基因總覽
TRB 是蛋白質編碼基因，其來源資料描述的產物為 M1-specific T cell receptor beta chain，屬於 αβ T 細胞受體的 β 鏈。此 β 鏈與相應的 α 鏈組成異源二聚體，並與 CD3 蛋白共同形成細胞表面的 T 細胞受體複合體。蛋白質全長 310 個胺基酸，具有 Ig-like V-type 與 Ig-like C1-type 結構域，並包含可變區、接合區、恆定區及跨膜區等部分。可變區中的 CDR1、CDR2 與 CDR3 是其重要序列區域；其中 CDR3-beta 參與抗原辨識。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
帶型資料未取得，未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
資料描述的 TRB β 鏈屬於一種特定的 αβ T 細胞受體 clonotype，能辨識流感 A 病毒（IAV）matrix protein 1 的免疫優勢表位 GILGFVFTL；此胜肽由 HLA-A*02:01 呈現。這種 clonotype 被歸類為 public TCR clonotype，在多位 HLA-A*02:01 個體的效應記憶 CD8 陽性 T 細胞中較常被選出，並與對 IAV 感染的長期免疫相關。它也能藉由分子模仿交叉辨識偶爾出現的 IAV 變異株，因而可對不同流感病毒株誘發免疫反應。
抗原辨識會促使細胞表面的 TR-CD3 聚集，並啟動細胞內 LCK。LCK 磷酸化 CD3G、CD3D、CD3E 與 CD247 的 ITAM 基序，促成 ZAP70 招募；接著 ZAP70 磷酸化 LAT，使多種訊號分子聚集形成 LAT signalosome。這些步驟將受體辨識轉換為細胞內訊號傳遞。
LAT signalosome 進一步分流至三條主要路徑：鈣訊號、mitogen-activated protein kinase（MAPK）激酶路徑，以及 nuclear factor NF-kappa-B（NF-kB）路徑。這些訊號促使轉錄因子動員，支持基因表現，並對 T 細胞分化為效應與記憶 T 細胞具有重要作用。上述訊號傳遞細節標示為 By similarity；其推論性質應與特定 clonotype 的辨識及免疫描述區分。
Promoter 與基因調控
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：310 aa
蛋白質長 310 個胺基酸，含 Ig-like V-type 與 Ig-like C1-type 結構域。序列註解標示可變區、接合區及恆定區，並在可變區辨識出 CDR1、CDR2 與 CDR3；另有 21 個胺基酸的訊號序列、跨膜區及細胞質拓撲區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
此蛋白質定位於細胞膜。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
TRB β 鏈與 TRAV27*01J42*01C*01 α 鏈形成由二硫鍵連結的異源二聚體。受體主要透過 CDR3-beta 與 HLA-A*02.01 所呈現的 GILGFVFTL 胜肽互動，採用「peg-notch」辨識模式。αβ 受體另與 CD3 蛋白組裝成穩定的八聚體複合體；此組裝於內質網進行，包含一個 αβ 異源二聚體、一個 CD3D-CD3E 異源二聚體、一個 CD3G-CD3E 異源二聚體及一個 CD247 同源二聚體。CD3G-CD3E 優先透過跨膜區與 β 鏈關聯；CD247 同源二聚體最後加入，且此步驟為複合體運送至細胞表面所必需。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 此 TRB β 鏈屬於特定 αβ T 細胞受體 clonotype，可辨識由 HLA-A*02:01 呈現的流感 A 病毒 matrix protein 1 免疫優勢表位 GILGFVFTL。此 public TCR clonotype 在多位 HLA-A*02:01 個體的效應記憶 CD8 陽性 T 細胞中較常被選出，並與對 IAV 的長期免疫相關；它也能藉分子模仿交叉辨識偶發 IAV 變異株。抗原辨識啟動 TR-CD3 聚集及 LCK、ZAP70、LAT 訊號傳遞，帶動鈣、MAPK 激酶與 NF-kB 路徑，促進轉錄因子動員及效應／記憶 T 細胞分化。 | 含實驗來源 | 證據與來源The beta chain of TRAV27*01J42*01C*01/TRBV19*01J2S7*01C*02 alpha-beta T cell receptor (TR) clonotype that is specific for HLA-A*02:01-restricted M/matrix protein 1 immunodominant epitope GILGFVFTL of influenza A virus (IAV). Classified as a public TCR clonotype, it is preferentially selected in effector memory CD8-positive T cells among multiple HLA-A*02:01 carriers/individuals and confers long-lived immunity against IAV infection. Can cross-recognize sporadically emerging IAV variants by molecular mimicry, inducing immunity toward different influenza strains. Antigen recognition initiates TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247 enabling the recruitment of ZAP70. In turn, ZAP70 phosphorylates LAT, which recruits numerous signaling molecules to form the LAT signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB) pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are critical for gene expression and essential for T cell differentiation into effector/memory T cells (By similarity) PMID 12796775 ↗ · PMID 18275829 ↗ · PMID 1833769 ↗ · PMID 27036003 ↗ · PMID 29997621 ↗ · PMID 7807026 ↗ |
| 交互作用 | TRB β 鏈與 TRAV27*01J42*01C*01 α 鏈形成二硫鍵連結的異源二聚體，並主要透過 CDR3-beta 以「peg-notch」模式辨識 HLA-A*02.01 呈現的 GILGFVFTL。αβ 受體與 CD3 蛋白在內質網組裝為穩定八聚體，組成包括一個 CD3D-CD3E 異源二聚體、一個 CD3G-CD3E 異源二聚體及一個 CD247 同源二聚體；CD3G-CD3E 優先與 β 鏈的跨膜區關聯。CD247 同源二聚體最後加入，且此步驟為複合體運送至細胞表面所必需。 | 含實驗來源 | 證據與來源Disulfide-linked heterodimer with TRAV27*01J42*01C*01 alpha chain. The TR primarily interacts via its CDR3-beta domain with M/matrix protein 1-derived peptide (GILGFVFTL) displayed by HLA-A*02.01 in a 'peg-notch' recognition mode. The alpha-beta TR associates with the transmembrane signaling CD3 coreceptor proteins to form the TR-CD3 (TCR). The assembly of alpha-beta TR heterodimers with CD3 occurs in the endoplasmic reticulum where a single alpha-beta TR heterodimer associates with one CD3D-CD3E heterodimer, one CD3G-CD3E heterodimer and one CD247 homodimer forming a stable octameric structure. CD3D-CD3E and CD3G-CD3E heterodimers preferentially associate with TR alpha and TR beta chains (via TM domain), respectively. The association of the CD247 homodimer is the last step of TCR assembly in the endoplasmic reticulum and is required for transport to the cell surface (By similarity) PMID 12796775 ↗ · PMID 18275829 ↗ · PMID 27036003 ↗ |
| 細胞定位 | 此蛋白質定位於細胞膜。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。