演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TPM2DA1

tropomyosin 2

TPM2 編碼 tropomyosin 2,屬於 tropomyosin 家族,可與肌動蛋白絲結合,參與肌肉收縮調節,也與非肌肉細胞的細胞骨架相關。

Homo sapiens9p13.3UniProt P07951
OFFICIAL SYMBOL
TPM2
CHROMOSOME
9
UNIPROT
P07951
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TPM2 是蛋白質編碼基因,產物 tropomyosin 2 屬於 tropomyosin 家族。其蛋白質全長 284 個胺基酸,來源資料將第 1–65 與第 117–136 個胺基酸區段標註為無序區。tropomyosin 2 可在肌肉與非肌肉細胞中與肌動蛋白絲結合,並具有不同細胞環境下的功能關聯;非肌肉型異構體也被指出可能參與受促效劑介導的受體內化。

Official symbol
TPM2
Gene name
tropomyosin 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12011
UniProt
P07951
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DA1NEM4AMCD1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99p13.3
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegTPM2pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr9:35,681,992–35,691,116
Gene span
9,125 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000645482 ★35,682,932–35,689,9259
ENST0000064432535,681,992–35,684,8024
ENST0000037829235,681,993–35,691,1039
ENST0000105075335,681,993–35,691,1039
ENST0000106798935,681,993–35,691,1039
ENST0000105076635,681,995–35,691,1039
ENST0000105076735,682,000–35,691,1039
ENST0000105076435,682,008–35,691,1039
ENST0000110484935,682,008–35,691,1035
ENST0000112514735,682,008–35,691,1039
ENST0000095157735,682,010–35,691,1039
ENST0000105076335,682,010–35,691,10310

顯示 12/35 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tropomyosin 2 可結合肌肉與非肌肉細胞中的肌動蛋白絲。在脊椎動物橫紋肌中,它與 troponin complex 協同,居於鈣離子依賴性收縮調節的核心環節;來源描述的是參與調節,而非單獨控制收縮,因此其作用應放在與 troponin complex 的協同關係中理解。

平滑肌收縮則與 tropomyosin 2 和 caldesmon 的交互作用有關。這項描述指出其調節脈絡不同於橫紋肌中與 troponin complex 相關的機制,但未進一步說明交互作用的分子步驟或條件,因此不宜延伸推論其作用方式。

在非肌肉細胞中,tropomyosin 2 被認為與穩定細胞骨架中的肌動蛋白絲有關。此功能與其結合肌動蛋白絲的特性相連,但來源未提供穩定作用的具體機制或實驗情境。非肌肉型異構體另可能參與受促效劑介導的受體內化;這項描述限於「可能」的角色,並未指明特定受體或內化途徑。

因此,TPM2 產物的功能依細胞與肌肉類型而異:在橫紋肌與平滑肌中分別涉及不同的收縮調節關係,在非肌肉細胞中則與肌動蛋白絲穩定及可能的受體內化相關。這些功能描述共同指出 tropomyosin 2 與肌動蛋白絲及其所處的調節環境密切相關,但來源沒有提供足以將上述作用一概而論的證據。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 35689925 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TPM2 ENST00000645482 GRCh38 chr9:35689825-35690925 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAATGGGGAAACATCCCAAAAAAGGGCAGAAAAGAAATTTCAGCATAAAGTTGGCCCACTGGGAAAGAGA
GGAGCGTCCGCGGGGAGCGGGGGAGAAGAGGGAAGGCGCGCGGAGGGGAGTGGGGCCAGGCGGAGCCAGG
GGCGGGGAGCGGAGGGGCTCGGGACGCGTCCGGGTGGGAGCGGGGGCGGGGAACGCGCGGTGACCAGCCT
GGCCGCAGCCGCGTGGAAAATATGCGGGGCACGTGGGGGGCGGGGCGGGGAGCTGGGTCCTGAGCCGCCG
GGTGCTCGCAGGAAGGGCCTGGCTCCAGGGGCAGGGGCTGGGAGGGGAGGCGAGGGGATGAGAGGTCAGG
CCGGTCCTGGGGGCAGCAAGCCCGGCCACACTCCCCACCGCGACCGGGGCTCTGGGCTCGCTTCCTGCTT
CAGTTTCCCCAAGCTCCCGATGAGACTCCGCTACTACCACCACGTCGATAACGCAAACCTAGAGGGACTC
AGGGTAAACTGAGGCACTCAAACTGCCGAGGAGCTCCGCCTCCCGAGAGACATTTAATCCGGGGGGATTT
GCAGGAAACTTCTAAATTAAGGGTAGCGGCTGCTGCAGCTGAGGGGGGGCACGCCGGTCCCTGCGCCCGG
GCAGCTGCCGTGAGCTCACGCCCCGAAATAGCCCCAGGGGCCCCAGCCGCAGCTGCCACTGGGTCCGGCT
GTCACTCAGAGGAAGCACGGAGCCCCCAGCCCAAGGGTCCCCTCCCCTTCGCATCGCCGGGGTTTTTCCA
GCCGACCGTCGGCCACTTTTTCCTCCGACGGCTGGCAGGGAAGAGGGGGATGGGGGCGGGACCCCAAGGG
AGGCGGTCCCCAGTGGGTGGGCGAAGGGGGCGGCCGCACCCCCCGGCCGGGCCGTGCTTCTGCCCCTACA
AGGTTTGGGCCGAGGTGGGGGAGGGTCCTGGTTGCCGGCCCCGCCCGGTCCCTCCCCGCCTTTTAGGCGC
CCGCGTGGCCGGGACGTCCCAGTCCCGCTCCGTCCTCCTCGCCTGCCACCGGTGCACCCAGTCCGCTCAC
CCAGCCCAGTCCGTCCGGTCCTCACCGCCTGCCGGCCGGCCCACCCCCCAC
TPM2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TPM2_1 ↗9:35,689,925負股35,689,915–35,689,974
TPM2_2 ↗9:35,690,598負股35,690,588–35,690,647

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_B9482 · enhancer · 35686286–35687190 · regulatory

ENSR9_9J6G8 · enhancer · 35687389–35687677 · regulatory

ENSR9_833BWN · enhancer · 35687798–35687927 · regulatory

ENSR9_B948H · promoter · 35689903–35690546 · regulatory

ENSR9_B948Q · enhancer · 35691547–35692363 · regulatory

· motif · 35686667–35686680 · motif

· motif · 35686667–35686680 · motif

· motif · 35689651–35689664 · motif

· motif · 35689827–35689837 · motif

· motif · 35689828–35689838 · motif

· motif · 35689989–35689999 · motif

· motif · 35690043–35690053 · motif

· motif · 35690094–35690104 · motif

· motif · 35690101–35690111 · motif

· motif · 35690178–35690188 · motif

· motif · 35690506–35690517 · motif

· motif · 35690577–35690584 · motif

· motif · 35690577–35690592 · motif

· motif · 35690578–35690591 · motif

· motif · 35690681–35690697 · motif

· motif · 35690681–35690697 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:284 aa

1 aa284 aa功能區域
依 P07951 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tropomyosin 2 屬於 tropomyosin 家族,蛋白質長度為 284 個胺基酸。資料將第 1–65 與第 117–136 個胺基酸區段標註為無序區;來源未提供其他結構域或功能區域註解。

功能區域Disordered1–65 aa
功能區域Disordered117–136 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P07951…

AlphaFold · P07951

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton

tropomyosin 2 位於細胞質的細胞骨架,並與 F-actin stress fibers 相關。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間定位差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 11 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DA1TPM2TPM1ABI2FARS2MESDMRFAP1SNAPINSOD1TFPTZNF229ZNF620ZNF785
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

tropomyosin 2 可形成同源二聚體,也可作為 β 鏈,與 TPM1、TPM3 或 TPM4 中任一 α 鏈形成異源二聚體。這些描述涉及二聚體組成;來源未列出其他複合體或互作關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響 TPM2 的變異與先天性肌病 23(CMYO23)相關;此自體顯性肌肉疾病可在出生至兒童期發病,表現包括肌張力低下、肌肉無力,病程可穩定或緩慢進展。肌肉組織檢查可見多種異常,包括肌纖維類型比例失衡、肌原纖維網絡不規則,以及線狀、棒狀或帽狀結構。

影響 TPM2 的變異也與遠端關節攣縮症 1A(DA1A)及 2B4(DA2B4)相關。DA1A 常見手指屈曲攣縮與馬蹄足;DA2B4 可有手足攣縮,並伴隨鼻唇溝明顯、口小及眼瞼裂向下傾斜等臉部特徵。這些資料描述的是變異與疾病的關聯。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tropomyosin 2 可結合肌肉與非肌肉細胞的肌動蛋白絲,並與 troponin complex 協同參與脊椎動物橫紋肌的鈣離子依賴性收縮調節。平滑肌收縮調節與其和 caldesmon 的交互作用有關;在非肌肉細胞中則涉及穩定細胞骨架肌動蛋白絲,非肌肉型異構體可能參與受促效劑介導的受體內化。推論支持
證據與來源

Binds to actin filaments in muscle and non-muscle cells. Plays a central role, in association with the troponin complex, in the calcium dependent regulation of vertebrate striated muscle contraction. Smooth muscle contraction is regulated by interaction with caldesmon. In non-muscle cells is implicated in stabilizing cytoskeleton actin filaments. The non-muscle isoform may have a role in agonist-mediated receptor internalization

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用tropomyosin 2 可形成同源二聚體,也可作為 β 鏈,與 TPM1、TPM3 或 TPM4 中任一 α 鏈形成異源二聚體。推論支持
證據與來源

Homodimer. Heterodimer of an alpha (TPM1, TPM3 or TPM4) and a beta (TPM2) chain

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位tropomyosin 2 位於細胞質的細胞骨架,並與 F-actin stress fibers 相關。推論支持
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton; Associates with F-actin stress fibers

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疾病關聯影響 TPM2 的變異與先天性肌病 23(CMYO23)相關。此自體顯性肌肉疾病於出生至兒童期發病,臨床表現包括肌張力低下與肌肉無力,病程可穩定或緩慢進展。肌肉組織檢查可見肌纖維類型比例失衡、肌原纖維網絡不規則、線狀或棒狀結構,以及位於肌膜下周邊且界線清楚的帽狀結構,並有肌節蛋白異常累積。含實驗來源
證據與來源

Congenital myopathy 23 CMYO23 An autosomal dominant muscular disorder characterized clinically by hypotonia and muscle weakness, and a static or slowly progressive clinical course. Disease onset ranges from birth to childhood. Histologic examination of muscle fibers shows various anomalies including fiber type disproportion, an irregular myofibrillar network, abnormal thread-like or rod-shaped structures, and cap-like structures which are well demarcated and peripherally located under the sarcolemma with abnormal accumulation of sarcomeric proteins. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 609285

PMID 11738357 ↗ · PMID 17434307 ↗ · PMID 17846275 ↗ · PMID 19047562 ↗ · PMID 19345583 ↗ · PMID 24692096 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 TPM2 的變異與遠端關節攣縮症 1A(DA1A)相關。此病屬遠端關節攣縮症,特徵為先天性關節攣縮,主要涉及兩個或以上肢體遠端部位,且沒有原發性神經或肌肉疾病。第一型常見手指屈曲攣縮與馬蹄足,部分指間皺褶發育不全或缺失也很常見;肩部與髖部較少受影響。含實驗來源
證據與來源

Arthrogryposis, distal, 1A DA1A A form of distal arthrogryposis, a disease characterized by congenital joint contractures that mainly involve two or more distal parts of the limbs, in the absence of a primary neurological or muscle disease. Distal arthrogryposis type 1 is characterized largely by camptodactyly and clubfoot. Hypoplasia and/or absence of some interphalangeal creases is common. The shoulders and hips are less frequently affected. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 108120

PMID 12592607 ↗ · PMID 24692096 ↗

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疾病關聯影響 TPM2 的變異與遠端關節攣縮症 2B4(DA2B4)相關。此病屬遠端關節攣縮症,特徵為先天性關節攣縮,主要涉及兩個或以上肢體遠端部位,且沒有原發性神經或肌肉疾病。第二型可有手足攣縮,並有具辨識度的臉部特徵,包括鼻唇溝明顯、口小及眼瞼裂向下傾斜。含實驗來源
證據與來源

Arthrogryposis, distal, 2B4 DA2B4 A form of distal arthrogryposis, a disease characterized by congenital joint contractures that mainly involve two or more distal parts of the limbs, in the absence of a primary neurological or muscle disease. Distal arthrogryposis type 2 is characterized by contractures of the hands and feet, and a distinctive face characterized by prominent nasolabial folds, small mouth and downslanting palpebral fissures. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 108120

PMID 17339586 ↗ · PMID 23678273 ↗ · PMID 30285720 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000645482 · 1,190 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCCCGCTCCGTCCTCCTCGCCTGCCACCGGTGCACCCA40
41GTCCGCTCACCCAGCCCAGTCCGTCCGGTCCTCACCGCCT80
81GCCGGCCGGCCCACCCCCCACCGCAGCCATGGACGCCATC120
121AAGAAGAAGATGCAGATGCTGAAGCTGGACAAGGAGAACG160
161CCATCGACCGCGCCGAGCAGGCCGAAGCCGACAAGAAGCA200
201AGCTGAGGACCGCTGCAAGCAGCTGGAGGAGGAGCAGCAG240
241GCCCTCCAGAAGAAGCTGAAGGGGACAGAGGATGAGGTGG280
281AAAAGTATTCTGAATCCGTGAAGGAGGCCCAGGAGAAACT320
321GGAGCAGGCCGAGAAGAAGGCCACTGATGCTGAGGCAGAT360
361GTGGCCTCCCTGAACCGCCGCATTCAGCTGGTTGAGGAGG400
401AGCTGGACCGGGCCCAGGAGCGCCTGGCTACAGCCCTGCA440
441GAAGCTGGAGGAGGCCGAGAAGGCGGCTGATGAGAGCGAG480
481AGAGGAATGAAGGTCATCGAAAACCGGGCCATGAAGGATG520
521AGGAGAAGATGGAACTGCAGGAGATGCAGCTGAAGGAGGC560
561CAAGCACATCGCTGAGGATTCAGACCGCAAATATGAAGAG600
601GTGGCCAGGAAGCTGGTGATCCTGGAAGGAGAGCTGGAGC640
641GCTCGGAGGAGAGGGCTGAGGTGGCCGAGAGTAAATGTGG680
681GGACCTAGAGGAGGAGCTGAAAATTGTTACCAACAACTTG720
721AAATCCCTGGAGGCCCAGGCGGACAAGTATTCCACCAAAG760
761AAGATAAATATGAAGAGGAGATCAAACTGTTGGAGGAGAA800
801GCTGAAGGAGGCTGAGACCCGAGCAGAGTTTGCCGAGAGG840
841TCTGTGGCAAAGTTGGAGAAAACCATCGATGACCTAGAAG880
881ATGAAGTCTATGCCCAGAAGATGAAGTACAAGGCCATTAG920
921CGAGGAACTGGACAACGCACTCAATGACATCACCTCCCTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。