基因總覽
TPST2 是一個蛋白質編碼基因,其產物為 tyrosylprotein sulfotransferase 2,屬於 protein sulfotransferase 家族。此酵素作用於多肽中的酪胺酸殘基,參與蛋白質的硫酸化修飾;其反應需要 3'-phosphoadenylyl sulfate(PAPS)作為共同受質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000338754 ★ | 26,521,996–26,590,132 | 7 |
| ENST00000454778 | 26,521,996–26,550,653 | 7 |
| ENST00000398110 | 26,521,996–26,565,601 | 7 |
| ENST00000403880 | 26,521,996–26,596,717 | 8 |
| ENST00000910410 | 26,521,996–26,590,152 | 8 |
| ENST00000910411 | 26,521,996–26,590,152 | 8 |
| ENST00000910412 | 26,521,996–26,590,152 | 9 |
| ENST00000910414 | 26,521,996–26,590,152 | 7 |
| ENST00000910415 | 26,521,996–26,590,152 | 8 |
| ENST00000910416 | 26,521,996–26,590,152 | 8 |
| ENST00000910417 | 26,521,996–26,590,152 | 7 |
| ENST00000910418 | 26,521,996–26,590,152 | 8 |
顯示 12/59 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TPST2 催化多肽中酪胺酸殘基的 O-硫酸化,作用位置位於多肽的酸性基序。此反應以 3'-phosphoadenylyl sulfate(PAPS)為共同受質,將硫酸基轉移至酪胺酸,形成 O-sulfo-L-tyrosine-[protein];反應同時產生 adenosine 3',5'-bisphosphate 與 H⁺。
這項酵素活性使 TPST2 能對多肽上的酪胺酸進行特定化學修飾。來源所述的反應描述了受質、共同受質及產物,但未提供其他下游效應或生物學過程的細節,因此其功能說明限於此硫酸基轉移反應。
Promoter 與基因調控
>TPST2 ENST00000338754 GRCh38 chr22:26590032-26591132 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCCAAAGTGCTAGAATCACAGGTGTGAGCCATGCACCTGACCCAGAAATTTATTTTAAACAGATAATATA TACATATGGCAAATAGAAAGTTAAAAGAGAACAAAGAACCAAAGTTCACAATGAAAAGTAAGCCTGCATG CCTACCCTACCTTTTCTTCAGGTATTCAATGCACAAGCATACGATGCATAGATAGCTCTATTATTTTTCC AATTTTACACATGAAGAAGCAGAAGCACTGAAAGGTTATAGAACTTAGACTGTGCTAAGATTTATCAGTC AGGAGTTTTGTTTCATTTGTGTATATCAGGGCTTCACAACCTTTACGCTATTCGGCATTTTTTGCAGGGT TTTTTTTGGGGGGGTAGTGGCAGGGCTGGGGGTGGAAAGGGTGTCCTATGCACCGCAGAATGTTTAGCAG CATTCCAGGCCTCTACTCACTAGATGCCAGTATCGCCTCTCCACTTCCCCAGTTATGACAACCAAAAATG TCTTCAGAGATTGCCAAATGTCGTGGTGGTGGAGGGATGTCAGGGCAAAATCCCTGATAAATGGAGAGAA TGTGGTATATCCACAAAAACTCCCTCCAAAACCACTGGTGTGTATGACTATACATCAGACCACCCCTTTC TTTTTTCTGTGTTTTACACAAACAGTAGCACGAATACACCCCGCTGCGGGTCTACTTTTCTTTTCTTACA CCACTTTTTGGTGATCATTCCACTTCATTGCTTACAGGCAGAAAGGAACTTCTCTTAAACAGAACTGACC GGGAGAAGTGGTGAGCTGCCCGTCCTAGGGGTAAGCCAGCGAGCAGACAGGGGCTTCCAGGGCGGCGGGG CGGGGTTCCCGGGGCGAGCCTCCGGGAAACTTCCCGACCAGCCTCTGCTCACCTCGCGGTCCCGAGGCGC AGTGGAGGGGATGGGGCGGGGCGGGGCGGGGCCGCGTATCGGGCCCGCCCCCGTACGTCACGTCGCCGCG GCCCCGCCCCCGCGCGGGCACCTCCCCCTTCCCCGGCTGGGGCGGCTGGAGAGCCGGGAGTCGCTGGGTG CGTGGGGCTGCCTCGCCGCGTCTCGCCACGGTAGGTGGCCCTGGGGCGGCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TPST2_2 ↗ | 22:26,565,341 | 負股 | 26,565,331–26,565,390 |
| TPST2_1 ↗ | 22:26,590,103 | 負股 | 26,590,093–26,590,152 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_B79G9 · enhancer · 26585095–26585637 · regulatory
ENSR22_588SHG · CTCF_binding_site · 26585152–26585173 · regulatory
ENSR22_9DJWX · enhancer · 26586561–26586991 · regulatory
ENSR22_C4M8F · enhancer · 26588308–26590121 · regulatory
ENSR22_588TB9 · CTCF_binding_site · 26589868–26589889 · regulatory
ENSR22_73K7SM · promoter · 26590122–26590230 · regulatory
ENSR22_B79H2 · enhancer · 26590231–26590933 · regulatory
ENSR22_B79HB · enhancer · 26592262–26592985 · regulatory
· motif · 26585154–26585170 · motif
· motif · 26587823–26587835 · motif
· motif · 26588838–26588853 · motif
· motif · 26589150–26589162 · motif
· motif · 26589163–26589175 · motif
· motif · 26589201–26589216 · motif
· motif · 26589209–26589224 · motif
· motif · 26589306–26589319 · motif
· motif · 26589480–26589495 · motif
· motif · 26589506–26589518 · motif
· motif · 26589870–26589886 · motif
· motif · 26590125–26590135 · motif
· motif · 26590137–26590150 · motif
· motif · 26590142–26590152 · motif
· motif · 26590166–26590179 · motif
· motif · 26590171–26590181 · motif
· motif · 26590191–26590201 · motif
· motif · 26590196–26590206 · motif
· motif · 26590201–26590211 · motif
· motif · 26591882–26591897 · motif
· motif · 26591884–26591899 · motif
· motif · 26592242–26592254 · motif
· motif · 26592332–26592345 · motif
· motif · 26592646–26592661 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:377 aa
TPST2 蛋白質長 377 個胺基酸,屬於 protein sulfotransferase 家族。其 N 端第 1–8 位胺基酸位於細胞質,第 9–25 位為螺旋型跨膜區,作為第二型膜蛋白的訊號錨定區;第 26–377 位位於腔面。第 101–105 位胺基酸區域與胜肽受質互動。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TPST2 位於 Golgi apparatus 膜,屬於單次穿膜的第二型膜蛋白。 定位資料未提供異構型差異或定位改變的條件。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
TPST2 可形成同源二聚體,也能與 TPST1 形成異源二聚體。來源未進一步說明這些二聚體的功能關係或其他交互作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TPST2 催化多肽酸性基序中的酪胺酸殘基進行 O-硫酸化,並以 3'-phosphoadenylyl sulfate(PAPS)作為共同受質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalyzes the O-sulfation of tyrosine residues within acidic motifs of polypeptides, using 3'-phosphoadenylyl sulfate (PAPS) as cosubstrate PMID 9733778 ↗ |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + 3'-phosphoadenylyl sulfate = O-sulfo-L-tyrosine-[protein] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-tyrosyl-[protein] + 3'-phosphoadenylyl sulfate = O-sulfo-L-tyrosine-[protein] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 9733778 ↗ |
| 交互作用 | TPST2 可形成同源二聚體,也可與 TPST1 形成異源二聚體;來源未提供這些二聚體形成的其他條件或功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TPST2 位於 Golgi apparatus 膜,屬於單次穿膜的第二型膜蛋白;此項定位描述未提供定位變化條件或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCTCCCCCTTCCCCGGCTGGGGCGGCTGGAGAGCCGGGAG40TCGCTGGGTGCGTGGGGCTGCCTCGCCGCGTCTCGCCACG80GGCTCTGCCAGCAGACAGCCTTGGCACACAGGCACAAGGG120CTGGAGCCCAGAGATGAGAGTGCCCAAGGGAGATGTGAGC160CTGGCGGGCTGCCCGCTAACCTGTCGCTGAAGCCCCAGAA200GCGGGCCCTCAGGCCAGGCCTACCCTGCCTCCGGCCCAGC240ATGCGCCTGTCGGTGCGGAGGGTGCTGCTGGCAGCCGGCT280GCGCCCTGGTCCTGGTGCTGGCGGTTCAGCTGGGACAGCA320GGTGCTAGAGTGCCGGGCGGTGCTGGCGGGCCTGCGGAGC360CCCCGGGGGGCCATGCGGCCTGAGCAGGAGGAGCTGGTGA400TGGTGGGCACCAACCACGTGGAATACCGCTATGGCAAGGC440CATGCCGCTCATCTTCGTGGGTGGCGTGCCTCGCAGTGGC480ACCACGTTGATGCGCGCCATGCTGGACGCGCACCCCGAGG520TGCGCTGCGGCGAGGAGACCCGCATCATCCCGCGCGTGCT560GGCCATGCGCCAGGCCTGGTCCAAGTCTGGCCGTGAGAAG600CTGCGGCTGGATGAGGCGGGGGTGACGGATGAGGTGCTGG640ACGCCGCCATGCAGGCCTTCATCCTGGAGGTGATTGCCAA680GCACGGAGAGCCGGCCCGCGTGCTCTGCAACAAGGACCCA720TTTACGCTCAAGTCCTCGGTCTACCTGTCGCGCCTGTTCC760CCAACTCCAAGTTCCTGCTGATGGTGCGGGACGGCCGGGC800CTCCGTGCACTCCATGATCACGCGCAAAGTCACCATTGCG840GGCTTTGACCTCAGCAGCTACCGTGACTGCCTCACCAAGT880GGAACAAGGCCATCGAGGTGATGTACGCCCAGTGCATGGA920GGTAGGCAAGGAGAAGTGCCTGCCTGTGTACTACGAGCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。