基因總覽
TPT1(tumor protein, translationally-controlled 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 TCTP 家族,長 172 個胺基酸。其蛋白質名稱為 Translationally-controlled tumor protein,亦有 Fortilin、Histamine-releasing factor 與 p23 等名稱。來源資料指出,TPT1 產物與鈣離子結合、微管穩定,以及 TSC22D1 介導的細胞凋亡調節有關;其中與 TSC22D1 的作用涉及降低該蛋白質的穩定性。這些資料勾勒出其分子角色,但未提供更細部的家族特徵或完整結構資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000530705 ★ | 45,333,471–45,341,183 | 6 |
| ENST00001131370 | 45,320,399–45,341,284 | 6 |
| ENST00000616577 | 45,333,471–45,341,284 | 6 |
| ENST00001132038 | 45,333,471–45,341,284 | 6 |
| ENST00001035597 | 45,333,473–45,341,284 | 6 |
| ENST00001035598 | 45,336,429–45,341,284 | 6 |
| ENST00000887578 | 45,336,660–45,341,284 | 6 |
| ENST00000929562 | 45,336,675–45,341,284 | 6 |
| ENST00000929563 | 45,336,863–45,341,284 | 6 |
| ENST00000929565 | 45,336,863–45,341,284 | 6 |
| ENST00001086128 | 45,336,863–45,341,284 | 6 |
| ENST00000929566 | 45,336,866–45,341,284 | 6 |
顯示 12/44 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TPT1 蛋白與鈣離子結合及微管穩定有關。來源將這兩項作用列為其參與的分子功能,但未進一步說明結合條件、作用方式或對微管的具體影響,因此不宜延伸解讀其作用機制。
在細胞凋亡調節方面,TPT1 是 TSC22D1 介導之細胞凋亡的負向調節因子。資料指出,TPT1 與 TSC22D1 蛋白質交互作用,並使其穩定性降低;此蛋白質穩定性變化與 TPT1 對該凋亡途徑的負向調節相關。來源未提供其他細胞情境或更詳細的下游作用,故其功能意義應限於這項已描述的關聯。
Promoter 與基因調控
>TPT1 ENST00000530705 GRCh38 chr13:45341083-45342183 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCCAAAGTTCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCAGGACCTGTTTTGTTTTAATACTTAGTAATTGG GTGTAAAGTCCTTCAAAAAACAGGTGGGGCAGGTGGGAAACTCCCTTTGTGTGACCCTCTAGCACCAGGG ATAAAATTTCAACTTCATCTTAAAGCGACAACATACTTTTCCAAGACCAAGTGCGAAATAGTAAAGGGAA GAGCTAGCTCCGTAGCCGTCCGCCACAGAATGCCACAAGCTTTCAATTATGGGACAAAATTGGAACACAT GGAAACCCTGTGCAGACTCCCGTGACATCTTCCCTCCTCTCCAAGTCCCTTCCCACAGACCTTGCGCCCC ACACGATTATTCCCCAGGGGCCGAGCAGGACGACTTGGGTCCCACTATCCGGACTCAGCGGTGCCCCCAC AAAAGCGTCCCAAAAACTCCAGCTGGGGCAGCCCTGGGGCAGATGCTGAAAAGTTGTCAGAGGCCCTCGG GCAGTCCCGAGATCTACCCCAGGCCAGAGGGCCTGACCCTCCCTAAATGCGACGTTCTCCTACCTTGGTT GATACTCACGTTCCCAGAAAAGGGTGGAACCTAGGCTGGACGAGGCGCAGGGCCAAAGTTTAATTCCTCT AAGCTCCACCCAGCTCCCAGCACCTCTCCAGGCGGCCCCGTGGGGTAGGGCGGAGCCGGGTCCAACGTAC TCCGCTTCCCCCGCTCCACCCACCCAGGGCTAGGGAGCGCCCCGAGAGTTGGCCTCCTCCCACGCTGCGC GCGCACCTCCCCGCCCCCACCCCTACCCGCTGGCGTGCCCAGTGGAACGGAGCCTTGTGTCTCCGCCTCA AGTCCCCGGATGCTCACCTCCCCGACTCGCCCCCGCTGTGGCCCCGCCCCCGCGCGGCTCTTCGTGCCAC GTCACCGCCTGCGTCGCTTCCGGAGGCGCAGCGGGCGATGACGTAGAGGGACGTGCCCTCTATATGAGGT TGGGGAGCGGCTGAGTCGGCCTTTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGGCTGCACCGC GCTCGCTCCGAGTTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TPT1_1 ↗ | 13:45,341,183 | 負股 | 45,341,173–45,341,232 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR13_83BZRF · promoter · 45339895–45340049 · regulatory
ENSR13_5DMXG8 · CTCF_binding_site · 45340602–45340626 · regulatory
ENSR13_BBZXR · promoter · 45341076–45341617 · regulatory
ENSR13_BBZXW · enhancer · 45341618–45342565 · regulatory
· motif · 45336632–45336645 · motif
· motif · 45336632–45336645 · motif
· motif · 45336703–45336714 · motif
· motif · 45339755–45339765 · motif
· motif · 45340134–45340145 · motif
· motif · 45340367–45340378 · motif
· motif · 45340425–45340434 · motif
· motif · 45340479–45340490 · motif
· motif · 45340479–45340490 · motif
· motif · 45340481–45340490 · motif
· motif · 45340604–45340620 · motif
· motif · 45340607–45340623 · motif
· motif · 45340628–45340637 · motif
· motif · 45340628–45340637 · motif
· motif · 45340640–45340653 · motif
· motif · 45340682–45340695 · motif
· motif · 45340825–45340835 · motif
· motif · 45340834–45340851 · motif
· motif · 45341069–45341079 · motif
· motif · 45341158–45341168 · motif
· motif · 45341165–45341175 · motif
· motif · 45341214–45341227 · motif
· motif · 45341250–45341259 · motif
· motif · 45341288–45341301 · motif
· motif · 45341293–45341303 · motif
· motif · 45341305–45341318 · motif
· motif · 45341388–45341398 · motif
· motif · 45341390–45341400 · motif
· motif · 45341391–45341404 · motif
· motif · 45341396–45341406 · motif
· motif · 45341403–45341412 · motif
· motif · 45341416–45341429 · motif
· motif · 45341456–45341469 · motif
· motif · 45341461–45341471 · motif
· motif · 45341560–45341575 · motif
· motif · 45341560–45341575 · motif
· motif · 45341561–45341575 · motif
· motif · 45341562–45341575 · motif
· motif · 45341654–45341667 · motif
· motif · 45341654–45341667 · motif
· motif · 45341812–45341825 · motif
· motif · 45341812–45341825 · motif
· motif · 45342100–45342115 · motif
· motif · 45342100–45342115 · motif
感染 enterovirus 71(EV71)時,TPT1 會受到下調。來源未說明此表現變化的幅度、時間或調控機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:172 aa
TPT1 蛋白長 172 個胺基酸,屬於 TCTP 家族;其 TCTP domain 涵蓋第 1 至 172 位胺基酸。第 70 至 172 位胺基酸區域則是降低 TSC22D1 蛋白穩定性所必需的區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TPT1 蛋白定位於細胞質。 來源未描述其定位隨條件或異構型而改變的情形。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
- ACTBP60709 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ATP1A1P05023 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- EEF1DP29692 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- HSPA9P38646 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- HSPB1P04792 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PRDX1Q06830 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RHEBQ15382 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TP53P04637 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- TRIP13Q15645 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TSC22D1Q15714 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TUBA1CQ9BQE3 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- XRCC5P13010 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- XRCC6P12956 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- YBX1P67809 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
TPT1 可形成同源二聚體,此項資訊標註為依相似性推定。另有資料指出,TPT1 與 STEAP3 及 TSC22D1 交互作用;與 TSC22D1 的交互作用會降低 TSC22D1 蛋白質的穩定性。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TPT1 與鈣離子結合及微管穩定有關;此外,它會與 TSC22D1 蛋白質交互作用並降低其穩定性,因此是 TSC22D1 介導之細胞凋亡的負向調節因子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in calcium binding and microtubule stabilization. Acts as a negative regulator of TSC22D1-mediated apoptosis, via interaction with and destabilization of TSC22D1 protein PMID 12167714 ↗ · PMID 15162379 ↗ · PMID 15958728 ↗ · PMID 18325344 ↗ |
| 交互作用 | TPT1 形成同源二聚體的資訊依相似性推定;另有資料指出 TPT1 與 STEAP3、TSC22D1 交互作用,其中與 TSC22D1 的交互作用會使 TSC22D1 蛋白質穩定性降低。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer (By similarity). Interacts with STEAP3. Interacts with TSC22D1; interaction results in the destabilization of TSC22D1 protein PMID 15319436 ↗ · PMID 18325344 ↗ |
| 細胞定位 | TPT1 蛋白質位於細胞質。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 感染 enterovirus 71(EV71)時,TPT1 的表現受到下調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCG40GCTGCACCGCGCTCGCTCCGAGTTTCAGGCTCGTGCTAAG80CTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCATCATGATT120ATCTACCGGGACCTCATCAGCCACGATGAGATGTTCTCCG160ACATCTACAAGATCCGGGAGATCGCGGACGGGTTGTGCCT200GGAGGTGGAGGGGAAGATGGTCAGTAGGACAGAAGGTAAC240ATTGATGACTCGCTCATTGGTGGAAATGCCTCCGCTGAAG280GCCCCGAGGGCGAAGGTACCGAAAGCACAGTAATCACTGG320TGTCGATATTGTCATGAACCATCACCTGCAGGAAACAAGT360TTCACAAAAGAAGCCTACAAGAAGTACATCAAAGATTACA400TGAAATCAATCAAAGGGAAACTTGAAGAACAGAGACCAGA440AAGAGTAAAACCTTTTATGACAGGGGCTGCAGAACAAATC480AAGCACATCCTTGCTAATTTCAAAAACTACCAGTTCTTTA520TTGGTGAAAACATGAATCCAGATGGCATGGTTGCTCTATT560GGACTACCGTGAGGATGGTGTGACCCCATATATGATTTTC600TTTAAGGATGGTTTAGAAATGGAAAAATGTTAACAAATGT640GGCAATTATTTTGGATCTATCACCTGTCATCATAACTGGC680TTCTGCTTGTCATCCACACAACACCAGGACTTAAGACAAA720TGGGACTGATGTCATCTTGAGCTCTTCATTTATTTTGACT760GTGATTTATTTGGAGTGGAGGCATTGTTTTTAAGAAAAAC800ATGTCATGTAGGTTGTCTAAAAATAAAATGCATTTAAACT840CATTTGAGAGAATGCCTTTTAGTTTAATGCATATTTAAAC880TAAATTGATCCTGTAGTGTTCCTGGAGAAGCTAGAGCCTG920ATTGTAGGCTACTACTCATCAATTAACTTCTACAGTGGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。