基因總覽
TPTE(transmembrane phosphatase with tensin homology)是蛋白質編碼基因,其產物為 Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE。此蛋白質長 551 個胺基酸,屬於具多段跨膜區的膜蛋白;序列中包含 Phosphatase tensin-type domain 與 C2 tensin-type domain,並有一段被註記為無序區的區域。現有資料將其可能角色概述為參與訊號傳導,但未提供更具體的生物學情境或作用對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000618007 ★ | 10,521,583–10,605,716 | 24 |
| ENST00000622113 | 10,521,553–10,606,140 | 23 |
| ENST00000427445 | 10,521,553–10,606,140 | 22 |
| ENST00001091160 | 10,521,553–10,606,140 | 22 |
| ENST00001131865 | 10,521,553–10,606,140 | 24 |
| ENST00000612957 | 10,521,572–10,567,699 | 10 |
| ENST00000612746 | 10,521,575–10,606,140 | 19 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TPTE 的功能資料指出,它可能參與訊號傳導。這項描述保留了推測性,資料沒有進一步說明相關訊號路徑、作用細胞或生物學條件,因此不能據此確定其參與的特定過程。
另有一項酵素反應註解,描述含磷酸化酪胺酸的蛋白質與水反應,產生酪胺酸蛋白質及磷酸。這表示註解所列的反應是蛋白質酪胺酸去磷酸化;資料未指出其底物身分、反應發生位置或此反應與訊號傳導之間的具體關聯。
因此,現有來源支持的功能範圍限於「可能參與訊號傳導」及上述去磷酸化反應式,尚不足以描述 TPTE 在特定生物學過程中的調控方式或功能結果。
Promoter 與基因調控
>TPTE ENST00000618007 GRCh38 chr21:10520583-10521683 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCAGCTCACTG CAGCCTCCGCTCCCTGATTCATGCCATTCTCCTGCCTCAACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACAGGCACCT GCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGAAGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGG TCTGGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC CGTGCCCAGCCCTATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTTCGTAGAGACAGGGTTTCGCTGTATTGCCCAGG CTGGTCTTGAACTCTCGGGTTTAGGTGAGCGCCTTGGCCCCCGAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCC ACTGTGCCTGGTTTCCCTTTCAAAAGAGATTTTGGGTGTTTCGTGTCACTGTATCCACGCCGCGTGCGGT CTCTTGTGCGTGGCTTCTTTTCCTGAGCACGCACAGCTGCCTTCTAACCCGCGAGCAATGGCGTTAAGGT TTTTGTTTGTAATTCGGGGGTGACCCAGGGGTTCGGGCCGCGGGCCCCTCCCCTCGCCCAGGCACACCTT GCAGAGGAGGGGGCGGCGGGGACAGGACCCGGGTCTGTGCCTGCGCACACCCTCGCGGGCCAACCCCCTC CCCCCCCGCCCCGCCGGGTACCTGTCACGGCTACTGCCGCGGCGCGCGCCCGCCACGTTAAGCCGGATGG CGGGAGGAGGGGTGCGGGGAGGGTGGCACGGCGCGCGCGTGCGCGGGAGTCGCCGAGCAAGAACTGGTAG TGCGCGCGCTCGCCGCTCGCTCGCGTCCCGGAGGCGGAGTCTGCGGCGGCGGGCGGAACGGGGGCGCGCC TATGCTAGTCACGTGGGCGCTGGGGCGGGGCCGGGCGGCCGTTCAAGGCAGGGGGCGGGGCGTCTCCGAG CGGCGGGGCCAAGGGAGGGCACAACAGCTGCTACCTGAACAGTTTCTGACCCAACAGTTACCCAGCGCCG GACTCGCTGCGCCCCGGCGGCTCTAGGGACCCCCGGCGCCTACACTTAGCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TPTE_1 ↗ | 21:10,521,468 | 正股 | 10,521,419–10,521,478 |
| TPTE_3 ↗ | 21:10,521,583 | 正股 | 10,521,534–10,521,593 |
| TPTE_2 ↗ | 21:10,543,949 | 正股 | 10,543,900–10,543,959 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR21_966QC · promoter · 10521087–10521593 · regulatory
ENSR21_54GS52 · CTCF_binding_site · 10521567–10521588 · regulatory
ENSR21_B44D9 · enhancer · 10521594–10522405 · regulatory
· motif · 10517537–10517546 · motif
· motif · 10520911–10520921 · motif
· motif · 10521500–10521509 · motif
· motif · 10521500–10521509 · motif
· motif · 10521569–10521585 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:551 aa
TPTE 蛋白質長 551 個胺基酸。序列含三段螺旋型跨膜區,分別位於第 91–111、128–148 與 164–184 位;另有 Phosphatase tensin-type domain(第 228–404 位)及 C2 tensin-type domain(第 411–540 位)。第 1–47 位被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TPTE 被註記為膜蛋白,並具有多段跨膜特徵。 現有資料未提供其在不同條件下的定位變化或異構型差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TPTE 可能參與訊號傳導;此描述保留可能性,未說明涉及的訊號路徑、作用情境或具體功能結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + H2O = L-tyrosyl-[protein] + phosphate | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | TPTE 被註記為膜上的多段跨膜蛋白;此定位描述未提供特定細胞區域或定位改變條件。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACAACAGCTGCTACCTGAACAGTTTCTGACCCAACAGTTA40CCCAGCGCCGGACTCGCTGCGCCCCGGCGGCTCTAGGGAC80CCCCGGCGCCTACACTTAGCTCCGCGCCCGAGAGAATGTT120GGACCGACGACACAAGACCTCAGACTTGTGTTATTCTAGC160AGCTGAACACACCCCAGGCTCTTCTGCCCGGCAGTGGCTC200TGGAAGCAGTCTGGTGTATAGAGTTATGGATTCACTACCA240GATTCTACTGTATGCTCTTGACAACTATGACCACAATGGT280CCACCCACAAATGAATTATCAGGAGTGAACCCAGAGGCAC320GTATGAATGAAAGTCCTGATCCGACTGACCTGGCGGGAGT360CATCATTGAGCTCGGCCCCAATGACAGTCCACAGACAAGT400GAATTTAAAGGAGCAACCGAGGAGGCACCTGCGAAAGAAA440GCCCACACACAAGTGAATTTAAAGGAGCAGCCCGGGTGTC480ACCTATCAGTGAAAGTGTGTTAGCACGACTTTCCAAGTTT520GAAGTTGAAGATGCTGAAAATGTTGCTTCATATGACAGCA560AGATTAAGAAAATTGTGCATTCAATTGTATCATCCTTTGC600ATTTGGACTATTTGGAGTTTTCCTGGTCTTACTGGATGTC640ACTCTCATCCTTGCCGACCTAATTTTCACTGACAGCAAAC680TTTATATTCCTTTGGAGTATCGTTCTATTTCTCTAGCTAT720TGCCTTATTTTTTCTCATGGATGTTCTTCTTCGAGTATTT760GTAGAAAGGAGACAGCAGTATTTTTCTGACTTATTTAACA800TTTTAGATACTGCCATTATTGTGATTCTTCTGCTGGTTGA840TGTCGTTTACATTTTTTTTGACATTAAGTTGCTTAGGAAT880ATTCCCAGATGGACACATTTACTTCGACTTCTACGACTTA920TTATTCTGTTAAGAATTTTTCATCTGTTTCATCAAAAAAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。