基因總覽
TRAF3IP2 是蛋白質編碼基因,其產物為 TRAF3 interacting protein 2。這種蛋白質兼具接頭分子與 E3 ubiquitin ligase 的角色,能參與細胞訊號傳遞。蛋白質全長為 574 個胺基酸,含有 SEFIR 結構域;其 N 端部分可介導與 TRAF6 的交互作用,序列中另有數段被註記為無序區域。這些結構特徵提供了理解其分子作用的基本背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000368761 ★ | 111,555,381–111,605,878 | 9 |
| ENST00000359831 | 111,555,381–111,605,871 | 9 |
| ENST00000340026 | 111,555,381–111,606,279 | 10 |
| ENST00000651547 | 111,555,381–111,605,844 | 11 |
| ENST00000368735 | 111,555,381–111,567,360 | 4 |
| ENST00000368734 | 111,555,381–111,567,121 | 4 |
| ENST00000368730 | 111,555,381–111,567,279 | 4 |
| ENST00000907309 | 111,555,381–111,606,253 | 11 |
| ENST00000907310 | 111,555,381–111,593,633 | 9 |
| ENST00000912363 | 111,555,381–111,605,871 | 10 |
| ENST00000945262 | 111,555,381–111,606,910 | 9 |
| ENST00000945263 | 111,555,381–111,605,951 | 10 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRAF3IP2 是 IL17A 訊號傳遞所需的接頭分子,也具有 E3 ubiquitin ligase 活性。它可將 ubiquitin 從 E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2V1-UBE2N 轉移至受質蛋白,並催化以 Lys-63 連接的多聚泛素化。這類修飾可增強蛋白質之間的交互作用及細胞訊號傳遞。
在 IL17A 刺激下,TRAF3IP2 透過 SEFIR domains 與受體鏈 IL17RA 及 IL17RC 交互作用,並催化 TRAF6 的 Lys-63 連接型多聚泛素化。接著由 TRAF6 介導 NF-kappa-B 與 MAP kinase 訊號路徑的活化,串接受體刺激與下游訊號反應。
來源指出,TRAF3IP2 的泛素轉移反應是將 ubiquitin 接至受質蛋白的 lysine 殘基;其功能描述並未進一步界定其他受質或更廣泛的生物學效應。因此,現有資料支持其在 IL17A 介導訊號中的特定接頭及泛素化角色,不宜據此推定其他未列出的作用。
Promoter 與基因調控
>TRAF3IP2 ENST00000368761 GRCh38 chr6:111605778-111606878 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CGCTCCTTCATGCAATAAATTCTGCAGGCTACTGATTAAACAATGGGAAGGAAAGGGGAGAAAAAAAATC TTGAGGTCAGGAAAATGCAGCCAGAGGAGGTTAGTGTGCATGTGTGCATGTGTATGTATGTGTGTGTGTG TGTTCTTAAAATTAACCACTTTTTTTGTGCCTGACAATAGGGTGGTGTGTGTGCACAAGCCACAGGCATG TGTATGCTGTGTGTACACGTGTGTCCAGGAGCATGGTCAGTGAGCCCCCCCCCACCCCCCCAGTGGTTAT GGGCAGCAAATACTGATTTTTTGGGTTTTTTTAAATTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTCGCTCTGTCGCC CAGTCTGGAGTGCAGTGGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGC CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTAGT AGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCTCCCGCCTCGGC CTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGCGCTCGGCAATGCTGATGTTTTAAGCAGTTAGAG GAGGTGGAAGAAGCTCGACTCCCTCTTCTTCCCCATTATCTGCCCACAATCCCCTCCTTTGGAGCTGCTA ATGATTACTAATTCTTAACATTCGAGTTCAATCTCCTCCCGGAGACACCCTCCCAGGCGAGGGCACTGCG ACTACACTGAGGTTCTGCCCACTCCTGGGCAGCTTCTTAGCTGGGTGGCGAAAACAAAAATGCCGCCTAA TTGGTCACTGGCCCTTTCTCATGAATGAAGGAGGTTTCTGTTTTAAGAAATAAAGTGACTCCTCAGCCGT TGATTCACTGCCCACAGGGAGATTTTGAGCAGAGGCTTCCTAGGCTCCGTAGAAATTTGCATACAGCTTC CACTTCCTGCTTCAGAGCCTGTTCTTCTACTTACCTGGGCCCGGAGAAGGTGGAGGGAGACGAGAAGCCG CCGAGAGCCGACTACCCTCCGGGCCCAGTCTGTCTGTCCGTGGTGGATCTA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRAF3IP2_1 ↗ | 6:111,605,875 | 負股 | 111,605,865–111,605,924 |
| TRAF3IP2_2 ↗ | 6:111,606,274 | 負股 | 111,606,264–111,606,323 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:574 aa
TRAF3 interacting protein 2 全長 574 個胺基酸,含有位於第 409 至 550 位胺基酸的 SEFIR 結構域。第 1 至 256 位胺基酸區域介導與 TRAF6 的交互作用;第 1 至 67、155 至 211 及 327 至 403 位胺基酸區域則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- FHL3Q96C98 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MRPL28Q13084 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RIMBP3Q9UFD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STK16O75716 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRAF6Q9Y4K3 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TRIP6Q15654 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TRAF3IP2 與 TRAF6 有直接交互作用,也與 IL17RA、IL17RC 及 IL17RB 交互作用。另有資料記載其與 IKBKG/NF-kappa B essential modulator、CHUK/IKK-alpha 及 IKBKB/IKK-beta 交互作用;來源未將這些關係描述為直接結合。
疾病與遺傳關聯
TRAF3IP2 相關變異與乾癬易感性有關;乾癬是一種常見的慢性皮膚發炎疾病,具有多因子成因。另有資料指出,影響 TRAF3IP2 的變異可造成家族性念珠菌症 8,這是一種原發性免疫缺陷,會使對 Candida 的免疫反應及感染清除能力受損,並可能造成皮膚、指甲與黏膜持續或反覆感染。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRAF3IP2 是 E3 ubiquitin ligase,可將 ubiquitin 從 E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2V1-UBE2N 轉移至受質蛋白,並催化 Lys-63 連接型多聚泛素化,以增強蛋白質交互作用及細胞訊號傳遞。它也是 IL17A 訊號傳遞所需的接頭分子;IL17A 刺激時,透過 SEFIR domains 與 IL17RA、IL17RC 交互作用,修飾 TRAF6,進而促使 TRAF6 活化 NF-kappa-B 與 MAP kinase 路徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源E3 ubiquitin ligase that catalyzes 'Lys-63'-linked polyubiquitination of target protein, enhancing protein-protein interaction and cell signaling. Transfers ubiquitin from E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2V1-UBE2N to substrate protein. Essential adapter molecule in IL17A-mediated signaling. Upon IL17A stimulation, interacts with IL17RA and IL17RC receptor chains through SEFIR domains and catalyzes 'Lys-63'-linked polyubiquitination of TRAF6, leading to TRAF6-mediated activation of NF-kappa-B and MAPkinase pathways PMID 19825828 ↗ · PMID 24120361 ↗ · PMID 33723527 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. | 含實驗來源 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. PMID 19825828 ↗ |
| 交互作用 | TRAF3IP2 與 TRAF6 有直接交互作用,也與 IL17RA、IL17RC 及 IL17RB 交互作用。來源另記載它與 IKBKG/NF-kappa B essential modulator、CHUK/IKK-alpha 及 IKBKB/IKK-beta 交互作用,但未將這些關係描述為直接交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with IKBKG/NF-kappa B essential modulator, with CHUK/IKK-alpha and with IKBKB/IKK-beta. Interacts with TRAF6; this interaction is direct. Interacts with IL17RA and IL17RC. Interacts with IL17RB PMID 12459498 ↗ · PMID 19825828 ↗ · PMID 24120361 ↗ · PMID 33723527 ↗ |
| 疾病關聯 | 乾癬是一種常見的慢性皮膚發炎疾病,成因具有多因子性,常見紅色鱗屑斑塊,通常出現在頭皮、手肘及膝部。病灶與角質形成細胞異常增生,以及發炎細胞浸潤真皮和表皮有關。影響 TRAF3IP2 的變異與乾癬易感性相關,來源未指出此關聯代表單一因果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Psoriasis 13 PSORS13 A common, chronic inflammatory disease of the skin with multifactorial etiology. It is characterized by red, scaly plaques usually found on the scalp, elbows and knees. These lesions are caused by abnormal keratinocyte proliferation and infiltration of inflammatory cells into the dermis and epidermis. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614070 PMID 20953186 ↗ · PMID 20953188 ↗ |
| 疾病關聯 | 家族性念珠菌症 8 是一種原發性免疫缺陷,患者的免疫反應改變,清除真菌感染的能力受損,且此缺陷選擇性影響對 Candida 的防禦。疾病可造成皮膚、指甲及黏膜持續或反覆感染,致病菌主要為 Candida albicans。來源指出,此病由影響 TRAF3IP2 的變異造成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Candidiasis, familial, 8 CANDF8 A primary immunodeficiency disorder with altered immune responses and impaired clearance of fungal infections, selective against Candida. It is characterized by persistent and/or recurrent infections of the skin, nails and mucous membranes caused by organisms of the genus Candida, mainly Candida albicans. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615527 PMID 24120361 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTTCTTCTACTTACCTGGGCCCGGAGAAGGTGGAGGGAGA40CGAGAAGCCGCCGAGAGCCGACTACCCTCCGGGCCCAGTC80TGTCTGTCCGTGGTGGATCTAAGAAACTAGAATGAACCGA120AGCATTCCTGTGGAGGTTGATGAATCAGAACCATACCCAA160GTCAGTTGCTGAAACCAATCCCAGAATATTCCCCGGAAGA200GGAATCAGAACCACCTGCTCCAAATATAAGGAACATGGCA240CCCAACAGCTTGTCTGCACCCACAATGCTTCACAATTCCT280CCGGAGACTTTTCTCAAGCTCACTCAACCCTGAAACTTGC320AAATCACCAGCGGCCTGTATCCCGGCAGGTCACCTGCCTG360CGCACTCAAGTTCTGGAGGACAGTGAAGACAGTTTCTGCA400GGAGACACCCAGGCCTGGGCAAAGCTTTCCCTTCTGGGTG440CTCTGCAGTCAGCGAGCCTGCGTCTGAGTCTGTGGTTGGA480GCCCTCCCTGCAGAGCATCAGTTTTCATTTATGGAAAAAC520GTAATCAATGGCTGGTATCTCAGCTTTCAGCGGCTTCTCC560TGACACTGGCCATGACTCAGACAAATCAGACCAAAGTTTA600CCTAATGCCTCAGCAGACTCCTTGGGCGGTAGCCAGGAGA640TGGTGCAACGGCCCCAGCCTCACAGGAACCGAGCAGGCCT680GGATCTGCCAACCATAGACACGGGATATGATTCCCAGCCC720CAGGATGTCCTGGGCATCAGGCAGCTGGAAAGGCCCCTGC760CCCTCACCTCCGTGTGTTACCCCCAGGACCTCCCCAGACC800TCTCAGGTCCAGGGAGTTCCCTCAGTTTGAACCTCAGAGG840TATCCAGCATGTGCACAGATGCTGCCTCCCAATCTTTCCC880CACATGCTCCATGGAACTATCATTACCATTGTCCTGGAAG920TCCCGATCACCAGGTGCCATATGGCCATGACTACCCTCGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。