基因總覽
TPD52L1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 TPD52 like 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6q22.31。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000534000 ★ | 125,153,773–125,264,407 | 7 |
| ENST00000534368 | 125,119,049–125,248,360 | 4 |
| ENST00000304877 | 125,153,649–125,264,407 | 8 |
| ENST00000368402 | 125,153,649–125,264,407 | 6 |
| ENST00000368388 | 125,153,649–125,264,407 | 5 |
| ENST00000527711 | 125,153,649–125,264,407 | 6 |
| ENST00000528193 | 125,153,649–125,263,062 | 7 |
| ENST00000995920 | 125,153,649–125,264,407 | 7 |
| ENST00001055383 | 125,153,649–125,263,496 | 6 |
| ENST00001093667 | 125,153,649–125,263,504 | 8 |
| ENST00001093668 | 125,153,649–125,263,498 | 7 |
| ENST00001114625 | 125,153,649–125,229,922 | 3 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>TPD52L1 ENST00000534000 GRCh38 chr6:125152773-125153873 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTAAATTGAAAACCTTCTGGAAAAGATTCACCATTCTAGATGCCATTAAGAACATTTATAATTCGTGGG AGGAAGTCAAAACGTCAACATTAACAGGAGTTTGGAAAAAGTTGATTCCAACCCTCCTGAATGACTTTGG GAGTTCAGGACTTCAAAGCAGGAAGTAACTGCAGATATGGTAGAAATAGCAAGAGAACTAGAATTAGAAG TGGAGCCTGAATATGTGAGTAAATTGCTCAATCTCATAAGACTTGAATGGTTGAGGAGTTGCTTCTTATG GACAAGCAAAGAAAATGGTTACTTGAAATGGAATCTACTCCTGGTGAAGTTGTTCACAGCATTGTTGAAA TGACAGCAAAAGATTTATAATTATATAAACTTAGTTGATAAAGCAATGGCAGGGTTTGAGATGATTGACT CCAATTTTGAAAAAAGTTATAATGTAGATAAAATGCTATCAACCAGCATTGCATGCTACAGAAAAATCTT TCATAAAAGGAAGAGTCAATTGATGCAGCAAACTTCATTGTTGTCCCATTTTAAGAAATTGACACAGCTA TTGCAGCCTTCAGCAATCACTACCAGGATCAATCAGCAGCCATCAACATCCAAGCAATGCCTTCCACCAC CAAAAAGATTCCCATTAGGTGAAGATGATCTTTAGCATTTTTTAGAAATAAAATATCTTTTTAAGTTAAG GTAGGTACATTGCTCTTTCTAGACATCGTGCTATTGCATACTTAACAGACTACAGCATAGTGCAAACGTA ACTTTTATATGCATTAGGAAACTGAAAAATTCGTGTGACTCGTTTTGTTGCAATACTCGCTTTATTGCGG GGGTCTGGAACCTAACCTGCAATATCTCTGCGTTATGCCCTTATAGCGCCGGGAGTGGGTGCCTTCCGCC GGCTGTACAGAGCGCCGGCAGGTGGCGCCCAGCGGCGAGCTTGTTCCAGCTTGGTTTGGGCCAGGTGGAC TGGAAGGGGCGGAGGTAACCAGAAGCGGCTAGTGGCGGCTGCCTGCGTCCCCAACCCCCTCCGCGCAGCG CTCGCGACACGCGTGCCAGGAGTGGGAGCGAGCGGCGGGGCCAGCTGCGTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TPD52L1_1 ↗ | 6:125,153,809 | 正股 | 125,153,760–125,153,819 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_BWSL5 · enhancer · 125149297–125150021 · regulatory
ENSR6_BWSLQ · promoter · 125153432–125154391 · regulatory
ENSR6_534FRS9 · CTCF_binding_site · 125153693–125153714 · regulatory
ENSR6_534FRTT · CTCF_binding_site · 125154030–125154051 · regulatory
ENSR6_CGFBG · enhancer · 125154392–125155462 · regulatory
ENSR6_534FRZ9 · CTCF_binding_site · 125154557–125154578 · regulatory
· motif · 125153695–125153711 · motif
· motif · 125154032–125154048 · motif
· motif · 125154503–125154518 · motif
· motif · 125154505–125154518 · motif
· motif · 125154508–125154520 · motif
· motif · 125154511–125154518 · motif
· motif · 125154535–125154549 · motif
· motif · 125154559–125154575 · motif
· motif · 125154561–125154574 · motif
· motif · 125154672–125154679 · motif
· motif · 125154745–125154758 · motif
· motif · 125154948–125154961 · motif
· motif · 125154948–125154961 · motif
· motif · 125154954–125154969 · motif
· motif · 125155118–125155132 · motif
· motif · 125157437–125157450 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：204 aa
TPD52L1 屬於 TPD52 family，蛋白質全長 204 個胺基酸。序列第 1 至 20 位被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- TPD52P55327 · UniProt INTERACTION · 7 experiments · 2 筆來源紀錄
- TPD52L3Q96J77 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- Tpd52Q62393 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PBX3Q96AL5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TPD52L1 可與同一家族的其他成員形成同源二聚體或異源二聚體；來源未提供特定互作對象或複合體的進一步資訊。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | TPD52L1 可與同一家族的其他成員形成同源二聚體或異源二聚體。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGAAGCGGCTAGTGGCGGCTGCCTGCGTCCCCAACCCCCT40CCGCGCAGCGCTCGCGACACGCGTGCCAGGAGTGGGAGCG80AGCGGCGGGGCCAGCTGCGTTCTGAGCCTGGGCGCAGCTG120CCATCTGCTCTGGGAAGCACCAGGGTGTCCCCGCCGCCCT160CAGCTCGAAGTCAGCCACCATGGAGGCGCAGGCACAAGGT200TTGTTGGAGACTGAACCGTTGCAAGGAACAGACGAAGATG240CAGTAGCCAGTGCTGACTTCTCTAGCATGCTCTCTGAGGA280GGAAAAGGAAGAGTTAAAAGCAGAGTTAGTTCAGCTAGAA320GACGAAATTACAACACTACGACAAGTTTTGTCAGCGAAAG360AAAGGCATCTAGTTGAGATAAAACAAAAACTCGGCATGAA400CCTGATGAATGAATTAAAACAGAACTTCAGCAAAAGCTGG440CATGACATGCAGACTACCACTGCCTACAAGAAAACACATG480AAACCCTGAGTCACGCAGGGCAAAAGGCAACTGCAGCTTT520CAGCAACGTTGGAACGGCCATCAGCAAGAAGTTCGGAGAC560ATGAGTTACTCCATTCGCCATTCCATAAGTATGCCTGCTA600TGAGGAATTCTCCTACTTTCAAATCATTTGAGGAGAGGGT640TGAGACAACTGTCACAAGCCTCAAGACGAAAGTAGGCGGT680ACGAACCCTAATGGAGGCAGTTTTGAGGAGGTCCTCAGCT720CCACGGCCCATGCCAGTGCCCAGAGCTTGGCAGGAGGCTC760CCGGCGGACCAAGGAGGAGGAGCTGCAGTGCTAAGTCCAG800CCAGCGTGCAGCTGCATCCAGAAACCGGCCACTACCCAGC840CCATCTCTGCCTGTGCTTATCCAGATAAGAAGACCAAAAT880CCCGCTGGGAAAAACCCAGGCCTTGACATTGTTATTCAAA920TGGCCCCTCCAGAAAGTTTAATGATTTCCATTTGTATTTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。