演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TPST1TANGO13A

tyrosylprotein sulfotransferase 1

TPST1 編碼 tyrosylprotein sulfotransferase 1,屬於蛋白質硫酸基轉移酶家族,可將硫酸基轉移至多肽中的特定酪胺酸殘基。

Homo sapiens7q11.21UniProt O60507
OFFICIAL SYMBOL
TPST1
CHROMOSOME
7
UNIPROT
O60507
PDB / ALPHAFOLD
5WRI
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TPST1 是人類的蛋白質編碼基因,其產物 tyrosylprotein sulfotransferase 1 屬於蛋白質硫酸基轉移酶家族。此酵素為單次穿膜的第二型膜蛋白,具有短的細胞質端、跨膜區段,以及較長的腔面區域;其腔面區段包含與胜肽受質作用的區域。這些特徵描述了蛋白質的家族歸屬與基本結構,並提供其執行酵素功能的分子背景。

Official symbol
TPST1
Gene name
tyrosylprotein sulfotransferase 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12020
UniProt
O60507
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TANGO13A

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q11.21
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegTPST1pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:66,205,289–66,420,549
Gene span
215,261 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000304842 ★66,205,334–66,360,4436
ENST0000064966466,205,289–66,360,4267
ENST0000090443666,205,289–66,399,6206
ENST0000090443766,205,289–66,399,6167
ENST0000090443866,205,289–66,389,7506
ENST0000090443966,205,289–66,360,4436
ENST0000090444066,205,289–66,360,4495
ENST0000090444166,205,289–66,360,4436
ENST0000090444266,205,289–66,360,4446
ENST0000090444366,205,289–66,360,4326
ENST0000090444466,205,289–66,360,4405
ENST0000090444566,205,289–66,360,4427

顯示 12/36 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tyrosylprotein sulfotransferase 1 催化多肽中酪胺酸殘基的 O-硫酸化。其作用位置不是任意的酪胺酸,而是位於多肽酸性基序中的酪胺酸殘基;因此,受質序列中的局部特徵是來源所述反應的一部分。酵素以 3'-phosphoadenylyl sulfate(PAPS)作為共同受質,將硫酸基轉移至受質酪胺酸,形成 O-sulfo-L-tyrosine-[protein],同時產生 adenosine 3',5'-bisphosphate 與 H(+)。

這項反應將酪胺酸側鏈轉變為硫酸化形式,構成此蛋白質所催化的化學修飾。來源將其界定為多肽的 O-硫酸化,並指出反應依賴 PAPS;不過,這些資料未進一步說明特定受質、下游生理結果或此修飾在不同生物過程中的作用,因此不延伸推論其個別功能影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 66205334 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TPST1 ENST00000304842 GRCh38 chr7:66204334-66205434 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCCTCCCCAGTAGCTGGGACGACAGGCGTCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGCAGGGA
CGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATTCACCAGCTTTGGCTTC
CCAAAGTGCTGTGATTAGAGGCATGAGCCACCCCACCTGGCCTAGCAGAGAGCAATTTTGAATACAGCTG
TTAGATTCTGCACTCATGCCTTCTCTAATCCATGTCACTGGAGTAGAAATAATTGCTTTGACAGAACCTG
GTGTAGATGTGTCTGTAGGAAGAAACTGTAAAATGAATGGATCATTTTGTGAAATATCTGCCCTTTCCCC
ACCTTTCTTTTGCTTCTTTGCCTTTTTCTCCCTAGTTTTCATTTCTTTCTTTTAGGGCGTCAGCCCCCCA
CCTCTGTGGTTGGGAGGGACTATTGCACGTCTACACTCTCGTGGGGATGAAATAGTGTTTGAGTTCGTTA
TTTGCATTTGCGCGTTATCTCCCCGAGGAGATGACAGCTTCTCTGCCAGCAGCGGGCAAAGGTGGGCTCT
GAAGCAGAGGAGAGGAATTATCAGGAAAAGCTCATTTTCTTCTCCTGTCCTAGGGTTTCACTGATGAAGG
CCTCTGGGACACCCACGTTGGGGGTGGGGGCGGTGAGGACCGCCACCTGCCCGCGGCTCCCCTGCAGCCA
GGCCACGCGCGCTGTTGCTAGGGCAACCACCCGGCCAGGCCTGCGGCTGCCGGGAAGCCCCCTCGGGAGC
GCGCACGGGAAGGGCTGTGGGGGCGCTGGCCGGCTGCGACGTCAGACCCCCGCCCCTCGGCGCCTGCCGG
ACCCAGCTCCATTCCCAGCCGCGCCTCCTTCGGTGGGCAGCCGGCCGGAACTCACGAATCAGAGCAGCCG
ACACATCGTCCGCTCAGCCAATCGTAGCAGATGTGTGATCCCGCCACCTCCCCGGACCCTGGCGGTTGTC
GCTGAGTTGGCGACCGCGGGAGACGCTGCTGAGGCGGCTTCGGTTGCGGGTCGGAACGGCGCTGCTCTGC
GGGGCCGGTCCAGGCTGGCAGCTGCCGGCGCTTGGCGGTGAGGGCGGGCTC
TPST1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TPST1_1 ↗7:66,205,334正股66,205,285–66,205,344

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_BH5Q9 · promoter · 66204844–66205395 · regulatory

ENSR7_C8KD8 · enhancer · 66205396–66207148 · regulatory

· motif · 66204971–66204984 · motif

· motif · 66204984–66204997 · motif

· motif · 66205046–66205061 · motif

· motif · 66205046–66205061 · motif

· motif · 66205117–66205130 · motif

· motif · 66205150–66205160 · motif

· motif · 66205191–66205201 · motif

· motif · 66205312–66205326 · motif

· motif · 66205339–66205353 · motif

· motif · 66205339–66205353 · motif

· motif · 66205379–66205392 · motif

· motif · 66205416–66205433 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:370 aa

1 aa370 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 O60507 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tyrosylprotein sulfotransferase 1 長 370 個胺基酸,屬於 protein sulfotransferase 家族。其第 1–8 個胺基酸位於細胞質側,第 9–25 個胺基酸構成螺旋型跨膜區,作為第二型膜蛋白的訊號錨定區;第 26–370 個胺基酸位於腔面。第 102–106 個胺基酸區段與胜肽受質作用。

拓樸區域Cytoplasmic1–8 aa
跨膜區Helical; Signal-anchor for type II membrane protein9–25 aa
拓樸區域Lumenal26–370 aa
功能區域Interaction with peptide substrate102–106 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5WRI…

PDB · 5WRI

X-ray · 1.60 A · A/B=43-341

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Golgi apparatus membrane

tyrosylprotein sulfotransferase 1 定位於 Golgi apparatus membrane,並屬單次穿膜的第二型膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TANGO13ATPST1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

tyrosylprotein sulfotransferase 1 可形成同源二聚體,也可與 TPST2 形成異源二聚體。此處描述的是二聚體形成,來源未提供其他蛋白質結合或更大型複合體的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tyrosylprotein sulfotransferase 1 催化多肽酸性基序中的酪胺酸殘基進行 O-硫酸化,並以 3'-phosphoadenylyl sulfate(PAPS)作為共同受質,提供反應所需的硫酸基。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the O-sulfation of tyrosine residues within acidic motifs of polypeptides, using 3'-phosphoadenylyl sulfate (PAPS) as cosubstrate

PMID 28821720 ↗ · PMID 9501187 ↗ · PMID 9733778 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-tyrosyl-[protein] + 3'-phosphoadenylyl sulfate = O-sulfo-L-tyrosine-[protein] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-tyrosyl-[protein] + 3'-phosphoadenylyl sulfate = O-sulfo-L-tyrosine-[protein] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 28821720 ↗ · PMID 9501187 ↗ · PMID 9733778 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用tyrosylprotein sulfotransferase 1 可形成同源二聚體,也能與 TPST2 形成異源二聚體;來源列出兩種蛋白質組裝形式。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Can also form heterodimers with TPST2

PMID 16859706 ↗ · PMID 25660941 ↗ · PMID 28821720 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位tyrosylprotein sulfotransferase 1 位於 Golgi apparatus membrane,並為單次穿膜的第二型膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Golgi apparatus membrane / Single-pass type II membrane protein

PMID 16859706 ↗ · PMID 25660941 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000304842 · 1,981 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACGCTGCTGAGGCGGCTTCGGTTGCGGGTCGGAACGGC40
41GCTGCTCTGCGGGGCCGGTCCAGGCTGGCAGCTGCCGGCG80
81CTTGGCGGTGAGGGCGGGCTCCCGAGTGGCCCCCCACCGA120
121AGGCGGTGGGACCAGCGGCTGAGGCCAGGATGCCGTCCAG160
161GCGGCGCGGCGGCTCCTCACTCATCCCAGATGTTGGTTAT200
201CTTTCTGAAGTAGACTGTCCATGGCCTGAACATTTTCCGA240
241AAATCATTTTGAGCAAAATATCTGTTTAATAACAAGATAA280
281CCACATCAAGATGGTTGGAAAGCTGAAGCAGAACTTACTA320
321TTGGCATGTCTGGTGATTAGTTCTGTGACTGTGTTTTACC360
361TGGGCCAGCATGCCATGGAATGCCATCACCGGATAGAGGA400
401ACGTAGCCAGCCAGTCAAATTGGAGAGCACAAGGACCACT440
441GTGAGAACTGGCCTGGACCTCAAAGCCAACAAAACCTTTG480
481CCTATCACAAAGATATGCCTTTAATATTTATTGGAGGTGT520
521GCCTCGGAGTGGAACCACACTCATGAGGGCCATGCTGGAC560
561GCACATCCTGACATTCGCTGTGGAGAGGAAACCAGGGTCA600
601TTCCCCGAATCCTGGCCCTGAAGCAGATGTGGTCACGGTC640
641AAGTAAAGAGAAGATCCGCCTGGATGAGGCTGGTGTTACT680
681GATGAAGTGCTGGATTCTGCCATGCAAGCCTTCTTACTAG720
721AAATTATCGTTAAGCATGGGGAGCCAGCCCCTTATTTATG760
761TAATAAAGATCCTTTTGCCCTGAAATCTTTAACTTACCTT800
801TCTAGGTTATTCCCCAATGCCAAATTTCTCCTGATGGTCC840
841GAGATGGCCGGGCATCAGTACATTCAATGATTTCTCGAAA880
881AGTTACTATAGCTGGATTTGATCTGAACAGCTATAGGGAC920
921TGTTTGACAAAGTGGAATCGTGCTATAGAGACCATGTATA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。