演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TPSD1

tryptase delta 1

TPSD1 編碼的 tryptase delta 1 是肥大細胞中的中性蛋白酶,會在細胞活化並同步脫顆粒時分泌;其切割偏好包括 Arg 或 Lys 後方的胺基酸。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q9BZJ3
OFFICIAL SYMBOL
TPSD1
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9BZJ3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TPSD1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 tryptase delta 1。其產物屬於 peptidase S1 家族的 Tryptase 次家族,具有蛋白酶性質;來源將 tryptase 描述為肥大細胞中的主要中性蛋白酶。這些資訊界定了 tryptase delta 1 的蛋白質類型與家族歸屬,提供理解其分子功能的基本背景。

Official symbol
TPSD1
Gene name
tryptase delta 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14118
UniProt
Q9BZJ3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegTPSD1pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:1,256,059–1,259,008
Gene span
2,950 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000211076 ★1,256,069–1,259,0085
ENST000003975341,256,059–1,259,0086
ENST000007113931,256,069–1,259,0085

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tryptase delta 1 屬於肥大細胞中的中性蛋白酶。來源指出,tryptase 是肥大細胞內主要的中性蛋白酶,並會在細胞活化與脫顆粒相互連動的反應中分泌。這表示其分泌與肥大細胞的活化、顆粒釋放過程相連,而非僅描述蛋白質存在於細胞內;來源未進一步說明此蛋白酶在細胞外的特定作用對象或生理結果。

在酵素切割偏好方面,tryptase delta 1 可優先切割 Arg 或 Lys 之後的肽鍵,也就是切割位置偏向這兩種胺基酸的羧基端。不過,其底物專一性比 trypsin 更受限制。因此,雖然兩者都呈現對 Arg、Lys 相關切割位置的偏好,不能據此將 tryptase delta 1 的底物範圍等同於 trypsin;來源亦未列出更具體的受質或切割產物。

將細胞活化時的分泌特性與切割偏好合併來看,來源支持的功能描述聚焦於兩點:它是肥大細胞的主要中性蛋白酶之一,且具有受限於特定胺基酸位置的蛋白水解活性。現有資料沒有進一步界定這些切割作用所參與的特定生物過程,因此不延伸推定其下游機制或生理效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 1256069 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TPSD1 ENST00000211076 GRCh38 chr16:1255069-1256169 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTCCATGGGGAGCTGGGCTGGGGCTGGGGGTGAGTCCATGGGGAGCTGGACTGGGGCTGTGGGTGAGTC
CATGGGGAGCTGGGGCTGGGGCTGGGACTACTCCATGGGGAGCTGGGGCTGGGGCTGGGACTAGTCCATG
GGGAGCTGGGCTGGGGCTGTGGGTGAGTCCATGGGGAGCTGGGCTGGGGCTGGGGGTGAGTCCATGGGGA
GCTGGGCTGGGTCTCCTGGGGTTGCACCTGCACTCCTGTCTGCCCTTCCCTCTGCGGATGAAGCTCAGAT
CCCATGATAAGAAGGCACCTGCAGACCAGGGGACCTGCACGGACAGCCCCAGAGGTGGACATTGAGGAAT
CGTTGGAGGACTTGGGTCTCATACGGGAGGTGGGGAGCAGGGCCCCTTCCTGGCTGAGGACACTTGGTGC
TGTCCCCTCTCAAGGCTGTTTCCCCATCTGACAAAGGGGTCTCATGTGAGCCCCCAACCAAGTGAGTCGA
GGAGGGCTGGCCCCACCCCCGTGGATTCGGAGTCCGTAGGAGGGGTGTCACCCGTCATGTCCCCACCCCG
TGGGCACCTTCCCGTCTCTTGGAGGGTGGCCCATGGACATGAGTTCCTCACCCCGTGTCCCTCTTGGGGA
AACAGGTTTCAGGAGCGACGGGTCTTGTAGCCTGGGGCAGCCAGGCCACCTGGGTGCAGCTATGCCTGAA
GGCCTCCTGGCACCGAGACAGGGGCAGGAGCAGATCCCACCAGCGGGAAGGTGGTGGGTTCCAGTGCTGG
GATCCACCAGCTGACAGGTGGAGCTGCGAGCCTCCAGTGCTCAGCCCTCGGCGGGGCCTGCCTGGCAGCC
CCACACACAGAGGGCATCGGGGTGGCGGGGGCATGTGTTACACGGGGGCCCTGGGTCTGAGTCATCCACT
TCCTCCGAGTCTGGATGGGAGGACCCAGCGCCCCTCCTCCGCCCCCTCCTGATCTGGAAGCATAAATGGG
GAGGGGAGAGCCCGCTGGGTAGAAGGAACAGGGAGTGGCCAGGGTAAGTCCCTACTCTCAGAGACCCTGA
CATCAGCGTCACCTGGAGCAGAGTGGCCCAGCCTCAGACTCAGAGCACCAA
TPSD1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TPSD1_2 ↗16:1,253,770正股1,253,721–1,253,780
TPSD1_1 ↗16:1,256,069正股1,256,020–1,256,079
TPSD1_3 ↗16:1,256,270正股1,256,221–1,256,280

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_B8PF · enhancer · 1253730–1254312 · regulatory

· motif · 1258284–1258291 · motif

· motif · 1258309–1258321 · motif

· motif · 1258312–1258319 · motif

· motif · 1258313–1258326 · motif

· motif · 1258316–1258328 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:242 aa

1 aa242 aa結構域訊號胜肽
依 Q9BZJ3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tryptase delta 1 蛋白質長 242 個胺基酸。其第 1–25 位為訊號序列;第 38–242 位註解為 Peptidase S1 結構域。家族分類將其歸入 peptidase S1 家族的 Tryptase 次家族。

訊號胜肽1–25 aa
結構域Peptidase S138–242 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9BZJ3…

AlphaFold · Q9BZJ3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

tryptase delta 1 為分泌型蛋白質;肥大細胞活化時,會自分泌顆粒釋出。 來源未提供其他定位或不同異構型的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TPSD1TPSD1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

tryptase delta 1 以同源四聚體形式存在。來源未指出其他結合夥伴、複合體成員或功能性互作關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tryptase 是肥大細胞中主要的中性蛋白酶,並在肥大細胞活化與脫顆粒同步發生的反應中分泌。推論支持
證據與來源

Tryptase is the major neutral protease present in mast cells and is secreted upon the coupled activation-degranulation response of this cell type

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性tryptase delta 1 優先切割 Arg 或 Lys 後方的肽鍵,但其底物專一性比 trypsin 更受限制。含實驗來源
證據與來源

Preferential cleavage: Arg-|-Xaa, Lys-|-Xaa, but with more restricted specificity than trypsin.

PMID 12391231 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homotetramer推論支持
證據與來源

Homotetramer

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位tryptase delta 1 是分泌型蛋白質;肥大細胞活化時,會自分泌顆粒釋出。推論支持
證據與來源

Secreted; Released from the secretory granules upon mast cell activation

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000211076 · 1,573 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAAGGAACAGGGAGTGGCCAGGGTAAGTCCCTACTCTCA40
41GAGACCCTGACATCAGCGTCACCTGGAGCAGAGTGGCCCA80
81GCCTCAGACTCAGAGCACCAAGACCCAGGCCCGCAGGCCT120
121GGACCCACCCCGGTCCCCCCGTCCCAGCTCCATTCTTCAC160
161CCCACAATCTGTAGCCCCCAGCCCTGCCCTGTGAGGCCCG200
201GCCAGGCCCACGATGCTCCTCCTTGCTCCCCAGATGCTGA240
241GCCTGCTGCTGCTGGCGCTGCCCGTCCTGGCGAGCCCGGC280
281CTACGTGGCCCCTGCCCCAGGCCAGGCCCTGCAGCAAACG320
321GGCATTGTTGGGGGGCAGGAGGCCCCCAGGAGCAAGTGGC360
361CCTGGCAGGTGAGCCTGAGAGTCCGCGGCCCATACTGGAT400
401GCACTTCTGCGGGGGCTCCCTCATCCACCCCCAGTGGGTG440
441CTAACCGCGGCGCACTGCGTGGAACCGGACATCAAGGATC480
481TGGCCGCCCTCAGGGTGCAACTGCGGGAGCAGCACCTCTA520
521CTACCAGGACCAGCTGCTGCCGGTCAGCAGGATCATCGTG560
561CACCCACAGTTCTACATCATCCAGACCGGGGCGGACATCG600
601CCCTGCTGGAGCTGGAGGAGCCCGTGAACATCTCCAGCCA640
641CATCCACACGGTCACGCTGCCCCCTGCCTCGGAGACCTTC680
681CCCCCGGGGATGCCGTGCTGGGTCACTGGCTGGGGCGACG720
721TGGACAATAATGTGCACCTGCCGCCGCCATACCCGCTGAA760
761GGAGGTGGAAGTCCCCGTAGTGGAAAACCACCTTTGCAAC800
801GCGGAATATCACACCGGCCTCCATACGGGCCACAGCTTTC840
841AAATCGTCCGCGATGACATGCTGTGTGCGGGGAGCGAAAA880
881TCACGACTCCTGCCAGGGTGACTCTGGAGGGCCCCTGGTC920
921TGCAAGGTGAATGGCACCTAACTGCAGGCGGGCGTGGTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。