCTTTCGATGGAC CCTCACAGAGGGAGCATCTGAATGGGGCATCCTTTGAAAAAGGAACCTAGGACCCTGTGGATGGACTCTG TCATTCTCCATGGTCCTAAAAAGCAAAAGTCAAAGTGTTCTTCTGTGTAATACCCATAAAGCACAGGAGG AGATTTCTTAGCTCACTGTCCTCCATCCTAGCCAGGGCCCTCTCCCCTCTCTATGCCTTCAATGTGATTT TCACCTTGACCCCTGTCACTGTGTGAACACTGAAGCTTTCTTTGGACAAGGCACCAGACTCACAGTTGTA GGTAAGACATTTTTCAGGTTCTTTTGCAGATCCGTCACAGGGAAAAGTGGGTCCACAGTGTCCCTTTTAG AGTGGCTATATTCTTATGTGCTAACTATGGCTACACCTTCGGTTCGGGGACCAGGTTAACCGTTGTAGGT AAGGCTGGGGGTCTCTAGGAGGGGTGCGATGAGGGAGGACTCTGTCCTGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_B33C4B · enhancer · 142782911–142783832 · regulatory
ENSR7_538KQP3 · CTCF_binding_site · 142783129–142783150 · regulatory
ENSR7_538KQQP · CTCF_binding_site · 142783493–142783514 · regulatory
ENSR7_867CCS · enhancer · 142784228–142784418 · regulatory
ENSR7_944N7D · enhancer · 142785832–142786208 · regulatory
ENSR7_7BDP22 · enhancer · 142790645–142790764 · regulatory
· motif · 142782823–142782834 · motif
· motif · 142782999–142783015 · motif
· motif · 142783131–142783147 · motif
· motif · 142783236–142783249 · motif
· motif · 142783236–142783249 · motif
· motif · 142783245–142783259 · motif
· motif · 142783393–142783404 · motif
· motif · 142783393–142783404 · motif
· motif · 142783495–142783511 · motif
· motif · 142783500–142783516 · motif
基因座與轉錄註解
TRBJ1-2 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000633553 ★ | TR_J_gene | 48 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBJ1-2 預測可能參與適應性免疫反應;其產物也預測可能位於質膜,並可能是 T cell receptor complex 的一部分。這些均為預測性註記,未提供具體作用機制或實驗條件。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in adaptive immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
CTAACTATGGCTACACCTTCGGTTCGGGGACCAGGTTAAC40CGTTGTAG48cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。