基因總覽
TP53BP2 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 tumor protein p53 binding protein 2。其產物屬於 ASPP family，是參與細胞凋亡與細胞生長調節的蛋白質。蛋白質序列包含多個 ANK 重複區與 SH3 domain，並有數段被註記為無序區域；這些結構註記描述其序列特徵，不代表各區域的作用都已在此來源中界定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000343537 ★ | 223,779,893–223,845,947 | 18 |
| ENST00000391878 | 223,779,893–223,845,930 | 19 |
| ENST00000863547 | 223,779,893–223,845,968 | 18 |
| ENST00000863548 | 223,779,893–223,845,968 | 18 |
| ENST00001008978 | 223,779,893–223,845,968 | 17 |
| ENST00001080994 | 223,779,893–223,845,968 | 18 |
| ENST00001143619 | 223,779,893–223,845,968 | 18 |
| ENST00000494100 | 223,795,838–223,814,328 | 5 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TP53BP2 是細胞凋亡與細胞生長調節因子，其作用與多種蛋白質互作相關。它能調節 TP53，在體內增強 TP53 與 DNA 的結合，以及 TP53 在促凋亡基因啟動子上的轉錄活化功能，因而支持 TP53 促進細胞凋亡的作用。
TP53BP2 也會影響 NAE1 促成 NEDD8 與 CUL1 結合的能力。它抑制這項結合反應，並因此降低 NAE1 誘導細胞凋亡的能力。這項作用與它增強 TP53 促凋亡功能的描述不同，顯示其參與凋亡調節時，可能因所涉及的分子作用而產生不同方向的影響。
此外，TP53BP2 會阻礙細胞週期進程於 G2/M 階段。其促進細胞凋亡的活性則會受到 DDX42 互作抑制。這些資料指出，TP53BP2 可透過調節 TP53、影響 NAE1 相關反應，以及與 DDX42 的互作，參與細胞凋亡和細胞週期調控；來源未進一步說明這些作用在不同細胞情境中的相對貢獻。
Promoter 與基因調控
>TP53BP2 ENST00000343537 GRCh38 chr1:223845847-223846947 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTTACTAGAACAAAGCTTCCTGGAGTTAGGGTTCCCGCAGTATGTGTCTCTCTGGAAGGTGGAATAAAAG CCTGAACCCGCTCTGCTACTCTTTGGAAGGCAGCCCTGCCATTTCCCTAGGCCTTGGCCTCCCTCCCTGG AAAAGGATGGTATCCACCGGCTCCCCGTATCGGAGGCTGTTTGCAGGGTGTTCCCAGCACCCCCCAGGGA AGCTCCTCAGAATGCTGCCTGACACATTTTTACAAAATTTATTTTTATTGTGGTAAAACATACACAACAT AAAAGTTATCCCTTTATCCAGTTTGCGGTGTACGTTTGTTAACCTTACAGCAAGTAACACATGAGTTTTA AATTAGAATTTGGACAACGGCAAATGAGATGAAAGGCGAACAATCCGAAAGCCGGATCACTGAGGAGCTC TGGGAACGCGCCGCGAGCTGAAGCCACACGGGGAACTCCATTTTGTCGGGACAGGGTCGGTCCTGGCCGC CTCCAGGGAGTCGGGTAGTTTCCGCGGCGTGGCCCGGGCCTCCCCTGAAGTCCGTCCGCCTCTCTCCGCC TGGCCCAGCGGCGCGGCCGCCGGAGGACTCTGTCCACGCGCCCAACGTCGGGCGCCCTGTTCTGAAGGCA AAGGGTCCCCTGCCTCGCACGACTCGGAGCCGCCGAGGAGGTGACGGCGGCAGCCCTGGGGCGGCTCGGT GCCATTCACTACCATCCTGTTTTCCTGAGGCGCGGCCTTCCAATTGCCCCGGCTCCGCTAGGAGGCGCGC GCTCCAGCCGCTCCGCCGCGCGGCCCCGACCGCACTTCAGTCCGGGGCGAAGAAAGAAAAGGCGGCCGGC TCCCGCCGCTCCCCGTCTACCCAGCCGGGCCCGCGCAGGCGCGCGCAGCTCCCGTTCCCGCGGCCGCCCC TCCCCCAGGCCGCCGGGCGCGCCGCGGGCGGGGTCGGCGCGGGGGGCGGAGCCGGCACGGGCTCGGCTGG GGCCCGACCCGGGATTAGTTGGTTTCGGAGCGGAGGAGGGAGCCCCGACCGTCACGAGCGTCGAAGAGAC AAAGCCGCGTCAGGGGGCCCGGCCGGGGCGGGGGAGCCCGGGGCTTGTTGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TP53BP2_1 ↗ | 1:223,845,947 | 負股 | 223,845,937–223,845,996 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_CS7PH · enhancer · 223843941–223845919 · regulatory
ENSR1_53XMK7M · CTCF_binding_site · 223845031–223845052 · regulatory
ENSR1_88KNRH · promoter · 223845920–223846059 · regulatory
ENSR1_53XMKDX · CTCF_binding_site · 223846177–223846198 · regulatory
ENSR1_959SWF · promoter · 223846313–223846813 · regulatory
ENSR1_959SWJ · enhancer · 223846814–223847176 · regulatory
· motif · 223843148–223843163 · motif
· motif · 223844925–223844933 · motif
· motif · 223844925–223844940 · motif
· motif · 223845033–223845049 · motif
· motif · 223845539–223845554 · motif
· motif · 223845615–223845624 · motif
· motif · 223845615–223845626 · motif
· motif · 223845615–223845626 · motif
· motif · 223845738–223845751 · motif
· motif · 223845784–223845797 · motif
· motif · 223846065–223846076 · motif
· motif · 223846065–223846076 · motif
· motif · 223846111–223846121 · motif
· motif · 223846179–223846195 · motif
· motif · 223846637–223846645 · motif
· motif · 223846637–223846652 · motif
· motif · 223846689–223846700 · motif
· motif · 223846736–223846749 · motif
· motif · 223846736–223846749 · motif
· motif · 223849375–223849388 · motif
在 UV 照射造成 DNA 損傷後，TP53BP2 會受到野生型 TP53 下調；此下調未見於突變型 TP53。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1128 aa
TP53BP2 蛋白質長 1128 個胺基酸，屬於 ASPP family。其序列包含四個 ANK 重複區（ANK 1–4）及位於 C 端附近的 SH3 domain，另有 SH3-binding motif。多段序列被註記為無序區域；來源亦標示 332–348 殘基區段與 APPBP1 互作，876–1128 殘基區段介導與 APC2 的互作。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TP53BP2 主要位於核周區域，只有少部分位於細胞核。 DDX42 過量表現時，TP53BP2 會被滯留於細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 49 個夥伴
- APC2O95996 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BCL2P10415 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- BCL2L1Q07817-1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BCL2L2Q92843 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CTNNB1P35222 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- EP300Q09472 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ITCHQ96J02 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PPP1CAP62136 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- PPP1CCP36873 · UniProt INTERACTION · 12 experiments · 2 筆來源紀錄
- RANP62826 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- RELAQ04206 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- TP53P04637 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- TP63Q9H3D4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TP73O15350 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- YWHAZP63104 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- P27958P27958 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- YAP1P46937 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- Irs1P35569 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Irs1P35570 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- YAP1P46936 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ATPAF2Q8N5M1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAIAP2Q9UQB8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC92Q53HC0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CWF19L2Q2TBE0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TP53BP2 與 TP53 的互作可促進促凋亡活性；它也與 BCL2、protein phosphatase 1、RELA、APC2、NAE1 及 DDX42 互作。TP53BP2 與 RELA 的互作可能阻止凋亡活化，可能是藉由妨礙 TP53BP2 與 TP53 的互作。DDX42 經由 TP53BP2 的 C 端互作；此互作不受 TP53BP2 泛素化抑制，且不依賴 TP53。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TP53BP2 參與調節細胞凋亡與細胞生長；它在體內增強 TP53 對促凋亡基因啟動子的 DNA 結合及轉錄活化。它抑制 NAE1 將 NEDD8 結合至 CUL1，並因此降低 NAE1 誘導凋亡的能力；同時會阻礙細胞週期進程於 G2/M。與 DDX42 互作會抑制其促凋亡活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Regulator that plays a central role in regulation of apoptosis and cell growth via its interactions with proteins such as TP53. Regulates TP53 by enhancing the DNA binding and transactivation function of TP53 on the promoters of pro-apoptotic genes in vivo. Inhibits the ability of NAE1 to conjugate NEDD8 to CUL1, and thereby decreases NAE1 ability to induce apoptosis. Impedes cell cycle progression at G2/M. Its apoptosis-stimulating activity is inhibited by its interaction with DDX42 PMID 11684014 ↗ · PMID 12524540 ↗ · PMID 12694406 ↗ · PMID 19377511 ↗ |
| 交互作用 | TP53BP2 與 TP53、BCL2、protein phosphatase 1、RELA、APC2、NAE1 及 DDX42 互作。與 TP53 的互作促進促凋亡活性；與 RELA 的互作可能抑制凋亡活化，可能是因而妨礙 TP53BP2 與 TP53 互作。DDX42 經由 TP53BP2 的 C 端互作，且此互作不受 TP53BP2 泛素化抑制，也不依賴 TP53。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with P53/TP53; the interaction promotes pro-apoptotic activity. Interacts with BCL2. Interacts with protein phosphatase 1. Interacts with RELA NF-kappa-B subunit. This interaction probably prevents the activation of apoptosis, possibly by preventing its interaction with TP53. Interacts with APC2 and NAE1. Interacts with DDX42 (via the C-terminus); the interaction is not inhibited by TP53BP2 ubiquitination and is independent of p53/TP53 PMID 10498867 ↗ · PMID 10646860 ↗ · PMID 11684014 ↗ · PMID 12524540 ↗ · PMID 12694406 ↗ · PMID 19377511 ↗ · PMID 8016121 ↗ · PMID 8668206 ↗ |
| 細胞定位 | TP53BP2 位於細胞質的核周區域及細胞核，主要分布於核周區域，只有少部分位於細胞核。DDX42 過量表現時，TP53BP2 會被滯留在細胞質。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytoplasm, perinuclear region; Nucleus; Predominantly found in the perinuclear region. Some small fraction is nuclear. Sequester in the cytoplasm on overexpression of DDX42 |
| 調控 | 在 UV 照射造成 DNA 損傷後，野生型 TP53 會下調 TP53BP2；突變型 TP53 則不會造成此下調。 | 含實驗來源 | 證據與來源Following DNA damage induced by UV irradiation. Down-regulated by wild-type, but not mutant, p53/TP53 PMID 11027272 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGTTTCGGAGCGGAGGAGGGAGCCCCGACCGTCACGAGCG40TCGAAGAGACAAAGCCGCGTCAGGGGGCCCGGCCGGGGCG80GGGGAGCCCGGGGCTTGTTGGTGCCCCAGCCCGCGCGGAG120GGCCCTTCGGACCCGCGCGCCGCCGCTGCCGCCGCCGCCG160CCTCGCAACAGGTCCGGGCGGCCTCGCTCTCCGCTCCCCT200CCCCCGCATCCGCGACCCTCCGGGGCACCTCAGCTCGGCC240GGGGCCGCAGTCTGGCCACCCGCTTCCATGCGGTTCGGGT280CCAAGATGATGCCGATGTTTCTTACCGTGTATCTCAGTAA320CAATGAGCAGCACTTCACAGAAGTTCCAGTTACTCCAGAA360ACAATATGCAGAGACGTGGTGGATCTGTGCAAAGAACCCG400GCGAGAGTGATTGCCATTTGGCTGAAGTGTGGTGTGGCTC440TGAACGTCCAGTTGCGGATAATGAGCGAATGTTTGATGTT480CTTCAACGATTTGGAAGTCAGAGGAACGAAGTTCGCTTCT520TCCTTCGTCATGAACGCCCCCCTGGCAGGGACATTGTGAG560TGGACCAAGATCTCAGGATCCAAGTTTAAAAAGAAATGGT600GTAAAAGTTCCTGGTGAATATCGAAGAAAGGAGAACGGTG640TTAATAGTCCTAGGATGGATCTGACTCTTGCTGAACTTCA680GGAAATGGCATCTCGCCAGCAGCAACAGATTGAAGCCCAG720CAACAATTGCTGGCAACTAAGGAACAGCGCTTAAAGTTTT760TGAAACAACAAGATCAGCGACAACAGCAACAAGTTGCTGA800GCAGGAGAAACTTAAAAGGCTAAAAGAAATAGCTGAGAAT840CAGGAAGCTAAGCTAAAAAAAGTGAGAGCACTTAAAGGCC880ACGTGGAACAGAAGAGACTAAGCAATGGGAAACTTGTGGA920GGAAATTGAACAGATGAATAATTTGTTCCAGCAAAAACAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。