基因總覽
TRAF1 是蛋白質編碼基因，產物為 TNF receptor associated factor 1，屬於訊號接頭分子。其功能涉及多種訊號路徑，包含 NF-kappa-B 與 MAPK；在免疫訊號傳遞中，TRAF1 可與 TRAF2 組成異源三聚體，並參與 E3 ubiquitin-protein ligase 複合體。蛋白質全長 416 個胺基酸，具有位於第 266 至 412 個胺基酸的 MATH 結構域；N 端第 1 至 24 個胺基酸區域則被註記為無序區。這些特徵構成其參與蛋白質互作與訊號調節的基本分子背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000373887 ★ | 120,902,393–120,926,796 | 8 |
| ENST00000546084 | 120,902,393–120,914,572 | 6 |
| ENST00000540010 | 120,902,393–120,929,204 | 9 |
| ENST00000871615 | 120,902,393–120,929,134 | 8 |
| ENST00000871616 | 120,902,393–120,929,638 | 9 |
| ENST00000871617 | 120,902,393–120,929,204 | 9 |
| ENST00000913542 | 120,902,393–120,929,204 | 8 |
| ENST00000963770 | 120,902,393–120,931,875 | 9 |
| ENST00000963771 | 120,902,393–120,929,171 | 9 |
| ENST00000963772 | 120,902,393–120,929,171 | 9 |
| ENST00000963773 | 120,902,393–120,929,084 | 9 |
| ENST00000963774 | 120,902,393–120,929,204 | 9 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRAF1 是訊號接頭，可參與 NF-kappa-B、MAPK 等多條路徑，因此與發炎及細胞凋亡反應的調節相關。在 T 細胞中，它對活化具有調節作用：依相似性推定，TRAF1 可限制已活化 T 細胞中不依賴共刺激的 NIK 活化；另一方面，也能促進由 TNFRSF9 引發的典型 NF-kappa-B 路徑。這些作用顯示 TRAF1 在不同受體或細胞狀態下，可能參與調控訊號輸出的方式並不相同。
TRAF1 與 TRAF2 形成異源三聚體，並作為 E3 ubiquitin-protein ligase 複合體的一部分，介導目標蛋白質的泛素化；已列出的目標包括 MAP3K14 與 gasdermin D/GSDMD。此複合體亦可將抗凋亡 E3 ligases BIRC2 與 BIRC3 招募至 TNFRSF1B/TNFR2，將受體訊號與抗凋亡相關調節連結起來。
在抗病毒訊號中，TRAF1 位於 RIG-I/MAVS 路徑的 MAVS 下游，可增強 type I interferon 訊號。另在感染情境下，TRAF1 會放大 LMP1 介導的 MAP kinase 與典型 NF-kappa-B 路徑活性，但不放大非典型 NF-kappa-B 路徑，顯示其對不同 NF-kappa-B 分支的影響具有選擇性。
依相似性推定，TRAF1 也參與破骨細胞生成調節：它可避免 MLST8 被泛素化及降解，進而促進 PI3K-AKT 訊號，並增強破骨細胞中的氧化磷酸化。這些作用將 TRAF1 的訊號調節功能連結至破骨細胞的代謝狀態與生成過程；此處的機制屬相似性推定。
Promoter 與基因調控
>TRAF1 ENST00000373887 GRCh38 chr9:120926696-120927796 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGAGGTCGTTTGTTATGGGGGTGGAGGTCCTGATGTACATTGTGGCGGTAAGATGCCGTGCTGTCTTTGC CACCAGCCTGTGGCAGCCCTGGTGTTACACCAGGGCAGGTGGGCAGTTTAATGTATCTCAGGCCAGATGA CCTGCCCTGCCCACCTGTTGAGGCTCCAGTAGATAGACGTGAAAGCACAGTATAAGCATAATGCACCACT TTAATCCTTTTCTCTGAGGAGCTGGAAGGCCTGTAGTCACCATCTGAGCCAAATGTCATTCAAGTACTTC ACTTGGGTTACACACCACACTTTGACCCACTATCTCATTTAGTCATCACAACAAATGGGTGAAATAGGTA TTATTGTCCCATTTTACAGATGCAGAATCTGAGTTTCAGGGAAGTTAAGGACTTTGTCCCAGGGCCCACA GTTAGTAAGCAGTGGACCCAGGATTTCAACTCAGCTCTGTCTGACCTCAAAACCCATGATCTGAAACCAC TGTGAAAGTTTGCAAAACCTCTGTAGCAGCCAAGCAGGATGGAAAGATGTGTAGGGATTGTCTTCTCCAT TTGATAGATGAGACAAGAGCTGGGTACTCTGATCTCCATCCCAAGCACACAGAGCTTGGGGCCCCACAGC CCTGGTGTGAATCCCACTCCACTACCAGAGGCTGTGTGCCTTTGGACCAGGCATCTTGCTTCTCTGACCC TATATACAGCTGCAGAAGAATTCCTTGCAGGTTGCTGTAAGGATTTGGAGGGAAACTGTTGCCCAGCACA CAGTACACATTCTGGGAGCCATCGTTTCCCCAGTGCACTTTTCCTGCAAATGTGGATCTACATCCCACTT GGATGCTGAGACCAGCTGCTGTGATCTTGCATTTGTTTAGCGCTTTGTTCTCCTTGAGGCAGTAAAGTGG TGGCACCTGACCGGAGCATGTAGCCACCTATGACTTCCTGAGTGGGGTGGTGTGGGGAGGGCCCTGAGGA GTCTGTGGTCCTAGGCCTTGGATTTCATCAGGGCTTTCCTGCTCCTTCTGGTTGCCTCAGTCCCAGGCAA GATAGGGTCCCAGAATCTTACAGCCCAGAGGCCACCTGTTGCAACTTCTTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRAF1_1 ↗ | 9:120,926,163 | 負股 | 120,926,153–120,926,212 |
| TRAF1_2 ↗ | 9:120,929,154 | 負股 | 120,929,144–120,929,203 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_BTZXH · enhancer · 120921547–120922199 · regulatory
ENSR9_533FZ36 · CTCF_binding_site · 120926759–120926780 · regulatory
ENSR9_93QZXG · promoter · 120926786–120927286 · regulatory
ENSR9_CFZZP · enhancer · 120927939–120929162 · regulatory
ENSR9_533FZG5 · CTCF_binding_site · 120929127–120929148 · regulatory
ENSR9_93QZZ6 · promoter · 120929163–120929663 · regulatory
ENSR9_CFZZZ · enhancer · 120931148–120932638 · regulatory
· motif · 120923087–120923109 · motif
· motif · 120923087–120923109 · motif
· motif · 120924205–120924216 · motif
· motif · 120924633–120924648 · motif
· motif · 120924638–120924650 · motif
· motif · 120924641–120924648 · motif
· motif · 120925150–120925158 · motif
· motif · 120925150–120925165 · motif
· motif · 120925161–120925173 · motif
· motif · 120926202–120926219 · motif
· motif · 120926230–120926238 · motif
· motif · 120926371–120926384 · motif
· motif · 120926562–120926575 · motif
· motif · 120926562–120926575 · motif
· motif · 120926761–120926777 · motif
· motif · 120926806–120926823 · motif
· motif · 120927042–120927053 · motif
· motif · 120927318–120927335 · motif
· motif · 120927320–120927335 · motif
· motif · 120927453–120927475 · motif
· motif · 120927453–120927475 · motif
· motif · 120927488–120927501 · motif
· motif · 120928066–120928075 · motif
· motif · 120928348–120928361 · motif
· motif · 120928348–120928361 · motif
· motif · 120928469–120928480 · motif
· motif · 120928557–120928564 · motif
· motif · 120928671–120928684 · motif
· motif · 120928672–120928685 · motif
· motif · 120928672–120928685 · motif
· motif · 120928816–120928829 · motif
· motif · 120928915–120928928 · motif
· motif · 120929120–120929133 · motif
· motif · 120929129–120929145 · motif
· motif · 120929157–120929166 · motif
· motif · 120929386–120929395 · motif
· motif · 120929432–120929447 · motif
· motif · 120929514–120929522 · motif
· motif · 120931229–120931242 · motif
· motif · 120931229–120931242 · motif
· motif · 120931609–120931622 · motif
· motif · 120931665–120931672 · motif
· motif · 120931669–120931691 · motif
· motif · 120931669–120931691 · motif
· motif · 120931688–120931701 · motif
· motif · 120931728–120931741 · motif
· motif · 120931728–120931741 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：416 aa
TNF receptor associated factor 1 全長 416 個胺基酸。其第 266 至 412 個胺基酸區域含有 MATH 結構域；第 1 至 24 個胺基酸區域則註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TRAF1 的定位註記為細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 195 個夥伴
- A1CFQ9NQ94 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ACTN3Q08043 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AIRIMQ9NX04 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- AKAP17AQ02040-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AQP1P29972 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARID5AQ03989 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARSJQ8N5N6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BARD1A0AVN2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BARD1Q99728 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BCL6P41182 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- BEX2Q9BXY8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BIRC2Q13490 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- C1orf216Q8TAB5 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- C2CD6Q53TS8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CARHSP1Q9Y2V2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC116Q8IYX3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CCDC120Q96HB5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- CCDC146Q8IYE0-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC185Q8N715 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC198Q9NVL8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCHCR1Q8TD31-3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CDCA3Q99618 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CDK18Q07002 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDKN1AP38936 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDKN2BP42772 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
TRAF1 可形成同源三聚體，也可與 TRAF2 組成異源三聚體。來源列出其與多種 TNF receptor family 成員及其他蛋白質的互作，包括 BIRC2、BIRC3、MAP3K14、TBK1、MAVS 與 GSDMD；其中 BIRC2 或 BIRC3 可與 TRAF1–TRAF2 異源三聚體互作。感染情境下，TRAF1 與 Epstein-Barr virus BNFL1/LMP1 互作，該互作會招募 TRAF1:TRAF2，後者再與 LUBAC 結合並活化 TAB1/TAK1 複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRAF1 是參與 NF-kappa-B、MAPK 等多條訊號路徑的接頭分子，與發炎及凋亡反應調節相關。依相似性推定，它在活化 T 細胞中限制不依賴共刺激的 NIK 活化，並促進 TNFRSF9 引發的典型 NF-kappa-B 路徑。TRAF1 與 TRAF2 形成異源三聚體，參與 E3 ubiquitin-protein ligase 複合體對 MAP3K14、GSDMD 等目標進行泛素化；複合體亦將 BIRC2、BIRC3 招募至 TNFRSF1B/TNFR2。它在 RIG-I/MAVS 路徑中位於 MAVS 下游以增強 type I interferon 訊號，並依相似性推定透過維持 MLST8、促進 PI3K-AKT 訊號及氧化磷酸化調節破骨細胞生成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Adapter molecule that is involved in multiple signaling pathways including the NF-kappa-B and MAPK pathways and thus influences inflammatory and apoptotic responses. Plays a critical role in regulating T-cell activation both through restricting the costimulation-independent activation of NIK in activated T-cells and by promoting the TNFRSF9-induced classical NF-kappa-B pathway (By similarity). Forms a heterotrimer with TRAF2 as part of an E3 ubiquitin-protein ligase complex that mediates ubiquitination of target proteins such as MAP3K14 and gasdermin D/GSDMD. This complex also recruits the antiapoptotic E3 ligases BIRC2 and BIRC3 to TNFRSF1B/TNFR2. Acts downstream of MAVS within the RIG-I/MAVS antiviral pathway to enhance type I interferon signaling. Regulates osteoclastogenesis by preventing ubiquitination and degradation of MLST8, thereby promoting PI3K-AKT signaling and enhancing oxidative phosphorylation in osteoclasts (By similarity) PMID 10692572 ↗ · PMID 16323247 ↗ · PMID 18429822 ↗ · PMID 19287455 ↗ · PMID 19698991 ↗ · PMID 20385093 ↗ · PMID 38995016 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境下，TRAF1 會放大 LMP1 介導的 MAP kinase 與典型 NF-kappa-B 路徑活性；此作用不包括非典型 NF-kappa-B 路徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Amplifies LMP1-mediated MAP kinase and canonical NF-kappa-B pathway but not non-canonical NF-kappa-B pathway activity PMID 25996949 ↗ |
| 交互作用 | TRAF1 可形成同源三聚體，也可與 TRAF2 形成異源三聚體。其互作對象包括多種 TNF receptor family 成員、TANK/ITRAF、TRAIP、RIPK2，以及 NFATC2IP、TRAFD1、HIVEP3、MAP3K14、GPS2、TBK1、MAVS 與 GSDMD；部分互作依相似性推定。TRAF1 與 BIRC2、BIRC3 的 N 端互作，且單一 BIRC2 或 BIRC3 分子可與 TRAF1–TRAF2 異源三聚體互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotrimer. Heterotrimer with TRAF2. Interacts with TNFRSF1A/TNFR1, TNFRSF1B/TNFR2, TNFRSF4, TNFRSF5/CD40, TNFRSF8/CD30, TNFRSF9/CD137, TNFRSF11A/RANK, TNFRSF13C, TNFRSF18/AITR, TNFRSF17/BCMA, TNFRSF19/TROY, TNFRSF19L/RELT, XEDAR, EDAR, TANK/ITRAF, TRAIP and RIPK2. Interacts with BIRC2 and BIRC3 N-terminus; a single BIRC2 or BIRC3 molecule interacts with a heterotrimer formed by TRAF1 and TRAF2. Interacts with NFATC2IP, TRAFD1 and with HIVEP3 (By similarity). Interacts with MAP3K14. Interacts with GPS2 (By similarity). Interacts with TBK1 (By similarity). Interacts with MAVS. Interacts with GSDMD PMID 10037686 ↗ · PMID 10809768 ↗ · PMID 10903733 ↗ · PMID 11035039 ↗ · PMID 11313261 ↗ · PMID 11907583 ↗ · PMID 15383523 ↗ · PMID 16323247 ↗ · PMID 19287455 ↗ · PMID 19698991 ↗ · PMID 20385093 ↗ · PMID 20447407 ↗ · PMID 27151821 ↗ · PMID 38995016 ↗ · PMID 40097387 ↗ · PMID 8069916 ↗ · PMID 8627180 ↗ · PMID 8710854 ↗ · PMID 9418902 ↗ · PMID 9607925 ↗ · PMID 9642260 ↗ · PMID 9705938 ↗ · PMID 9718306 ↗ · PMID 9774460 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，TRAF1 與 Epstein-Barr virus BNFL1/LMP1 互作。此互作會招募 TRAF1:TRAF2；接著 TRAF1:TRAF2 與 LUBAC 結合，並活化 TAB1/TAK1 複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Epstein-Barr virus BNFL1/LMP1; this interaction recruits TRAF1:TRAF2, which in turn associates with LUBAC and activates the TAB1/TAK1 complex PMID 25996949 ↗ |
| 細胞定位 | TRAF1 的細胞定位註記為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GATTTCATCAGGGCTTTCCTGCTCCTTCTGGTTGCCTCAG40TCCCAGGCAAGATAGGGTCCCAGAATCTTACAGCCCAGAG80GCCACCTGTTGCAACTTCTTTTTTACAGATGGAGTCATCA120GAACCCACTGTGAGGAAGTGACTTCTCCTTGAGGTCACCC160AGACACTCCAAACAGAGCAGAGCAAAAGCGCCTAGAACTT200GAAATTTTGGACCTGTCTCCAACACCCTGGGGATTTCCAC240CAGGAAGCCTTCAGTCACCATCCAGGGGATTTTTATCGCC280ACAAAGGGTAATTCCTGCTCCATCCCTGCTGTGACTCAGC320TGTGACGTTGAACCACACAAGCCAGAGAGAAGAAGATAAA360GTCATCAGAGCTCCTACTCACCAGAGAGTGAGGCCCAGGC400CAGGACTCCACAAGGCTGGTCCCCTGCCCTGGAGCAACTT440AAACAGGCCCTCTGGCCAGCCTGGAACCCTGAGATGGCCT480CCAGCTCAGGCAGCAGTCCTCGCCCGGCCCCTGATGAGAA520TGAGTTTCCCTTTGGGTGCCCTCCCACCGTCTGCCAGGAC560CCAAAGGAGCCCAGGGCTCTCTGCTGTGCAGGCTGTCTCT600CTGAGAACCCGAGGAATGGCGAGGATCAGATCTGCCCCAA640ATGCAGAGGGGAAGACCTCCAGTCTATAAGCCCAGGAAGC680CGTCTTCGAACTCAGGAGAAGGCTCACCCCGAGGTGGCTG720AGGCTGGAATTGGGTGCCCCTTTGCAGGTGTCGGCTGCTC760CTTCAAGGGAAGCCCACAGTCTGTGCAAGAGCATGAGGTC800ACCTCCCAGACCTCCCACCTAAACCTGCTGTTGGGGTTCA840TGAAACAGTGGAAGGCCCGGCTGGGCTGTGGCCTGGAGTC880TGGGCCCATGGCCCTGGAGCAGAACCTGTCAGACCTGCAG920CTGCAGGCAGCCGTGGAAGTGGCGGGGGACCTGGAGGTCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。