基因總覽
TRAV8-6 的正式名稱為 T cell receptor alpha variable 8-6，屬於 T cell receptor gene。T 細胞受體由兩條鏈組成，可為 α 與 β 鏈，或 δ 與 γ 鏈；其 α、δ 基因座包含可變區（V）、接合區（J）及恆定區（C）片段。TRAV/DV 符號所涵蓋的可變區片段可用於 α 鏈或 δ 鏈。NCBI 摘要描述的是 T 細胞受體 α、δ 基因座的生殖系排列，並指出 α 基因座中有些 V 與 J 片段不能編碼蛋白質、屬於假基因；資料未單獨說明 TRAV8-6 本身的蛋白質產物或結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390443 ★ | 21,978,459–21,979,120 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
T 細胞受體辨識外來抗原時，所辨識的是經處理成小型胜肽，並結合於抗原呈現細胞表面主要組織相容性複合體（MHC）分子的抗原。受體由 α、β 鏈或 δ、γ 鏈構成；TRAV/DV 類可變區片段可參與 α 鏈或 δ 鏈的組成。這些片段的重組有助於形成具不同抗原辨識能力的受體。
在單一細胞中，T 細胞受體基因座依序進行重排與表現：δ、γ、β，接著是 α。若 δ 與 γ 重排皆產生功能性鏈，細胞便表現 δ、γ 受體；若未能如此，才繼續重排 β 與 α 基因座。這段發育順序說明，α 鏈的重組與表現發生在特定條件下，而非所有細胞都必然進入同一結果。
α 鏈由一個 V 片段與一個 J 片段在 DNA 層級重組形成；δ 鏈則先由 D 與 J 片段接合，再由 V 片段接上 D-J 基因。兩種鏈的 C 片段之後都透過 RNA 層級的剪接接合。多種 V 片段與數個 J 片段的不同組合，提供受體辨識多樣性的來源；此外，末端去氧核苷酸轉移酶隨機加入核苷酸，可在接合處再增加序列變化。來源指出，α 基因座中有些 V、J 片段不能編碼蛋白質，因而歸類為假基因。
Promoter 與基因調控
>TRAV8-6 ENST00000390443 GRCh38 chr14:21977459-21978559 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAATTATTATTACTAACTCATTTCCAGAACTCATTATTAGTCTGTTCAGGTTTTCAATTTCTTCTTGGT TGAATATATAGAGGTTATTTTCTTCCAGGAATTTATTCGTTTTCTCCAGGTTTTCTAATTTTTATGAATA GTGGTGTTCCTAGTATTCTCTTAGGGTCTTTTGTATTTCTATGGGATCAATTGTAATGTCTCCTTTGTCA TTTCTGATTGTGCTTATTTGGAACTTCTCTCTTATTTTCTTCATTAACCTACTTAGTGGTGTATCAATCT TGTTTATTCTTCCTGAAAGACAACTTTTGGTTTTATTGATCCTCTGTATGGATTTTCAAGTCTCAATTTT GTTCAGTTCTTTTCTGATTTTGTTTATTTATTTTCTTCTGCTAGCTTTTGGCTTTGTTTGTTCTTCTTTT TCTAGTCCTTCTAATTGTGATGCTAGAATGCTCACTTGAGATCTTTCTAATTTCTTGATATAAGTATTTA GCAGTATAAACTTTCCTATTAACACCTTTAGCTGCAAACCAAAGACTCTGGAATTTTGTCTTTCTGTTTT CATTAATTTTTGCTCTACTTTGTTGTTTACCCAAAAGTCATTGAGGAGCAAGTTGTTTAATTTCCGTGTA ACTGTGTGGTTTTGAGAGATCTCCTTGGTAATGATTTCCATTTTTATTACACTGTGGTCCAAGATTATGC TTGGTATGATTTTGGTATTTTTGAATTTATTGCAATTTGCTTTATGGCTTCAATTTCTCAATAATTTTGA GATTAATATCATGTACTATACAGAAGGTAACATCATCACAGATTCAGGAGGAAAGAAACGCTTTCTGTTG AAGTTTTGATATCATGTCTGAAATGAGAAGGAAACAGCTTGCTCCCTTGGATCCGTGGTTCCTCCTGTTG CCTCTAGAGGGCGATGTTGCATCAAGTAGGCATCTGTTTTCATCGCAGACCATCCTCATCCATTGAGCCT CCTCCCTGTAGCTGGCTGATGTAGCTCGTTGATGTCTGTGTGGATAGGGAGCTGTGACGAGAGCAAGAGG TCAGAACACATCCAGGCTCCTTAAGGGAAAGCCTCTTTCTGTTTCTGAAAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_9BPJH · enhancer · 21978263–21978655 · regulatory
ENSR14_576KKP · CTCF_binding_site · 21978365–21978386 · regulatory
· motif · 21978367–21978383 · motif
基因座與轉錄註解
TRAV8-6 依 HGNC／Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390443 ★ | TR_V_gene | 561 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | T 細胞受體辨識的是經處理成小型胜肽、並結合於抗原呈現細胞表面 MHC 分子的外來抗原。受體由 α、β 鏈或 δ、γ 鏈組成；單一細胞的基因座依序重排 δ、γ、β、α，若 δ 與 γ 均形成可用功能鏈，便表現這兩條鏈，否則繼續重排 β 與 α。α、δ 基因座含 V、J、C 片段，δ 基因座另有 D 片段且位於 α 基因座的 V、J 片段之間。α 鏈由 V-J 重組形成，δ 鏈先 D-J 再接 V；兩者的 C 片段之後經 RNA 剪接接合。多種 V 與數個 J 的組合，以及末端去氧核苷酸轉移酶隨機加入核苷酸所造成的接合多樣性，擴大抗原辨識範圍。五個可變片段可用於 α 或 δ 鏈，並以 TRAV/DV 符號描述；α 基因座的若干 V、J 片段不能編碼蛋白質，屬於假基因。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源T cell receptors recognize foreign antigens which have been processed as small peptides and bound to major histocompatibility complex (MHC) molecules at the surface of antigen presenting cells (APC). Each T cell receptor is a dimer consisting of one alpha and one beta chain or one delta and one gamma chain. In a single cell, the T cell receptor loci are rearranged and expressed in the order delta, gamma, beta, and alpha. If both delta and gamma rearrangements produce functional chains, the cell expresses delta and gamma. If not, the cell proceeds to rearrange the beta and alpha loci. This region represents the germline organization of the T cell receptor alpha and delta loci. Both the alpha and delta loci include V (variable), J (joining), and C (constant) segments and the delta locus also includes diversity (D) segments. The delta locus is situated within the alpha locus, between the alpha V and J segments. During T cell development, the delta chain is synthesized by a recombination event at the DNA level joining a D segment with a J segment; a V segment is then joined to the D-J gene. The alpha chain is synthesized by recombination joining a single V segment with a J segment. For both chains, the C segment is later joined by splicing at the RNA level. Recombination of many different V segments with several J segments provides a wide range of antigen recognition. Additional diversity is attained by junctional diversity, resulting from the random additional of nucleotides by terminal deoxynucleotidyltransferase. Five variable segments can be used in either alpha or delta chains and are described by TRAV/DV symbols. Several V and J segments of the alpha locus are known to be incapable of encoding a protein and are considered pseudogenes. |
DNA 與 RNA 序列
GTAGCTCGTTGATGTCTGTGTGGATAGGGAGCTGTGACGA40GAGCAAGAGGTCAGAACACATCCAGGCTCCTTAAGGGAAA80GCCTCTTTCTGTTTCTGAAACTTTTCAAAGCCAGGGACTT120GTCCAATCCAACCTCCTCACAGTTCCTAGCTCCTGAGGCT160CAGCGCCCTTGGCTTCTGTCCGCCCAGCTTAAGGTCCTGC200AGCATTGCCACTGCTCAGCCATGCTCCTGCTGCTCGTCCC240AGCGTTCCAGGTGATTTTTACCCTGGGAGGAACCAGAGCC280CAGTCTGTGACCCAGCTTGACAGCCAAGTCCCTGTCTTTG320AAGAAGCCCCTGTGGAGCTGAGGTGCAACTACTCATCGTC360TGTTTCAGTGTATCTCTTCTGGTATGTGCAATACCCCAAC400CAAGGACTCCAGCTTCTCCTGAAGTATTTATCAGGATCCA440CCCTGGTTGAAAGCATCAACGGTTTTGAGGCTGAATTTAA480CAAGAGTCAAACTTCCTTCCACTTGAGGAAACCCTCAGTC520CATATAAGCGACACGGCTGAGTACTTCTGTGCTGTGAGTG560A561cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。