演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TPX2p100

TPX2 microtubule nucleation factor

TPX2 microtubule nucleation factor 是 TPX2 家族蛋白,也是紡錘體組裝因子;它參與細胞分裂時的微管組裝,並調節 AURKA 的活性與定位。

Homo sapiens20q11.21UniProt Q9ULW0
OFFICIAL SYMBOL
TPX2
CHROMOSOME
20
UNIPROT
Q9ULW0
PDB / ALPHAFOLD
6BJC
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TPX2 基因是蛋白質編碼基因,產物為 TPX2 microtubule nucleation factor,屬於 TPX2 family。這種蛋白質的主要角色與細胞分裂時紡錘體及微管的組裝有關,也能調節 AURKA 的活化和定位。其名稱所指的微管成核功能,反映它在紡錘體形成中的角色;來源並未提供更完整的結構域或整體結構描述,相關序列特徵見蛋白質特徵部分。

Official symbol
TPX2
Gene name
TPX2 microtubule nucleation factor
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1249
UniProt
Q9ULW0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
p100DIL-2HCA519FLS353C20orf2C20orf1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2020q11.21
chr20 · 64,444,167 bp · GRCh38chr20p13 · 1–5100000 · gnegchr20p12.3 · 5100001–9200000 · gpos75chr20p12.2 · 9200001–12000000 · gnegchr20p12.1 · 12000001–17900000 · gpos75chr20p11.23 · 17900001–21300000 · gnegchr20p11.22 · 21300001–22300000 · gpos25chr20p11.21 · 22300001–25700000 · gnegchr20p11.1 · 25700001–28100000 · acenchr20q11.1 · 28100001–30400000 · acenchr20q11.21 · 30400001–33500000 · gnegchr20q11.22 · 33500001–35800000 · gpos25chr20q11.23 · 35800001–39000000 · gnegchr20q12 · 39000001–43100000 · gpos75chr20q13.11 · 43100001–43500000 · gnegchr20q13.12 · 43500001–47800000 · gpos25chr20q13.13 · 47800001–51200000 · gnegchr20q13.2 · 51200001–56400000 · gpos75chr20q13.31 · 56400001–57800000 · gnegchr20q13.32 · 57800001–59700000 · gpos50chr20q13.33 · 59700001–64444167 · gnegTPX2pq1 bp64,444,167 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr20:31,739,248–31,801,805
Gene span
62,558 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000300403 ★31,739,290–31,801,80018
ENST0000034051331,739,248–31,801,80519
ENST0000085393931,739,248–31,801,80518
ENST0000085394131,739,248–31,801,80517
ENST0000085394331,739,248–31,801,80517
ENST0000085394431,739,248–31,801,80518
ENST0000085394531,739,248–31,801,80517
ENST0000085394631,739,248–31,801,80517
ENST0000085394731,739,248–31,801,80518
ENST0000085394831,739,248–31,801,80518
ENST0000093405031,739,248–31,801,80518
ENST0000093405231,739,248–31,801,80518

顯示 12/34 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TPX2 是紡錘體組裝因子,對有絲分裂紡錘體的正常形成不可或缺。它也參與染色質或動粒依賴的微管成核,並促進 AURKA 定位至紡錘體微管,將激酶調節與微管組裝連結起來。細胞凋亡時,TPX2 亦是正常組裝微管所需的因子。

TPX2 可活化 AURKA:它促進 AURKA 在 Thr-288 位點自體磷酸化,並保護該位點,避免去磷酸化。這些作用支持 AURKA 維持活化狀態;來源指出其結果與紡錘體微管上的 AURKA 定位及局部微管成核相關。

TPX2 的活性受 importin-alpha 結合調控;結合後,TPX2 會失活。有絲分裂開始時,GOLGA2 與 importin-alpha 作用,使 TPX2 脫離 importin-alpha。釋出的 TPX2 因而能活化 AURKA kinase,並刺激局部微管成核。這描述了細胞進入有絲分裂時,解除抑制與啟動局部微管組裝的調控關係。

此外,TPX2 參與凋亡期間的微管正常組裝,顯示其作用不只限於有絲分裂紡錘體。現有資料支持它在不同細胞狀態下與微管組裝相關,但未進一步說明凋亡微管組裝的分子機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 31739290 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TPX2 ENST00000300403 GRCh38 chr20:31738290-31739390 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTGATCTGCCTGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACATGCGTGAGCTACCGCACCCAGCCTAGGC
TTAATTTTTGAATCTTTAGCTTTTGCTGGTATTATGAAGGGGGTTGTTTTGTTGTTCTTGTTGCTGCTAT
TTTCTAATTGATTAAAAAAAATTAAGATGGTGGGGGTGGTCTCGTTATGATGTCTACGCTGTTCTGGAAC
TCTTGGTCTCAAGGGATCCTTCTGCTTTAGCCTCCTGTGGAGCTGGGATTATAGGTGAGCGCCACGAAGC
CCGGCCTCTAATTAATTATCGGTGGTGTATAAAAAGAACAGACCTTCTTAATTCGAATCCCATCTTCTCC
ATTTATTATGTGATTTTGGACATGTTTGTTCAACTTCTCCTAGACTTTGTTTTCTTTTTACGACATGGGG
ATCATAAAGCCGGGATGCAGTTGGGAATAAAACCGGATAAAGCTCCCAACGAACCGCGGGTTTCATAAGA
TCAGGGCAGGGACTGGGTAAAAGGTTTCAAAGACTCCTGCACTATTGGGAAGGACGCTACGGGCGAGTCT
ATGTTGCATGCAGGCGACTCCATGTTAAGACGAAGTGAACTCCCTGAACCTTCAAGGGATAATGCACAAC
CATAACGAGAATAATTTTTAAAAATAGAGTTTTCTTCCCTGAAAACTTGGAGAGGTCCAGGATGCGCGCC
ATTCTGTGATCTAGGTTGACTCTCCACCTCTTCAGTTGGTACCACCTTTCCCAAATAGTTTGGAGCAGAG
CACTCCGGTCTTTGTAATAACGTACTCCTAAGAGCTGTTCCAGTGGACTCACGCAGGCGCAGGAGACTAC
ACTTCCCAGGAACTCCGGGCCGCGTTGTTCGCTGGTACCTCCTTCTGACTTCCGGTATTGCTGCGGTCTG
TAGGGCCAATCGGGAGCCTGGAATTGCTTTCCCGGCGCTCTGATTGGTGCATTCGACTAGGCTGCCTGGG
TTCAAAATTTCAACGATACTGAATGAGTCCCGCGGCGGGTTGGCTCGCGCTTCGTTGTCAGATCTGAGGC
GAGGCTAGGTGAGCCGTGGGAAGAAAAGAGGGAGCAGCTAGGGCGCGGGTC
TPX2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TPX2_1 ↗20:31,739,323正股31,739,274–31,739,333

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR20_B8B3S · enhancer · 31738288–31739133 · regulatory

ENSR20_8X79L · promoter · 31739134–31739300 · regulatory

ENSR20_B8B3Z · enhancer · 31739301–31740057 · regulatory

ENSR20_B8B44 · enhancer · 31740163–31740936 · regulatory

· motif · 31735179–31735193 · motif

· motif · 31738129–31738143 · motif

· motif · 31739109–31739120 · motif

· motif · 31739109–31739120 · motif

· motif · 31739176–31739185 · motif

· motif · 31739176–31739187 · motif

· motif · 31739176–31739187 · motif

· motif · 31739176–31739189 · motif

· motif · 31739468–31739485 · motif

· motif · 31740214–31740225 · motif

· motif · 31740350–31740372 · motif

· motif · 31740350–31740372 · motif

· motif · 31740425–31740440 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:747 aa

1 aa747 aa功能區域
依 Q9ULW0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TPX2 microtubule nucleation factor 長 747 個胺基酸,屬於 TPX2 family。序列註解指出第 110–143 與 156–202 位胺基酸區段為無序區;這些是資料庫標示的區域特徵,來源未提供其他結構域資訊。

功能區域Disordered110–143 aa
功能區域Disordered156–202 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6BJC…

PDB · 6BJC

EM · 3.30 A · P/T=1-747

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm, cytoskeleton, spindle;Cytoplasm, cytoskeleton, spindle pole

細胞週期階段會影響 TPX2 的分布:S 期與 G2 期時,它分散於細胞核;有絲分裂期間則集中與紡錘體及紡錘極相關。 細胞凋亡時,TPX2 會離開細胞核,並可在凋亡微管上偵測到。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 11 個夥伴 · 最多顯示 50 個
p100TPX2AURKACALRCDH1CDK5R1DLSTGOLGA2GRB2HMMRNCK1NEK7PIK3R1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TPX2 與 AURKA、importin-alpha、HNRNPU 和 KIF11 有交互作用;與 BCL2L10 的交互作用則依序列相似性推定。功能方面,importin-alpha 結合會使 TPX2 失活,而 TPX2 與 HNRNPU 的交互作用會將 HNRNPU 招募至紡錘體微管。來源未將這些交互作用描述為同一複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TPX2 是紡錘體組裝因子,參與正常有絲分裂紡錘體與凋亡期間微管的組裝,也參與染色質或動粒依賴的微管成核。它促使 AURKA 定位至紡錘體微管,並藉由促進 Thr-288 自體磷酸化、避免該位點去磷酸化來活化 AURKA。TPX2 與 importin-alpha 結合時會失活;有絲分裂開始時,GOLGA2 與 importin-alpha 作用並釋放 TPX2,使其活化 AURKA kinase、刺激局部微管成核。含實驗來源
證據與來源

Spindle assembly factor required for normal assembly of mitotic spindles. Required for normal assembly of microtubules during apoptosis. Required for chromatin and/or kinetochore dependent microtubule nucleation. Mediates AURKA localization to spindle microtubules. Activates AURKA by promoting its autophosphorylation at 'Thr-288' and protects this residue against dephosphorylation. TPX2 is inactivated upon binding to importin-alpha. At the onset of mitosis, GOLGA2 interacts with importin-alpha, liberating TPX2 from importin-alpha, allowing TPX2 to activate AURKA kinase and stimulate local microtubule nucleation

PMID 18663142 ↗ · PMID 19208764 ↗ · PMID 26165940 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TPX2 與 AURKA、importin-alpha、HNRNPU 及 KIF11 有交互作用;其中與 importin-alpha 結合會使 TPX2 失活,而與 HNRNPU 的交互作用會招募 HNRNPU 至紡錘體微管。TPX2 也與 BCL2L10 交互作用,但此關係是依序列相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Interacts with AURKA. Interacts with importin-alpha; leading to inactivate TPX2. Interacts with HNRNPU; this interaction recruits HNRNPU to spindle microtubules (MTs). Interacts with BCL2L10 (By similarity). Interacts with KIF11

PMID 14580337 ↗ · PMID 18662907 ↗ · PMID 18663142 ↗ · PMID 21242313 ↗ · PMID 25986610 ↗ · PMID 26165940 ↗ · PMID 37728657 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TPX2 的細胞內分布會隨細胞週期與細胞狀態改變:S 期及 G2 期時,它分散於細胞核;有絲分裂期間則與紡錘體和紡錘極緊密相關。細胞凋亡時,TPX2 會離開細胞核,並可在凋亡微管上偵測到。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle pole; During mitosis it is strictly associated with the spindle pole and with the mitotic spindle, whereas during S and G2, it is diffusely distributed throughout the nucleus. Is released from the nucleus in apoptotic cells and is detected on apoptotic microtubules

PMID 19208764 ↗ · PMID 18663142 ↗ · PMID 37728657 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000300403 · 3,473 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAATGAGTCCCGCGGCGGGTTGGCTCGCGCTTCGTTGTCA40
41GATCTGAGGCGAGGCTAGGTGAGCCGTGGGAAGAAAAGAG80
81GGAGCAGCTAGGGCGCGGGTCTCCCTCCTCCCGGAGTTTG120
121GAACGGCTGAAGTTCACCTTCCAGCCCCTAGCGCCGTTCG160
161CGCCGCTAGGCCTGGCTTCTGAGGCGGTTGCGGTGCTCGG200
201TCGCCGCCTAGGCGGGGCAGGGTGCGAGCAGGGGCTTCGG240
241GCCACGCTTCTCTTGGCGACAGGATTTTGCTGTGAAGTCC280
281GTCCGGGAAACGGAGGAAAAAAAGAGTTGCGGGAGGCTGT320
321CGGCTAATAACGGTTCTTGATACATATTTGCCAGACTTCA360
361AGATTTCAGAAAAGGGGTGAAAGAGAAGATTGCAACTTTG400
401AGTCAGACCTGTAGGCCTGATAGACTGATTAAACCACAGA440
441AGGTGACCTGCTGAGAAAAGTGGTACAAATACTGGGAAAA480
481ACCTGCTCTTCTGCGTTAAGTGGGAGACAATGTCACAAGT520
521TAAAAGCTCTTATTCCTATGATGCCCCCTCGGATTTCATC560
561AATTTTTCATCCTTGGATGATGAAGGAGATACTCAAAACA600
601TAGATTCATGGTTTGAGGAGAAGGCCAATTTGGAGAATAA640
641GTTACTGGGGAAGAATGGAACTGGAGGGCTTTTTCAGGGC680
681AAAACTCCTTTGAGAAAGGCTAATCTTCAGCAAGCTATTG720
721TCACACCTTTGAAACCAGTTGACAACACTTACTACAAAGA760
761GGCAGAAAAAGAAAATCTTGTGGAACAATCCATTCCGTCA800
801AATGCTTGTTCTTCCCTGGAAGTTGAGGCAGCCATATCAA840
841GAAAAACTCCAGCCCAGCCTCAGAGAAGATCTCTTAGGCT880
881TTCTGCTCAGAAGGATTTGGAACAGAAAGAAAAGCATCAT920
921GTAAAAATGAAAGCCAAGAGATGTGCCACTCCTGTAATCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。