基因總覽
TPD52L2 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 TPD52 like 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 20q13.33。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000346249 ★ | 63,865,270–63,891,538 | 7 |
| ENST00000611972 | 63,865,199–63,891,545 | 5 |
| ENST00000615907 | 63,865,199–63,891,545 | 6 |
| ENST00000369927 | 63,865,199–63,890,424 | 6 |
| ENST00000348257 | 63,865,199–63,891,545 | 6 |
| ENST00000352482 | 63,865,199–63,891,545 | 8 |
| ENST00000217121 | 63,865,199–63,891,545 | 9 |
| ENST00000351424 | 63,865,199–63,891,545 | 8 |
| ENST00000358548 | 63,865,199–63,891,545 | 7 |
| ENST00000879320 | 63,865,199–63,891,538 | 7 |
| ENST00000879321 | 63,865,199–63,891,541 | 6 |
| ENST00000879322 | 63,865,199–63,891,538 | 7 |
顯示 12/32 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>TPD52L2 ENST00000346249 GRCh38 chr20:63864270-63865370 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCTGTGGAGTGGGGAGGGCGCAGCGCTGGTCGCCCTGAACAGGAAGTGAGACAACCTCGGGGTGCACACG CGCAGGCCCGAGCCGCAGGGTCCACGCCCGAGGCGAGGCGGCAGCGGCGCCTGCAGGGCGAGGGGACGAA TCGCGATCTTTTTCAGAGTAACCCGCGTACAATAAAAAGTCCCCATGAAAAGGACAAACTAGCCAGGCGT GAGGGGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTAAGGTCA GGAGTTCTAGACCAGCCTGGCCAAGGTGGCGAAACCCCCGTCTCTACTACAAATACGAAAATTAGCCGGA CGTGTTGGCGCGCGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGAATCGCTTGAACCCGGAGG GCAGAGATTGGAGTGAGCTGAGATCGCGCCATGGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCT CAAAAACAAACAAAAAAGGACCAACTAAAAAAAGAATATAAATACAATAAATAACAGGACTTACGGGGGC AGGCTGACCCCTAAAGTAAGGGGTCGGGCTGGAAAGGATCTCAAGGGGTCAGAGTTTGAGCCGCCGAGGC GCGCGAGCCCCAGCACTCCTAGGCAGCTGCATCCGCCCCGGAAGATCCCCTGGGGCCCTGCGCTGGCTTT CCACAGCGCCATGTTGGACGGTCCTCCCACTTCCCACCTTCCCAGTCCTCCCGCTACTCTGACCGTTCTA CCTGTGATTCTCGCTGGTGGAGTCAACCTGGAATGGATTCCCGCCGAACCACGCCTCCCTTTCCTGGTTC GCCCGCAGTTTCGGCCTATCAGGTTGAGTCGGGTAAACCAGGACGGGCCAAGCGGCACTCTCATTGGATA TCACTGGTGGGGGCGGGAAGAAGGCGGAGCACGTGCCCGGGCGGAAGTAGCCGTCGCATCGCGGATTACG AAACGCCGCGGAGCTGAGGCAGTTCCGCTGGCTAGTGTGTACGCGGCGAGCTTCTCCCGGCGCCGCCCGC TCGGCTCCCATAGCGCCCGCGACAGCGGTCCGGACGCCGCCCGAACATGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TPD52L2_1 ↗ | 20:63,865,271 | 正股 | 63,865,222–63,865,281 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_9XCD8 · enhancer · 63860544–63860954 · regulatory
ENSR20_C8C4R · enhancer · 63863124–63864916 · regulatory
ENSR20_9XCFH · promoter · 63864917–63865339 · regulatory
ENSR20_BGN7S · enhancer · 63865340–63865863 · regulatory
ENSR20_9XCFR · promoter · 63865864–63866364 · regulatory
· motif · 63862358–63862373 · motif
· motif · 63863664–63863679 · motif
· motif · 63863664–63863679 · motif
· motif · 63863665–63863679 · motif
· motif · 63864090–63864101 · motif
· motif · 63864260–63864273 · motif
· motif · 63864306–63864317 · motif
· motif · 63864308–63864317 · motif
· motif · 63864325–63864341 · motif
· motif · 63864332–63864343 · motif
· motif · 63864332–63864343 · motif
· motif · 63864338–63864349 · motif
· motif · 63864338–63864349 · motif
· motif · 63864541–63864553 · motif
· motif · 63864543–63864558 · motif
· motif · 63864874–63864887 · motif
· motif · 63864943–63864956 · motif
· motif · 63864943–63864956 · motif
· motif · 63865076–63865087 · motif
· motif · 63865087–63865097 · motif
· motif · 63865188–63865198 · motif
· motif · 63865207–63865216 · motif
· motif · 63865207–63865216 · motif
· motif · 63865207–63865216 · motif
· motif · 63865207–63865216 · motif
· motif · 63865217–63865228 · motif
· motif · 63865217–63865228 · motif
· motif · 63865219–63865228 · motif
· motif · 63865244–63865253 · motif
· motif · 63865473–63865493 · motif
· motif · 63865524–63865536 · motif
· motif · 63865527–63865534 · motif
· motif · 63865613–63865626 · motif
· motif · 63865613–63865626 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：206 aa
TPD52L2 蛋白長 206 個胺基酸，屬於 TPD52 family。序列註解指出，胺基端第 1–24 位及羧基端第 175–206 位為無序區域；這些區段的註解描述的是序列特徵，並未提供其具體功能。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- ABHD5Q8WTS1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COQ8AQ8NI60 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH3GLB1Q9Y371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Tpd52Q62393 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TPD52L2 可與 TPD52 family 的其他成員形成同源二聚體或異源二聚體；此二聚體關係為依相似性推定。另有資料記載 TPD52L2 與 MAL2 互作，但未說明兩者是否形成複合體或其互作的功能意義。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | TPD52L2 可與同一家族的其他成員形成同源二聚體或異源二聚體，此關係是依相似性推定；另有互作資料指出，TPD52L2 與 MAL2 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a homodimer or heterodimer with other members of the family (By similarity). Interacts with MAL2 PMID 11549320 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTCCGCTGGCTAGTGTGTACGCGGCGAGCTTCTCCCGG40CGCCGCCCGCTCGGCTCCCATAGCGCCCGCGACAGCGGTC80CGGACGCCGCCCGAACATGGACTCCGCCGGCCAAGATATC120AACCTGAATTCTCCTAACAAAGGTCTGCTGTCTGACTCCA160TGACGGATGTTCCTGTCGACACAGGTGTGGCTGCCCGGAC200TCCTGCTGTTGAGGGTCTGACAGAGGCTGAGGAGGAGGAG240CTCAGGGCTGAGCTTACCAAGGTGGAAGAGGAAATTGTCA280CTCTGCGCCAGGTCCTGGCAGCCAAGGAGAGGCACTGTGG320AGAGCTCAAGAGGAGGCTGGGCCTCTCCACCCTGGGGGAG360CTGAAACAGAACCTGTCCAGGAGCTGGCATGACGTGCAGG400TCTCTAGCGCCTATGTGAAAACTTCTGAGAAACTTGGAGA440GTGGAATGAGAAAGTGACCCAGTCAGACCTCTACAAGAAG480ACTCAGGAAACTCTTTCACAGGCAGGACAGAAGACTTCAG520CTGCCCTGTCCACAGTGGGCTCTGCCATCAGCAGGAAGCT560TGGAGACATGAGGAACTCTGCGACCTTCAAGTCGTTTGAG600GACCGAGTTGGGACCATAAAGTCTAAGGTTGTGGGTGACA640GAGAGAACGGCAGTGACAACCTCCCTTCCTCAGCGGGGAG680TGGTGACAAGCCCCTGTCGGATCCCGCACCTTTCTAAGCC720TGTGGTTGCTTCACCCGCTGCAGAGCACACGCAACCCAGC760CTCAGCATCACAGCCGCAGCTCTGTTCAGCGGAGCAGCCA800GCCAGGGCGGATGAGCAGAGCCGGCCCTGAGGACAGTCCT840GCCCATCCACGCGGAGATGTGGCTGCCGCGTTTGCATGAA880TTTGAAGAACACAGGCTTGTACACAGATGTTTTACACTCA920CGTTTGTAGATGAAACAGATCACTGTGCTGTCCTTCCTAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。