基因總覽
TRAV10 的正式名稱為 T cell receptor alpha variable 10，屬於 T cell receptor gene，位於 T cell receptor alpha 與 delta 基因座的基因組區域。此區域包含可變區（V）、接合區（J）與恆定區（C）片段；delta 基因座另含多樣性（D）片段，並位於 alpha 基因座內、介於 alpha 的 V 與 J 片段之間。TRAV/DV 名稱用於標示可供 alpha 或 delta 鏈使用的五個可變區片段之一。alpha 基因座中有些 V、J 片段已知無法編碼蛋白質，並被歸類為假基因；來源未指明 TRAV10 本身是否屬於此類。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000390432 ★ | 21,825,472–21,826,075 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
T cell receptor 的功能，是辨識抗原呈現細胞表面的主要組織相容性複合體（MHC）分子所呈現的小型外來胜肽。受體由兩條鏈組成，可為 alpha 與 beta 鏈，或 delta 與 gamma 鏈。TRAV10 所屬的可變區片段參與受體多樣性的形成；來源描述的是 alpha/delta 基因座整體的重組機制，並未單獨說明 TRAV10 的特定分子作用或辨識對象。
T cell 發育期間，受體基因座依序進行重組與表現：delta、gamma、beta，接著是 alpha。若 delta 與 gamma 的重組都產生功能性鏈，細胞便表現 delta/gamma 受體；若否，則繼續重組 beta 與 alpha 基因座。delta 鏈先由 DNA 層級的 D 與 J 片段接合，再將 V 片段接到 D-J 基因；alpha 鏈則由單一 V 片段與 J 片段接合形成。兩種鏈的 C 片段之後都會在 RNA 層級透過剪接接上。
多個 V 片段與數個 J 片段的不同組合，可擴大抗原辨識範圍；接合處的多樣性則提供額外變化，來源將其歸因於 terminal deoxynucleotidyltransferase 隨機添加核苷酸。這些機制描述的是受體基因座如何產生多樣性，不能據此推定 TRAV10 單獨決定某一特定抗原的辨識。
Promoter 與基因調控
>TRAV10 ENST00000390432 GRCh38 chr14:21824472-21825572 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACGGTCTTTACCTCTAGCAAATCTTTTCCAAAAGCCTACTTTGCTTATACAACTATAATATACCAACTTT CTTTTTATTGTTTCTTGTATAACTATTTCCATTCTTTCAACTTCTCTGAGCTTTAAATTTCAAACTTAAA ATAAATCCTCATATATCTACACTCTCAACTGTTCATAAGCTTCTTATTTCACTGAGAAAATAGAAACAAT CAGAAGAGAATTTTCAAAAACTTCAACACTTACCAGTCACTTGCATCTATGCTCAAATACTCTGTCTTTC CTCTCATTAGAATGTCATCCCCTGTGTGCAGGGACTTTGCTTATTCTCAGCACTTATCATCATACCTGAA AATGTAGGCATTTGAAAAATAATTGTTGAATTAAAAATGAATAATAAAAATAACTCTGTCATTACCAGAA CAAAACTATCATTTATTCATTCCCTCAATAAAAATTTATTATATGCCTATTTATTGACAGGCCTTATTCT AGCAACTGACAATGTAGCAGAGAATAGAACAGATAAAAGTCCCTATCCTAAGGGAGCTTATATTTCAGTT GAAGGCTAAGTTCATGTTAGCCACTACAATAAGCCTTTACATGAATCATCTCTTCAATCTTTCAAAAATT GTTAGGTAAGTGTTATCATACCTATTTTCAGATGAGAAAGCTAAGGCTCAACTCTCCTATTTAATATCAC ATAGAGCCAGAATGCAGAGCTTCAAATATATGTCTAAATTACTAATCTACTGTGCTGATATAGACATGAA GGGCTTTATCCTCTATATCATGCTGCAAATAGGAGGAAAAAAGCTTGATCAAAAGTTCTAAGCAATTGTA GCTCTGACCCCAAGAGGGCAGTATTTGCATTCGCCCCGCCTGCAGGTCTGAATGTGTAGTATGTGTAACA TAGCGAAGCCTGGTCTCTGATTGGCTAGGGATACCCTCTGAGAAACCCTTTGGTTAGTGTTAAAAAAAAA GAGAAGATGTTGAATACACAAGTCAACTTCTGGGAGCAGATCTCTGCAGAATAAAAATGAAAAAGCATCT GACGACCTTCTTGGTGATTTTGTGGCTTTATTTTTATAGTAAGTTAGTGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_9BMW7 · enhancer · 21825207–21825493 · regulatory
基因座與轉錄註解
TRAV10 依 HGNC／Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000390432 ★ | TR_V_gene | 379 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | T cell receptor 由 alpha/beta 或 delta/gamma 鏈組成，可辨識抗原呈現細胞表面 MHC 所呈現的小型外來胜肽。T 細胞發育時，受體基因座依序重組；alpha/delta 基因座具有 V、J、C 片段，delta 另有 D 片段且位於 alpha 基因座內。alpha 鏈由 V-J 重組形成，delta 鏈先接合 D-J 再接上 V，兩者之 C 片段後續透過 RNA 剪接連接。V、J 組合及 terminal deoxynucleotidyltransferase 隨機添加核苷酸可增加辨識多樣性；部分 alpha 位點片段為不能編碼蛋白質的假基因。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源T cell receptors recognize foreign antigens which have been processed as small peptides and bound to major histocompatibility complex (MHC) molecules at the surface of antigen presenting cells (APC). Each T cell receptor is a dimer consisting of one alpha and one beta chain or one delta and one gamma chain. In a single cell, the T cell receptor loci are rearranged and expressed in the order delta, gamma, beta, and alpha. If both delta and gamma rearrangements produce functional chains, the cell expresses delta and gamma. If not, the cell proceeds to rearrange the beta and alpha loci. This region represents the germline organization of the T cell receptor alpha and delta loci. Both the alpha and delta loci include V (variable), J (joining), and C (constant) segments and the delta locus also includes diversity (D) segments. The delta locus is situated within the alpha locus, between the alpha V and J segments. During T cell development, the delta chain is synthesized by a recombination event at the DNA level joining a D segment with a J segment; a V segment is then joined to the D-J gene. The alpha chain is synthesized by recombination joining a single V segment with a J segment. For both chains, the C segment is later joined by splicing at the RNA level. Recombination of many different V segments with several J segments provides a wide range of antigen recognition. Additional diversity is attained by junctional diversity, resulting from the random additional of nucleotides by terminal deoxynucleotidyltransferase. Five variable segments can be used in either alpha or delta chains and are described by TRAV/DV symbols. Several V and J segments of the alpha locus are known to be incapable of encoding a protein and are considered pseudogenes. |
DNA 與 RNA 序列
AGTCAACTTCTGGGAGCAGATCTCTGCAGAATAAAAATGA40AAAAGCATCTGACGACCTTCTTGGTGATTTTGTGGCTTTA80TTTTTATAGGGGGAATGGCAAAAACCAAGTGGAGCAGAGT120CCTCAGTCCCTGATCATCCTGGAGGGAAAGAACTGCACTC160TTCAATGCAATTATACAGTGAGCCCCTTCAGCAACTTAAG200GTGGTATAAGCAAGATACGGGGAGAGGTCCTGTTTCCCTG240ACAATCATGACTTTCAGTGAGAACACAAAGTCGAACGGAA280GATATACAGCAACTCTGGATGCAGACACAAAGCAAAGCTC320TCTGCACATCACAGCCTCCCAGCTCAGCGATTCAGCCTCC360TACATCTGTGTGGTGAGCG379cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。