基因總覽
TPD52 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 tumor protein D52。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 8q21.13。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000518937 ★ | 80,034,745–80,171,564 | 8 |
| ENST00000379096 | 80,034,745–80,171,641 | 6 |
| ENST00000520527 | 80,034,745–80,080,816 | 8 |
| ENST00000517427 | 80,034,745–80,080,816 | 7 |
| ENST00000379097 | 80,034,745–80,080,816 | 6 |
| ENST00000519303 | 80,034,745–80,171,200 | 8 |
| ENST00000448733 | 80,034,745–80,080,831 | 7 |
| ENST00000861105 | 80,034,745–80,171,641 | 7 |
| ENST00000861106 | 80,034,745–80,171,641 | 5 |
| ENST00000925382 | 80,034,745–80,171,641 | 4 |
| ENST00000999152 | 80,034,745–80,171,641 | 7 |
| ENST00000999153 | 80,034,745–80,171,641 | 5 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>TPD52 ENST00000518937 GRCh38 chr8:80171464-80172564 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACAGTCACTTCAGGTAACTACAAGTAATTTTAAAACATCTGAATAAGTGCTTCTTTGTTGTCTGTGGAGT GCTACACAATGCTTCGGCCTAAACGTCAAGCAACACAGAAAAGAAGCCCCACTTCATTTGCAGCCTCAGA TAGCTTACGAAATTGAGACACCACCTGAAGACCATGACCCATACAATCAAAGTGACTTCATGGAAGACGA GTAACTGCAAAACCCTGTGAAAACAGATTGTTAACGCTACTAATGAAAAGAACTGGATTGTTACGGGAAC CTCAAACTGTCCTTTGATCAACGGACATGACGCCTCAACACGCATTTTCCAAAGATCTCTGCTGATAATT CTGACCTTCGGTTAATTTAATTAATTTCATTTGATTTAATTCATTTTAGTGTTGTCCTCAGTCCCGCACT CAAAACAGATTTTTATTATATGAAAATCTTCCTAGTCACCTAAAAAATCCGCATTCTATGGAAAAGACTA TATAATTTTTCAAGAGATTCTTTGCAATTTTCACCTATGCTGGTTTATGACCTAGTTAGAGAAGACATCA TAGGGCATTATTTAGGTAATAAAATACAGAGAGAAAAGAGCCACTGGCATTTCTAAATAACGTTCCTGTG TTTCCTACTGTAAGTATAGGAAAGTAGGTGTTCGCAGATGCAGAGAAAGGGCATCTCCAAGGCCTCGGAG GAAACTTTTGATTTTATAAATAACTTGATGGTGGAAGGCAAACGCCATCCCGGTTCCCAAGCAGGCTCCA CGCAGCCTCCATGGCCGAGTCCATCTCCTCGCCGTCCTCTTCCCTCCTCCCGGCCGACTTCCAGCCGGTG CGGGAGTCGGGGTGCGCCCGGCCCTCCTAGCGCTGCGCCGCCCGCGCCGACGTGGCGGAGCGCACAGGTC GACCGGGTCAGGTGGTTGGGTGACGCCCCAGGAAAGCGCTCCAGGCCGAGGGCGGGCGGCGCCGCCGCGC CCGACGCCTCTGGGGGTGGGGACTTCGCGGGAGTCGCCGGCGGAGGCGAGGAGGAGCTCTGCGCGGCGCG GCGGGCGATCCGAGCCGGGACGGGCTGCAGGCGGGGGTGCTGCAGAGGACA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 13 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TPD52_3 ↗ | 8:80,037,122 | 負股 | 80,037,112–80,037,171 |
| TPD52_13 ↗ | 8:80,037,655 | 負股 | 80,037,645–80,037,704 |
| TPD52_12 ↗ | 8:80,037,860 | 負股 | 80,037,850–80,037,909 |
| TPD52_11 ↗ | 8:80,038,265 | 負股 | 80,038,255–80,038,314 |
| TPD52_6 ↗ | 8:80,042,618 | 負股 | 80,042,608–80,042,667 |
| TPD52_4 ↗ | 8:80,043,541 | 負股 | 80,043,531–80,043,590 |
| TPD52_5 ↗ | 8:80,051,859 | 負股 | 80,051,849–80,051,908 |
| TPD52_8 ↗ | 8:80,053,359 | 負股 | 80,053,349–80,053,408 |
| TPD52_7 ↗ | 8:80,064,559 | 負股 | 80,064,549–80,064,608 |
| TPD52_10 ↗ | 8:80,080,553 | 負股 | 80,080,543–80,080,602 |
| TPD52_2 ↗ | 8:80,080,830 | 負股 | 80,080,820–80,080,879 |
| TPD52_9 ↗ | 8:80,171,121 | 負股 | 80,171,111–80,171,170 |
| TPD52_1 ↗ | 8:80,171,564 | 負股 | 80,171,554–80,171,613 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_BKWKC · enhancer · 80167318–80168331 · regulatory
ENSR8_BKWKH · enhancer · 80168451–80169010 · regulatory
ENSR8_84CMBJ · enhancer · 80169621–80169861 · regulatory
ENSR8_BKWKR · enhancer · 80170406–80171189 · regulatory
ENSR8_BKWKW · promoter · 80171190–80172054 · regulatory
ENSR8_5NT5S6 · CTCF_binding_site · 80171450–80171471 · regulatory
ENSR8_936S75 · enhancer · 80172576–80172849 · regulatory
· motif · 80167230–80167245 · motif
· motif · 80167453–80167466 · motif
· motif · 80167454–80167467 · motif
· motif · 80167454–80167467 · motif
· motif · 80167481–80167492 · motif
· motif · 80167492–80167503 · motif
· motif · 80167494–80167503 · motif
· motif · 80167648–80167659 · motif
· motif · 80168719–80168733 · motif
· motif · 80168719–80168733 · motif
· motif · 80169294–80169316 · motif
· motif · 80169294–80169316 · motif
· motif · 80170821–80170836 · motif
· motif · 80170864–80170881 · motif
· motif · 80170931–80170943 · motif
· motif · 80171108–80171119 · motif
· motif · 80171317–80171326 · motif
· motif · 80171452–80171468 · motif
· motif · 80174513–80174526 · motif
· motif · 80174513–80174526 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：224 aa
TPD52（tumor protein D52）屬於 TPD52 family，蛋白質長度為 224 個胺基酸。其第 187 至 224 位胺基酸區段被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- TPD52L1Q16890 · UniProt INTERACTION · 7 experiments · 2 筆來源紀錄
- TPD52L3Q96J77 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MIEF1Q9NQG6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH3GLB1Q9Y371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPG21Q9NZD8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- THAP4Q8WY91 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TTPAP49638 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TPD52 可與同一家族的其他成員形成同源二聚體或異源二聚體；所有異構型也都會與數種 14-3-3 蛋白質互作。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | TPD52 可與同一家族的其他成員形成同源二聚體或異源二聚體；此外，所有異構型都會與數種 14-3-3 蛋白質互作。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Forms a homodimer or heterodimer with other members of the family. All isoforms interact with several 14-3-3 proteins |
核酸與蛋白質序列
GACTTCGCGGGAGTCGCCGGCGGAGGCGAGGAGGAGCTCT40GCGCGGCGCGGCGGGCGATCCGAGCCGGGACGGGCTGCAG80GCGGGGGTGCTGCAGAGGACACGAGGCGGCGGGCTGGAGA120CATGGACCGCGGCGAGCAAGGTCTGCTGAGAACAGACCCA160GTCCCTGAGGAAGGAGAAGATGTTGCTGCCACGATCAGTG200CCACAGAGACCCTCTCGGAAGAGGAGCAGGAAGAGCTAAG240AAGAGAACTTGCAAAGGTAGAAGAAGAAATCCAGACTCTG280TCTCAAGTGTTAGCAGCAAAAGAGAAGCATCTAGCAGAGA320TCAAGCGGAAACTTGGAATCAATTCTCTACAGGAACTAAA360ACAGAACATTGCCAAAGGGTGGCAAGACGTGACAGCAACA400TCTGCTTACAAGAAGACATCTGAAACCTTATCCCAGGCTG440GACAGAAGGCCTCAGCTGCTTTTTCGTCTGTTGGCTCAGT480CATCACCAAAAAGCTGGAAGATGTAAAATTGCAAGCCTTT520TCACATTCCTTTAGTATACGTTCCATTCAGCATTCAATTA560GCATGCCTGCTATGAGAAACTCCCCAACTTTTAAATCATT600TGAAGAAAAGGTCGAAAACTTAAAGTCTAAAGTAGGGGGA640ACCAAGCCTGCTGGTGGTGATTTTGGAGAAGTCTTGAATT680CGGCTGCAAATGCTAGTGCCACCACCACGGAGCCTCTTCC720AGAAAAGACACAGGAGAGCCTGTGAGATTCCTACCTTTGT760TCTGCTACCCACTGCCAGATGCTGCAAGCGAGGTCCAAGC800ACATCTTGTCAACATGCATTGCCATGAATTTCTACCAGAT840GTGCTTTTATTTAGCTTTACATATTCCTTTGACCAAATAG880TTTGTGGGTTAAACAAAATGAAAATATCTTCACCTCTATT920CTTGGGAAACACCCTTTAGTGTACATTTATGTTCCTTTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。