演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TPTEPTEN2

transmembrane phosphatase with tensin homology

TPTE 是一種跨膜蛋白磷酸酶,可能參與訊號傳導;其蛋白質具有多段跨膜區及 tensin-type 磷酸酶相關結構域。

Homo sapiens21p11.2UniProt P56180
OFFICIAL SYMBOL
TPTE
CHROMOSOME
21
UNIPROT
P56180
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TPTE(transmembrane phosphatase with tensin homology)是蛋白質編碼基因,其產物為 Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE。此蛋白質長 551 個胺基酸,屬於具多段跨膜區的膜蛋白;序列中包含 Phosphatase tensin-type domain 與 C2 tensin-type domain,並有一段被註記為無序區的區域。現有資料將其可能角色概述為參與訊號傳導,但未提供更具體的生物學情境或作用對象。

Official symbol
TPTE
Gene name
transmembrane phosphatase with tensin homology
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12023
UniProt
P56180
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PTEN2CT44TPTE1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121p11.2
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegTPTEpq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr21:10,521,553–10,606,140
Gene span
84,588 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000618007 ★10,521,583–10,605,71624
ENST0000062211310,521,553–10,606,14023
ENST0000042744510,521,553–10,606,14022
ENST0000109116010,521,553–10,606,14022
ENST0000113186510,521,553–10,606,14024
ENST0000061295710,521,572–10,567,69910
ENST0000061274610,521,575–10,606,14019

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TPTE 的功能資料指出,它可能參與訊號傳導。這項描述保留了推測性,資料沒有進一步說明相關訊號路徑、作用細胞或生物學條件,因此不能據此確定其參與的特定過程。

另有一項酵素反應註解,描述含磷酸化酪胺酸的蛋白質與水反應,產生酪胺酸蛋白質及磷酸。這表示註解所列的反應是蛋白質酪胺酸去磷酸化;資料未指出其底物身分、反應發生位置或此反應與訊號傳導之間的具體關聯。

因此,現有來源支持的功能範圍限於「可能參與訊號傳導」及上述去磷酸化反應式,尚不足以描述 TPTE 在特定生物學過程中的調控方式或功能結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 10521583 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TPTE ENST00000618007 GRCh38 chr21:10520583-10521683 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCAGCTCACTG
CAGCCTCCGCTCCCTGATTCATGCCATTCTCCTGCCTCAACCTCCCAAGTAGCTAGGACTACAGGCACCT
GCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGAAGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGG
TCTGGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC
CGTGCCCAGCCCTATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTTCGTAGAGACAGGGTTTCGCTGTATTGCCCAGG
CTGGTCTTGAACTCTCGGGTTTAGGTGAGCGCCTTGGCCCCCGAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCC
ACTGTGCCTGGTTTCCCTTTCAAAAGAGATTTTGGGTGTTTCGTGTCACTGTATCCACGCCGCGTGCGGT
CTCTTGTGCGTGGCTTCTTTTCCTGAGCACGCACAGCTGCCTTCTAACCCGCGAGCAATGGCGTTAAGGT
TTTTGTTTGTAATTCGGGGGTGACCCAGGGGTTCGGGCCGCGGGCCCCTCCCCTCGCCCAGGCACACCTT
GCAGAGGAGGGGGCGGCGGGGACAGGACCCGGGTCTGTGCCTGCGCACACCCTCGCGGGCCAACCCCCTC
CCCCCCCGCCCCGCCGGGTACCTGTCACGGCTACTGCCGCGGCGCGCGCCCGCCACGTTAAGCCGGATGG
CGGGAGGAGGGGTGCGGGGAGGGTGGCACGGCGCGCGCGTGCGCGGGAGTCGCCGAGCAAGAACTGGTAG
TGCGCGCGCTCGCCGCTCGCTCGCGTCCCGGAGGCGGAGTCTGCGGCGGCGGGCGGAACGGGGGCGCGCC
TATGCTAGTCACGTGGGCGCTGGGGCGGGGCCGGGCGGCCGTTCAAGGCAGGGGGCGGGGCGTCTCCGAG
CGGCGGGGCCAAGGGAGGGCACAACAGCTGCTACCTGAACAGTTTCTGACCCAACAGTTACCCAGCGCCG
GACTCGCTGCGCCCCGGCGGCTCTAGGGACCCCCGGCGCCTACACTTAGCT
TPTE 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TPTE_1 ↗21:10,521,468正股10,521,419–10,521,478
TPTE_3 ↗21:10,521,583正股10,521,534–10,521,593
TPTE_2 ↗21:10,543,949正股10,543,900–10,543,959

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_966QC · promoter · 10521087–10521593 · regulatory

ENSR21_54GS52 · CTCF_binding_site · 10521567–10521588 · regulatory

ENSR21_B44D9 · enhancer · 10521594–10522405 · regulatory

· motif · 10517537–10517546 · motif

· motif · 10520911–10520921 · motif

· motif · 10521500–10521509 · motif

· motif · 10521500–10521509 · motif

· motif · 10521569–10521585 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:551 aa

1 aa551 aa結構域功能區域跨膜區
依 P56180 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TPTE 蛋白質長 551 個胺基酸。序列含三段螺旋型跨膜區,分別位於第 91–111、128–148 與 164–184 位;另有 Phosphatase tensin-type domain(第 228–404 位)及 C2 tensin-type domain(第 411–540 位)。第 1–47 位被註記為無序區。

跨膜區Helical91–111 aa
跨膜區Helical128–148 aa
跨膜區Helical164–184 aa
結構域Phosphatase tensin-type228–404 aa
結構域C2 tensin-type411–540 aa
功能區域Disordered1–47 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P56180…

AlphaFold · P56180

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

TPTE 被註記為膜蛋白,並具有多段跨膜特徵。 現有資料未提供其在不同條件下的定位變化或異構型差異。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PTEN2TPTEMEOX2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TPTE 可能參與訊號傳導;此描述保留可能性,未說明涉及的訊號路徑、作用情境或具體功能結果。資料庫紀錄
證據與來源

Could be involved in signal transduction

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + H2O = L-tyrosyl-[protein] + phosphate資料庫紀錄
證據與來源

O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + H2O = L-tyrosyl-[protein] + phosphate

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TPTE 被註記為膜上的多段跨膜蛋白;此定位描述未提供特定細胞區域或定位改變條件。資料庫紀錄
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000618007 · 2,142 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACAACAGCTGCTACCTGAACAGTTTCTGACCCAACAGTTA40
41CCCAGCGCCGGACTCGCTGCGCCCCGGCGGCTCTAGGGAC80
81CCCCGGCGCCTACACTTAGCTCCGCGCCCGAGAGAATGTT120
121GGACCGACGACACAAGACCTCAGACTTGTGTTATTCTAGC160
161AGCTGAACACACCCCAGGCTCTTCTGCCCGGCAGTGGCTC200
201TGGAAGCAGTCTGGTGTATAGAGTTATGGATTCACTACCA240
241GATTCTACTGTATGCTCTTGACAACTATGACCACAATGGT280
281CCACCCACAAATGAATTATCAGGAGTGAACCCAGAGGCAC320
321GTATGAATGAAAGTCCTGATCCGACTGACCTGGCGGGAGT360
361CATCATTGAGCTCGGCCCCAATGACAGTCCACAGACAAGT400
401GAATTTAAAGGAGCAACCGAGGAGGCACCTGCGAAAGAAA440
441GCCCACACACAAGTGAATTTAAAGGAGCAGCCCGGGTGTC480
481ACCTATCAGTGAAAGTGTGTTAGCACGACTTTCCAAGTTT520
521GAAGTTGAAGATGCTGAAAATGTTGCTTCATATGACAGCA560
561AGATTAAGAAAATTGTGCATTCAATTGTATCATCCTTTGC600
601ATTTGGACTATTTGGAGTTTTCCTGGTCTTACTGGATGTC640
641ACTCTCATCCTTGCCGACCTAATTTTCACTGACAGCAAAC680
681TTTATATTCCTTTGGAGTATCGTTCTATTTCTCTAGCTAT720
721TGCCTTATTTTTTCTCATGGATGTTCTTCTTCGAGTATTT760
761GTAGAAAGGAGACAGCAGTATTTTTCTGACTTATTTAACA800
801TTTTAGATACTGCCATTATTGTGATTCTTCTGCTGGTTGA840
841TGTCGTTTACATTTTTTTTGACATTAAGTTGCTTAGGAAT880
881ATTCCCAGATGGACACATTTACTTCGACTTCTACGACTTA920
921TTATTCTGTTAAGAATTTTTCATCTGTTTCATCAAAAAAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。