演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TPT1TCTP

tumor protein, translationally-controlled 1

TPT1 編碼 TCTP 家族蛋白,與鈣離子結合及微管穩定有關,也可透過影響 TSC22D1 蛋白穩定性,調節其介導的細胞凋亡。

Homo sapiens13q14.13UniProt P13693
OFFICIAL SYMBOL
TPT1
CHROMOSOME
13
UNIPROT
P13693
PDB / ALPHAFOLD
1YZ1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TPT1(tumor protein, translationally-controlled 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 TCTP 家族,長 172 個胺基酸。其蛋白質名稱為 Translationally-controlled tumor protein,亦有 Fortilin、Histamine-releasing factor 與 p23 等名稱。來源資料指出,TPT1 產物與鈣離子結合、微管穩定,以及 TSC22D1 介導的細胞凋亡調節有關;其中與 TSC22D1 的作用涉及降低該蛋白質的穩定性。這些資料勾勒出其分子角色,但未提供更細部的家族特徵或完整結構資訊。

Official symbol
TPT1
Gene name
tumor protein, translationally-controlled 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12022
UniProt
P13693
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TCTPfortilin

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1313q14.13
chr13 · 114,364,328 bp · GRCh38chr13p13 · 1–4600000 · gvarchr13p12 · 4600001–10100000 · stalkchr13p11.2 · 10100001–16500000 · gvarchr13p11.1 · 16500001–17700000 · acenchr13q11 · 17700001–18900000 · acenchr13q12.11 · 18900001–22600000 · gnegchr13q12.12 · 22600001–24900000 · gpos25chr13q12.13 · 24900001–27200000 · gnegchr13q12.2 · 27200001–28300000 · gpos25chr13q12.3 · 28300001–31600000 · gnegchr13q13.1 · 31600001–33400000 · gpos50chr13q13.2 · 33400001–34900000 · gnegchr13q13.3 · 34900001–39500000 · gpos75chr13q14.11 · 39500001–44600000 · gnegchr13q14.12 · 44600001–45200000 · gpos25chr13q14.13 · 45200001–46700000 · gnegchr13q14.2 · 46700001–50300000 · gpos50chr13q14.3 · 50300001–54700000 · gnegchr13q21.1 · 54700001–59000000 · gpos100chr13q21.2 · 59000001–61800000 · gnegchr13q21.31 · 61800001–65200000 · gpos75chr13q21.32 · 65200001–68100000 · gnegchr13q21.33 · 68100001–72800000 · gpos100chr13q22.1 · 72800001–74900000 · gnegchr13q22.2 · 74900001–76700000 · gpos50chr13q22.3 · 76700001–78500000 · gnegchr13q31.1 · 78500001–87100000 · gpos100chr13q31.2 · 87100001–89400000 · gnegchr13q31.3 · 89400001–94400000 · gpos100chr13q32.1 · 94400001–97500000 · gnegchr13q32.2 · 97500001–98700000 · gpos25chr13q32.3 · 98700001–101100000 · gnegchr13q33.1 · 101100001–104200000 · gpos100chr13q33.2 · 104200001–106400000 · gnegchr13q33.3 · 106400001–109600000 · gpos100chr13q34 · 109600001–114364328 · gnegTPT1pq1 bp114,364,328 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr13:45,320,399–45,341,284
Gene span
20,886 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000530705 ★45,333,471–45,341,1836
ENST0000113137045,320,399–45,341,2846
ENST0000061657745,333,471–45,341,2846
ENST0000113203845,333,471–45,341,2846
ENST0000103559745,333,473–45,341,2846
ENST0000103559845,336,429–45,341,2846
ENST0000088757845,336,660–45,341,2846
ENST0000092956245,336,675–45,341,2846
ENST0000092956345,336,863–45,341,2846
ENST0000092956545,336,863–45,341,2846
ENST0000108612845,336,863–45,341,2846
ENST0000092956645,336,866–45,341,2846

顯示 12/44 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TPT1 蛋白與鈣離子結合及微管穩定有關。來源將這兩項作用列為其參與的分子功能,但未進一步說明結合條件、作用方式或對微管的具體影響,因此不宜延伸解讀其作用機制。

在細胞凋亡調節方面,TPT1 是 TSC22D1 介導之細胞凋亡的負向調節因子。資料指出,TPT1 與 TSC22D1 蛋白質交互作用,並使其穩定性降低;此蛋白質穩定性變化與 TPT1 對該凋亡途徑的負向調節相關。來源未提供其他細胞情境或更詳細的下游作用,故其功能意義應限於這項已描述的關聯。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45341183 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TPT1 ENST00000530705 GRCh38 chr13:45341083-45342183 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCAAAGTTCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCAGGACCTGTTTTGTTTTAATACTTAGTAATTGG
GTGTAAAGTCCTTCAAAAAACAGGTGGGGCAGGTGGGAAACTCCCTTTGTGTGACCCTCTAGCACCAGGG
ATAAAATTTCAACTTCATCTTAAAGCGACAACATACTTTTCCAAGACCAAGTGCGAAATAGTAAAGGGAA
GAGCTAGCTCCGTAGCCGTCCGCCACAGAATGCCACAAGCTTTCAATTATGGGACAAAATTGGAACACAT
GGAAACCCTGTGCAGACTCCCGTGACATCTTCCCTCCTCTCCAAGTCCCTTCCCACAGACCTTGCGCCCC
ACACGATTATTCCCCAGGGGCCGAGCAGGACGACTTGGGTCCCACTATCCGGACTCAGCGGTGCCCCCAC
AAAAGCGTCCCAAAAACTCCAGCTGGGGCAGCCCTGGGGCAGATGCTGAAAAGTTGTCAGAGGCCCTCGG
GCAGTCCCGAGATCTACCCCAGGCCAGAGGGCCTGACCCTCCCTAAATGCGACGTTCTCCTACCTTGGTT
GATACTCACGTTCCCAGAAAAGGGTGGAACCTAGGCTGGACGAGGCGCAGGGCCAAAGTTTAATTCCTCT
AAGCTCCACCCAGCTCCCAGCACCTCTCCAGGCGGCCCCGTGGGGTAGGGCGGAGCCGGGTCCAACGTAC
TCCGCTTCCCCCGCTCCACCCACCCAGGGCTAGGGAGCGCCCCGAGAGTTGGCCTCCTCCCACGCTGCGC
GCGCACCTCCCCGCCCCCACCCCTACCCGCTGGCGTGCCCAGTGGAACGGAGCCTTGTGTCTCCGCCTCA
AGTCCCCGGATGCTCACCTCCCCGACTCGCCCCCGCTGTGGCCCCGCCCCCGCGCGGCTCTTCGTGCCAC
GTCACCGCCTGCGTCGCTTCCGGAGGCGCAGCGGGCGATGACGTAGAGGGACGTGCCCTCTATATGAGGT
TGGGGAGCGGCTGAGTCGGCCTTTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGGCTGCACCGC
GCTCGCTCCGAGTTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCC
TPT1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TPT1_1 ↗13:45,341,183負股45,341,173–45,341,232

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR13_83BZRF · promoter · 45339895–45340049 · regulatory

ENSR13_5DMXG8 · CTCF_binding_site · 45340602–45340626 · regulatory

ENSR13_BBZXR · promoter · 45341076–45341617 · regulatory

ENSR13_BBZXW · enhancer · 45341618–45342565 · regulatory

· motif · 45336632–45336645 · motif

· motif · 45336632–45336645 · motif

· motif · 45336703–45336714 · motif

· motif · 45339755–45339765 · motif

· motif · 45340134–45340145 · motif

· motif · 45340367–45340378 · motif

· motif · 45340425–45340434 · motif

· motif · 45340479–45340490 · motif

· motif · 45340479–45340490 · motif

· motif · 45340481–45340490 · motif

· motif · 45340604–45340620 · motif

· motif · 45340607–45340623 · motif

· motif · 45340628–45340637 · motif

· motif · 45340628–45340637 · motif

· motif · 45340640–45340653 · motif

· motif · 45340682–45340695 · motif

· motif · 45340825–45340835 · motif

· motif · 45340834–45340851 · motif

· motif · 45341069–45341079 · motif

· motif · 45341158–45341168 · motif

· motif · 45341165–45341175 · motif

· motif · 45341214–45341227 · motif

· motif · 45341250–45341259 · motif

· motif · 45341288–45341301 · motif

· motif · 45341293–45341303 · motif

· motif · 45341305–45341318 · motif

· motif · 45341388–45341398 · motif

· motif · 45341390–45341400 · motif

· motif · 45341391–45341404 · motif

· motif · 45341396–45341406 · motif

· motif · 45341403–45341412 · motif

· motif · 45341416–45341429 · motif

· motif · 45341456–45341469 · motif

· motif · 45341461–45341471 · motif

· motif · 45341560–45341575 · motif

· motif · 45341560–45341575 · motif

· motif · 45341561–45341575 · motif

· motif · 45341562–45341575 · motif

· motif · 45341654–45341667 · motif

· motif · 45341654–45341667 · motif

· motif · 45341812–45341825 · motif

· motif · 45341812–45341825 · motif

· motif · 45342100–45342115 · motif

· motif · 45342100–45342115 · motif

感染 enterovirus 71(EV71)時,TPT1 會受到下調。來源未說明此表現變化的幅度、時間或調控機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:172 aa

1 aa172 aa結構域功能區域
依 P13693 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TPT1 蛋白長 172 個胺基酸,屬於 TCTP 家族;其 TCTP domain 涵蓋第 1 至 172 位胺基酸。第 70 至 172 位胺基酸區域則是降低 TSC22D1 蛋白穩定性所必需的區段。

結構域TCTP1–172 aa
功能區域Required for reduction of TSC22D1 protein stability70–172 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1YZ1…

PDB · 1YZ1

X-ray · 2.00 A · A/B/C/D=1-172

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

TPT1 蛋白定位於細胞質。 來源未描述其定位隨條件或異構型而改變的情形。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 14 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TCTPTPT1ACTBATP1A1EEF1DHSPA9HSPB1PRDX1RHEBTP53TRIP13TSC22D1TUBA1CXRCC5XRCC6YBX1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TPT1 可形成同源二聚體,此項資訊標註為依相似性推定。另有資料指出,TPT1 與 STEAP3 及 TSC22D1 交互作用;與 TSC22D1 的交互作用會降低 TSC22D1 蛋白質的穩定性。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TPT1 與鈣離子結合及微管穩定有關;此外,它會與 TSC22D1 蛋白質交互作用並降低其穩定性,因此是 TSC22D1 介導之細胞凋亡的負向調節因子。含實驗來源
證據與來源

Involved in calcium binding and microtubule stabilization. Acts as a negative regulator of TSC22D1-mediated apoptosis, via interaction with and destabilization of TSC22D1 protein

PMID 12167714 ↗ · PMID 15162379 ↗ · PMID 15958728 ↗ · PMID 18325344 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TPT1 形成同源二聚體的資訊依相似性推定;另有資料指出 TPT1 與 STEAP3、TSC22D1 交互作用,其中與 TSC22D1 的交互作用會使 TSC22D1 蛋白質穩定性降低。含實驗來源
證據與來源

Homodimer (By similarity). Interacts with STEAP3. Interacts with TSC22D1; interaction results in the destabilization of TSC22D1 protein

PMID 15319436 ↗ · PMID 18325344 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TPT1 蛋白質位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 9059837 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控感染 enterovirus 71(EV71)時,TPT1 的表現受到下調。含實驗來源
證據與來源

Down-regulated in response to enterovirus 71 (EV71) infection

PMID 16548883 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000530705 · 4,548 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1CTTTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCG40
41GCTGCACCGCGCTCGCTCCGAGTTTCAGGCTCGTGCTAAG80
81CTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCATCATGATT120
121ATCTACCGGGACCTCATCAGCCACGATGAGATGTTCTCCG160
161ACATCTACAAGATCCGGGAGATCGCGGACGGGTTGTGCCT200
201GGAGGTGGAGGGGAAGATGGTCAGTAGGACAGAAGGTAAC240
241ATTGATGACTCGCTCATTGGTGGAAATGCCTCCGCTGAAG280
281GCCCCGAGGGCGAAGGTACCGAAAGCACAGTAATCACTGG320
321TGTCGATATTGTCATGAACCATCACCTGCAGGAAACAAGT360
361TTCACAAAAGAAGCCTACAAGAAGTACATCAAAGATTACA400
401TGAAATCAATCAAAGGGAAACTTGAAGAACAGAGACCAGA440
441AAGAGTAAAACCTTTTATGACAGGGGCTGCAGAACAAATC480
481AAGCACATCCTTGCTAATTTCAAAAACTACCAGTTCTTTA520
521TTGGTGAAAACATGAATCCAGATGGCATGGTTGCTCTATT560
561GGACTACCGTGAGGATGGTGTGACCCCATATATGATTTTC600
601TTTAAGGATGGTTTAGAAATGGAAAAATGTTAACAAATGT640
641GGCAATTATTTTGGATCTATCACCTGTCATCATAACTGGC680
681TTCTGCTTGTCATCCACACAACACCAGGACTTAAGACAAA720
721TGGGACTGATGTCATCTTGAGCTCTTCATTTATTTTGACT760
761GTGATTTATTTGGAGTGGAGGCATTGTTTTTAAGAAAAAC800
801ATGTCATGTAGGTTGTCTAAAAATAAAATGCATTTAAACT840
841CATTTGAGAGAATGCCTTTTAGTTTAATGCATATTTAAAC880
881TAAATTGATCCTGTAGTGTTCCTGGAGAAGCTAGAGCCTG920
921ATTGTAGGCTACTACTCATCAATTAACTTCTACAGTGGAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。