演化之聲
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Human Gene Atlas›TRAJ21
HUMAN GENE LOCUS

TRAJ21

T cell receptor alpha joining 21

TRAJ21 是 T cell receptor alpha joining 21，屬於人類 T cell receptor 基因；其名稱指向 T cell receptor alpha 的 joining 區段。

Homo sapiens14q11.2
OFFICIAL SYMBOL
TRAJ21
CHROMOSOME
14
LOCUS TYPE
TR_J_gene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TRAJ21 的正式名稱為 T cell receptor alpha joining 21，屬於 T cell receptor gene。T cell receptor alpha locus 由 V（variable）、J（joining）與 C（constant）區段組成；TRAJ21 的名稱標示其與 alpha joining 區段的關係。T cell receptor alpha 與 delta loci 的基因組織彼此交錯：delta locus 位於 alpha locus 內，介於 alpha 的 V 與 J 區段之間。此基因所屬的區域因此涉及兩種 T cell receptor 鏈的基因組排列；來源指出，alpha locus 中有些 V 與 J 區段無法編碼蛋白質，並被視為 pseudogenes，但未指出 TRAJ21 本身是否屬於此類。

Official symbol
TRAJ21
Gene name
T cell receptor alpha joining 21
Organism
Homo sapiens
Gene type
T cell receptor gene
HGNC ID
HGNC:12050
Locus type
T cell receptor gene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q11.2
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegTRAJ21pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr14:22,523,600–22,523,654
Gene span
55 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000390516 ★22,523,600–22,523,6541

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

T cell receptor alpha joining 21 所屬的 alpha locus 參與 T cell receptor alpha chain 的形成。T cell receptor 可辨識外來抗原，但其辨識對象是經處理成小胜肽、並結合於 antigen-presenting cells 表面 major histocompatibility complex（MHC）分子的抗原。T cell receptor 可由 alpha 與 beta 鏈，或 delta 與 gamma 鏈組成；來源描述的是 T cell receptor loci 的一般重組與表現次序，並未提供 TRAJ21 個別的實驗結果或特定功能差異。

T cell 發育期間，alpha chain 的基因片段透過 DNA 層級的重組形成：一個 V segment 與一個 J segment 接合，之後 C segment 再經 RNA 層級的剪接接上。相較之下，delta chain 的形成先由 D segment 與 J segment 接合，再接上 V segment；delta locus 位於 alpha locus 之內。來源描述這些為兩個 loci 的重組方式，未將特定步驟限定為 TRAJ21 單一基因的作用。

不同 V segments 與多個 J segments 的重組組合，提供廣泛的抗原辨識範圍；接合處還可因 terminal deoxynucleotidyltransferase 隨機加入核苷酸而增加多樣性。部分 V segments 可供 alpha 或 delta chains 使用，並以 TRAV/DV 符號描述。來源另指出，alpha locus 中有些 V 與 J segments 無法編碼蛋白質，因而被視為 pseudogenes；但未說明 TRAJ21 是否屬於這些 pseudogenes。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準：負數為上游、正數為下游，包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 22523600 · 正股
查看轉錄本與 TSS ↗
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TRAJ21 ENST00000390516 GRCh38 chr14:22522600-22523700 strand=1 5′→3′
相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter
ACATTGCTTATCATTTCTACAAGTGAGAACAAGTAAGCCCCTGGCCCTCCAAAATTGCATGAGTATTATA
ATTACTTGGCTTAGATTGAAGTCACTTCTGTGTTACTTCTCATAACTGTGTTCATTTGTTGAGATCTGTT
TAACTCCAAACTGTGTGGGCGTCTAACTGTTGGCACTAAGGTTTCTTTTCTCTTGAAATTGCCAGCAAAA
TATTTTACCCATAAATAATGTTTCATCTAGACTTGCAAATGACAACTAACACTGCAGGCTCTTTTTTTTT
CTTTTGCTTTGTTTCTTTTTTTCTGAAGGGAATATGCAAGCAGGAAGCAAAAAAAAAAAAAAAGCCAAAA
TGTACAGTTTGACTGTGGGGTCTGGGAGGAGAGTGTCAATGTGGATGCTAAAATATACATGGTTGTATAA
TGTAGGTACTGTCACAGAGAGGCTATAGTGATCTTATTAGATCATACATACAGAGCACCACTGGTCAGCT
GGCGTTGCTCGGGGTGTCCTTAAGAAAAGCTCAGGTCTAGTTGTCAAGTGCAACCCAGATTCAGATACAG
AGTCTCAGAGAGAAGCTTCCAGATCACCCTGGAGCTAAATGCAGAATATGAATTTTCCCCTTAGTTAAGT
CTACCTGAGGGGAATTTTCATTTATAATTAGGAAAAGAGAAAGGTAAAGAACATTTACTTGCAGTGTCCT
GTTTCAAATATTGTGTGCATTGAGCACAGAGGACACAAGAATGAACCCAAGCAGAAAACTAAAGAAAAGA
AATCAATAAAACCACTGAAGAAAACCAGTTGCCCTTATCTTGCCTGTCTCTGATAATGAATGTGCCTTCC
CTGCTCATTCCTCACTTTGGTTCTCAAATTTTCCAGGGAATTAGCAAAGAACTGGTAGGGTTGGGTTAGT
CTTGGTCTAATTTGGTTAGTCATCTCTGGATAACAAGTCTCCTTTTTAGGAAGTGCCAGGGGATTTTTTG
TAATGCCAATAAACATGGTGTACAACTTCAACAAATTTTACTTTGGATCTGGGACCAAACTCAATGTAAA
ACCAAGTAAGTTATAGTTGCCTAGAAGAAAAAGTTACCAACACATTATGCT
TRAJ21 位於正股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控／motif 註解

ENSR14_9BXC5 · enhancer · 22519602–22519949 · regulatory

ENSR14_C48C4 · enhancer · 22520135–22521299 · regulatory

ENSR14_8MTR8 · enhancer · 22524803–22525034 · regulatory

· motif · 22519337–22519352 · motif

· motif · 22519459–22519473 · motif

· motif · 22519463–22519473 · motif

· motif · 22519624–22519637 · motif

· motif · 22519916–22519929 · motif

· motif · 22519927–22519940 · motif

· motif · 22519927–22519940 · motif

· motif · 22520041–22520054 · motif

· motif · 22520190–22520205 · motif

· motif · 22520412–22520427 · motif

· motif · 22520945–22520954 · motif

· motif · 22520945–22520956 · motif

· motif · 22520945–22520956 · motif

· motif · 22520945–22520958 · motif

· motif · 22521648–22521661 · motif

· motif · 22521648–22521661 · motif

· motif · 22521740–22521752 · motif

· motif · 22521742–22521764 · motif

· motif · 22521742–22521764 · motif

· motif · 22522063–22522077 · motif

· motif · 22522064–22522077 · motif

· motif · 22524358–22524375 · motif

· motif · 22524572–22524587 · motif

· motif · 22524604–22524621 · motif

· motif · 22525467–22525480 · motif

· motif · 22525467–22525480 · motif

· motif · 22525838–22525851 · motif

· motif · 22525838–22525851 · motif

· motif · 22526941–22526952 · motif

· motif · 22527162–22527175 · motif

· motif · 22527162–22527175 · motif

· motif · 22528320–22528332 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

T cell receptor gene

TRAJ21 依 HGNC／Ensembl 分類為 T cell receptor gene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000390516 ★TR_J_gene55 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質；細胞核內有核仁，粗面內質網鄰接核膜，粒線體含內膜摺疊，高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位，器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量；未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體：外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡（示意）
定位：尚未取得定位註解
NCBI Gene／RefSeq

動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能T cell receptor 可辨識呈現在 antigen-presenting cells 表面的 MHC 分子所結合之小胜肽抗原，並由 alpha-beta 或 delta-gamma 鏈組成。T cell 發育時，相關基因座依序重組；alpha chain 由 V 與 J 片段接合，delta chain 則先接合 D 與 J，再接上 V。C 片段透過 RNA 剪接接合；V、J 組合及接合處隨機加入核苷酸，增加辨識多樣性。部分 alpha locus 片段不能編碼蛋白質，屬 pseudogenes。資料庫紀錄
證據與來源

T cell receptors recognize foreign antigens which have been processed as small peptides and bound to major histocompatibility complex (MHC) molecules at the surface of antigen presenting cells (APC). Each T cell receptor is a dimer consisting of one alpha and one beta chain or one delta and one gamma chain. In a single cell, the T cell receptor loci are rearranged and expressed in the order delta, gamma, beta, and alpha. If both delta and gamma rearrangements produce functional chains, the cell expresses delta and gamma. If not, the cell proceeds to rearrange the beta and alpha loci. This region represents the germline organization of the T cell receptor alpha and delta loci. Both the alpha and delta loci include V (variable), J (joining), and C (constant) segments and the delta locus also includes diversity (D) segments. The delta locus is situated within the alpha locus, between the alpha V and J segments. During T cell development, the delta chain is synthesized by a recombination event at the DNA level joining a D segment with a J segment; a V segment is then joined to the D-J gene. The alpha chain is synthesized by recombination joining a single V segment with a J segment. For both chains, the C segment is later joined by splicing at the RNA level. Recombination of many different V segments with several J segments provides a wide range of antigen recognition. Additional diversity is attained by junctional diversity, resulting from the random additional of nucleotides by terminal deoxynucleotidyltransferase. Five variable segments can be used in either alpha or delta chains and are described by TRAV/DV symbols. Several V and J segments of the alpha locus are known to be incapable of encoding a protein and are considered pseudogenes.

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000390516 · 55 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列，保留非編碼區。
1TACAACTTCAACAAATTTTACTTTGGATCTGGGACCAAAC40
41TCAATGTAAAACCAA55

cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。

13 / DATA PROVENANCE

資料來源與研究連結

HGNC ↗NCBI Gene ↗Ensembl ↗EPDnew v006 · UCSC ↗

HGNC · CC0 ↗ · Ensembl · 資料使用說明 ↗ · EPD team／SIB · CC BY 4.0 ↗ · NCBI／RefSeq · 資料政策與免責聲明 ↗

資料更新：2026-11-05