基因總覽
TP73 是蛋白質編碼基因，產物 tumor protein p73 屬於 p53 家族。其蛋白質具有多個功能區域，包括轉錄活化區、DNA 結合區、寡聚化區及 SAM 結構域；不同異構型是否含有轉錄活化區，與其功能差異有關。來源並指出，TP73 具有多種異構型，且其中部分異構型之間的作用關係並不相同。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000378295 ★ | 3,652,516–3,736,201 | 14 |
| ENST00000604074 | 3,652,307–3,736,201 | 11 |
| ENST00000354437 | 3,652,307–3,736,201 | 13 |
| ENST00001140270 | 3,652,307–3,736,201 | 14 |
| ENST00000603362 | 3,652,565–3,733,079 | 12 |
| ENST00000604479 | 3,652,565–3,733,079 | 12 |
| ENST00000713570 | 3,669,034–3,736,201 | 14 |
| ENST00000908821 | 3,669,034–3,736,201 | 12 |
| ENST00000917568 | 3,675,283–3,736,201 | 12 |
| ENST00001089267 | 3,675,283–3,736,201 | 13 |
| ENST00000713572 | 3,675,318–3,736,201 | 14 |
| ENST00000917569 | 3,675,572–3,736,201 | 14 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TP73 參與 DNA 損傷引發的細胞凋亡反應，但不同異構型的作用方向可能相反。含有轉錄活化區的異構型具有促凋亡作用；缺少此區域的異構型則具有抗凋亡作用，並會阻斷 p53 與具轉錄活化能力的 p73 異構型功能。因此，TP73 的生物學作用會隨異構型而異，不能將所有 p73 產物視為具有相同的凋亡效應。
TP73 也參與肺部纖毛細胞分化的正向調控，並被描述為此過程的必要因子。來源另指出，TP73 可活化 FOXJ1 的表現；此項功能標示為依相似性推定，應與已明確描述的肺部纖毛細胞分化作用區分看待。
TP73 可能具有腫瘤抑制蛋白的角色，但來源以「可能」描述，並未將此定位表述為確定結論。整體而言，來源所支持的功能涵蓋異構型相關的凋亡調節，以及肺部纖毛細胞分化；至於 FOXJ1 表現調控則屬依相似性推定。另有生化註記指出，每個亞基可結合一個鋅離子。
Promoter 與基因調控
>TP73 ENST00000378295 GRCh38 chr1:3651516-3652616 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCTAGCCAGGGCCTGGTGTACGTGGTCGAGGGCCCTGGAAGCCCCGATGGCCTAGGAGGAGCAGGCGGGC GGGGCGGCGGGTGTCGCTGGCCGGTAGAGAGCTTCGGCCTGACCTAGCGCAGGTCTGGTGCGCGCAGAGA ACAACTCCAAGCGCACCGACGCCCGCGAGCTCCTTCCAAACACCGAACGGGATCCAGAGCCCGAGCCCAC AGGCGGCGGCCGGGGGAGGGAGCAGGGTGCTGGCCGCCGCCCGGGAGTGTTCGCGTCCTGGGTGACCCCT GGAAGGACGTGGGGCCCAAACTCCGGCTGGGGTTGGGAGAGCAGCCCCCAGAGGCTCTCCGCGGGATCCT CTGCCGGGCGGGACCGTGGCTCCACAGGAGAAGTGGGTGGCAAGCCCTGCTTGGCGGAAAGCAGCCGTTC CCCTCCTCCTGGGCCTGGGGCGGCGCCCCTCACCCCTGTTCCCCGCCCCTCACCCCTGTTCCCCGCCGGC CACATCCCCTGCCCCTTGGATTCCAAGCGCCCCGCGCGCCGAGGAGCCCAGCGCTAGTGGCGGCGGCCAG GAGAGACCCGGGTGTCAGGAAAGATGGGCCGTCTGGGGGACAGCAGGGAGTCCGGGGGAAACGCAGGCGT CGGGCACAGAGTCGGCACCGGCGTCCCCAGCTCTGCCGAAGATCGCGGTCGGGTCTGGCCCGCGGGAGGG GCCCTGGCGCCGGACCTGCTTCGGCCCTGCGTGGGCGGCCTCGCCGGGCTCTGCAGGAGCGACGCGCGCC AAAAGGCGGCGGGAAGGAGGCGGGGCAGAGCGCGCCCGGGACCCCGACTTGGACGCGGCCAGCTGGAGAG GCGGAGCGCCGGGAGGAGACCTTGGCCCCGCCGCGACTCGGTGGCCCGCGCTGCCTTCCCGCGCGCCGGG CTAAAAAGGCGCTAACGCCCGCGGCCGCCTACTCCCCGCGGCGCCTCCCCTCCCCGCGCCCATATAACCC GCCTAGGGGCCGGGCAGCCCGCCCTGCCTCCCCGCCCGCGCACCCGCCCGGAGGCTCGCGCGCCCGCGAA GGGGACGCAGCGAAACCGGGGCCCGCGCCAGGCCAGCCGGGACGGACGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TP73_1 ↗ | 1:3,652,516 | 正股 | 3,652,467–3,652,526 |
| TP73_3 ↗ | 1:3,690,672 | 正股 | 3,690,623–3,690,682 |
| TP73_2 ↗ | 1:3,698,046 | 正股 | 3,697,997–3,698,056 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_5T6T9 · CTCF_binding_site · 3650015–3650036 · regulatory
ENSR1_BPK5 · promoter · 3650048–3650593 · regulatory
ENSR1_BPKD · promoter · 3652026–3652575 · regulatory
ENSR1_BPKH · enhancer · 3652576–3653590 · regulatory
ENSR1_84WC3 · enhancer · 3654693–3654939 · regulatory
· motif · 3649544–3649553 · motif
· motif · 3649574–3649583 · motif
· motif · 3649603–3649612 · motif
· motif · 3649650–3649659 · motif
· motif · 3649680–3649689 · motif
· motif · 3649740–3649749 · motif
· motif · 3649770–3649779 · motif
· motif · 3649800–3649809 · motif
· motif · 3649817–3649826 · motif
· motif · 3650017–3650033 · motif
· motif · 3650092–3650103 · motif
· motif · 3650092–3650103 · motif
· motif · 3650094–3650103 · motif
· motif · 3650104–3650117 · motif
· motif · 3650106–3650117 · motif
· motif · 3650106–3650117 · motif
· motif · 3650108–3650117 · motif
· motif · 3650195–3650205 · motif
· motif · 3650197–3650210 · motif
· motif · 3650382–3650393 · motif
· motif · 3651076–3651085 · motif
· motif · 3651398–3651405 · motif
· motif · 3651784–3651796 · motif
· motif · 3651787–3651794 · motif
· motif · 3652241–3652254 · motif
· motif · 3653205–3653218 · motif
· motif · 3653205–3653218 · motif
· motif · 3653956–3653968 · motif
· motif · 3653958–3653965 · motif
· motif · 3653958–3653973 · motif
· motif · 3656096–3656107 · motif
· motif · 3656447–3656469 · motif
· motif · 3656743–3656752 · motif
· motif · 3656831–3656846 · motif
· motif · 3656901–3656913 · motif
· motif · 3656969–3656984 · motif
· motif · 3656993–3657010 · motif
· motif · 3656999–3657009 · motif
· motif · 3657400–3657413 · motif
TP73 不會因 DNA 損傷而被誘導。缺少轉錄活化區的異構型會阻斷基因誘導。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：636 aa
tumor protein p73 屬於 p53 家族，蛋白質長度為 636 個胺基酸。其 N 端具有轉錄活化區，另有 DNA 結合區、寡聚化區及 SAM 結構域；序列中亦註記 PPxY motif。部分區段被標示為無序區。寡聚化區與 HIPK2 的作用區域有重疊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TP73 位於細胞核與細胞質；DNA 損傷時會在細胞核內累積。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
- AURKAO14965 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- EP300Q09472 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HSPA9P38646 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- ITCHQ96J02 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 3 筆來源紀錄
- MDM2Q00987 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NEDD4P46934 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PMS2P54278-1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF144BQ7Z419 · UniProt INTERACTION · 2 experiments · 2 筆來源紀錄
- RUNX2Q13950 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SIRT1Q96EB6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TP53BP2Q13625 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TP63Q9H3D4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- WWOXQ9NZC7 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 3 筆來源紀錄
- YAP1P46937 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
- Cables1Q9ESJ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CASP8AP2Q9UKL3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- E6P03126 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TP73 與 p53/TP53、CABLES1 形成複合體，並與多種蛋白質互作。異構型差異明確：Beta 可同源互作並與 p53/TP53 互作，Alpha 不具這些已列出的互作；Gamma 可同源互作並與所有 p73 異構型互作；Delta 則與 Gamma、Alpha 及自身互作。Alpha 和 Beta 與 HIPK2 互作，另有異構型特異的 RANBP9、WWOX 互作紀錄。TP73 也透過 SAM 結構域與 FBXO45、NQO1 互作；NQO1 互作依賴 NADH，並在氧化壓力下穩定 TP73、保護其免於 20S proteasome 的非泛素依賴性降解。HCK 與 TP73 互作會抑制 TP73 活性及其降解。
疾病與遺傳關聯
TP73 變異與原發性纖毛運動障礙 47 型及無腦回畸形相關；此病為自體隱性遺傳，通常在出生後不久或幼年發病。患者可有運動纖毛異常、反覆呼吸道感染、慢性發炎及支氣管擴張，也可能出現智能發展受損、中樞性低張力，以及無腦回畸形、胼胝體變薄或缺如等腦部結構異常。來源指出未觀察到內臟左右位異常。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TP73 參與 DNA 損傷相關的細胞凋亡反應；含轉錄活化區的異構型促進凋亡，缺少該區域者則具抗凋亡作用，並阻斷 p53 與具轉錄活化能力的 p73 異構型功能。TP73 可能是腫瘤抑制蛋白；其活化 FOXJ1 表現的作用為依相似性推定，且是肺部纖毛細胞分化正向調控的必要因子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Participates in the apoptotic response to DNA damage. Isoforms containing the transactivation domain are pro-apoptotic, isoforms lacking the domain are anti-apoptotic and block the function of p53 and transactivating p73 isoforms. May be a tumor suppressor protein. Is an activator of FOXJ1 expression (By similarity). It is an essential factor for the positive regulation of lung ciliated cell differentiation PMID 10203277 ↗ · PMID 11753569 ↗ · PMID 18174154 ↗ · PMID 34077761 ↗ |
| 分子活性 | TP73 每個亞基可結合一個鋅離子。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | TP73 與 p53/TP53、CABLES1 形成複合體，並有多種依異構型而異的互作：Beta 與自身及 p53/TP53 互作，Alpha 不具此互作；Gamma 與自身及所有 p73 異構型互作；Delta 與 Gamma、Alpha 及自身互作。Alpha、Beta 與 HIPK2 互作，Alpha 另與 RANBP9、Beta 與 WWOX 互作。TP73 亦透過 SAM 結構域與 FBXO45、NQO1 互作，並與磷酸化 YAP1、HECW2 互作；其 C 端寡聚化區與 ABL1 tyrosine kinase 的 SH3 結構域結合。HCK 互作會抑制 TP73 活性及降解；NQO1 互作依賴 NADH，可在氧化壓力下穩定 TP73，並保護其免於 20S proteasome 的非泛素依賴性降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Found in a complex with p53/TP53 and CABLES1. The C-terminal oligomerization domain binds to the ABL1 tyrosine kinase SH3 domain. Interacts with HECW2. Isoform Beta interacts homotypically and with p53/TP53, whereas isoform Alpha does not. Isoform Gamma interacts homotypically and with all p73 isoforms. Isoform Delta interacts with isoform Gamma, isoform Alpha, and homotypically. Isoforms Alpha and Beta interact with HIPK2. Isoform Alpha interacts with RANBP9. Isoform Beta interacts with WWOX. Interacts (via SAM domain) with FBXO45 (via B30.2/SPRY domain). Interacts with YAP1 (phosphorylated form). Interacts with HCK (via SH3 domain); this inhibits TP73 activity and degradation. Interacts (via SAM domain) with NQO1; this interaction is NADH-dependent, stabilizes TP73 in response to oxidative stress and protects it from ubiquitin-independent degradation by the 20S proteasome PMID 10391251 ↗ · PMID 11706030 ↗ · PMID 11925430 ↗ · PMID 12890487 ↗ · PMID 15070730 ↗ · PMID 15558019 ↗ · PMID 17535448 ↗ · PMID 18280240 ↗ · PMID 19581926 ↗ · PMID 28291250 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，TP73 與 Epstein-Barr virus 蛋白 EBNA6 互作；此互作會抑制 TP73 介導的細胞凋亡路徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Epstein-Barr virus protein EBNA6; this interaction inhibits TP73-mediated apoptotic pathway PMID 24314664 ↗ |
| 細胞定位 | TP73 位於細胞核與細胞質；DNA 損傷時會在細胞核內累積。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | TP73 不會因 DNA 損傷而被誘導；缺少轉錄活化區的異構型會阻斷基因誘導。 | 含實驗來源 | 證據與來源Not induced by DNA damage. Isoforms lacking the transactivation domain block gene induction PMID 11753569 ↗ |
| 疾病關聯 | TP73 變異會造成原發性纖毛運動障礙 47 型及無腦回畸形。此自體隱性疾病通常在出生後不久或幼年發病，特徵包括運動纖毛異常、反覆呼吸道感染導致的慢性發炎與支氣管擴張，並可伴隨智能發展受損、中樞性低張力及腦部結構異常，尤以無腦回畸形和胼胝體變薄或缺如為主；未觀察到內臟左右位異常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ciliary dyskinesia, primary, 47, and lissencephaly CILD47 A form of primary ciliary dyskinesia, a disorder characterized by abnormalities of motile cilia. Respiratory infections leading to chronic inflammation and bronchiectasis are recurrent, due to defects in the respiratory cilia. CILD47 is an autosomal recessive form characterized by onset soon after birth or in early childhood. Affected individuals also have neurologic features, such as impaired intellectual development and central hypotonia, associated with structural brain abnormalities, most notably lissencephaly and thin or absent corpus callosum. No situs abnormalities have been observed. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 619466 PMID 34077761 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCCCTGCCTCCCCGCCCGCGCACCCGCCCGGAGGCTCGCG40CGCCCGCGAAGGGGACGCAGCGAAACCGGGGCCCGCGCCA80GGCCAGCCGGGACGGACGCCGATGCCCGGGGCTGCGACGG120CTGCAGAGCGAGCTGCCCTCGGAGGCCGGCGTGGGGAAGA160TGGCCCAGTCCACCGCCACCTCCCCTGATGGGGGCACCAC200GTTTGAGCACCTCTGGAGCTCTCTGGAACCAGACAGCACC240TACTTCGACCTTCCCCAGTCAAGCCGGGGGAATAATGAGG280TGGTGGGCGGAACGGATTCCAGCATGGACGTCTTCCACCT320GGAGGGCATGACTACATCTGTCATGGCCCAGTTCAATCTG360CTGAGCAGCACCATGGACCAGATGAGCAGCCGCGCGGCCT400CGGCCAGCCCCTACACCCCAGAGCACGCCGCCAGCGTGCC440CACCCACTCGCCCTACGCACAACCCAGCTCCACCTTCGAC480ACCATGTCGCCGGCGCCTGTCATCCCCTCCAACACCGACT520ACCCCGGACCCCACCACTTTGAGGTCACTTTCCAGCAGTC560CAGCACGGCCAAGTCAGCCACCTGGACGTACTCCCCGCTC600TTGAAGAAACTCTACTGCCAGATCGCCAAGACATGCCCCA640TCCAGATCAAGGTGTCCACCCCGCCACCCCCAGGCACCGC680CATCCGGGCCATGCCTGTTTACAAGAAAGCGGAGCACGTG720ACCGACGTCGTGAAACGCTGCCCCAACCACGAGCTCGGGA760GGGACTTCAACGAAGGACAGTCTGCTCCAGCCAGCCACCT800CATCCGCGTGGAAGGCAATAATCTCTCGCAGTATGTGGAT840GACCCTGTCACCGGCAGGCAGAGCGTCGTGGTGCCCTATG880AGCCACCACAGGTGGGGACGGAATTCACCACCATCCTGTA920CAACTTCATGTGTAACAGCAGCTGTGTAGGGGGCATGAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。