基因總覽
TRAV32 的正式名稱為 T cell receptor alpha variable 32 (pseudogene)，屬於 T cell receptor pseudogene。這個分類表示它是 T cell receptor alpha variable 位點中的假基因，而非可據此描述為具有功能性蛋白質產物的基因。其基因座位於人類第 14 號染色體的 14q11.2。可用資料未提供 TRAV32 的 RNA、蛋白質結構或其他專屬分子特徵，因此不進一步推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000553993 ★ | 22,185,562–22,186,057 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
T cell receptor 可辨識外來抗原；這些抗原先被處理成小型胜肽，並與主要組織相容性複合體（MHC）分子結合，呈現在抗原呈現細胞（APC）表面。T cell receptor 通常由一條 alpha 鏈與一條 beta 鏈，或一條 delta 鏈與一條 gamma 鏈組成。來源描述的是 T cell receptor alpha 與 delta 位點的一般組織和重組方式，並未提供 TRAV32 個別參與抗原辨識的證據。
在單一細胞中，T cell receptor 位點依序進行重排與表現：delta、gamma、beta，最後為 alpha。若 delta 與 gamma 的重排都產生功能性鏈，細胞便表現 delta 與 gamma；若未產生功能性鏈，則繼續重排 beta 與 alpha 位點。alpha 與 delta 位點都包含 V（可變）、J（接合）及 C（恆定）片段；delta 位點另有 D（多樣性）片段，且位於 alpha 位點內、介於 alpha 的 V 與 J 片段之間。
T 細胞發育時，delta 鏈先在 DNA 層級將 D 片段與 J 片段重組，再接上 V 片段；alpha 鏈則由單一 V 片段與 J 片段重組形成。兩種鏈的 C 片段其後都透過 RNA 層級的剪接接合。不同 V 片段與多個 J 片段的組合，能擴大可辨識抗原的範圍；末端去氧核苷酸轉移酶隨機加入核苷酸，也會形成接合區多樣性，進一步增加變化。
部分可用於 alpha 或 delta 鏈的可變片段以 TRAV/DV 符號表示。來源指出，alpha 位點中有數個 V 與 J 片段無法編碼蛋白質，因而歸類為假基因；但沒有指明其中哪些片段包括 TRAV32，也未描述 TRAV32 的個別功能。
Promoter 與基因調控
>TRAV32 ENST00000553993 GRCh38 chr14:22184562-22185662 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTTTCTTTGACTATGAGTTTATCTTTCCTGCCAGATCCAAAATGACTAATAAAATGAGAGATACAGTCA GTCTAGACTCGAACCAGGAAGAGTCTCTAAAATCCAAATGAGTAACTCTAATGGTCTCTCTGAAGACTCT GCACTGTTGCTTCTTTAAAGATAAACATTAAAATAGAAACCCGCATCTCTAATAAAATATTTGTCTTTCC CAGACTTTCTTGAGAGTGAGTCTGGAGTGACCATTTTGTGGTAACAGATCATCATTTGGGGTTATTATTT AAGCACCAGTTCCCTCATATTTGTGCTGTCAGTCACTTCCTCAAAGCTTCCCATTCAGTATGTTTTAACT TAAGACTCAGAAGGACACATTGATGATAAGAAGTTTCTCAGTGGGTCTGAAGCTTAGCTCCAACACTGCT TGTCTTAGAATAGAGACTTTATCTTACTAGGACACCAAAGAAGACTGTTACTACATGGCATGAATATCTG CTTCTTCTTTATTTAAAAAAAAAAAGTGCAGAAGGCATCAATGGATAACATTCTCTATGTTTTCATTTGA GTCTAGTAGTTTTCTGTTCTTACTTTGTACTGTCAGGCTTTTTTTCCCCTTATATCTACCTTAAACCCTA TAAAGAACTACTACAGATCAGAAACTTTAAATGCAAGATCTGTAACTTAATCACCAGAAATATAAACCAG AAATATGACTTTCTACTAATTTCCTACTTGTGAAGTAAGATGTTCTAAGGGATAGGCAGACATGCCAGCT CTCCTTCTAAAGACAGAATGTGTGTTATACACGTGGCCTTGGCAATTAGAGGTCTGTACACAGGATGGCA GCACTTCATTTTCACATGCAGAGAAATGGAATGTTCAACTCTGTTGGGCAGAGCATAGCTTGTCTCCTAT TGGCTTATAGCCAGGTTAAGAAAGAGCAAGAATACACTGAGAATAGAATATGTTCTCCTTCCCAGATAGT ATAGATCATTGATGATTCTAATGGCAAGAAGAATGGAAAAGTCCCTGGGAGCTTTATTCAAATTCAGCTG AAGCGTAAGTGCAGGGCTTCTGGAGGGGTCCATCACAAGTCTGGGGAAGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_B6DTK · enhancer · 22184386–22184956 · regulatory
ENSR14_8MLHQ · enhancer · 22185295–22185496 · regulatory
ENSR14_B6DWG · enhancer · 22190457–22191011 · regulatory
基因座與轉錄註解
TRAV32 依 HGNC／Ensembl 分類為 T cell receptor pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000553993 ★ | TR_V_pseudogene | 340 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | T cell receptor 辨識呈現在 APC 表面的 MHC 結合小型胜肽，通常由 alpha-beta 或 delta-gamma 鏈組成。T 細胞發育時，位點依 delta、gamma、beta、alpha 順序重排；alpha 與 delta 鏈以不同 V、J、D 片段組合形成，並經 RNA 剪接接上 C 片段。多種片段組合及末端去氧核苷酸轉移酶加入核苷酸可增加抗原辨識多樣性；alpha 位點部分 V、J 片段不能編碼蛋白質，屬假基因。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源T cell receptors recognize foreign antigens which have been processed as small peptides and bound to major histocompatibility complex (MHC) molecules at the surface of antigen presenting cells (APC). Each T cell receptor is a dimer consisting of one alpha and one beta chain or one delta and one gamma chain. In a single cell, the T cell receptor loci are rearranged and expressed in the order delta, gamma, beta, and alpha. If both delta and gamma rearrangements produce functional chains, the cell expresses delta and gamma. If not, the cell proceeds to rearrange the beta and alpha loci. This region represents the germline organization of the T cell receptor alpha and delta loci. Both the alpha and delta loci include V (variable), J (joining), and C (constant) segments and the delta locus also includes diversity (D) segments. The delta locus is situated within the alpha locus, between the alpha V and J segments. During T cell development, the delta chain is synthesized by a recombination event at the DNA level joining a D segment with a J segment; a V segment is then joined to the D-J gene. The alpha chain is synthesized by recombination joining a single V segment with a J segment. For both chains, the C segment is later joined by splicing at the RNA level. Recombination of many different V segments with several J segments provides a wide range of antigen recognition. Additional diversity is attained by junctional diversity, resulting from the random additional of nucleotides by terminal deoxynucleotidyltransferase. Five variable segments can be used in either alpha or delta chains and are described by TRAV/DV symbols. Several V and J segments of the alpha locus are known to be incapable of encoding a protein and are considered pseudogenes. |
DNA 與 RNA 序列
ATGGCAAGAAGAATGGAAAAGTCCCTGGGAGCTTTATTCA40AATTCAGCTGAAGCTGGCCAAGAAAAGGATGTGATACAGA80GTTATTCAAATCTAAATGTCTAGGAGAGAGAAATGGCCGT120TATTAATGACAGTTATACAGATGGAGCTTTGAATTATTTC160TGTTGGTACAAGAAGAAAACGGGGAAGGCCCTAATATCTT200AATGGAGATTCATTCAAATGTGGATAGAAAACAGGACAGA240AGGCTCACTGTACTGTTGAATAAAAATGCTAAACATGTCT280CCCTGCATATTACAGCCACCCAACCAGGAGACTCATTCCT320GTACTTCTGTGCAGTGAGAA340cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。