基因總覽
TRAF3(TNF receptor associated factor 3)是蛋白質編碼基因,產物屬於 TNF receptor-associated factor 家族。這個蛋白質具有 E3 ubiquitin ligase 活性,能調節多種訊息傳遞路徑;相關作用涵蓋免疫與非免疫細胞中的生物過程。其功能涉及 NF-kappa-B、MAPK 與 IRF 等路徑,並與免疫反應調節相關。來源也指出,TRAF3 參與抗體同型轉換及 T 細胞依賴性免疫反應;其具體分子作用方式則見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000392745 ★ | 102,777,449–102,911,500 | 12 |
| ENST00000560371 | 102,777,326–102,911,500 | 11 |
| ENST00000539721 | 102,777,326–102,911,500 | 8 |
| ENST00000351691 | 102,777,326–102,911,500 | 11 |
| ENST00000860914 | 102,777,326–102,911,500 | 10 |
| ENST00000860915 | 102,777,326–102,911,500 | 10 |
| ENST00000860916 | 102,777,326–102,911,500 | 12 |
| ENST00000860917 | 102,777,326–102,911,500 | 12 |
| ENST00000939074 | 102,777,326–102,911,500 | 9 |
| ENST00000939075 | 102,777,326–102,911,500 | 5 |
| ENST00000952335 | 102,777,326–102,911,500 | 13 |
| ENST00000952336 | 102,777,326–102,911,500 | 13 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRAF3 是細胞質 E3 ubiquitin ligase,能調節 NF-kappa-B、MAPK 與 IRF 訊息傳遞路徑,因而參與免疫及非免疫細胞中的多種生物過程。它可將 ubiquitin 加到受體蛋白的 lysine 上;在 TLR 與 RLR 訊息傳遞中,TRAF3 促進包括 ASC 在內的底物形成 Lys-63 連結的 polyubiquitin chain,進而促成 type I interferon response 或 inflammasome 活化。
在部分 TLR(例如 TLR4)活化後,TRAF3 可負向調節 NF-kappa-B,可能有助於避免發炎反應失控。另一方面,TRAF3 經 Lys-48 連結的 polyubiquitination 降解,是 MAPK 活化及發炎細胞激素產生所需的步驟。當 TLR4 協調細菌排出時,TRAF3 則可發生 Lys-33 連結的 polyubiquitination,隨後結合 RALGDS,促使 exocyst complex 移動,使細胞內細菌迅速排出以利清除。
TRAF3 也持續抑制 alternative NF-kappa-B pathway;此路徑與 B 細胞存活及淋巴器官發育有關。TRAF3 下調 NFKB2 的蛋白水解加工,因而抑制 NF-kappa-B 的 non-canonical 活化,並促進 MAP3K14 ubiquitination 及其後續的 proteasomal degradation。
在免疫功能方面,TRAF3 是 IgM 轉換為 IgG 的正常抗體同型轉換所需因子,也參與 T 細胞依賴性免疫反應。其對不同訊息路徑的調節方向與結果,會隨刺激及 ubiquitin 連結型式而異。
Promoter 與基因調控
>TRAF3 ENST00000392745 GRCh38 chr14:102776449-102777549 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCAGAAGCCCTCCCTTCGCTTCCCACCTCGCCAGGCCCAGCCAGGCTGGGTGCTGCCTTGGTGGGCCTAG GTGAATCACTGACACACCACTGATGCCTTTGGGGCAGAAGGCAGAGGCCTCGGGAGAAATGCGCAGGCCC CAGCGGCCTGGTGGAGGGTGCAGGGGGCGCAGGGGCAGCCAGGACCGCCGAGGACGCTGGGGGCACGTGG CAAACTGGCTACCCTGTCCACCCGTGAGCAAGACACCACTCCGGGGGCGTGGGAGGGTCCAAGGGAGGGA GAAAGGAAAGTGCCACCAAACTAATGTGGAGCCCTGCCCTCTGCATGCGAAAAGGGGCTCCACGGCCTGA GTCACCCTCAGCCCCACCTGCGTGTGCGCGAGGGTGCGTGGCCTGGTACGCGTGCGCACGGTGTTGGTGA GCGTGTGTGTGCGTGTCCGCTTGAGGGGAATGTGACCGTCGTGTATGCGTCCGCGACAGTGCGGGGGGCC GCATATCGGACCCGTGCGTGTGCGTAGGGGTCGCGTGTGGCCATGGGCACACGGGCGTGCACGCACGGGG GCTGCGTATGCTATGCTGGCGTGGGGGGTGCGGGCGAGGTGGCCGCGGGGAGGAGCGGCGCCAGCACCTC TCGGCCCCCACGCGGCCTGCGTGGCTTTTTGACCCGGAAAGGCGGGGACGCGGGGACGCGCGGCGGCGGG GGCGCGGCGGGGGCGGCGCAGAGCGAGGAGGCCCGCGGGGCGCGCGGCGGGGACGGGAGGGAGGCGGGGG GCGCCCGGGGCCGTCCCCGCCCCGCGCCGCGGCGCCGCCGTTGCTAAGGCCGGGCGGGCGGCCGCCGGGC GCTAGGGCCCTTAGCAACGGGTCGCGGGCGCGCGCGGGGGGCCGGCGGGCGCGTGGGGCCGGCGGCGCTC GCGGGCTCCTGCCGCTCCCACGCGCGCGGGCGGCGGGGGCGGGGCGGCGGGCGCGCCGGGGATTTCCAGC GCGCGAGAGGAAGTGCCTGCGCGGGGCTGCGTGAGGGAGCGAGGGAGCGAGGGAGCGCGGCGCGGCCGCC GCGTGCGCGAGCCGGGGTTGCAGCCCAGCCGGGACTTTCCAGCCGGCGGCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRAF3_1 ↗ | 14:102,777,449 | 正股 | 102,777,400–102,777,459 |
| TRAF3_2 ↗ | 14:102,777,605 | 正股 | 102,777,556–102,777,615 |
| TRAF3_3 ↗ | 14:102,779,300 | 正股 | 102,779,251–102,779,310 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_93HRDM · enhancer · 102773222–102773501 · regulatory
ENSR14_5W6NBN · CTCF_binding_site · 102773366–102773387 · regulatory
ENSR14_93HRF2 · enhancer · 102774427–102774801 · regulatory
ENSR14_BQDP4 · promoter · 102774802–102775371 · regulatory
ENSR14_93HRFG · promoter · 102775823–102776323 · regulatory
ENSR14_BQDPD · promoter · 102776959–102777625 · regulatory
ENSR14_CD7CR · enhancer · 102777626–102779234 · regulatory
ENSR14_852KX4 · enhancer · 102779764–102779956 · regulatory
ENSR14_5W6PG2 · CTCF_binding_site · 102779919–102779940 · regulatory
· motif · 102773368–102773384 · motif
· motif · 102773848–102773863 · motif
· motif · 102774094–102774105 · motif
· motif · 102774141–102774156 · motif
· motif · 102774146–102774158 · motif
· motif · 102774149–102774156 · motif
· motif · 102774237–102774248 · motif
· motif · 102774459–102774468 · motif
· motif · 102774459–102774468 · motif
· motif · 102775463–102775477 · motif
· motif · 102775602–102775617 · motif
· motif · 102775607–102775619 · motif
· motif · 102775610–102775617 · motif
· motif · 102775909–102775916 · motif
· motif · 102776205–102776227 · motif
· motif · 102776205–102776227 · motif
· motif · 102776266–102776274 · motif
· motif · 102776421–102776443 · motif
· motif · 102776421–102776443 · motif
· motif · 102776726–102776746 · motif
· motif · 102776795–102776803 · motif
· motif · 102776811–102776820 · motif
· motif · 102777024–102777037 · motif
· motif · 102777088–102777105 · motif
· motif · 102777099–102777114 · motif
· motif · 102777109–102777120 · motif
· motif · 102777135–102777148 · motif
· motif · 102777141–102777154 · motif
· motif · 102777152–102777165 · motif
· motif · 102777192–102777205 · motif
· motif · 102777228–102777241 · motif
· motif · 102777371–102777384 · motif
· motif · 102777388–102777401 · motif
· motif · 102777496–102777507 · motif
· motif · 102778000–102778007 · motif
· motif · 102778141–102778149 · motif
· motif · 102779861–102779870 · motif
· motif · 102779921–102779937 · motif
· motif · 102780782–102780797 · motif
· motif · 102780806–102780818 · motif
· motif · 102780970–102780981 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:568 aa
TRAF3 蛋白質長 568 個胺基酸,屬於 TNF receptor-associated factor 家族。註解包含 N 端第 1–28 位的無序區、RING-type zinc finger(第 68–77 位)、兩個 TRAF-type zinc finger(第 135–190 位及第 191–249 位),以及第 415–560 位的 MATH domain。第 392–415 位另被註記為與 Andes hantavirus 及 New York hantavirus glycoprotein N 互作相關的區域。
蛋白質三維結構
PDB · 8ZUK
EM · 2.83 A · A/B/C/G/H/I/M/N/O/S/T/U/Y/Z/a/e/f/g/k/l/m=267-568
查看原始結構紀錄 ↗實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。
細胞內定位
TRAF3 註記位於細胞質、胞內體及粒線體。 依相似性推定,在 LPS 訊息傳遞時,TRAF3 會與 TLR4 一同經歷內吞;另有資料指出 TRAF3 與 TRIM35 共定位於粒線體。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 41 個夥伴
- ASCC1Q8N9N2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BIVMQ86UB2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- BRAFP15056 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- C10orf62Q5T681 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC13Q8IYE1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC184Q52MB2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD40P25942 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDC37Q16543 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EDA2RQ9HAV5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GMEB1Q9Y692 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GMEB2Q9UKD1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IFT25Q9Y547 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IP6K3Q96PC2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LTBRP36941 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MAP3K14Q99558 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- NTAQ1Q96HA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PDZD4Q17RL8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIAS2O75928-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POM121Q96HA1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PSMB8P28062-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTPN22Q9Y2R2 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAD23AP54725 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RIPK1Q13546 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RIPK2O43353 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
TRAF3 可形成同源三聚體,也能與 TRAF2、TRAF5 形成異源三聚體。其互作對象包括多種受體及訊息傳遞蛋白;例如與 TNFRSF5/CD40 的互作會受 TANK/ITRAF 調節,因兩者競爭相同結合位點。TRAF3 也被發現與 TRAF2、MAP3K14、BIRC3 同處一複合體;LPS 刺激時則會被招募至含多種訊息傳遞成分的暫時性複合體,此項為相似性推定。感染情境下,New York、Andes 與 Tula hantavirus 的 glycoprotein N 均可與 TRAF3 互作,並抑制 TRAF3-TBK1 complex 形成;TRAF3 另與 Epstein-Barr virus 蛋白 LMP1 互作。
疾病與遺傳關聯
影響 TRAF3 的變異與兩種常染色體顯性免疫缺陷相關。Immunodeficiency 132A 的特徵包括對部分病原體感染較易感,例如 Herpes simplex virus 與 Mycobacterium abscessus,並有包括 INFB、IL6 在內的細胞激素產生受損。Immunodeficiency 132B 通常於兒童期發病,可見反覆上、下呼吸道感染、B 細胞淋巴組織增生及 T 細胞亞群與功能失調;其他表現不一,可包括自體免疫、自體發炎,以及免疫球蛋白過多或過少。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 10 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRAF3 是細胞質 E3 ubiquitin ligase,可調節 NF-kappa-B、MAPK 與 IRF 路徑。在 TLR、RLR 訊息傳遞中,它促進底物形成 Lys-63 polyubiquitin chain,連結至 type I interferon response 或 inflammasome 活化;在特定 TLR 刺激下也調節 NF-kappa-B、MAPK 及發炎反應,並參與細菌排出、抗體同型轉換與 T 細胞依賴性免疫。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasmic E3 ubiquitin ligase that regulates various signaling pathways, such as the NF-kappa-B, mitogen-activated protein kinase (MAPK) and interferon regulatory factor (IRF) pathways, and thus controls a lot of biological processes in both immune and non-immune cell types. In TLR and RLR signaling pathways, acts as an E3 ubiquitin ligase promoting the synthesis of 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains on several substrates such as ASC that lead to the activation of the type I interferon response or the inflammasome. Following the activation of certain TLRs such as TLR4, acts as a negative NF-kappa-B regulator, possibly to avoid unregulated inflammatory response, and its degradation via 'Lys-48'-linked polyubiquitination is required for MAPK activation and production of inflammatory cytokines. Alternatively, when TLR4 orchestrates bacterial expulsion, TRAF3 undergoes 'Lys-33'-linked polyubiquitination and subsequently binds to RALGDS, mobilizing the exocyst complex to rapidly expel intracellular bacteria back for clearance. Also acts as a constitutive negative regulator of the alternative NF-kappa-B pathway, which controls B-cell survival and lymphoid organ development. Required for normal antibody isotype switching from IgM to IgG. Plays a role T-cell dependent immune responses. Down-regulates proteolytic processing of NFKB2, and thereby inhibits non-canonical activation of NF-kappa-B. Promotes ubiquitination and proteasomal degradation of MAP3K14 PMID 15084608 ↗ · PMID 15383523 ↗ · PMID 17991829 ↗ · PMID 19937093 ↗ · PMID 20097753 ↗ · PMID 20185819 ↗ · PMID 25847972 ↗ · PMID 27980081 ↗ · PMID 32562145 ↗ · PMID 33148796 ↗ · PMID 33608556 ↗ · PMID 34011520 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. | 含實驗來源 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. PMID 25847972 ↗ |
| 交互作用 | TRAF3 可形成同源三聚體,或與 TRAF2、TRAF5 組成異源三聚體,並與多種受體及訊息傳遞蛋白互作。TANK/ITRAF 會競爭 TNFRSF5/CD40 的相同結合位點;TRAF3 也可參與含 TRAF2、MAP3K14、BIRC3 的複合體。LPS 刺激時其被招募至暫時性複合體屬於相似性推定,另有多項互作及促進 ubiquitination 的關係。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotrimer. Heterotrimer with TRAF2 and TRAF5. Interacts with LTBR/TNFRSF3, TNFRSF4, TNFRSF5/CD40, TNFRSF8/CD30, TNFRSF13C TNFRSF17/BCMA, TLR4 and EDAR. Interacts with MAP3K5, MAP3K14, TRAIP/TRIP, TDP2/TTRAP, TANK/ITRAF and IFT54. Interaction with TNFRSF5/CD40 is modulated by TANK/ITRAF, which competes for the same binding site. Interacts with TICAM1. Interacts with TRAFD1. Interacts with OTUB1, OTUB2 and OTUD5. Interacts with RNF216, OPTN and TBK1. Identified in a complex with TRAF2, MAP3K14 and BIRC3. Interacts with BIRC2 and BIRC3. Upon exposure to bacterial lipopolysaccharide (LPS), recruited to a transient complex containing TLR4, TRAF3, TRAF6, IKBKG, MAP3K7, MYD88, TICAM1, BIRC2, BIRC3 and UBE2N (By similarity). Interacts (via RING-type zinc finger domain) with SRC. Interacts with CARD14. Interacts (via MATH domain) with PTPN22; the interaction promotes TRAF3 polyubiquitination. Interacts with MAVS. Directly interacts with DDX3X; this interaction stimulates TRAF3 'Lys-63' ubiquitination. Interacts with IRF3. Interacts with IKBKE in the course of Sendai virus infection. Interacts with TRIM35. Interacts with GAPDH; promoting TRAF3 ubiquitination. Interacts with PPP3CA and PPP3CB (By similarity). Interacts with ATP1B1; promoting TRAF3 ubiquitination. Interacts with RALGDS. Interacts with FBXO11 PMID 10037686 ↗ · PMID 10523862 ↗ · PMID 10764746 ↗ · PMID 10791955 ↗ · PMID 10809768 ↗ · PMID 10903733 ↗ · PMID 10984535 ↗ · PMID 11035039 ↗ · PMID 12005438 ↗ · PMID 14517219 ↗ · PMID 15084608 ↗ · PMID 15383523 ↗ · PMID 15585864 ↗ · PMID 16009714 ↗ · PMID 17991829 ↗ · PMID 19419966 ↗ · PMID 19893624 ↗ · PMID 19996094 ↗ · PMID 20097753 ↗ · PMID 20174559 ↗ · PMID 21302310 ↗ · PMID 23871208 ↗ · PMID 27387501 ↗ · PMID 27438768 ↗ · PMID 27980081 ↗ · PMID 32562145 ↗ · PMID 36897010 ↗ · PMID 7527023 ↗ · PMID 7530216 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中,TRAF3 的 N 端與 New York hantavirus 的 glycoprotein N C 端互作;此互作會抑制 TRAF3-TBK1 complexes 的形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts (via N-terminus) with New York hantavirus glycoprotein N (via C-terminus); this interaction inhibits the formation of TRAF3-TBK1 complexes PMID 18614628 ↗ · PMID 24390324 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中,Andes hantavirus 的 glycoprotein N 可與 TRAF3 互作;該病毒蛋白的 C 端參與此互作,並抑制 TRAF3-TBK1 complexes 的形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Andes hantavirus glycoprotein N (via C-terminus); this interaction inhibits the formation of TRAF3-TBK1 complexes PMID 24390324 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中,Tula hantavirus 的 glycoprotein N 可與 TRAF3 互作,互作涉及該病毒蛋白的 C 端;此關係會抑制 TRAF3-TBK1 complexes 的形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Tula hantavirus glycoprotein N (via C-terminus); this interaction inhibits the formation of TRAF3-TBK1 complexes PMID 24390324 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染相關的互作註記中,TRAF3 與 Epstein-Barr virus 蛋白 LMP1 有互作;此筆資料未進一步描述互作的作用或結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TRAF3 註記位於細胞質、胞內體及粒線體。依相似性推定,在 LPS 訊息傳遞時會與 TLR4 一同經歷內吞;另有資料指出 TRAF3 與 TRIM35 共定位於粒線體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Endosome; Mitochondrion; Undergoes endocytosis together with TLR4 upon LPS signaling (By similarity). Co-localized to mitochondria with TRIM35 PMID 25847972 ↗ · PMID 34011520 ↗ · PMID 32562145 ↗ |
| 疾病關聯 | Immunodeficiency 132A 是常染色體顯性免疫疾病,與影響 TRAF3 的變異相關。患者對某些病原體較易感,包括 Herpes simplex virus 與 Mycobacterium abscessus;免疫檢查可見細胞激素產生受損,所列例子包括 INFB 與 IL6。 | 含實驗來源 | 證據與來源Immunodeficiency 132A IMD132A An autosomal dominant immunologic disorder characterized by increased susceptibility to infection with certain pathogens, including Herpes simplex virus and Mycobacterium abscessus. Immunologic work-up shows impaired production of cytokines, including INFB and IL6. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614849 PMID 20832341 ↗ · PMID 36004314 ↗ |
| 疾病關聯 | Immunodeficiency 132B 是常染色體顯性免疫疾病,與影響 TRAF3 的變異相關,通常於兒童期出現反覆上、下呼吸道感染、B 細胞淋巴組織增生及 T 細胞亞群與功能失調。其他不一定出現的表現包括自體免疫、自體發炎,以及免疫球蛋白過多或過少。 | 含實驗來源 | 證據與來源Immunodeficiency 132B IMD132B An autosomal dominant immune disorder characterized by childhood onset of recurrent upper and lower respiratory infections, B-cell lymphoid hyperplasia, and dysregulation of T-cell subsets and function. Additional variable features include autoimmunity, autoinflammation, and hyper- or hypogammaglobulinemia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 621096 PMID 35960817 ↗ · PMID 39579173 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCGGGGCTGCGTGAGGGAGCGAGGGAGCGAGGGAGCGCGG40CGCGGCCGCCGCGTGCGCGAGCCGGGGTTGCAGCCCAGCC80GGGACTTTCCAGCCGGCGGCAGCCGCGGCGGCCGCCGGCT120CTTCCCCGCCCCCCGCCATGGGGCAGCCCGGGGAGCAGAA160CGCTGCGGACCGCGGCGGAGGACGCGCCCGGCGCCCCTGA200GCCGGCCGAGCGGCGACGGACCGCGAGATGAGGAAAATGA240GGCCCAAAGAAGTGATGCCACTTGGTTAAGGTCCCAGAGC280AGGTCAGAATCAGACCTAGGATCAGAAACCTGGCTCCTGG320CTCCTGGCTCCCTACTCTTCTAAGGATCGCTGTCCTGACA360GAAGAGAACTCCTCTTTCCTAAAATGGAGTCGAGTAAAAA400GATGGACTCTCCTGGCGCGCTGCAGACTAACCCGCCGCTA440AAGCTGCACACTGACCGCAGTGCTGGGACGCCAGTTTTTG480TCCCTGAACAAGGAGGTTACAAGGAAAAGTTTGTGAAGAC520CGTGGAGGACAAGTACAAGTGTGAGAAGTGCCACCTGGTG560CTGTGCAGCCCGAAGCAGACCGAGTGTGGGCACCGCTTCT600GCGAGAGCTGCATGGCGGCCCTGCTGAGCTCTTCAAGTCC640AAAATGTACAGCGTGTCAAGAGAGCATCGTTAAAGATAAG680GTGTTTAAGGATAATTGCTGCAAGAGAGAAATTCTGGCTC720TTCAGATCTATTGTCGGAATGAAAGCAGAGGTTGTGCAGA760GCAGTTAATGCTGGGACATCTGCTGGTGCATTTAAAAAAT800GATTGCCATTTTGAAGAACTTCCATGTGTGCGTCCTGACT840GCAAAGAAAAGGTCTTGAGGAAAGACCTGCGAGACCACGT880GGAGAAGGCGTGTAAATACCGGGAAGCCACATGCAGCCAC920TGCAAGAGTCAGGTTCCGATGATCGCGCTGCAGAAACACG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。