基因總覽
TRBD1 的正式名稱為 T cell receptor beta diversity 1,分類為 T cell receptor gene。現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物的性質、家族歸屬或結構特色,因此不據此補述。資料庫摘要僅預測它可能與適應性免疫反應及 T cell receptor complex 有關,相關定位與角色仍屬預測。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000632684 ★ | 142,786,213–142,786,224 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料將 TRBD1 與適應性免疫反應相連,但這項功能描述屬預測,未提供作用機制或實驗細節。資料亦預測 TRBD1 可能位於質膜,並可能是 T cell receptor complex 的一部分;這些定位與複合體關係同樣不是已確證的結論。
Promoter 與基因調控
>TRBD1 ENST00000632684 GRCh38 chr7:142785213-142786313 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCAGTTTCTGTTGTATCTTTACAGTGTTTCTGTATACAAAATGTATACAAAATCAAGTAAATACAAAAGT ATAATTCTTCTTTTCCCCCCTCTGTTAGACAAAGGTGGCATCTAGTTATGCTATTCTGAGACTTTCTCTT TTCTGGGTTAATAATGTATCTTAGAGAATTTTCCATAGCAATATAAAATATTTTGATTCTTTTTTTAGCA TTGAATATTACTCCATTGTGTGAACATATCACAGTTTATCCAGTCCCTTACTGATGGGCATATAATTCAA TTTTGTCAGTCAAATTAGTGAAAAGTGTATTTTGATGAAGTTTTTTTAATTTTATTTTTCTTATTGTGAT TTTTTTTCCCTTATAGTTAGGTACCATTTGGATTTATTTTTCTCTGAACAATTTACTCTTCACCTATTTT TATTGGGCTGCTGGATTATTTTCCTATTGATTTTTAGGAGTTCACCACATGTTGAGGAGATTAGCCCTGA TGGTGAGAACTAGGAATATTTTTCCCAGATTGTTATGTATATTTTGATTCTGTTTATATTTTACCATGCG AGTGTGTCATCATTATGTCGTTGTTTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGATTTTAAGTCATAGCTTAAAA CCCTCCGAGTGACGCACAGCCTCGGGGCAGGGCCAGGGTAGTGATGGGGGCTGTGGCTTCTCTATAAGGA CATGCCCCAACGTGACAACAGCTTGGAGAGGGGTGGGTACTGGAGAAGACCAGCCCCTTCGCCAAACAGC CTTACAAAGACATCCAGCTCTAAGGAGCTCAAAACATCCTGAGGACAGTGCCTGGAGGTGAGAAGGAAGC CCCCGGCCTGGTCCATACCCCACCACCAACTTGCATAATGGGGGGTGATGTCACCCACCCTCCACTCCCC TCAAAGGAGCAGCTGCTCTGGTGGTCTCTCCCAGGCTCTGGGGGCGGACCCATGGGAGGGGCTGTTTTTG TACAAAGCTGTAACATTGTGGGGACAGGGGGCCACAATGATTCAACTCTACGGGAAACCTTTACAAAAAC CTCTCTGGCGGTCCCAACTCCCAGAGTCCTCTTCTTTCCTCCTGGGTCACA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_B33C4B · enhancer · 142782911–142783832 · regulatory
ENSR7_538KQP3 · CTCF_binding_site · 142783129–142783150 · regulatory
ENSR7_538KQQP · CTCF_binding_site · 142783493–142783514 · regulatory
ENSR7_867CCS · enhancer · 142784228–142784418 · regulatory
ENSR7_944N7D · enhancer · 142785832–142786208 · regulatory
ENSR7_7BDP22 · enhancer · 142790645–142790764 · regulatory
· motif · 142782823–142782834 · motif
· motif · 142782999–142783015 · motif
· motif · 142783131–142783147 · motif
· motif · 142783236–142783249 · motif
· motif · 142783236–142783249 · motif
· motif · 142783245–142783259 · motif
· motif · 142783393–142783404 · motif
· motif · 142783393–142783404 · motif
· motif · 142783495–142783511 · motif
· motif · 142783500–142783516 · motif
基因座與轉錄註解
TRBD1 依 HGNC/Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000632684 ★ | TR_D_gene | 12 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRBD1 預測可能參與適應性免疫反應,也預測可能位於質膜並成為 T cell receptor complex 的一部分;這些描述均屬預測。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in adaptive immune response. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of T cell receptor complex. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
GGGACAGGGGGC12cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。