基因總覽
TRAPPC2B 是蛋白質編碼基因，其產物正式名稱為 trafficking protein particle complex subunit 2B。依蛋白質家族註釋，TRAPPC2B 屬於 TRAPP 小次單元家族中的 Sedlin 亞家族；其名稱也反映它與運輸蛋白粒子複合體的關聯。現有資料指出，該蛋白質可參與多亞基 TRAPP 複合體，並與 ENO1、TRAPPC2L 等分子有互作記錄。功能註釋另提及它可能參與由內質網至高基氏體的囊泡運輸，但未提供更具體的作用方式或結構資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000543226 ★ | 57,363,551–57,365,405 | 2 |
| ENST00001094257 | 57,363,478–57,365,420 | 2 |
| ENST00001142120 | 57,363,478–57,365,509 | 2 |
| ENST00001094258 | 57,363,499–57,365,509 | 2 |
| ENST00000596755 | 57,363,567–57,365,309 | 1 |
| ENST00001094259 | 57,363,761–57,365,509 | 2 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRAPPC2B 的功能註釋指出，它可阻止 ENO1 所造成的轉錄抑制，以及由 ENO1 引發的細胞死亡。這描述的是對 ENO1 相關效應的抑制；現有資料未進一步說明其分子機制、作用所需條件，或這些效應發生的細胞系統，因此不宜延伸推論其調控途徑。
此外，TRAPPC2B 可能參與囊泡由內質網運送至高基氏體的過程。此項功能以「可能」表述，資料未詳述它在運輸中的具體步驟、所需複合體組成或對運輸結果的影響。它被註釋為 TRAPP 多亞基複合體的一員，與其可能參與囊泡運輸的角色相符，但現有資料不足以將特定運輸機制歸因於 TRAPPC2B。
Promoter 與基因調控
>TRAPPC2B ENST00000543226 GRCh38 chr19:57362551-57363651 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGAAGGAGATAAGATCATGAAAGTTCACAGTTTTTATTGGGGATAATACGTTCCCTGTGTACATATACT CCAACTATGGAATGGCACAAAATGTCCTGTCAGGAAATGGCATGTATCAGTCACTCTCATTTTCAGACAG GATTGAGACTTTTAAAATAAATGTAAAATATTTCAGACATGAAGTAATAAGTATTATTAGAATAAAAGCA TTGCACTCTTGGTAGGAACACAATCACTGACTCTACAGACAGTAATGATGTTTTCTTCTGGATCCAGAGG CACAGCGTCACCCTTTCAATCTACGTCGGTATCTCCTGTCTTCTTTTGTGCAAATTCCCAGCCATGTAGT CTTTCTTTGTTCTCTTGGACCAACCATATTGAAGCTTAATAAATAGAAGTCAAAGTTTAACTGTATGTGT ATTTGAAAAGCAACATATGGCTGAGAGGCATGAGTAGAGACAGAGTGCCTTTGTGGTATAGTGTGTCCCT TTGGCGGTGTAGCCGTTGAGAACTTGCTGTGCTTCACAATCCGATATCATAGGTCCCTCACATTTCTGTG AGTATCCTAGACCTTACTTCAAGAAAATCTGGTTATGTCGCCTTTAAGAGCAACCCAAGCCCCGTCCTGT CCGTGGAGTCCGGCACTCTGTTTACCAGCTCCCCTGACGGTGCCACTGAGCCTCTATCCGCCATATAAGG ACTGACCAACGCTCTAAGGCAAGTCCAGAAGCGGTGTCGAAACTTCATAACCCAGAAGACACTGCGGTTC TCGGCAGCGCGACTGACCCAATGAATGTGCAGGAAGGAACCTTTGCGTGCGTGCGTGCGTGCGTGCGTCC GTCCTCGTGCTCGCGCATCGTAGGAGGGCGGGACTTCCGGCGTCCTCTTGCCGTGGTTGATTTGATTTTC TCTGGTGTTTTCACTAGTTCCGGCCTTTGGCGCTCTATGACGTCACCGAAGTGACGGAGCGGAAAAGCGC GAGAAGCGGCTTGGTTCCTTGTACGCAGAGGCGGTAGTGACACAGGCACAACTGACAGTGGCAGAAGCTC AGCTGACAAGGACTGGGGACGGCGGTGTCCTTGTCTTGCCTTTGTCGCCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRAPPC2B_1 ↗ | 19:57,363,551 | 正股 | 57,363,502–57,363,561 |
| TRAPPC2B_2 ↗ | 19:57,364,764 | 正股 | 57,364,715–57,364,774 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_BFDD4 · promoter · 57363061–57363577 · regulatory
ENSR19_BFDD6 · enhancer · 57363578–57364222 · regulatory
· motif · 57359498–57359512 · motif
· motif · 57359498–57359512 · motif
· motif · 57363236–57363246 · motif
· motif · 57363238–57363253 · motif
· motif · 57363238–57363253 · motif
· motif · 57363422–57363431 · motif
· motif · 57363422–57363433 · motif
· motif · 57363475–57363484 · motif
· motif · 57363495–57363508 · motif
· motif · 57363495–57363508 · motif
· motif · 57363648–57363658 · motif
· motif · 57367750–57367761 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：140 aa
TRAPPC2B 蛋白質屬於 TRAPP 小次單元家族，並歸入 Sedlin 亞家族。現有蛋白質註釋未提供結構域、序列區段或其他功能區域的具體資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TRAPPC2B 註釋於細胞核、細胞質及核周區域，也見於內質網—高基氏體中間區室；另記錄其位於核周顆粒狀結構。 資料未說明這些位置是否隨條件改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
TRAPPC2B 是多亞基 TRAPP 複合體的一員，並有與 ENO1、TRAPPC2L 互作的記錄。另有同源二聚化，以及與 PITX1、SF1、TRAPPC3 互作的註釋；這些關係標示為依相似性推定，與前述互作證據層級不同。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRAPPC2B 可阻止 ENO1 所造成的轉錄抑制及細胞死亡；此外，它可能參與囊泡由內質網運送至高基氏體，但資料未詳述此運輸作用的具體機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Prevents transcriptional repression and induction of cell death by ENO1. May play a role in vesicular transport from endoplasmic reticulum to Golgi PMID 11134351 ↗ |
| 交互作用 | TRAPPC2B 可形成同源二聚體，且屬於多亞基 TRAPP 複合體；資料記錄其與 ENO1、TRAPPC2L 互作。與 PITX1、SF1、TRAPPC3 的互作及同源二聚化註釋依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Can homodimerize (By similarity). Part of the multisubunit TRAPP (transport protein particle) complex. Interacts with ENO1 and TRAPPC2L. Interacts with PITX1, SF1 and TRAPPC3 (By similarity) PMID 11134351 ↗ · PMID 11805826 ↗ · PMID 19416478 ↗ |
| 細胞定位 | TRAPPC2B 的定位註釋包括細胞核、核周細胞質、內質網—高基氏體中間區室及細胞質，也記錄於核周顆粒狀結構；來源未提供定位變化的條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm, perinuclear region; Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; Cytoplasm; Localized in perinuclear granular structures PMID 11134351 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTACGCAGAGGCGGTAGTGACACAGGCACAACTGACAGTG40GCAGAAGCTCAGCTGACAAGGACTGGGGACGGCGGTGTCC80TTGTCTTGCCTTTGTCGCCCCCGCCCCTCTCTTCCCTGGC120TGGACTTGCGGAGTCCCCGCCGAAGAACCCGAGGAGCCAT160ATATTGAAGACCATGTCTGGAAGCTTCTACTTTGTAATTG200TTGGTCACCATGATAATCCAGTTTTTGAAATGGAGTTTTT240GCCAGCTGGGAAGGCAGAATCCAAAGACGACCATCGTCAT280CTGAACCAGTTCATAGCTCATGCTGCTCTCGACCTCGTAG320ATGAGAACATGTGGCTGTCGAACAACATGTACTTGAAAAC360TGTGGACAAGTTCAACGAGTGGTTTGTGTCAGCATTTGTC400ACCGCGGGGCATATGAGGTTTATTATGCTTCATGACATAA440GACAAGAAGATGGAATAAAGAACTTCTTTACTGATGTTTA480TGATTTATATATAAAATTTTCAATGAATCCATTTTATGAA520CCCAATTCTCCTATTCGATCAAGTGCATTTGACAGAAAAG560TTCAGTTTCTTGGGAAGAAACACCTTTTAAGCTGAATGGA600GAAAATTCCAAAATAAATTATATCACCACAATGGTGTATA640CTCAGGAATGTGTACATTGTAAATTACTTGATTAAATAGC680CTGGAAATCTTTTGTGTATTCTCAGCTTATCTAAACTTAA720TGAAATTTCTTTTATATTTAAAAA744cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。