演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TPST2TANGO13B

tyrosylprotein sulfotransferase 2

TPST2 編碼 tyrosylprotein sulfotransferase 2,催化多肽中酪胺酸殘基的 O-硫酸化。

Homo sapiens22q12.1UniProt O60704
OFFICIAL SYMBOL
TPST2
CHROMOSOME
22
UNIPROT
O60704
PDB / ALPHAFOLD
3AP3
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TPST2 是一個蛋白質編碼基因,其產物為 tyrosylprotein sulfotransferase 2,屬於 protein sulfotransferase 家族。此酵素作用於多肽中的酪胺酸殘基,參與蛋白質的硫酸化修飾;其反應需要 3'-phosphoadenylyl sulfate(PAPS)作為共同受質。

Official symbol
TPST2
Gene name
tyrosylprotein sulfotransferase 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12021
UniProt
O60704
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TANGO13B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q12.1
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegTPST2pq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr22:26,521,996–26,596,717
Gene span
74,722 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000338754 ★26,521,996–26,590,1327
ENST0000045477826,521,996–26,550,6537
ENST0000039811026,521,996–26,565,6017
ENST0000040388026,521,996–26,596,7178
ENST0000091041026,521,996–26,590,1528
ENST0000091041126,521,996–26,590,1528
ENST0000091041226,521,996–26,590,1529
ENST0000091041426,521,996–26,590,1527
ENST0000091041526,521,996–26,590,1528
ENST0000091041626,521,996–26,590,1528
ENST0000091041726,521,996–26,590,1527
ENST0000091041826,521,996–26,590,1528

顯示 12/59 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TPST2 催化多肽中酪胺酸殘基的 O-硫酸化,作用位置位於多肽的酸性基序。此反應以 3'-phosphoadenylyl sulfate(PAPS)為共同受質,將硫酸基轉移至酪胺酸,形成 O-sulfo-L-tyrosine-[protein];反應同時產生 adenosine 3',5'-bisphosphate 與 H⁺。

這項酵素活性使 TPST2 能對多肽上的酪胺酸進行特定化學修飾。來源所述的反應描述了受質、共同受質及產物,但未提供其他下游效應或生物學過程的細節,因此其功能說明限於此硫酸基轉移反應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 26590132 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TPST2 ENST00000338754 GRCh38 chr22:26590032-26591132 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCAAAGTGCTAGAATCACAGGTGTGAGCCATGCACCTGACCCAGAAATTTATTTTAAACAGATAATATA
TACATATGGCAAATAGAAAGTTAAAAGAGAACAAAGAACCAAAGTTCACAATGAAAAGTAAGCCTGCATG
CCTACCCTACCTTTTCTTCAGGTATTCAATGCACAAGCATACGATGCATAGATAGCTCTATTATTTTTCC
AATTTTACACATGAAGAAGCAGAAGCACTGAAAGGTTATAGAACTTAGACTGTGCTAAGATTTATCAGTC
AGGAGTTTTGTTTCATTTGTGTATATCAGGGCTTCACAACCTTTACGCTATTCGGCATTTTTTGCAGGGT
TTTTTTTGGGGGGGTAGTGGCAGGGCTGGGGGTGGAAAGGGTGTCCTATGCACCGCAGAATGTTTAGCAG
CATTCCAGGCCTCTACTCACTAGATGCCAGTATCGCCTCTCCACTTCCCCAGTTATGACAACCAAAAATG
TCTTCAGAGATTGCCAAATGTCGTGGTGGTGGAGGGATGTCAGGGCAAAATCCCTGATAAATGGAGAGAA
TGTGGTATATCCACAAAAACTCCCTCCAAAACCACTGGTGTGTATGACTATACATCAGACCACCCCTTTC
TTTTTTCTGTGTTTTACACAAACAGTAGCACGAATACACCCCGCTGCGGGTCTACTTTTCTTTTCTTACA
CCACTTTTTGGTGATCATTCCACTTCATTGCTTACAGGCAGAAAGGAACTTCTCTTAAACAGAACTGACC
GGGAGAAGTGGTGAGCTGCCCGTCCTAGGGGTAAGCCAGCGAGCAGACAGGGGCTTCCAGGGCGGCGGGG
CGGGGTTCCCGGGGCGAGCCTCCGGGAAACTTCCCGACCAGCCTCTGCTCACCTCGCGGTCCCGAGGCGC
AGTGGAGGGGATGGGGCGGGGCGGGGCGGGGCCGCGTATCGGGCCCGCCCCCGTACGTCACGTCGCCGCG
GCCCCGCCCCCGCGCGGGCACCTCCCCCTTCCCCGGCTGGGGCGGCTGGAGAGCCGGGAGTCGCTGGGTG
CGTGGGGCTGCCTCGCCGCGTCTCGCCACGGTAGGTGGCCCTGGGGCGGCA
TPST2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TPST2_2 ↗22:26,565,341負股26,565,331–26,565,390
TPST2_1 ↗22:26,590,103負股26,590,093–26,590,152

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_B79G9 · enhancer · 26585095–26585637 · regulatory

ENSR22_588SHG · CTCF_binding_site · 26585152–26585173 · regulatory

ENSR22_9DJWX · enhancer · 26586561–26586991 · regulatory

ENSR22_C4M8F · enhancer · 26588308–26590121 · regulatory

ENSR22_588TB9 · CTCF_binding_site · 26589868–26589889 · regulatory

ENSR22_73K7SM · promoter · 26590122–26590230 · regulatory

ENSR22_B79H2 · enhancer · 26590231–26590933 · regulatory

ENSR22_B79HB · enhancer · 26592262–26592985 · regulatory

· motif · 26585154–26585170 · motif

· motif · 26587823–26587835 · motif

· motif · 26588838–26588853 · motif

· motif · 26589150–26589162 · motif

· motif · 26589163–26589175 · motif

· motif · 26589201–26589216 · motif

· motif · 26589209–26589224 · motif

· motif · 26589306–26589319 · motif

· motif · 26589480–26589495 · motif

· motif · 26589506–26589518 · motif

· motif · 26589870–26589886 · motif

· motif · 26590125–26590135 · motif

· motif · 26590137–26590150 · motif

· motif · 26590142–26590152 · motif

· motif · 26590166–26590179 · motif

· motif · 26590171–26590181 · motif

· motif · 26590191–26590201 · motif

· motif · 26590196–26590206 · motif

· motif · 26590201–26590211 · motif

· motif · 26591882–26591897 · motif

· motif · 26591884–26591899 · motif

· motif · 26592242–26592254 · motif

· motif · 26592332–26592345 · motif

· motif · 26592646–26592661 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:377 aa

1 aa377 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 O60704 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TPST2 蛋白質長 377 個胺基酸,屬於 protein sulfotransferase 家族。其 N 端第 1–8 位胺基酸位於細胞質,第 9–25 位為螺旋型跨膜區,作為第二型膜蛋白的訊號錨定區;第 26–377 位位於腔面。第 101–105 位胺基酸區域與胜肽受質互動。

拓樸區域Cytoplasmic1–8 aa
跨膜區Helical; Signal-anchor for type II membrane protein9–25 aa
拓樸區域Lumenal26–377 aa
功能區域Interaction with peptide substrate101–105 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3AP3…

PDB · 3AP3

X-ray · 3.50 A · A/B/C/D=43-377

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Golgi apparatus membrane

TPST2 位於 Golgi apparatus 膜,屬於單次穿膜的第二型膜蛋白。 定位資料未提供異構型差異或定位改變的條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TANGO13BTPST2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TPST2 可形成同源二聚體,也能與 TPST1 形成異源二聚體。來源未進一步說明這些二聚體的功能關係或其他交互作用。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TPST2 催化多肽酸性基序中的酪胺酸殘基進行 O-硫酸化,並以 3'-phosphoadenylyl sulfate(PAPS)作為共同受質。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the O-sulfation of tyrosine residues within acidic motifs of polypeptides, using 3'-phosphoadenylyl sulfate (PAPS) as cosubstrate

PMID 9733778 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-tyrosyl-[protein] + 3'-phosphoadenylyl sulfate = O-sulfo-L-tyrosine-[protein] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-tyrosyl-[protein] + 3'-phosphoadenylyl sulfate = O-sulfo-L-tyrosine-[protein] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 9733778 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TPST2 可形成同源二聚體,也可與 TPST1 形成異源二聚體;來源未提供這些二聚體形成的其他條件或功能結果。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Can also form heterodimers with TPST1

PMID 23481380 ↗ · PMID 25660941 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TPST2 位於 Golgi apparatus 膜,屬於單次穿膜的第二型膜蛋白;此項定位描述未提供定位變化條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Golgi apparatus membrane / Single-pass type II membrane protein

PMID 25660941 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000338754 · 5,653 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTCCCCCTTCCCCGGCTGGGGCGGCTGGAGAGCCGGGAG40
41TCGCTGGGTGCGTGGGGCTGCCTCGCCGCGTCTCGCCACG80
81GGCTCTGCCAGCAGACAGCCTTGGCACACAGGCACAAGGG120
121CTGGAGCCCAGAGATGAGAGTGCCCAAGGGAGATGTGAGC160
161CTGGCGGGCTGCCCGCTAACCTGTCGCTGAAGCCCCAGAA200
201GCGGGCCCTCAGGCCAGGCCTACCCTGCCTCCGGCCCAGC240
241ATGCGCCTGTCGGTGCGGAGGGTGCTGCTGGCAGCCGGCT280
281GCGCCCTGGTCCTGGTGCTGGCGGTTCAGCTGGGACAGCA320
321GGTGCTAGAGTGCCGGGCGGTGCTGGCGGGCCTGCGGAGC360
361CCCCGGGGGGCCATGCGGCCTGAGCAGGAGGAGCTGGTGA400
401TGGTGGGCACCAACCACGTGGAATACCGCTATGGCAAGGC440
441CATGCCGCTCATCTTCGTGGGTGGCGTGCCTCGCAGTGGC480
481ACCACGTTGATGCGCGCCATGCTGGACGCGCACCCCGAGG520
521TGCGCTGCGGCGAGGAGACCCGCATCATCCCGCGCGTGCT560
561GGCCATGCGCCAGGCCTGGTCCAAGTCTGGCCGTGAGAAG600
601CTGCGGCTGGATGAGGCGGGGGTGACGGATGAGGTGCTGG640
641ACGCCGCCATGCAGGCCTTCATCCTGGAGGTGATTGCCAA680
681GCACGGAGAGCCGGCCCGCGTGCTCTGCAACAAGGACCCA720
721TTTACGCTCAAGTCCTCGGTCTACCTGTCGCGCCTGTTCC760
761CCAACTCCAAGTTCCTGCTGATGGTGCGGGACGGCCGGGC800
801CTCCGTGCACTCCATGATCACGCGCAAAGTCACCATTGCG840
841GGCTTTGACCTCAGCAGCTACCGTGACTGCCTCACCAAGT880
881GGAACAAGGCCATCGAGGTGATGTACGCCCAGTGCATGGA920
921GGTAGGCAAGGAGAAGTGCCTGCCTGTGTACTACGAGCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。