基因總覽
TPST1 是人類的蛋白質編碼基因,其產物 tyrosylprotein sulfotransferase 1 屬於蛋白質硫酸基轉移酶家族。此酵素為單次穿膜的第二型膜蛋白,具有短的細胞質端、跨膜區段,以及較長的腔面區域;其腔面區段包含與胜肽受質作用的區域。這些特徵描述了蛋白質的家族歸屬與基本結構,並提供其執行酵素功能的分子背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000304842 ★ | 66,205,334–66,360,443 | 6 |
| ENST00000649664 | 66,205,289–66,360,426 | 7 |
| ENST00000904436 | 66,205,289–66,399,620 | 6 |
| ENST00000904437 | 66,205,289–66,399,616 | 7 |
| ENST00000904438 | 66,205,289–66,389,750 | 6 |
| ENST00000904439 | 66,205,289–66,360,443 | 6 |
| ENST00000904440 | 66,205,289–66,360,449 | 5 |
| ENST00000904441 | 66,205,289–66,360,443 | 6 |
| ENST00000904442 | 66,205,289–66,360,444 | 6 |
| ENST00000904443 | 66,205,289–66,360,432 | 6 |
| ENST00000904444 | 66,205,289–66,360,440 | 5 |
| ENST00000904445 | 66,205,289–66,360,442 | 7 |
顯示 12/36 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
tyrosylprotein sulfotransferase 1 催化多肽中酪胺酸殘基的 O-硫酸化。其作用位置不是任意的酪胺酸,而是位於多肽酸性基序中的酪胺酸殘基;因此,受質序列中的局部特徵是來源所述反應的一部分。酵素以 3'-phosphoadenylyl sulfate(PAPS)作為共同受質,將硫酸基轉移至受質酪胺酸,形成 O-sulfo-L-tyrosine-[protein],同時產生 adenosine 3',5'-bisphosphate 與 H(+)。
這項反應將酪胺酸側鏈轉變為硫酸化形式,構成此蛋白質所催化的化學修飾。來源將其界定為多肽的 O-硫酸化,並指出反應依賴 PAPS;不過,這些資料未進一步說明特定受質、下游生理結果或此修飾在不同生物過程中的作用,因此不延伸推論其個別功能影響。
Promoter 與基因調控
>TPST1 ENST00000304842 GRCh38 chr7:66204334-66205434 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCTCCCCAGTAGCTGGGACGACAGGCGTCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGCAGGGA CGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATTCACCAGCTTTGGCTTC CCAAAGTGCTGTGATTAGAGGCATGAGCCACCCCACCTGGCCTAGCAGAGAGCAATTTTGAATACAGCTG TTAGATTCTGCACTCATGCCTTCTCTAATCCATGTCACTGGAGTAGAAATAATTGCTTTGACAGAACCTG GTGTAGATGTGTCTGTAGGAAGAAACTGTAAAATGAATGGATCATTTTGTGAAATATCTGCCCTTTCCCC ACCTTTCTTTTGCTTCTTTGCCTTTTTCTCCCTAGTTTTCATTTCTTTCTTTTAGGGCGTCAGCCCCCCA CCTCTGTGGTTGGGAGGGACTATTGCACGTCTACACTCTCGTGGGGATGAAATAGTGTTTGAGTTCGTTA TTTGCATTTGCGCGTTATCTCCCCGAGGAGATGACAGCTTCTCTGCCAGCAGCGGGCAAAGGTGGGCTCT GAAGCAGAGGAGAGGAATTATCAGGAAAAGCTCATTTTCTTCTCCTGTCCTAGGGTTTCACTGATGAAGG CCTCTGGGACACCCACGTTGGGGGTGGGGGCGGTGAGGACCGCCACCTGCCCGCGGCTCCCCTGCAGCCA GGCCACGCGCGCTGTTGCTAGGGCAACCACCCGGCCAGGCCTGCGGCTGCCGGGAAGCCCCCTCGGGAGC GCGCACGGGAAGGGCTGTGGGGGCGCTGGCCGGCTGCGACGTCAGACCCCCGCCCCTCGGCGCCTGCCGG ACCCAGCTCCATTCCCAGCCGCGCCTCCTTCGGTGGGCAGCCGGCCGGAACTCACGAATCAGAGCAGCCG ACACATCGTCCGCTCAGCCAATCGTAGCAGATGTGTGATCCCGCCACCTCCCCGGACCCTGGCGGTTGTC GCTGAGTTGGCGACCGCGGGAGACGCTGCTGAGGCGGCTTCGGTTGCGGGTCGGAACGGCGCTGCTCTGC GGGGCCGGTCCAGGCTGGCAGCTGCCGGCGCTTGGCGGTGAGGGCGGGCTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TPST1_1 ↗ | 7:66,205,334 | 正股 | 66,205,285–66,205,344 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_BH5Q9 · promoter · 66204844–66205395 · regulatory
ENSR7_C8KD8 · enhancer · 66205396–66207148 · regulatory
· motif · 66204971–66204984 · motif
· motif · 66204984–66204997 · motif
· motif · 66205046–66205061 · motif
· motif · 66205046–66205061 · motif
· motif · 66205117–66205130 · motif
· motif · 66205150–66205160 · motif
· motif · 66205191–66205201 · motif
· motif · 66205312–66205326 · motif
· motif · 66205339–66205353 · motif
· motif · 66205339–66205353 · motif
· motif · 66205379–66205392 · motif
· motif · 66205416–66205433 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:370 aa
tyrosylprotein sulfotransferase 1 長 370 個胺基酸,屬於 protein sulfotransferase 家族。其第 1–8 個胺基酸位於細胞質側,第 9–25 個胺基酸構成螺旋型跨膜區,作為第二型膜蛋白的訊號錨定區;第 26–370 個胺基酸位於腔面。第 102–106 個胺基酸區段與胜肽受質作用。
蛋白質三維結構
細胞內定位
tyrosylprotein sulfotransferase 1 定位於 Golgi apparatus membrane,並屬單次穿膜的第二型膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
tyrosylprotein sulfotransferase 1 可形成同源二聚體,也可與 TPST2 形成異源二聚體。此處描述的是二聚體形成,來源未提供其他蛋白質結合或更大型複合體的資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | tyrosylprotein sulfotransferase 1 催化多肽酸性基序中的酪胺酸殘基進行 O-硫酸化,並以 3'-phosphoadenylyl sulfate(PAPS)作為共同受質,提供反應所需的硫酸基。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalyzes the O-sulfation of tyrosine residues within acidic motifs of polypeptides, using 3'-phosphoadenylyl sulfate (PAPS) as cosubstrate PMID 28821720 ↗ · PMID 9501187 ↗ · PMID 9733778 ↗ |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + 3'-phosphoadenylyl sulfate = O-sulfo-L-tyrosine-[protein] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-tyrosyl-[protein] + 3'-phosphoadenylyl sulfate = O-sulfo-L-tyrosine-[protein] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 28821720 ↗ · PMID 9501187 ↗ · PMID 9733778 ↗ |
| 交互作用 | tyrosylprotein sulfotransferase 1 可形成同源二聚體,也能與 TPST2 形成異源二聚體;來源列出兩種蛋白質組裝形式。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Can also form heterodimers with TPST2 PMID 16859706 ↗ · PMID 25660941 ↗ · PMID 28821720 ↗ |
| 細胞定位 | tyrosylprotein sulfotransferase 1 位於 Golgi apparatus membrane,並為單次穿膜的第二型膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Golgi apparatus membrane / Single-pass type II membrane protein PMID 16859706 ↗ · PMID 25660941 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGACGCTGCTGAGGCGGCTTCGGTTGCGGGTCGGAACGGC40GCTGCTCTGCGGGGCCGGTCCAGGCTGGCAGCTGCCGGCG80CTTGGCGGTGAGGGCGGGCTCCCGAGTGGCCCCCCACCGA120AGGCGGTGGGACCAGCGGCTGAGGCCAGGATGCCGTCCAG160GCGGCGCGGCGGCTCCTCACTCATCCCAGATGTTGGTTAT200CTTTCTGAAGTAGACTGTCCATGGCCTGAACATTTTCCGA240AAATCATTTTGAGCAAAATATCTGTTTAATAACAAGATAA280CCACATCAAGATGGTTGGAAAGCTGAAGCAGAACTTACTA320TTGGCATGTCTGGTGATTAGTTCTGTGACTGTGTTTTACC360TGGGCCAGCATGCCATGGAATGCCATCACCGGATAGAGGA400ACGTAGCCAGCCAGTCAAATTGGAGAGCACAAGGACCACT440GTGAGAACTGGCCTGGACCTCAAAGCCAACAAAACCTTTG480CCTATCACAAAGATATGCCTTTAATATTTATTGGAGGTGT520GCCTCGGAGTGGAACCACACTCATGAGGGCCATGCTGGAC560GCACATCCTGACATTCGCTGTGGAGAGGAAACCAGGGTCA600TTCCCCGAATCCTGGCCCTGAAGCAGATGTGGTCACGGTC640AAGTAAAGAGAAGATCCGCCTGGATGAGGCTGGTGTTACT680GATGAAGTGCTGGATTCTGCCATGCAAGCCTTCTTACTAG720AAATTATCGTTAAGCATGGGGAGCCAGCCCCTTATTTATG760TAATAAAGATCCTTTTGCCCTGAAATCTTTAACTTACCTT800TCTAGGTTATTCCCCAATGCCAAATTTCTCCTGATGGTCC840GAGATGGCCGGGCATCAGTACATTCAATGATTTCTCGAAA880AGTTACTATAGCTGGATTTGATCTGAACAGCTATAGGGAC920TGTTTGACAAAGTGGAATCGTGCTATAGAGACCATGTATA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。