演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TRAF3CAP-1

TNF receptor associated factor 3

TRAF3 是 TNF receptor associated factor 3,屬於 TNF receptor-associated factor 家族,並以細胞質 E3 ubiquitin ligase 的身分參與多種訊息傳遞調控。

Homo sapiens14q32.32UniProt Q13114
OFFICIAL SYMBOL
TRAF3
CHROMOSOME
14
UNIPROT
Q13114
PDB / ALPHAFOLD
8ZUK
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TRAF3(TNF receptor associated factor 3)是蛋白質編碼基因,產物屬於 TNF receptor-associated factor 家族。這個蛋白質具有 E3 ubiquitin ligase 活性,能調節多種訊息傳遞路徑;相關作用涵蓋免疫與非免疫細胞中的生物過程。其功能涉及 NF-kappa-B、MAPK 與 IRF 等路徑,並與免疫反應調節相關。來源也指出,TRAF3 參與抗體同型轉換及 T 細胞依賴性免疫反應;其具體分子作用方式則見下方功能說明。

Official symbol
TRAF3
Gene name
TNF receptor associated factor 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12033
UniProt
Q13114
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CAP-1CD40bpCRAF1LAP1RNF118

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q32.32
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegTRAF3pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr14:102,777,326–102,911,500
Gene span
134,175 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000392745 ★102,777,449–102,911,50012
ENST00000560371102,777,326–102,911,50011
ENST00000539721102,777,326–102,911,5008
ENST00000351691102,777,326–102,911,50011
ENST00000860914102,777,326–102,911,50010
ENST00000860915102,777,326–102,911,50010
ENST00000860916102,777,326–102,911,50012
ENST00000860917102,777,326–102,911,50012
ENST00000939074102,777,326–102,911,5009
ENST00000939075102,777,326–102,911,5005
ENST00000952335102,777,326–102,911,50013
ENST00000952336102,777,326–102,911,50013

顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TRAF3 是細胞質 E3 ubiquitin ligase,能調節 NF-kappa-B、MAPK 與 IRF 訊息傳遞路徑,因而參與免疫及非免疫細胞中的多種生物過程。它可將 ubiquitin 加到受體蛋白的 lysine 上;在 TLR 與 RLR 訊息傳遞中,TRAF3 促進包括 ASC 在內的底物形成 Lys-63 連結的 polyubiquitin chain,進而促成 type I interferon response 或 inflammasome 活化。

在部分 TLR(例如 TLR4)活化後,TRAF3 可負向調節 NF-kappa-B,可能有助於避免發炎反應失控。另一方面,TRAF3 經 Lys-48 連結的 polyubiquitination 降解,是 MAPK 活化及發炎細胞激素產生所需的步驟。當 TLR4 協調細菌排出時,TRAF3 則可發生 Lys-33 連結的 polyubiquitination,隨後結合 RALGDS,促使 exocyst complex 移動,使細胞內細菌迅速排出以利清除。

TRAF3 也持續抑制 alternative NF-kappa-B pathway;此路徑與 B 細胞存活及淋巴器官發育有關。TRAF3 下調 NFKB2 的蛋白水解加工,因而抑制 NF-kappa-B 的 non-canonical 活化,並促進 MAP3K14 ubiquitination 及其後續的 proteasomal degradation。

在免疫功能方面,TRAF3 是 IgM 轉換為 IgG 的正常抗體同型轉換所需因子,也參與 T 細胞依賴性免疫反應。其對不同訊息路徑的調節方向與結果,會隨刺激及 ubiquitin 連結型式而異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 102777449 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TRAF3 ENST00000392745 GRCh38 chr14:102776449-102777549 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCAGAAGCCCTCCCTTCGCTTCCCACCTCGCCAGGCCCAGCCAGGCTGGGTGCTGCCTTGGTGGGCCTAG
GTGAATCACTGACACACCACTGATGCCTTTGGGGCAGAAGGCAGAGGCCTCGGGAGAAATGCGCAGGCCC
CAGCGGCCTGGTGGAGGGTGCAGGGGGCGCAGGGGCAGCCAGGACCGCCGAGGACGCTGGGGGCACGTGG
CAAACTGGCTACCCTGTCCACCCGTGAGCAAGACACCACTCCGGGGGCGTGGGAGGGTCCAAGGGAGGGA
GAAAGGAAAGTGCCACCAAACTAATGTGGAGCCCTGCCCTCTGCATGCGAAAAGGGGCTCCACGGCCTGA
GTCACCCTCAGCCCCACCTGCGTGTGCGCGAGGGTGCGTGGCCTGGTACGCGTGCGCACGGTGTTGGTGA
GCGTGTGTGTGCGTGTCCGCTTGAGGGGAATGTGACCGTCGTGTATGCGTCCGCGACAGTGCGGGGGGCC
GCATATCGGACCCGTGCGTGTGCGTAGGGGTCGCGTGTGGCCATGGGCACACGGGCGTGCACGCACGGGG
GCTGCGTATGCTATGCTGGCGTGGGGGGTGCGGGCGAGGTGGCCGCGGGGAGGAGCGGCGCCAGCACCTC
TCGGCCCCCACGCGGCCTGCGTGGCTTTTTGACCCGGAAAGGCGGGGACGCGGGGACGCGCGGCGGCGGG
GGCGCGGCGGGGGCGGCGCAGAGCGAGGAGGCCCGCGGGGCGCGCGGCGGGGACGGGAGGGAGGCGGGGG
GCGCCCGGGGCCGTCCCCGCCCCGCGCCGCGGCGCCGCCGTTGCTAAGGCCGGGCGGGCGGCCGCCGGGC
GCTAGGGCCCTTAGCAACGGGTCGCGGGCGCGCGCGGGGGGCCGGCGGGCGCGTGGGGCCGGCGGCGCTC
GCGGGCTCCTGCCGCTCCCACGCGCGCGGGCGGCGGGGGCGGGGCGGCGGGCGCGCCGGGGATTTCCAGC
GCGCGAGAGGAAGTGCCTGCGCGGGGCTGCGTGAGGGAGCGAGGGAGCGAGGGAGCGCGGCGCGGCCGCC
GCGTGCGCGAGCCGGGGTTGCAGCCCAGCCGGGACTTTCCAGCCGGCGGCA
TRAF3 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TRAF3_1 ↗14:102,777,449正股102,777,400–102,777,459
TRAF3_2 ↗14:102,777,605正股102,777,556–102,777,615
TRAF3_3 ↗14:102,779,300正股102,779,251–102,779,310

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_93HRDM · enhancer · 102773222–102773501 · regulatory

ENSR14_5W6NBN · CTCF_binding_site · 102773366–102773387 · regulatory

ENSR14_93HRF2 · enhancer · 102774427–102774801 · regulatory

ENSR14_BQDP4 · promoter · 102774802–102775371 · regulatory

ENSR14_93HRFG · promoter · 102775823–102776323 · regulatory

ENSR14_BQDPD · promoter · 102776959–102777625 · regulatory

ENSR14_CD7CR · enhancer · 102777626–102779234 · regulatory

ENSR14_852KX4 · enhancer · 102779764–102779956 · regulatory

ENSR14_5W6PG2 · CTCF_binding_site · 102779919–102779940 · regulatory

· motif · 102773368–102773384 · motif

· motif · 102773848–102773863 · motif

· motif · 102774094–102774105 · motif

· motif · 102774141–102774156 · motif

· motif · 102774146–102774158 · motif

· motif · 102774149–102774156 · motif

· motif · 102774237–102774248 · motif

· motif · 102774459–102774468 · motif

· motif · 102774459–102774468 · motif

· motif · 102775463–102775477 · motif

· motif · 102775602–102775617 · motif

· motif · 102775607–102775619 · motif

· motif · 102775610–102775617 · motif

· motif · 102775909–102775916 · motif

· motif · 102776205–102776227 · motif

· motif · 102776205–102776227 · motif

· motif · 102776266–102776274 · motif

· motif · 102776421–102776443 · motif

· motif · 102776421–102776443 · motif

· motif · 102776726–102776746 · motif

· motif · 102776795–102776803 · motif

· motif · 102776811–102776820 · motif

· motif · 102777024–102777037 · motif

· motif · 102777088–102777105 · motif

· motif · 102777099–102777114 · motif

· motif · 102777109–102777120 · motif

· motif · 102777135–102777148 · motif

· motif · 102777141–102777154 · motif

· motif · 102777152–102777165 · motif

· motif · 102777192–102777205 · motif

· motif · 102777228–102777241 · motif

· motif · 102777371–102777384 · motif

· motif · 102777388–102777401 · motif

· motif · 102777496–102777507 · motif

· motif · 102778000–102778007 · motif

· motif · 102778141–102778149 · motif

· motif · 102779861–102779870 · motif

· motif · 102779921–102779937 · motif

· motif · 102780782–102780797 · motif

· motif · 102780806–102780818 · motif

· motif · 102780970–102780981 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:568 aa

1 aa568 aa結構域功能區域鋅指
依 Q13114 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TRAF3 蛋白質長 568 個胺基酸,屬於 TNF receptor-associated factor 家族。註解包含 N 端第 1–28 位的無序區、RING-type zinc finger(第 68–77 位)、兩個 TRAF-type zinc finger(第 135–190 位及第 191–249 位),以及第 415–560 位的 MATH domain。第 392–415 位另被註記為與 Andes hantavirus 及 New York hantavirus glycoprotein N 互作相關的區域。

結構域MATH415–560 aa
鋅指RING-type68–77 aa
鋅指TRAF-type 1135–190 aa
鋅指TRAF-type 2191–249 aa
功能區域Disordered1–28 aa
功能區域(Microbial infection) Interaction with glycoprotein N of Andes and New York hantaviruses392–415 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8ZUK…

PDB · 8ZUK

EM · 2.83 A · A/B/C/G/H/I/M/N/O/S/T/U/Y/Z/a/e/f/g/k/l/m=267-568

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Endosome;Mitochondrion

TRAF3 註記位於細胞質、胞內體及粒線體。 依相似性推定,在 LPS 訊息傳遞時,TRAF3 會與 TLR4 一同經歷內吞;另有資料指出 TRAF3 與 TRIM35 共定位於粒線體。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 41 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CAP-1TRAF3ASCC1BIVMBRAFC10orf62CCDC13CCDC184CD40CDC37EDA2RGMEB1GMEB2IFT25IP6K3LNX1LTBRMAP3K14NTAQ1PDZD4PIAS2POM121PSMB8PTPN22RAD23ARIPK1RIPK2RIPPLY1RNF4SHPKSNAP29TANKTBK1TRAF3IP1TRAF5UBE2IWDR5ZBTB49ZMYND11ZSCAN4Azi2Irf1Zbp1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 41 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TRAF3 可形成同源三聚體,也能與 TRAF2、TRAF5 形成異源三聚體。其互作對象包括多種受體及訊息傳遞蛋白;例如與 TNFRSF5/CD40 的互作會受 TANK/ITRAF 調節,因兩者競爭相同結合位點。TRAF3 也被發現與 TRAF2、MAP3K14、BIRC3 同處一複合體;LPS 刺激時則會被招募至含多種訊息傳遞成分的暫時性複合體,此項為相似性推定。感染情境下,New York、Andes 與 Tula hantavirus 的 glycoprotein N 均可與 TRAF3 互作,並抑制 TRAF3-TBK1 complex 形成;TRAF3 另與 Epstein-Barr virus 蛋白 LMP1 互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響 TRAF3 的變異與兩種常染色體顯性免疫缺陷相關。Immunodeficiency 132A 的特徵包括對部分病原體感染較易感,例如 Herpes simplex virus 與 Mycobacterium abscessus,並有包括 INFB、IL6 在內的細胞激素產生受損。Immunodeficiency 132B 通常於兒童期發病,可見反覆上、下呼吸道感染、B 細胞淋巴組織增生及 T 細胞亞群與功能失調;其他表現不一,可包括自體免疫、自體發炎,以及免疫球蛋白過多或過少。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

10 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 10 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TRAF3 是細胞質 E3 ubiquitin ligase,可調節 NF-kappa-B、MAPK 與 IRF 路徑。在 TLR、RLR 訊息傳遞中,它促進底物形成 Lys-63 polyubiquitin chain,連結至 type I interferon response 或 inflammasome 活化;在特定 TLR 刺激下也調節 NF-kappa-B、MAPK 及發炎反應,並參與細菌排出、抗體同型轉換與 T 細胞依賴性免疫。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasmic E3 ubiquitin ligase that regulates various signaling pathways, such as the NF-kappa-B, mitogen-activated protein kinase (MAPK) and interferon regulatory factor (IRF) pathways, and thus controls a lot of biological processes in both immune and non-immune cell types. In TLR and RLR signaling pathways, acts as an E3 ubiquitin ligase promoting the synthesis of 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains on several substrates such as ASC that lead to the activation of the type I interferon response or the inflammasome. Following the activation of certain TLRs such as TLR4, acts as a negative NF-kappa-B regulator, possibly to avoid unregulated inflammatory response, and its degradation via 'Lys-48'-linked polyubiquitination is required for MAPK activation and production of inflammatory cytokines. Alternatively, when TLR4 orchestrates bacterial expulsion, TRAF3 undergoes 'Lys-33'-linked polyubiquitination and subsequently binds to RALGDS, mobilizing the exocyst complex to rapidly expel intracellular bacteria back for clearance. Also acts as a constitutive negative regulator of the alternative NF-kappa-B pathway, which controls B-cell survival and lymphoid organ development. Required for normal antibody isotype switching from IgM to IgG. Plays a role T-cell dependent immune responses. Down-regulates proteolytic processing of NFKB2, and thereby inhibits non-canonical activation of NF-kappa-B. Promotes ubiquitination and proteasomal degradation of MAP3K14

PMID 15084608 ↗ · PMID 15383523 ↗ · PMID 17991829 ↗ · PMID 19937093 ↗ · PMID 20097753 ↗ · PMID 20185819 ↗ · PMID 25847972 ↗ · PMID 27980081 ↗ · PMID 32562145 ↗ · PMID 33148796 ↗ · PMID 33608556 ↗ · PMID 34011520 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine.含實驗來源
證據與來源

S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine.

PMID 25847972 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TRAF3 可形成同源三聚體,或與 TRAF2、TRAF5 組成異源三聚體,並與多種受體及訊息傳遞蛋白互作。TANK/ITRAF 會競爭 TNFRSF5/CD40 的相同結合位點;TRAF3 也可參與含 TRAF2、MAP3K14、BIRC3 的複合體。LPS 刺激時其被招募至暫時性複合體屬於相似性推定,另有多項互作及促進 ubiquitination 的關係。含實驗來源
證據與來源

Homotrimer. Heterotrimer with TRAF2 and TRAF5. Interacts with LTBR/TNFRSF3, TNFRSF4, TNFRSF5/CD40, TNFRSF8/CD30, TNFRSF13C TNFRSF17/BCMA, TLR4 and EDAR. Interacts with MAP3K5, MAP3K14, TRAIP/TRIP, TDP2/TTRAP, TANK/ITRAF and IFT54. Interaction with TNFRSF5/CD40 is modulated by TANK/ITRAF, which competes for the same binding site. Interacts with TICAM1. Interacts with TRAFD1. Interacts with OTUB1, OTUB2 and OTUD5. Interacts with RNF216, OPTN and TBK1. Identified in a complex with TRAF2, MAP3K14 and BIRC3. Interacts with BIRC2 and BIRC3. Upon exposure to bacterial lipopolysaccharide (LPS), recruited to a transient complex containing TLR4, TRAF3, TRAF6, IKBKG, MAP3K7, MYD88, TICAM1, BIRC2, BIRC3 and UBE2N (By similarity). Interacts (via RING-type zinc finger domain) with SRC. Interacts with CARD14. Interacts (via MATH domain) with PTPN22; the interaction promotes TRAF3 polyubiquitination. Interacts with MAVS. Directly interacts with DDX3X; this interaction stimulates TRAF3 'Lys-63' ubiquitination. Interacts with IRF3. Interacts with IKBKE in the course of Sendai virus infection. Interacts with TRIM35. Interacts with GAPDH; promoting TRAF3 ubiquitination. Interacts with PPP3CA and PPP3CB (By similarity). Interacts with ATP1B1; promoting TRAF3 ubiquitination. Interacts with RALGDS. Interacts with FBXO11

PMID 10037686 ↗ · PMID 10523862 ↗ · PMID 10764746 ↗ · PMID 10791955 ↗ · PMID 10809768 ↗ · PMID 10903733 ↗ · PMID 10984535 ↗ · PMID 11035039 ↗ · PMID 12005438 ↗ · PMID 14517219 ↗ · PMID 15084608 ↗ · PMID 15383523 ↗ · PMID 15585864 ↗ · PMID 16009714 ↗ · PMID 17991829 ↗ · PMID 19419966 ↗ · PMID 19893624 ↗ · PMID 19996094 ↗ · PMID 20097753 ↗ · PMID 20174559 ↗ · PMID 21302310 ↗ · PMID 23871208 ↗ · PMID 27387501 ↗ · PMID 27438768 ↗ · PMID 27980081 ↗ · PMID 32562145 ↗ · PMID 36897010 ↗ · PMID 7527023 ↗ · PMID 7530216 ↗

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交互作用在微生物感染情境中,TRAF3 的 N 端與 New York hantavirus 的 glycoprotein N C 端互作;此互作會抑制 TRAF3-TBK1 complexes 的形成。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts (via N-terminus) with New York hantavirus glycoprotein N (via C-terminus); this interaction inhibits the formation of TRAF3-TBK1 complexes

PMID 18614628 ↗ · PMID 24390324 ↗

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交互作用在微生物感染情境中,Andes hantavirus 的 glycoprotein N 可與 TRAF3 互作;該病毒蛋白的 C 端參與此互作,並抑制 TRAF3-TBK1 complexes 的形成。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Andes hantavirus glycoprotein N (via C-terminus); this interaction inhibits the formation of TRAF3-TBK1 complexes

PMID 24390324 ↗

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交互作用在微生物感染情境中,Tula hantavirus 的 glycoprotein N 可與 TRAF3 互作,互作涉及該病毒蛋白的 C 端;此關係會抑制 TRAF3-TBK1 complexes 的形成。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Tula hantavirus glycoprotein N (via C-terminus); this interaction inhibits the formation of TRAF3-TBK1 complexes

PMID 24390324 ↗

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交互作用在微生物感染相關的互作註記中,TRAF3 與 Epstein-Barr virus 蛋白 LMP1 有互作;此筆資料未進一步描述互作的作用或結果。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Epstein-Barr virus protein LMP1

PMID 7859281 ↗

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細胞定位TRAF3 註記位於細胞質、胞內體及粒線體。依相似性推定,在 LPS 訊息傳遞時會與 TLR4 一同經歷內吞;另有資料指出 TRAF3 與 TRIM35 共定位於粒線體。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Endosome; Mitochondrion; Undergoes endocytosis together with TLR4 upon LPS signaling (By similarity). Co-localized to mitochondria with TRIM35

PMID 25847972 ↗ · PMID 34011520 ↗ · PMID 32562145 ↗

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疾病關聯Immunodeficiency 132A 是常染色體顯性免疫疾病,與影響 TRAF3 的變異相關。患者對某些病原體較易感,包括 Herpes simplex virus 與 Mycobacterium abscessus;免疫檢查可見細胞激素產生受損,所列例子包括 INFB 與 IL6。含實驗來源
證據與來源

Immunodeficiency 132A IMD132A An autosomal dominant immunologic disorder characterized by increased susceptibility to infection with certain pathogens, including Herpes simplex virus and Mycobacterium abscessus. Immunologic work-up shows impaired production of cytokines, including INFB and IL6. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614849

PMID 20832341 ↗ · PMID 36004314 ↗

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疾病關聯Immunodeficiency 132B 是常染色體顯性免疫疾病,與影響 TRAF3 的變異相關,通常於兒童期出現反覆上、下呼吸道感染、B 細胞淋巴組織增生及 T 細胞亞群與功能失調。其他不一定出現的表現包括自體免疫、自體發炎,以及免疫球蛋白過多或過少。含實驗來源
證據與來源

Immunodeficiency 132B IMD132B An autosomal dominant immune disorder characterized by childhood onset of recurrent upper and lower respiratory infections, B-cell lymphoid hyperplasia, and dysregulation of T-cell subsets and function. Additional variable features include autoimmunity, autoinflammation, and hyper- or hypogammaglobulinemia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 621096

PMID 35960817 ↗ · PMID 39579173 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 10 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000392745 · 7,806 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCGGGGCTGCGTGAGGGAGCGAGGGAGCGAGGGAGCGCGG40
41CGCGGCCGCCGCGTGCGCGAGCCGGGGTTGCAGCCCAGCC80
81GGGACTTTCCAGCCGGCGGCAGCCGCGGCGGCCGCCGGCT120
121CTTCCCCGCCCCCCGCCATGGGGCAGCCCGGGGAGCAGAA160
161CGCTGCGGACCGCGGCGGAGGACGCGCCCGGCGCCCCTGA200
201GCCGGCCGAGCGGCGACGGACCGCGAGATGAGGAAAATGA240
241GGCCCAAAGAAGTGATGCCACTTGGTTAAGGTCCCAGAGC280
281AGGTCAGAATCAGACCTAGGATCAGAAACCTGGCTCCTGG320
321CTCCTGGCTCCCTACTCTTCTAAGGATCGCTGTCCTGACA360
361GAAGAGAACTCCTCTTTCCTAAAATGGAGTCGAGTAAAAA400
401GATGGACTCTCCTGGCGCGCTGCAGACTAACCCGCCGCTA440
441AAGCTGCACACTGACCGCAGTGCTGGGACGCCAGTTTTTG480
481TCCCTGAACAAGGAGGTTACAAGGAAAAGTTTGTGAAGAC520
521CGTGGAGGACAAGTACAAGTGTGAGAAGTGCCACCTGGTG560
561CTGTGCAGCCCGAAGCAGACCGAGTGTGGGCACCGCTTCT600
601GCGAGAGCTGCATGGCGGCCCTGCTGAGCTCTTCAAGTCC640
641AAAATGTACAGCGTGTCAAGAGAGCATCGTTAAAGATAAG680
681GTGTTTAAGGATAATTGCTGCAAGAGAGAAATTCTGGCTC720
721TTCAGATCTATTGTCGGAATGAAAGCAGAGGTTGTGCAGA760
761GCAGTTAATGCTGGGACATCTGCTGGTGCATTTAAAAAAT800
801GATTGCCATTTTGAAGAACTTCCATGTGTGCGTCCTGACT840
841GCAAAGAAAAGGTCTTGAGGAAAGACCTGCGAGACCACGT880
881GGAGAAGGCGTGTAAATACCGGGAAGCCACATGCAGCCAC920
921TGCAAGAGTCAGGTTCCGATGATCGCGCTGCAGAAACACG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。