演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TPSB2

tryptase beta 2

TPSB2 編碼 tryptase beta 2,屬於 tryptase subfamily 的中性蛋白酶,主要存在於肥大細胞,並可能參與先天免疫。

Homo sapiens16p13.3UniProt P20231
OFFICIAL SYMBOL
TPSB2
CHROMOSOME
16
UNIPROT
P20231
PDB / ALPHAFOLD
2BM2
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TPSB2 是蛋白質編碼基因,產物為 tryptase beta 2,屬於 peptidase S1 family 的 tryptase subfamily。這種中性蛋白酶主要存在於肥大細胞,並可能參與先天免疫。其蛋白質全長 275 個胺基酸,包含訊號胜肽及 Peptidase S1 結構域。這些資訊勾勒出其家族歸屬、基本結構與細胞來源;關於其活性及不同分子形式的作用,見功能與交互作用說明。

Official symbol
TPSB2
Gene name
tryptase beta 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14120
UniProt
P20231
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegTPSB2pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:1,227,272–1,233,725
Gene span
6,454 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000606293 ★1,228,336–1,230,1846
ENST000006121421,228,336–1,230,1665
ENST000007114211,228,336–1,230,1846
ENST000009059211,228,336–1,230,1665
ENST000009059221,228,336–1,230,1665
ENST000009558021,228,336–1,233,7257
ENST000009558031,228,336–1,230,1846
ENST000009059231,228,338–1,229,9515

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tryptase beta 2 是肥大細胞中的主要中性蛋白酶。肥大細胞受到活化並伴隨脫顆粒反應時,會分泌 tryptase;因此,這種酶的釋出與細胞活化及脫顆粒相連。來源指出它可能參與先天免疫,但未進一步界定其在此免疫過程中的具體作用,故此功能應保留為可能性,而非確定結論。

在底物切割方面,tryptase beta 2 優先切割 Arg 或 Lys 之後的鍵結,亦即 Arg-|-Xaa 與 Lys-|-Xaa。其切割偏好與 trypsin 有相似之處,但專一性範圍較受限制;這描述了酶辨識並切割底物的偏好,來源未提供更多底物種類或反應條件。

tryptase beta 2 的活性也與其分子組成狀態相關。以 tetramer 形式存在時,酶的活性位點受到遮蔽;單體形式則具有可接觸大型蛋白質與抑制劑的活性位點。因此,單體與 tetramer 不僅組成不同,功能上也有所區別。來源舉 fibrinogen 為例:它可作為單體形式的底物,但不是 tetramer 形式的底物。單體形式亦可與 SERPINB6 形成複合體。

這些資料顯示,酶的底物偏好、分子組成與肥大細胞活化時的釋出,構成目前來源所支持的功能面向。來源並未說明其可能參與先天免疫的具體路徑,也未將特定免疫結果直接歸因於 tryptase beta 2。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 1230184 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TPSB2 ENST00000606293 GRCh38 chr16:1230084-1231184 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTCCATGGGGAGCTGGGCTGGGGCTGGGGGTGAGTCCATGGGGAGCTGGGCTGGGGCTGGGGGTGAGTC
CATGGGGAGCTGGGGCTGGGGCTGGGACTAGTCCATGGGCAGCTGGGCTGGGGCTGGGGGTGAGTCCATG
GGGAGCTGGGCTGGGGCTGGGGGTGAGTCCATGGGGAGCTGGGCTGGGGTTGGGGGTGAGTCCATGGGGA
GCTGGGCTGGGTCTCCTGGGGTTGCACCTGCACTCCTGTCTGCCCTTCCCTCTGCCGATGAAGCTCAGAT
CCCATGATAAGGAGGCACCTGCAGACCAGGGGTCCTGCACGGACAGCCCCAGAGGTGGACATTGAGGACT
CGTAGGAGGACTTGGGTCTCATACGGCGGGTGGGGAGCAGGGCCCCTTCCTGGCTGAGGACACTTGGTGC
TGTCCCCTCTCAAGGCTGTTTCCCCATCTGACAAAGGGGTCTCATGTGAGCCTCCCACCAAGTGAGTCGA
GGAGGGCTGGCGCCACCCCCGTGGATTCGGAGTCCGTAAGAGGGGTGTCACCCGTCATGTCCCCACCCCG
TGGGCACCTTCCCGTCTCTTGGAGGGTGGCCCATGGACATGAGTTCCTCACCCCGTGTCCCTCTTGGGGA
AACAGGTTTCAGGAGCGATGGGTCTTGTAGCCTGGGACAGCCAGGCCACCTGGGTGCAGCAATGCCTGAA
GGCCTCCTGGCACCGAGACAGGGGCAGGAGCAGATCCCACCAGCGGGAAGGTGGTGGGTTCTAGTGCTGG
GATCCACCAGCTGACAGGTGGAGCTGCCAGTCTCCAGTGCTCAGCCCTCAGCGGGGCCTGCCTGGCAGCC
CCACACACAGAGGGCATCGGGGTGGCGGGGGCACGTGTTACACGGGGGCCCTGGGTCTGAGTCATCCACT
TCCTCCGAGTCTGGATGGGAGGACCCAGCGCCCCTCCTCCGCCCCCTCCTGATCTGGAAGCATAAATGGG
GAGGGGAGAGCCCACTGGGTAGAAGGAACAGGGAGCGGCCAGGGTAAGTCCCCACTCTCAGAGACCCTGA
CATCAGCGTCACCTGGAGCAGAGTGGCCCAGCCTCAGACTCAGAGCACCAA
TPSB2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TPSB2_1 ↗16:1,230,184負股1,230,174–1,230,233

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_73XJM · enhancer · 1225660–1225782 · regulatory

ENSR16_8Z9D · promoter · 1225783–1225929 · regulatory

ENSR16_B8LB · enhancer · 1232105–1232687 · regulatory

· motif · 1225858–1225872 · motif

· motif · 1225858–1225872 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:275 aa

1 aa275 aa結構域訊號胜肽
依 P20231 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tryptase beta 2 長 275 個胺基酸,N 端第 1–18 位為訊號胜肽;第 31–272 位註解為 Peptidase S1 結構域。蛋白質屬於 peptidase S1 family 的 tryptase subfamily。

訊號胜肽1–18 aa
結構域Peptidase S131–272 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2BM2…

PDB · 2BM2

X-ray · 2.20 A · A/B/C/D=31-275

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

tryptase beta 2 可被分泌;肥大細胞活化時,會由分泌顆粒釋出。 來源未提供其他定位或異構型差異資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TPSB2TPSB2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

tryptase beta 2 可形成 homotetramer;在沒有 heparin 時,活性 tetramer 於中性或酸性 pH 可轉為非活性單體。低濃度非活性單體在 pH 6.0 且有 heparin 時可轉為活性單體;活性單體濃度較高時,則可依序形成活性單體與活性 tetramer。單體與 tetramer 的底物可及性不同,單體可作用於 fibrinogen,tetramer 則不可;單體亦可與 SERPINB6 形成複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tryptase 是肥大細胞中主要的中性蛋白酶,會在肥大細胞活化與脫顆粒相伴發生時分泌;它可能參與先天免疫,但此處未進一步說明具體作用。推論支持
證據與來源

Tryptase is the major neutral protease present in mast cells and is secreted upon the coupled activation-degranulation response of this cell type. May play a role in innate immunity

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性tryptase 優先切割 Arg 或 Lys 之後的鍵結(Arg-|-Xaa、Lys-|-Xaa),但其底物專一性比 trypsin 更受限制。資料庫紀錄
證據與來源

Preferential cleavage: Arg-|-Xaa, Lys-|-Xaa, but with more restricted specificity than trypsin.

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用tryptase 可形成 homotetramer。無 heparin 時,活性 tetramer 在中性或酸性 pH 會轉為非活性單體;低濃度非活性單體在 pH 6.0 且有 heparin 時可轉為活性單體,較高濃度的活性單體則可形成活性單體並進而形成活性 tetramer。單體活性位點可接觸大型蛋白質與抑制劑,且單體能切割 fibrinogen,tetramer 則不能;單體也會與 SERPINB6 形成複合體。含實驗來源
證據與來源

Homotetramer. The active tetramer is converted to inactive monomers at neutral and acidic pH in the absence of heparin. Low concentrations of inactive monomers become active monomers at pH 6.0 in the presence of heparin. When the concentration of active monomers is higher, they convert to active monomers and then to active tetramers. These monomers are active and functionally distinct from the tetrameric enzyme. In contrast to the hidden active sites in the tetrameric form, the active site of the monomeric form is accessible for macromolecular proteins and inhibitors, e.g. fibrinogen which is a substrate for the monomeric but not for the tetrameric form. The monomeric form forms a complex with SERPINB6

PMID 18039527 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位tryptase beta 2 可被分泌;肥大細胞活化時,會從分泌顆粒釋出。資料庫紀錄
證據與來源

Secreted; Released from the secretory granules upon mast cell activation

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000606293 · 1,165 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAAGGAACAGGGAGCGGCCAGGATGCTGAATCTGCTGCT40
41GCTGGCGCTGCCCGTCCTGGCGAGCCGCGCCTACGCGGCC80
81CCTGCCCCAGGCCAGGCCCTGCAGCGAGTGGGCATCGTTG120
121GGGGTCAGGAGGCCCCCAGGAGCAAGTGGCCCTGGCAGGT160
161GAGCCTGAGAGTCCGCGACCGATACTGGATGCACTTCTGC200
201GGGGGCTCCCTCATCCACCCCCAGTGGGTGCTGACCGCAG240
241CGCACTGCGTGGGACCGGACGTCAAGGATCTGGCCGCCCT280
281CAGGGTGCAACTGCGGGAGCAGCACCTCTACTACCAGGAC320
321CAGCTGCTGCCGGTCAGCAGGATCATCGTGCACCCACAGT360
361TCTACACCGCCCAGATCGGAGCGGACATCGCCCTGCTGGA400
401GCTGGAGGAGCCGGTGAACGTCTCCAGCCACGTCCACACG440
441GTCACCCTGCCCCCTGCCTCAGAGACCTTCCCCCCGGGGA480
481TGCCGTGCTGGGTCACTGGCTGGGGCGATGTGGACAATGA520
521TGAGCGCCTCCCACCGCCATTTCCTCTGAAGCAGGTGAAG560
561GTCCCCATAATGGAAAACCACATTTGTGACGCAAAATACC600
601ACCTTGGCGCCTACACGGGAGACGACGTCCGCATCGTCCG640
641TGACGACATGCTGTGTGCCGGGAACACCCGGAGGGACTCA680
681TGCCAGGGCGACTCCGGAGGGCCCCTGGTGTGCAAGGTGA720
721ATGGCACCTGGCTGCAGGCGGGCGTGGTCAGCTGGGGCGA760
761GGGCTGTGCCCAGCCCAACCGGCCTGGCATCTACACCCGT800
801GTCACCTACTACTTGGACTGGATCCACCACTATGTCCCCA840
841AAAAGCCGTGAGTCAGGCCTGGGGTGTCCACCTGGGTCAC880
881TGGAGAGCCAGCCCCTCCTGTTCAAAACACCACTGCTTCC920
921TACCCAGGTGGCGACTGCCCCCCACACCTTCCCTGCCCCG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。