演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TRAF3IP2DKFZP586G0522

TRAF3 interacting protein 2

TRAF3IP2 編碼的 TRAF3 interacting protein 2 是參與 IL17A 訊號傳遞的接頭分子,也具有 E3 ubiquitin ligase 活性。

Homo sapiens6q21UniProt O43734
OFFICIAL SYMBOL
TRAF3IP2
CHROMOSOME
6
UNIPROT
O43734
PDB / ALPHAFOLD
9OT1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TRAF3IP2 是蛋白質編碼基因,其產物為 TRAF3 interacting protein 2。這種蛋白質兼具接頭分子與 E3 ubiquitin ligase 的角色,能參與細胞訊號傳遞。蛋白質全長為 574 個胺基酸,含有 SEFIR 結構域;其 N 端部分可介導與 TRAF6 的交互作用,序列中另有數段被註記為無序區域。這些結構特徵提供了理解其分子作用的基本背景。

Official symbol
TRAF3IP2
Gene name
TRAF3 interacting protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1343
UniProt
O43734
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DKFZP586G0522ACT1CIKSC6orf4C6orf5C6orf6C6orf2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66q21
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegTRAF3IP2pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:111,555,381–111,606,910
Gene span
51,530 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000368761 ★111,555,381–111,605,8789
ENST00000359831111,555,381–111,605,8719
ENST00000340026111,555,381–111,606,27910
ENST00000651547111,555,381–111,605,84411
ENST00000368735111,555,381–111,567,3604
ENST00000368734111,555,381–111,567,1214
ENST00000368730111,555,381–111,567,2794
ENST00000907309111,555,381–111,606,25311
ENST00000907310111,555,381–111,593,6339
ENST00000912363111,555,381–111,605,87110
ENST00000945262111,555,381–111,606,9109
ENST00000945263111,555,381–111,605,95110

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TRAF3IP2 是 IL17A 訊號傳遞所需的接頭分子,也具有 E3 ubiquitin ligase 活性。它可將 ubiquitin 從 E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2V1-UBE2N 轉移至受質蛋白,並催化以 Lys-63 連接的多聚泛素化。這類修飾可增強蛋白質之間的交互作用及細胞訊號傳遞。

在 IL17A 刺激下,TRAF3IP2 透過 SEFIR domains 與受體鏈 IL17RA 及 IL17RC 交互作用,並催化 TRAF6 的 Lys-63 連接型多聚泛素化。接著由 TRAF6 介導 NF-kappa-B 與 MAP kinase 訊號路徑的活化,串接受體刺激與下游訊號反應。

來源指出,TRAF3IP2 的泛素轉移反應是將 ubiquitin 接至受質蛋白的 lysine 殘基;其功能描述並未進一步界定其他受質或更廣泛的生物學效應。因此,現有資料支持其在 IL17A 介導訊號中的特定接頭及泛素化角色,不宜據此推定其他未列出的作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 111605878 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TRAF3IP2 ENST00000368761 GRCh38 chr6:111605778-111606878 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CGCTCCTTCATGCAATAAATTCTGCAGGCTACTGATTAAACAATGGGAAGGAAAGGGGAGAAAAAAAATC
TTGAGGTCAGGAAAATGCAGCCAGAGGAGGTTAGTGTGCATGTGTGCATGTGTATGTATGTGTGTGTGTG
TGTTCTTAAAATTAACCACTTTTTTTGTGCCTGACAATAGGGTGGTGTGTGTGCACAAGCCACAGGCATG
TGTATGCTGTGTGTACACGTGTGTCCAGGAGCATGGTCAGTGAGCCCCCCCCCACCCCCCCAGTGGTTAT
GGGCAGCAAATACTGATTTTTTGGGTTTTTTTAAATTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTCGCTCTGTCGCC
CAGTCTGGAGTGCAGTGGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGC
CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGTCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTAGT
AGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCTCCCGCCTCGGC
CTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCGCGCTCGGCAATGCTGATGTTTTAAGCAGTTAGAG
GAGGTGGAAGAAGCTCGACTCCCTCTTCTTCCCCATTATCTGCCCACAATCCCCTCCTTTGGAGCTGCTA
ATGATTACTAATTCTTAACATTCGAGTTCAATCTCCTCCCGGAGACACCCTCCCAGGCGAGGGCACTGCG
ACTACACTGAGGTTCTGCCCACTCCTGGGCAGCTTCTTAGCTGGGTGGCGAAAACAAAAATGCCGCCTAA
TTGGTCACTGGCCCTTTCTCATGAATGAAGGAGGTTTCTGTTTTAAGAAATAAAGTGACTCCTCAGCCGT
TGATTCACTGCCCACAGGGAGATTTTGAGCAGAGGCTTCCTAGGCTCCGTAGAAATTTGCATACAGCTTC
CACTTCCTGCTTCAGAGCCTGTTCTTCTACTTACCTGGGCCCGGAGAAGGTGGAGGGAGACGAGAAGCCG
CCGAGAGCCGACTACCCTCCGGGCCCAGTCTGTCTGTCCGTGGTGGATCTA
TRAF3IP2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TRAF3IP2_1 ↗6:111,605,875負股111,605,865–111,605,924
TRAF3IP2_2 ↗6:111,606,274負股111,606,264–111,606,323

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:574 aa

1 aa574 aa結構域功能區域
依 O43734 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TRAF3 interacting protein 2 全長 574 個胺基酸,含有位於第 409 至 550 位胺基酸的 SEFIR 結構域。第 1 至 256 位胺基酸區域介導與 TRAF6 的交互作用;第 1 至 67、155 至 211 及 327 至 403 位胺基酸區域則註記為無序區域。

結構域SEFIR409–550 aa
功能區域Mediates interaction with TRAF61–256 aa
功能區域Disordered1–67 aa
功能區域Disordered155–211 aa
功能區域Disordered327–403 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9OT1…

PDB · 9OT1

EM · 3.00 A · E/F/G/H/I/J/K/L/M/N/O/P/Q/R/S=372-574

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DKFZP586G052TRAF3IP2FHL3MRPL28RIMBP3STK16TRAF6TRIP6
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TRAF3IP2 與 TRAF6 有直接交互作用,也與 IL17RA、IL17RC 及 IL17RB 交互作用。另有資料記載其與 IKBKG/NF-kappa B essential modulator、CHUK/IKK-alpha 及 IKBKB/IKK-beta 交互作用;來源未將這些關係描述為直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TRAF3IP2 相關變異與乾癬易感性有關;乾癬是一種常見的慢性皮膚發炎疾病,具有多因子成因。另有資料指出,影響 TRAF3IP2 的變異可造成家族性念珠菌症 8,這是一種原發性免疫缺陷,會使對 Candida 的免疫反應及感染清除能力受損,並可能造成皮膚、指甲與黏膜持續或反覆感染。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TRAF3IP2 是 E3 ubiquitin ligase,可將 ubiquitin 從 E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2V1-UBE2N 轉移至受質蛋白,並催化 Lys-63 連接型多聚泛素化,以增強蛋白質交互作用及細胞訊號傳遞。它也是 IL17A 訊號傳遞所需的接頭分子;IL17A 刺激時,透過 SEFIR domains 與 IL17RA、IL17RC 交互作用,修飾 TRAF6,進而促使 TRAF6 活化 NF-kappa-B 與 MAP kinase 路徑。含實驗來源
證據與來源

E3 ubiquitin ligase that catalyzes 'Lys-63'-linked polyubiquitination of target protein, enhancing protein-protein interaction and cell signaling. Transfers ubiquitin from E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2V1-UBE2N to substrate protein. Essential adapter molecule in IL17A-mediated signaling. Upon IL17A stimulation, interacts with IL17RA and IL17RC receptor chains through SEFIR domains and catalyzes 'Lys-63'-linked polyubiquitination of TRAF6, leading to TRAF6-mediated activation of NF-kappa-B and MAPkinase pathways

PMID 19825828 ↗ · PMID 24120361 ↗ · PMID 33723527 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine.含實驗來源
證據與來源

S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine.

PMID 19825828 ↗

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交互作用TRAF3IP2 與 TRAF6 有直接交互作用,也與 IL17RA、IL17RC 及 IL17RB 交互作用。來源另記載它與 IKBKG/NF-kappa B essential modulator、CHUK/IKK-alpha 及 IKBKB/IKK-beta 交互作用,但未將這些關係描述為直接交互作用。含實驗來源
證據與來源

Interacts with IKBKG/NF-kappa B essential modulator, with CHUK/IKK-alpha and with IKBKB/IKK-beta. Interacts with TRAF6; this interaction is direct. Interacts with IL17RA and IL17RC. Interacts with IL17RB

PMID 12459498 ↗ · PMID 19825828 ↗ · PMID 24120361 ↗ · PMID 33723527 ↗

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疾病關聯乾癬是一種常見的慢性皮膚發炎疾病,成因具有多因子性,常見紅色鱗屑斑塊,通常出現在頭皮、手肘及膝部。病灶與角質形成細胞異常增生,以及發炎細胞浸潤真皮和表皮有關。影響 TRAF3IP2 的變異與乾癬易感性相關,來源未指出此關聯代表單一因果。含實驗來源
證據與來源

Psoriasis 13 PSORS13 A common, chronic inflammatory disease of the skin with multifactorial etiology. It is characterized by red, scaly plaques usually found on the scalp, elbows and knees. These lesions are caused by abnormal keratinocyte proliferation and infiltration of inflammatory cells into the dermis and epidermis. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614070

PMID 20953186 ↗ · PMID 20953188 ↗

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疾病關聯家族性念珠菌症 8 是一種原發性免疫缺陷,患者的免疫反應改變,清除真菌感染的能力受損,且此缺陷選擇性影響對 Candida 的防禦。疾病可造成皮膚、指甲及黏膜持續或反覆感染,致病菌主要為 Candida albicans。來源指出,此病由影響 TRAF3IP2 的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Candidiasis, familial, 8 CANDF8 A primary immunodeficiency disorder with altered immune responses and impaired clearance of fungal infections, selective against Candida. It is characterized by persistent and/or recurrent infections of the skin, nails and mucous membranes caused by organisms of the genus Candida, mainly Candida albicans. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615527

PMID 24120361 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000368761 · 5,833 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTTCTTCTACTTACCTGGGCCCGGAGAAGGTGGAGGGAGA40
41CGAGAAGCCGCCGAGAGCCGACTACCCTCCGGGCCCAGTC80
81TGTCTGTCCGTGGTGGATCTAAGAAACTAGAATGAACCGA120
121AGCATTCCTGTGGAGGTTGATGAATCAGAACCATACCCAA160
161GTCAGTTGCTGAAACCAATCCCAGAATATTCCCCGGAAGA200
201GGAATCAGAACCACCTGCTCCAAATATAAGGAACATGGCA240
241CCCAACAGCTTGTCTGCACCCACAATGCTTCACAATTCCT280
281CCGGAGACTTTTCTCAAGCTCACTCAACCCTGAAACTTGC320
321AAATCACCAGCGGCCTGTATCCCGGCAGGTCACCTGCCTG360
361CGCACTCAAGTTCTGGAGGACAGTGAAGACAGTTTCTGCA400
401GGAGACACCCAGGCCTGGGCAAAGCTTTCCCTTCTGGGTG440
441CTCTGCAGTCAGCGAGCCTGCGTCTGAGTCTGTGGTTGGA480
481GCCCTCCCTGCAGAGCATCAGTTTTCATTTATGGAAAAAC520
521GTAATCAATGGCTGGTATCTCAGCTTTCAGCGGCTTCTCC560
561TGACACTGGCCATGACTCAGACAAATCAGACCAAAGTTTA600
601CCTAATGCCTCAGCAGACTCCTTGGGCGGTAGCCAGGAGA640
641TGGTGCAACGGCCCCAGCCTCACAGGAACCGAGCAGGCCT680
681GGATCTGCCAACCATAGACACGGGATATGATTCCCAGCCC720
721CAGGATGTCCTGGGCATCAGGCAGCTGGAAAGGCCCCTGC760
761CCCTCACCTCCGTGTGTTACCCCCAGGACCTCCCCAGACC800
801TCTCAGGTCCAGGGAGTTCCCTCAGTTTGAACCTCAGAGG840
841TATCCAGCATGTGCACAGATGCTGCCTCCCAATCTTTCCC880
881CACATGCTCCATGGAACTATCATTACCATTGTCCTGGAAG920
921TCCCGATCACCAGGTGCCATATGGCCATGACTACCCTCGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。